Autism spectrum disorder (ASD) is a highly heritable and heterogeneous group of neurodevelopmental phenotypes diagnosed in more than 1% of children. Common genetic variants contribute substantially to ASD susceptibility, but to date no individual variants have been robustly associated with ASD. With a marked sample-size increase from a unique Danish population resource, we report a genome-wide association meta-analysis of 18,381 individuals with ASD and 27,969 controls that identified five genome-wide-significant loci. Leveraging GWAS results from three phenotypes with significantly overlapping genetic architectures (schizophrenia, major depression, and educational attainment), we identified seven additional loci shared with other traits at equally strict significance levels. Dissecting the polygenic architecture, we found both quantitative and qualitative polygenic heterogeneity across ASD subtypes. These results highlight biological insights, particularly relating to neuronal function and corticogenesis, and establish that GWAS performed at scale will be much more productive in the near term in ASD. A genome-wide-association meta-analysis of 18,381 austim spectrum disorder (ASD) cases and 27,969 controls identifies five risk loci. The authors find quantitative and qualitative polygenic heterogeneity across ASD subtypes.

A key component of genetic architecture is the allelic spectrum influencing trait variability. For autism spectrum disorder (herein termed autism), the nature of the allelic spectrum is uncertain. Individual risk-associated genes have been identified from rare variation, especially de novo mutations. From this evidence, one might conclude that rare variation dominates the allelic spectrum in autism, yet recent studies show that common variation, individually of small effect, has substantial impact en masse. At issue is how much of an impact relative to rare variation this common variation has. Using a unique epidemiological sample from Sweden, new methods that distinguish total narrow-sense heritability from that due to common variation and synthesis of results from other studies, we reach several conclusions about autism's genetic architecture: its narrow-sense heritability is ∼52.4%, with most due to common variation, and rare de novo mutations contribute substantially to individual liability, yet their contribution to variance in liability, 2.6%, is modest compared to that for heritable variation.

Importance

 Autism spectrum disorder (ASD) aggregates in families, but the individual risk and to what extent this is caused by genetic factors or shared or nonshared environmental factors remains unresolved. 

Objective

 To provide estimates of familial aggregation and heritability of ASD. 

Design, Setting, and Participants

 A population-based cohort including 2 049 973 Swedish children born 1982 through 2006. We identified 37 570 twin pairs, 2 642 064 full sibling pairs, 432 281 maternal and 445 531 paternal half sibling pairs, and 5 799 875 cousin pairs. Diagnoses of ASD to December 31, 2009 were ascertained. 

Main Outcomes and Measures

 The relative recurrence risk (RRR) measures familial aggregation of disease. The RRR is the relative risk of autism in a participant with a sibling or cousin who has the diagnosis (exposed) compared with the risk in a participant with no diagnosed family member (unexposed). We calculated RRR for both ASD and autistic disorder adjusting for age, birth year, sex, parental psychiatric history, and parental age. We estimated how much of the probability of developing ASD can be related to genetic (additive and dominant) and environmental (shared and nonshared) factors. 

Results

 In the sample, 14 516 children were diagnosed with ASD, of whom 5689 had autistic disorder. The RRR and rate per 100 000 person-years for ASD among monozygotic twins was estimated to be 153.0 (95% CI, 56.7-412.8; rate, 6274 for exposed vs 27 for unexposed ); for dizygotic twins, 8.2 (95% CI, 3.7-18.1; rate, 805 for exposed vs 55 for unexposed); for full siblings, 10.3 (95% CI, 9.4-11.3; rate, 829 for exposed vs 49 for unexposed); for maternal half siblings, 3.3 (95% CI, 2.6-4.2; rate, 492 for exposed vs 94 for unexposed); for paternal half siblings, 2.9 (95% CI, 2.2-3.7; rate, 371 for exposed vs 85 for unexposed); and for cousins, 2.0 (95% CI, 1.8-2.2; rate, 155 for exposed vs 49 for unexposed). The RRR pattern was similar for autistic disorder but of slightly higher magnitude. We found support for a disease etiology including only additive genetic and nonshared environmental effects. The ASD heritability was estimated to be 0.50 (95% CI, 0.45-0.56) and the autistic disorder heritability was estimated to 0.54 (95% CI, 0.44-0.64). 

