GD
Guillaume Dumas
Author with expertise in Analysis of Brain Functional Connectivity Networks
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
20
(75% Open Access)
Cited by:
1,106
h-index:
44
/
i10-index:
124
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Inter-Brain Synchronization during Social Interaction

Guillaume Dumas et al.Aug 17, 2010
During social interaction, both participants are continuously active, each modifying their own actions in response to the continuously changing actions of the partner. This continuous mutual adaptation results in interactional synchrony to which both members contribute. Freely exchanging the role of imitator and model is a well-framed example of interactional synchrony resulting from a mutual behavioral negotiation. How the participants' brain activity underlies this process is currently a question that hyperscanning recordings allow us to explore. In particular, it remains largely unknown to what extent oscillatory synchronization could emerge between two brains during social interaction. To explore this issue, 18 participants paired as 9 dyads were recorded with dual-video and dual-EEG setups while they were engaged in spontaneous imitation of hand movements. We measured interactional synchrony and the turn-taking between model and imitator. We discovered by the use of nonlinear techniques that states of interactional synchrony correlate with the emergence of an interbrain synchronizing network in the alpha-mu band between the right centroparietal regions. These regions have been suggested to play a pivotal role in social interaction. Here, they acted symmetrically as key functional hubs in the interindividual brainweb. Additionally, neural synchronization became asymmetrical in the higher frequency bands possibly reflecting a top-down modulation of the roles of model and imitator in the ongoing interaction.
0

Brain-to-brain coupling during handholding is associated with pain reduction

Pavel Goldstein et al.Feb 26, 2018
The mechanisms underlying analgesia related to social touch are not clear. While recent research highlights the role of the empathy of the observer to pain relief in the target, the contribution of social interaction to analgesia is unknown. The current study examines brain-to-brain coupling during pain with interpersonal touch and tests the involvement of interbrain synchrony in pain alleviation. Romantic partners were assigned the roles of target (pain receiver) and observer (pain observer) under pain-no-pain and touch-no-touch conditions concurrent with EEG recording. Brain-to-brain coupling in alpha-mu band (8-12 Hz) was estimated by a three-step multilevel analysis procedure based on running window circular correlation coefficient and post hoc power of the findings was calculated using simulations. Our findings indicate that hand-holding during pain administration increases brain-to-brain coupling in a network that mainly involves the central regions of the pain target and the right hemisphere of the pain observer. Moreover, brain-to-brain coupling in this network was found to correlate with analgesia magnitude and observer's empathic accuracy. These findings indicate that brain-to-brain coupling may be involved in touch-related analgesia.
0

Normative age modelling of cortical thickness in autistic males

Richard Bethlehem et al.Jan 23, 2018
Abstract Understanding heterogeneity in neural phenotypes is an important goal on the path to precision medicine for autism spectrum disorders (ASD). Age is a critically important variable in normal structural brain development and examining structural features with respect to age-related norms could help to explain ASD heterogeneity in neural phenotypes. Here we examined how cortical thickness (CT) in ASD can be parameterized as an individualized metric of deviance relative to typically-developing (TD) age-related norms. Across a large sample (n=870 per group) and wide age range (5-40 years), we applied a normative modelling approach that provides individualized whole-brain maps of age-related CT deviance in ASD. This approach isolates a subgroup of ASD individuals with highly age-deviant CT. The median prevalence of this ASD subgroup across all brain regions is 7.6%, and can reach as high as 10% for some brain regions. This work showcases an individualized approach for understanding ASD heterogeneity that could potentially further prioritize work on a subset of individuals with significant cortical pathophysiology represented in age-related CT deviance. Rather than cortical thickness pathology being a widespread characteristic of most ASD patients, only a small subset of ASD individuals are actually highly deviant relative to age-norms. These individuals drive small on-average effects from case-control comparisons. Rather than sticking to the diagnostic label of autism, future research should pivot to focus on isolating subsets of autism patients with highly deviant phenotypes and better understand the underlying mechanisms that drive those phenotypes.
0
Citation24
0
Save
22

Towards robust and replicable sex differences in the intrinsic brain function of autism

