Background: The aims of this study were to develop and evaluate a high/low-emulsifier diet and compare emulsifier content with preclinical studies that have associated Crohn’s disease with emulsifiers. Methods: Supermarkets were audited with a seven-day high- (HED) and low-emulsifier diet (LED) meal plan developed. The emulsifier content of food was sought from food manufacturers, compared to acceptable daily intake (ADI), and doses were provided in trials. Nutritional composition analysis was completed. Healthy adults ate these diets for seven days in a randomized single-blinded cross-over feeding study to assess palatability, tolerability, satiety, food variety, dietary adherence, blinding and the ease of following the meal plan via visual analogue scale. Results: A database of 1680 foods was created. There was no difference in nutritional content between the HED and LED, except HED had a higher ultra-processed food content (p < 0.001). The HED contained 41 emulsifiers, with 53% of the products able to be quantified for emulsifiers (2.8 g/d), which did not exceed the ADI, was similar to that in observational studies, and was exceeded by doses used in experimental studies. In ten participants, diets were rated similarly in palatability—HED mean 62 (5% CI 37–86) mm vs. LED 68 (54–82) mm—in tolerability—HED 41 (20–61) mm vs. LED 55 (37–73) mm—and in satiety HED 57 (32–81) mm vs. LED 49 (24–73) mm. The combined diets were easy to follow (82 (67–97) mm) with good variety (65 (47–81)) and excellent adherence. Conclusion: Nutritionally well-matched HED and LED were successfully developed, palatable and well tolerated.

Summary Background Although dietary emulsifiers are implicated in the pathogenesis of Crohn's disease, their effect has not been studied in humans. Aim To determine the effects of high‐ and low‐emulsifier diets (HED, LED) on intestinal barrier function in healthy subjects in unstressed and acutely stressed states. Methods We conducted a single‐blinded, cross‐over, controlled feeding trial in 22 healthy adults. After recording 7 days of their habitual diet, we randomised participants to HED or LED with ≥3‐week washout between diets. On dietary completion, acute stress was induced via intravenous corticotrophin‐releasing hormone. We assessed dietary adherence, effects on 2‐h urinary lactulose: rhamnose ratio (LRR), serum concentrations of lipopolysaccharide‐binding protein, soluble‐CD14 and markers of epithelial injury and inflammation. Results Dietary adherence was excellent. In an unstressed state, median (interquartile range) LRR during HED was 0.030 (0.018–0.042); on LED, this was 0.042 (0.029–0.078; p = 0.04). LPB concentrations were lower on HED than LED ( p = 0.026), but no differences were observed for epithelial injury or inflammation. Under acute stress, LRR increased by 89% (−1% to 486%) on HED ( p = 0.004), differing ( p = 0.001) from 39% (1%–90%) decrease on LED ( p = 0.009). Soluble‐CD14 also increased ( p < 0.001). The LED had a prolonged carry‐over effect on suppressing HED‐induced changes during stress. Similar changes in LRR and soluble‐CD14 were observed when HED was used as the first diet (both p < 0.01). Conclusion High intake of emulsifiers improved barrier function in the unstressed state, but increased intestinal permeability to stress, without evidence of inflammation. A LED was protective of the stress effect.

The optimal dosing strategy for infliximab in steroid-refractory acute severe ulcerative colitis (ASUC) is unknown. We compared intensified and standard dose infliximab rescue strategies and explored maintenance therapies following infliximab induction in ASUC.

Background and aims: Although genome-wide association studies (GWAS) in inflammatory bowel disease (IBD) have identified a large number of common disease susceptibility alleles for both Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC), a substantial fraction of IBD heritability remains unexplained, suggesting that rare coding genetic variants may also have a role in pathogenesis. We used high-throughput sequencing in families with multiple cases of IBD, followed by genotyping of cases and controls, to investigate whether rare protein altering genetic variants are associated with susceptibility to IBD. Methods: Whole exome sequencing was carried out in 10 families in which 3 or more individuals were affected with IBD. A stepwise filtering approach was applied to exome variants to identify potential causal variants. Follow-up genotyping was performed in 6,025 IBD cases (2,948 CD; 3,077 UC) and 7,238 controls. Results: Our exome variant analysis revealed coding variants in the NLRP7 gene that were present in affected individuals in two distinct families. Genotyping of the two variants, p.S361L and p.R801H, in IBD cases and controls showed that the p.S361L variant was significantly associated with an increased risk of ulcerative colitis (odds ratio 4.79, p=0.0039) and IBD (odds ratio 3.17, p=0.037). A combined analysis of both variants showed suggestive association with an increased risk of IBD (odds ratio 2.77, p=0.018). Conclusions: The results suggest that NLRP7 signalling and inflammasome formation may be a significant component in the pathogenesis of IBD.

