PM
Peter McGuffin
Author with expertise in Genomic Studies and Association Analyses
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
28
(39% Open Access)
Cited by:
10,670
h-index:
106
/
i10-index:
405
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Large-scale genome-wide association analysis of bipolar disorder identifies a new susceptibility locus near ODZ4

Pamela Mahon et al.Sep 18, 2011
The Psychiatric GWAS Consortium Bipolar Disorder Working Group reports a large-scale genome-wide association study of 7,481 individuals with bipolar disorder with replication in 4,493 cases. The Consortium identifies a new susceptibility locus near ODZ4 and replicates a known association near CACNA1C for bipolar disorder. We conducted a combined genome-wide association study (GWAS) of 7,481 individuals with bipolar disorder (cases) and 9,250 controls as part of the Psychiatric GWAS Consortium. Our replication study tested 34 SNPs in 4,496 independent cases with bipolar disorder and 42,422 independent controls and found that 18 of 34 SNPs had P < 0.05, with 31 of 34 SNPs having signals with the same direction of effect (P = 3.8 × 10−7). An analysis of all 11,974 bipolar disorder cases and 51,792 controls confirmed genome-wide significant evidence of association for CACNA1C and identified a new intronic variant in ODZ4. We identified a pathway comprised of subunits of calcium channels enriched in bipolar disorder association intervals. Finally, a combined GWAS analysis of schizophrenia and bipolar disorder yielded strong association evidence for SNPs in CACNA1C and in the region of NEK4-ITIH1-ITIH3-ITIH4. Our replication results imply that increasing sample sizes in bipolar disorder will confirm many additional loci.
0
Citation1,348
0
Save
0

The analysis of 51 genes in DSM-IV combined type attention deficit hyperactivity disorder: association signals in DRD4, DAT1 and 16 other genes

Keeley Brookes et al.Aug 8, 2006
Attention deficit hyperactivity disorder (ADHD) is a common neurodevelopmental disorder, starting in early childhood and persisting into adulthood in the majority of cases. Family and twin studies have demonstrated the importance of genetic factors and candidate gene association studies have identified several loci that exert small but significant effects on ADHD. To provide further clarification of reported associations and identify novel associated genes, we examined 1038 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) spanning 51 candidate genes involved in the regulation of neurotransmitter pathways, particularly dopamine, norepinephrine and serotonin pathways, in addition to circadian rhythm genes. Analysis used within family tests of association in a sample of 776 DSM-IV ADHD combined type cases ascertained for the International Multi-centre ADHD Gene project. We found nominal significance with one or more SNPs in 18 genes, including the two most replicated findings in the literature: DRD4 and DAT1. Gene-wide tests, adjusted for the number of SNPs analysed in each gene, identified associations with TPH2, ARRB2, SYP, DAT1, ADRB2, HES1, MAOA and PNMT. Further studies will be needed to confirm or refute the observed associations and their generalisability to other samples.
0
Citation530
0
Save
0

The bipolar disorder risk allele at CACNA1C also confers risk of recurrent major depression and of schizophrenia

Green Ek et al.Jul 21, 2009
Molecular genetic analysis offers opportunities to advance our understanding of the nosological relationship between psychiatric diagnostic categories in general, and the mood and psychotic disorders in particular. Strong evidence (P=7.0 × 10−7) of association at the polymorphism rs1006737 (within CACNA1C, the gene encoding the α-1C subunit of the L-type voltage-gated calcium channel) with the risk of bipolar disorder (BD) has recently been reported in a meta-analysis of three genome-wide association studies of BD, including our BD sample (N=1868) studied within the Wellcome Trust Case Control Consortium. Here, we have used our UK case samples of recurrent major depression (N=1196) and schizophrenia (N=479) and UK non-psychiatric comparison groups (N=15316) to examine the spectrum of phenotypic effect of the bipolar risk allele at rs1006737. We found that the risk allele conferred increased risk for schizophrenia (P=0.034) and recurrent major depression (P=0.013) with similar effect sizes to those previously observed in BD (allelic odds ratio ∼1.15). Our findings are evidence of some degree of overlap in the biological underpinnings of susceptibility to mental illness across the clinical spectrum of mood and psychotic disorders, and show that at least some loci can have a relatively general effect on susceptibility to diagnostic categories, as currently defined. Our findings will contribute to a better understanding of the pathogenesis of major psychiatric illness, and such knowledge should be useful in providing an etiological rationale for shaping psychiatric nosology, which is currently reliant entirely on descriptive clinical data.
0
Citation510
0
Save
0