Dorothea Floris et al.Jun 11, 2020
Abstract Background Marked sex differences in autism prevalence accentuate the need to understand the role of biological sex-related factors in autism. Efforts to unravel sex differences in the brain organization of autism have, however, been challenged by the limited availability of female data. Methods We addressed this gap by using a large sample of males and females with autism and neurotypical (NT) control individuals (ABIDE; Autism: 362 males, 82 females; NT: 409 males, 166 females; 7-18 years). Discovery analyses examined main effects of diagnosis, sex and their interaction across five resting-state fMRI (R-fMRI) metrics (voxel-level Z > 3.1, cluster-level P < 0.01, gaussian random field corrected). Secondary analyses assessed the robustness of the results to different pre-processing approaches and their replicability in two independent samples: the EU-AIMS Longitudinal European Autism Project (LEAP) and the Gender Explorations of Neurogenetics and Development to Advance Autism Research (GENDAAR). Results Discovery analyses in ABIDE revealed significant main effects across the intrinsic functional connectivity (iFC) of the posterior cingulate cortex, regional homogeneity and voxel-mirrored homotopic connectivity (VMHC) in several cortical regions, largely converging in the default network midline. Sex-by-diagnosis interactions were confined to the dorsolateral occipital cortex, with reduced VMHC in females with autism. All findings were robust to different pre-processing steps. Replicability in independent samples varied by R-fMRI measures and effects with the targeted sex-by-diagnosis interaction being replicated in the larger of the two replication samples – EU-AIMS LEAP. Limitations Given the lack of a priori harmonization among the discovery and replication datasets available to date, sample-related variation remained and may have affected replicability. Conclusions Atypical cross-hemispheric interactions are neurobiologically relevant to autism. They likely result from the combination of sex-dependent and sex-independent factors with a differential effect across functional cortical networks. Systematic assessments of the factors contributing to replicability are needed and necessitate coordinated large-scale data collection across studies.
10

Multilevel Development of Cognitive Abilities in an Artificial Neural Network

Konstantin Volzhenin et al.Jan 25, 2022
Abstract Several neuronal mechanisms have been proposed to account for the formation of cognitive abilities through postnatal interactions with the physical and socio-cultural environment. Here, we introduce a three-level computational model of information processing and acquisition of cognitive abilities. We propose minimal architectural requirements to build these levels and how the parameters affect their performance and relationships. The first sensorimotor level handles local nonconscious processing, here during a visual classification task. The second level or cognitive level globally integrates the information from multiple local processors via long-ranged connections and synthesizes it in a global, but still nonconscious manner. The third and cognitively highest level handles the information globally and consciously. It is based on the Global Neuronal Workspace (GNW) theory and is referred to as conscious level. We use trace and delay conditioning tasks to, respectively, challenge the second and third levels. Results first highlight the necessity of epigenesis through selection and stabilization of synapses at both local and global scales to allow the network to solve the first two tasks. At the global scale, dopamine appears necessary to properly provide credit assignment despite the temporal delay between perception and reward. At the third level, the presence of interneurons becomes necessary to maintain a self-sustained representation within the GNW in the absence of sensory input. Finally, while balanced spontaneous intrinsic activity facilitates epigenesis at both local and global scales, the balanced excitatory-inhibitory ratio increases performance. Finally, we discuss the plausibility of the model in both neurodevelopmental and artificial intelligence terms.
0

Experimenting with reproducibility in bioinformatics

Yang-Min Kim et al.Jun 20, 2017
Abstract Reproducibility has been shown to be limited in many scientific fields. This question is a fundamental tenet of the scientific activity, but the related issues of reusability of scientific data are poorly documented. Here, we present a case study of our attempt to reproduce a promising bioinformatics method [1] and illustrate the challenges to use a published method for which code and data were available. First, we tried to re-run the analysis with the code and data provided by the authors. Second, we reimplemented the method in Python to avoid dependency on a MATLAB licence and ease the execution of the code on HPCC (High-Performance Computing Cluster). Third, we assessed reusability of our reimplementation and the quality of our documentation. Then, we experimented with our own software and tested how easy it would be to start from our implementation to reproduce the results, hence attempting to estimate the robustness of the reproducibility. Finally, in a second part, we propose solutions from this case study and other observations to improve reproducibility and research efficiency at the individual and collective level. Availability last version of StratiPy (Python) with two examples of reproducibility are available at GitHub [2]. Contact yang-min.kim@pasteur.fr
0
Citation2
0
Save
0

Systematic detection of brain protein-coding genes under positive selection during primate evolution and their roles in cognition