Conclusions and Relevance

 Among children born in Sweden, the individual risk of ASD and autistic disorder increased with increasing genetic relatedness. Heritability of ASD and autistic disorder were estimated to be approximately 50%. These findings may inform the counseling of families with affected children.

This study reanalyzes Swedish cohort data to assess the stability under alternative assumptions and models of a previous estimate of the heritability of autism spectrum disorder.

Importance

 The origins and development of autism spectrum disorder (ASD) remain unresolved. No individual-level study has provided estimates of additive genetic, maternal, and environmental effects in ASD across several countries. 

Objective

 To estimate the additive genetic, maternal, and environmental effects in ASD. 

Design, Setting, and Participants

 Population-based, multinational cohort study including full birth cohorts of children from Denmark, Finland, Sweden, Israel, and Western Australia born between January 1, 1998, and December 31, 2011, and followed up to age 16 years. Data were analyzed from September 23, 2016 through February 4, 2018. 

Main Outcomes and Measures

 Across 5 countries, models were fitted to estimate variance components describing the total variance in risk for ASD occurrence owing to additive genetics, maternal, and shared and nonshared environmental effects. 

Results

 The analytic sample included 2 001 631 individuals, of whom 1 027 546 (51.3%) were male. Among the entire sample, 22 156 were diagnosed with ASD. The median (95% CI) ASD heritability was 80.8% (73.2%-85.5%) for country-specific point estimates, ranging from 50.9% (25.1%-75.6%) (Finland) to 86.8% (69.8%-100.0%) (Israel). For the Nordic countries combined, heritability estimates ranged from 81.2% (73.9%-85.3%) to 82.7% (79.1%-86.0%). Maternal effect was estimated to range from 0.4% to 1.6%. Estimates of genetic, maternal, and environmental effects for autistic disorder were similar with ASD. 

Conclusions and Relevance

 Based on population data from 5 countries, the heritability of ASD was estimated to be approximately 80%, indicating that the variation in ASD occurrence in the population is mostly owing to inherited genetic influences, with no support for contribution from maternal effects. The results suggest possible modest differences in the sources of ASD risk between countries.

Background Postpartum depression (PPD) can result in negative personal and child developmental outcomes. Only a few large population-based studies of PPD have used clinical diagnoses of depression and no study has examined how a maternal depression history interacts with known risk factors. The objective of this study was to examine the impact of a depression history on PPD and pre- and perinatal risk factors. Methods A nationwide prospective cohort study of all women with live singleton births in Sweden from 1997 through 2008 was conducted. Relative risk (RR) of clinical depression within the first year postpartum and two-sided 95% confidence intervals were estimated. Results The RR of PPD in women with a history of depression was estimated at 21.03 (confidence interval: 19.72–22.42), compared to those without. Among all women, PPD risk increased with advanced age (1.25 (1.13–1.37)) and gestational diabetes (1.70 (1.36–2.13)). Among women with a history of depression, pregestational diabetes (1.49 (1.01–2.21)) and mild preterm delivery also increased risk (1.20 (1.06–1.36)). Among women with no depression history, young age (2.14 (1.79–2.57)), undergoing instrument-assisted (1.23 (1.09–1.38)) or cesarean (1.64(1.07–2.50)) delivery, and moderate preterm delivery increased risk (1.36 (1.05–1.75)). Rates of PPD decreased considerably after the first postpartum month (RR = 0.27). Conclusion In the largest population-based study to date, the risk of PPD was more than 20 times higher for women with a depression history, compared to women without. Gestational diabetes was independently associated with a modestly increased PPD risk. Maternal depression history also had a modifying effect on pre- and perinatal PPD risk factors.