Objective: Relatives of individuals with Crohn's disease (CD) carry an increased number of CD-associated genetic variants and are at increased risk of developing the disease. Multiple environmental and genetic factors contribute to this increased risk. We aimed to estimate the utility of genotype, smoking, family history, and a panel of biomarkers to predict risk in asymptomatic first-degree relatives (FDRs) of CD patients. Design: We calculated a combined genotype (72 CD-associated genetic markers) and smoking relative risk score in 454 FDRs, and performed capsule endoscopy and collected 22 biomarkers in individuals from the highest and lowest risk quartiles. We then predicted small intestinal inflammation using genetic risk score, smoking status, number of relatives with CD, capsule transit time, and the panel of biomarkers in 124 individuals with complete data. Our principal analysis was to calculate the predictive utility from two machine learning classifiers: an elastic net and a random forest. Results: Both classifiers successfully predicted FDRs with intestinal inflammation: elastic net (AUC=0.80, 95% CI: 0.62-0.98), random forest (AUC=0.87, 95% CI: 0.75-1.00). The elastic net selected a 3-predictor solution: CD family history (OR=1.31), genetic risk score (OR=1.14), and faecal calprotectin (OR=1.04). The same 3 variables were among the top 5 most important predictors as ranked by the random forest. Conclusion: A readily collectable panel of genetic risk variants, added to family history and faecal calprotectin, predicts those at greatest risk for developing CD with a good degree of accuracy.

We assembled and analyzed genetic data of 47,351 multiple sclerosis (MS) subjects and 68,284 control subjects and establish a reference map of the genetic architecture of MS that includes 200 autosomal susceptibility variants outside the major histocompatibility complex (MHC), one chromosome X variant, and 32 independent associations within the extended MHC. We used an ensemble of methods to prioritize up to 551 potentially associated MS susceptibility genes, that implicate multiple innate and adaptive pathways distributed across the cellular components of the immune system. Using expression profiles from purified human microglia, we do find enrichment for MS genes in these brain-resident immune cells. Thus, while MS is most likely initially triggered by perturbation of peripheral immune responses the functional responses of microglia and other brain cells are also altered and may have a role in targeting an autoimmune process to the central nervous system.

Background: Endoscopic balloon dilatation (EBD) is an alternative therapy to avoid or delay surgery in stricturing Crohn’s disease (CD); however, certain factors determining outcomes remain poorly defined, and conflicting evidence exists in current studies. In one of the largest cohorts to date, we assess outcomes following EBD for stricturing CD for both anastomotic and de novo strictures. Methods: A retrospective cohort study of CD patients undergoing EBD was conducted at 12 hospitals across Australia and New Zealand. Local databases were used to identify cases from February 1999 to November 2019. Data from patient endoscopy reports and medical records were used to determine patient medical details and EBD outcomes. Multivariable analysis was undertaken to identify factors associated with technical and long‐term success. Results: A total of 273 patients with stricturing CD were identified (48% female; 49.6% Montreal L3 disease). Of 695 EBD procedures (355 anastomotic, 340 de novo strictures), the majority (80.1% of strictures with identified length) was performed on short strictures (< 4 cm). Technical success, defined as the ability to traverse the stricture with a colonoscope after dilation, was achieved in 577 (83%) of endoscopic procedures, with success more likely with de novo strictures compared with anastomotic strictures (aOR: 3.21, P = 0.010). A significantly higher failure rate was noted with long strictures (aOR: 0.09, P < 0.001). A total of 74 patients (27%) required surgery within 5 years with stricture length, the only significant factor associated with increased surgery risk (aHR: 2.37, P < 0.01). Conclusion: EBD is a highly effective and safe procedure in both de novo and anastomotic strictures < 4 cm that can prevent or delay the need for surgical treatment.