Guillaume Dumas et al.Jun 3, 2019
Abstract The human brain differs from that of other primates, but the genetic basis of these differences remains unclear. We investigated the evolutionary pressures acting on almost all human protein-coding genes ( N =11,667; 1:1 orthologs in primates) based on their divergence from those of early hominins, such as Neanderthals, and non-human primates. We confirm that genes encoding brain-related proteins are among the most strongly conserved protein-coding genes in the human genome. Combining our evolutionary pressure metrics for the protein-coding genome with recent datasets, we found that this conservation applied to genes functionally associated with the synapse and expressed in brain structures such as the prefrontal cortex and the cerebellum. Conversely, several genes presenting signatures commonly associated with positive selection appear as causing brain diseases or conditions, such as micro/macrocephaly, Joubert syndrome, dyslexia, and autism. Among those, a number of DNA damage response genes associated with microcephaly in humans such as BRCA1, NHEJ1, TOP3A , and RNF168 show strong signs of positive selection and might have played a role in human brain size expansion during primate evolution. We also showed that cerebellum granule neurons express a set of genes also presenting signatures of positive selection and that may have contributed to the emergence of fine motor skills and social cognition in humans. This resource is available online and can be used to estimate evolutionary constraints acting on a set of genes and to explore their relative contributions to human traits.
0
Citation1
0
Save
0

Challenges in Multi-Task Learning for fMRI-Based Diagnosis: Benefits for Psychiatric Conditions and CNVs Would Likely Require Thousands of Patients

Annabelle Harvey et al.Jan 1, 2024
Abstract There is a growing interest in using machine learning (ML) models to perform automatic diagnosis of psychiatric conditions; however, generalising the prediction of ML models to completely independent data can lead to sharp decrease in performance. Patients with different psychiatric diagnoses have traditionally been studied independently, yet there is a growing recognition of neuroimaging signatures shared across them as well as rare genetic copy number variants (CNVs). In this work, we assess the potential of multi-task learning (MTL) to improve accuracy by characterising multiple related conditions with a single model, making use of information shared across diagnostic categories and exposing the model to a larger and more diverse dataset. As a proof of concept, we first established the efficacy of MTL in a context where there is clearly information shared across tasks: the same target (age or sex) is predicted at different sites of data collection in a large functional magnetic resonance imaging (fMRI) dataset compiled from multiple studies. MTL generally led to substantial gains relative to independent prediction at each site. Performing scaling experiments on the UK Biobank, we observed that performance was highly dependent on sample size: for large sample sizes (N &gt; 6000) sex prediction was better using MTL across three sites (N = K per site) than prediction at a single site (N = 3K), but for small samples (N &lt; 500) MTL was actually detrimental for age prediction. We then used established machine-learning methods to benchmark the diagnostic accuracy of each of the 7 CNVs (N = 19–103) and 4 psychiatric conditions (N = 44–472) independently, replicating the accuracy previously reported in the literature on psychiatric conditions. We observed that MTL hurt performance when applied across the full set of diagnoses, and complementary analyses failed to identify pairs of conditions which would benefit from MTL. Taken together, our results show that if a successful multi-task diagnostic model of psychiatric conditions were to be developed with resting-state fMRI, it would likely require datasets with thousands of patients across different diagnoses.
0
Citation1
0
Save
1

A Neurodynamic Model of Inter-Brain Coupling in the Gamma Band

Quentin Moreau et al.Apr 11, 2022
Abstract The use of EEG to simultaneously record multiple brains (i.e., hyperscanning) during social interactions has led to the discovery of inter-brain coupling (IBC). IBC is defined as the neural synchronization between people and is considered to be a marker of social interaction. IBC has previously been observed across different frequency bands, including Theta [4-7 Hz]. Given the proximity of this frequency range with behavioral rhythms, models have been able to combine IBC in Theta with sensorimotor coordination patterns. Interestingly, empirical EEG-hyperscanning results also report the emergence of IBC in the Gamma range [>30 Hz]. Gamma oscillations’ fast and transient nature makes a direct link between Gamma-IBC and other (much slower) interpersonal dynamics difficult, leaving Gamma-IBC without a plausible model. However, at the intra-brain level, Gamma activity is coupled with the dynamics of lower frequencies through cross-frequency coupling (CFC). This paper provides a biophysical explanation for the emergence of Gamma inter-brain coupling using a Kuramoto model of four oscillators divided into two separate (brain) units. By modulating both the degree of inter-brain coupling in the Theta band (i.e., between-units coupling) and CFC (i.e., intra-unit Theta-Gamma coupling), we provide a theoretical explanation of the observed Gamma-IBC phenomenon in the EEG-hyperscanning literature.
Load More