MA
Mark Anderson
Author with expertise in Regulatory T Cell Development and Function
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
37
(84% Open Access)
Cited by:
9,364
h-index:
69
/
i10-index:
162
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Selective miRNA disruption in T reg cells leads to uncontrolled autoimmunity

X. Zhou et al.Aug 25, 2008
A new regulatory T (T reg) cell–specific, FoxP3-GFP-hCre bacterial artificial chromosome transgenic mouse was crossed to a conditional Dicer knockout (KO) mouse strain to analyze the role of microRNAs (miRNAs) in the development and function of T reg cells. Although thymic T reg cells developed normally in this setting, the cells showed evidence of altered differentiation and dysfunction in the periphery. Dicer-deficient T reg lineage cells failed to remain stable, as a subset of cells down-regulated the T reg cell–specific transcription factor FoxP3, whereas the majority expressed altered levels of multiple genes and proteins (including Neuropilin 1, glucocorticoid-induced tumor necrosis factor receptor, and cytotoxic T lymphocyte antigen 4) associated with the T reg cell fingerprint. In fact, a significant percentage of the T reg lineage cells took on a T helper cell memory phenotype including increased levels of CD127, interleukin 4, and interferon γ. Importantly, Dicer-deficient T reg cells lost suppression activity in vivo; the mice rapidly developed fatal systemic autoimmune disease resembling the FoxP3 KO phenotype. These results support a central role for miRNAs in maintaining the stability of differentiated T reg cell function in vivo and homeostasis of the adaptive immune system.
0
Citation508
0
Save
16

Clonally expanded B cells in multiple sclerosis bind EBV EBNA1 and GlialCAM

Tobias Lanz et al.Jan 24, 2022
Multiple sclerosis (MS) is a heterogenous autoimmune disease in which autoreactive lymphocytes attack the myelin sheath of the central nervous system. B lymphocytes in the cerebrospinal fluid (CSF) of patients with MS contribute to inflammation and secrete oligoclonal immunoglobulins1,2. Epstein-Barr virus (EBV) infection has been epidemiologically linked to MS, but its pathological role remains unclear3. Here we demonstrate high-affinity molecular mimicry between the EBV transcription factor EBV nuclear antigen 1 (EBNA1) and the central nervous system protein glial cell adhesion molecule (GlialCAM) and provide structural and in vivo functional evidence for its relevance. A cross-reactive CSF-derived antibody was initially identified by single-cell sequencing of the paired-chain B cell repertoire of MS blood and CSF, followed by protein microarray-based testing of recombinantly expressed CSF-derived antibodies against MS-associated viruses. Sequence analysis, affinity measurements and the crystal structure of the EBNA1-peptide epitope in complex with the autoreactive Fab fragment enabled tracking of the development of the naive EBNA1-restricted antibody to a mature EBNA1-GlialCAM cross-reactive antibody. Molecular mimicry is facilitated by a post-translational modification of GlialCAM. EBNA1 immunization exacerbates disease in a mouse model of MS, and anti-EBNA1 and anti-GlialCAM antibodies are prevalent in patients with MS. Our results provide a mechanistic link for the association between MS and EBV and could guide the development of new MS therapies.
16
Citation472
1
Save
0

Evaluation of SARS-CoV-2 serology assays reveals a range of test performance

Jeffrey Whitman et al.Aug 27, 2020
Appropriate use and interpretation of serological tests for assessments of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) exposure, infection and potential immunity require accurate data on assay performance. We conducted a head-to-head evaluation of ten point-of-care-style lateral flow assays (LFAs) and two laboratory-based enzyme-linked immunosorbent assays to detect anti-SARS-CoV-2 IgM and IgG antibodies in 5-d time intervals from symptom onset and studied the specificity of each assay in pre-coronavirus disease 2019 specimens. The percent of seropositive individuals increased with time, peaking in the latest time interval tested (>20 d after symptom onset). Test specificity ranged from 84.3% to 100.0% and was predominantly affected by variability in IgM results. LFA specificity could be increased by considering weak bands as negative, but this decreased detection of antibodies (sensitivity) in a subset of SARS-CoV-2 real-time PCR-positive cases. Our results underline the importance of seropositivity threshold determination and reader training for reliable LFA deployment. Although there was no standout serological assay, four tests achieved more than 80% positivity at later time points tested and more than 95% specificity.
0
Citation282
0
Save
0

Discovery of stimulation-responsive immune enhancers with CRISPR activation

Dimitre Simeonov et al.Aug 29, 2017
The authors use tiled CRISPR activation for functional enhancer discovery across two autoimmunity risk loci, CD69 and IL2RA, and identify elements with features of stimulus-responsive enhancers, including an IL2RA enhancer that harbours a fine-mapped autoimmunity risk variant. Enhancers are gene regulatory elements that shape cell-type-specific transcriptional programs and responses to specific extracellular cues. Mapping enhancer function is challenging because of our limited understanding of the cellular context in which each enhancer contributes to gene regulation. Here, Alexander Marson and colleagues use a tiled CRISPR activation (CRISPRa) approach for functional enhancer discovery across two autoimmunity risk loci: CD69 and IL2RA. They identify several elements with features of stimulus-responsive enhancers, including an IL2RA enhancer that contains an autoimmunity risk variant. This approach should be useful for discovering functional enhancers without prior knowledge of their specific biological context. The majority of genetic variants associated with common human diseases map to enhancers, non-coding elements that shape cell-type-specific transcriptional programs and responses to extracellular cues1,2,3. Systematic mapping of functional enhancers and their biological contexts is required to understand the mechanisms by which variation in non-coding genetic sequences contributes to disease. Functional enhancers can be mapped by genomic sequence disruption4,5,6, but this approach is limited to the subset of enhancers that are necessary in the particular cellular context being studied. We hypothesized that recruitment of a strong transcriptional activator to an enhancer would be sufficient to drive target gene expression, even if that enhancer was not currently active in the assayed cells. Here we describe a discovery platform that can identify stimulus-responsive enhancers for a target gene independent of stimulus exposure. We used tiled CRISPR activation (CRISPRa)7 to synthetically recruit a transcriptional activator to sites across large genomic regions (more than 100 kilobases) surrounding two key autoimmunity risk loci, CD69 and IL2RA. We identified several CRISPRa-responsive elements with chromatin features of stimulus-responsive enhancers, including an IL2RA enhancer that harbours an autoimmunity risk variant. Using engineered mouse models, we found that sequence perturbation of the disease-associated Il2ra enhancer did not entirely block Il2ra expression, but rather delayed the timing of gene activation in response to specific extracellular signals. Enhancer deletion skewed polarization of naive T cells towards a pro-inflammatory T helper (TH17) cell state and away from a regulatory T cell state. This integrated approach identifies functional enhancers and reveals how non-coding variation associated with human immune dysfunction alters context-specific gene programs.
0
Citation277
0
Save
Load More