A Twin Study of Genetic Relationships Between Psychotic Symptoms

Alastair Cardno et al.Apr 1, 2002
OBJECTIVE: Biometrical model fitting was applied to clinical data from twins to investigate whether operationally defined schizophrenic, schizoaffective, and manic syndromes share genetic risk factors. METHOD: Seventy-seven monozygotic and 89 same-sex dizygotic twin pairs in which the proband met the Research Diagnostic Criteria (RDC) for lifetime-ever schizophrenic, schizoaffective, or manic syndrome were ascertained from the Maudsley Twin Register in London. The syndromes were defined nonhierarchically. Correlations in liability were calculated for each syndrome in the monozygotic and dizygotic pairs and across the three pairings of schizophrenic-manic, schizophrenic-schizoaffective, and schizoaffective-manic syndromes both within probands and within pairs. For the three syndromes considered together, an independent pathway model was fitted. RESULTS: The model fitting showed significant genetic correlations between all three syndromes. There was evidence of both common and syndrome-specific genetic contributions to the variance in liability to the schizophrenic and manic syndromes, but the genetic liability to the schizoaffective syndrome was entirely shared in common with the other two syndromes. In contrast, environmental liability to the schizoaffective syndrome was not shared with the other syndromes. CONCLUSIONS: If diagnostic hierarchies are relaxed, there is a degree of overlap in the genes contributing to RDC schizophrenic, schizoaffective, and manic syndromes. Supplementing the traditional approach of assigning a single main lifetime diagnosis with information on within-person comorbidity of psychotic syndromes may provide valuable information about the familial aggregation of psychotic symptoms.
0
Citation455
0
Save
0

Rare loss-of-function variants in SETD1A are associated with schizophrenia and developmental disorders

Tarjinder Singh et al.Mar 14, 2016
The authors analyzed the whole-exome sequences of over 16,000 individuals and found that very rare variants predicted to disrupt the SETD1A gene confer substantial risk for schizophrenia. Damaging variants in SETD1A were also associated with diverse, severe developmental disorders, providing an important genetic link between schizophrenia and other neurodevelopmental disorders. By analyzing the whole-exome sequences of 4,264 schizophrenia cases, 9,343 controls and 1,077 trios, we identified a genome-wide significant association between rare loss-of-function (LoF) variants in SETD1A and risk for schizophrenia (P = 3.3 × 10−9). We found only two heterozygous LoF variants in 45,376 exomes from individuals without a neuropsychiatric diagnosis, indicating that SETD1A is substantially depleted of LoF variants in the general population. Seven of the ten individuals with schizophrenia carrying SETD1A LoF variants also had learning difficulties. We further identified four SETD1A LoF carriers among 4,281 children with severe developmental disorders and two more carriers in an independent sample of 5,720 Finnish exomes, both with notable neuropsychiatric phenotypes. Together, our observations indicate that LoF variants in SETD1A cause a range of neurodevelopmental disorders, including schizophrenia. Combining these data with previous common variant evidence, we suggest that epigenetic dysregulation, specifically in the histone H3K4 methylation pathway, is an important mechanism in the pathogenesis of schizophrenia.
0
Citation431
0
Save
0

Candidate Genes Expression Profile Associated with Antidepressants Response in the GENDEP Study: Differentiating between Baseline ‘Predictors’ and Longitudinal ‘Targets’

Annamaria Cattaneo et al.Sep 19, 2012
To improve the ‘personalized-medicine’ approach to the treatment of depression, we need to identify biomarkers that, assessed before starting treatment, predict future response to antidepressants (‘predictors’), as well as biomarkers that are targeted by antidepressants and change longitudinally during the treatment (‘targets’). In this study, we tested the leukocyte mRNA expression levels of genes belonging to glucocorticoid receptor (GR) function (FKBP-4, FKBP-5, and GR), inflammation (interleukin (IL)-1α, IL-1β, IL-4, IL-6, IL-7, IL-8, IL-10, macrophage inhibiting factor (MIF), and tumor necrosis factor (TNF)-α), and neuroplasticity (brain-derived neurotrophic factor (BDNF), p11 and VGF), in healthy controls (n=34) and depressed patients (n=74), before and after 8 weeks of treatment with escitalopram or nortriptyline, as part of the Genome-based Therapeutic Drugs for Depression study. Non-responders had higher baseline mRNA levels of IL-1β (+33%), MIF (+48%), and TNF-α (+39%). Antidepressants reduced the levels of IL-1β (−6%) and MIF (−24%), and increased the levels of GR (+5%) and p11 (+8%), but these changes were not associated with treatment response. In contrast, successful antidepressant response was associated with a reduction in the levels of IL-6 (−9%) and of FKBP5 (−11%), and with an increase in the levels of BDNF (+48%) and VGF (+20%)—that is, response was associated with changes in genes that did not predict, at the baseline, the response. Our findings indicate a dissociation between ‘predictors’ and ‘targets’ of antidepressant responders. Indeed, while higher levels of proinflammatory cytokines predict lack of future response to antidepressants, changes in inflammation associated with antidepressant response are not reflected by all cytokines at the same time. In contrast, modulation of the GR complex and of neuroplasticity is needed to observe a therapeutic antidepressant effect.
0
Citation395
0
Save
Load More