Objective To study the long term consequences of low carbohydrate diets, generally characterised by concomitant increases in protein intake, on cardiovascular health. Design Prospective cohort study. Setting Uppsala, Sweden. Participants From a random population sample, 43 396 Swedish women, aged 30-49 years at baseline, completed an extensive dietary questionnaire and were followed-up for an average of 15.7 years. Main outcome measures Association of incident cardiovascular diseases (ascertained by linkage with nationwide registries), overall and by diagnostic category, with decreasing carbohydrate intake (in tenths), increasing protein intake (in tenths), and an additive combination of these variables (low carbohydrate-high protein score, from 2 to 20), adjusted for intake of energy, intake of saturated and unsaturated fat, and several non-dietary variables. Results A one tenth decrease in carbohydrate intake or increase in protein intake or a 2 unit increase in the low carbohydrate-high protein score were all statistically significantly associated with increasing incidence of cardiovascular disease overall (n=1270)—incidence rate ratio estimates 1.04 (95% confidence interval 1.00 to 1.08), 1.04 (1.02 to 1.06), and 1.05 (1.02 to 1.08). No heterogeneity existed in the association of any of these scores with the five studied cardiovascular outcomes: ischaemic heart disease (n=703), ischaemic stroke (n=294), haemorrhagic stroke (n=70), subarachnoid haemorrhage (n=121), and peripheral arterial disease (n=82). Conclusions Low carbohydrate-high protein diets, used on a regular basis and without consideration of the nature of carbohydrates or the source of proteins, are associated with increased risk of cardiovascular disease.

Purpose The Obesity and Disease Development Sweden (ODDS) study was designed to create a large cohort to study body mass index (BMI), waist circumference (WC) and changes in weight and WC, in relation to morbidity and mortality. Participants ODDS includes 4 295 859 individuals, 2 165 048 men and 2 130 811 women, in Swedish cohorts and national registers with information on weight assessed once (2 555 098 individuals) or more (1 740 761 individuals), in total constituting 7 733 901 weight assessments at the age of 17–103 years in 1963–2020 (recalled weight as of 1911). Information on WC is available in 152 089 men and 212 658 women, out of whom 108 795 have repeated information on WC (in total 512 273 assessments). Information on morbidity and mortality was retrieved from national registers, with follow-up until the end of 2019–2021, varying between the registers. Findings to date Among all weight assessments (of which 85% are objectively measured), the median year, age and BMI (IQR) is 1985 (1977–1994) in men and 2001 (1991–2010) in women, age 19 (18–40) years in men and 30 (26–36) years in women and BMI 22.9 (20.9–25.4) kg/m 2 in men and 23.2 (21.2–26.1) kg/m 2 in women. Normal weight (BMI 18.5–24.9 kg/m 2 ) is present in 67% of assessments in men and 64% in women and obesity (BMI≥30 kg/m 2 ) in 5% of assessments in men and 10% in women. The median (IQR) follow-up time from the first objectively measured or self-reported current weight assessment until emigration, death or end of follow-up is 31.4 (21.8–40.8) years in men and 19.6 (9.3–29.0) years in women. During follow-up, 283 244 men and 123 457 women died. Future plans The large sample size and long follow-up of the ODDS Study will provide robust results on anthropometric measures in relation to risk of common diseases and causes of deaths, and novel findings in subgroups and rarer outcomes.

Autism spectrum disorder (ASD) is a highly heritable and heterogeneous group of neurodevelopmental phenotypes diagnosed in more than 1% of children. Common genetic variants contribute substantially to ASD susceptibility, but to date no individual variants have been robustly associated with ASD. With a marked sample size increase from a unique Danish population resource, we report a genome-wide association meta-analysis of 18,381 ASD cases and 27,969 controls that identifies five genome-wide significant loci. Leveraging GWAS results from three phenotypes with significantly overlapping genetic architectures (schizophrenia, major depression, and educational attainment), seven additional loci shared with other traits are identified at equally strict significance levels. Dissecting the polygenic architecture we find both quantitative and qualitative polygenic heterogeneity across ASD subtypes, in contrast to what is typically seen in other complex disorders. These results highlight biological insights, particularly relating to neuronal function and corticogenesis and establish that GWAS performed at scale will be much more productive in the near term in ASD, just as it has been in a broad range of important psychiatric and diverse medical phenotypes.