Genetic influences on psychiatric disorders transcend diagnostic boundaries, suggesting substantial pleiotropy of contributing loci. However, the nature and mechanisms of these pleiotropic effects remain unclear. We performed analyses of 232,964 cases and 494,162 controls from genome-wide studies of anorexia nervosa, attention-deficit/hyperactivity disorder, autism spectrum disorder, bipolar disorder, major depression, obsessive-compulsive disorder, schizophrenia, and Tourette syndrome. Genetic correlation analyses revealed a meaningful structure within the eight disorders, identifying three groups of inter-related disorders. Meta-analysis across these eight disorders detected 109 loci associated with at least two psychiatric disorders, including 23 loci with pleiotropic effects on four or more disorders and 11 loci with antagonistic effects on multiple disorders. The pleiotropic loci are located within genes that show heightened expression in the brain throughout the lifespan, beginning prenatally in the second trimester, and play prominent roles in neurodevelopmental processes. These findings have important implications for psychiatric nosology, drug development, and risk prediction.

Antidepressants (ADs) play a valuable role in treating the depressive episodes of bipolar disorder. However, 14% of these individuals taking ADs experience AD-associated mania (AAM) within a few weeks of starting treatment. Numerous studies have suggested potential clinical and genetic risk factors. We aimed to conduct a comprehensive systematic review and meta-analysis that integrates the past literature with the recent studies and identifies important predictors for AAM.The review was limited to experimentally designed studies that contain the relevant search terms in PubMed and PsychInfo. After removing studies that were in discordance with our criteria, the review included 24 reports examining clinical risk factors and 10 investigating genetic risk factors. Our meta-analysis was conducted on 5 clinical risk factors, each of which had at least 4 articles with extractable data.The only clinical factors in the literature that have been shown to be more indicative of AAM risk are AD monotherapy and tricyclic ADs. Among genetic factors, the serotonin transporter gene polymorphism may play a minor role in AAM. Our meta-analysis provided support for the number of prior depressive episodes.Prevention of AAM may be served by early detection of recurrent depression episodes. Further large-scale longitudinal studies are required to determine the underpinnings of AAM.

The complement component C4 gene has been identified as a strong marker for schizophrenia (SCZ) risk. The C4 gene has a complex genetic structure consisting of variable structural elements (C4A, C4B, C4L, and C4S) and compound structural forms (C4AL, C4BL, C4AS and C4BS). In addition, the variations in C4 structural forms may have a direct or indirect effect on the brain expression level of C4A and C4B proteins. Previous studies have associated C4AL with higher brain C4A expression and sex-dimorphism of C4 between males and females was observed. A total of 613 patients with DSM-IV SCZ or schizoaffective disorder (SCZ-AFF) were recruited to investigate the relationship between C4 gene variants and clinical characteristics of SCZ (age of onset, symptom severity, and global assessment of functioning (GAF)). This study also explored the effect of sex on the association of C4 with SCZ. 434 patients were included in the final analyses after genetic quality control. We observed associations between C4 and clinical characteristics of SCZ (age of onset, symptom severity, GAF) and found significant differences when males and females were examined separately. Overall, our preliminary findings encourage future investigations of C4 in SCZ-related phenotypes, including antipsychotic response and side effects. The study sample was of moderate size; therefore, further studies in larger samples are needed to extend and validate these results.

The genetic underpinnings of schizophrenia (SCZ) remain unclear. SCZ genetic studies thus far have only identified numerous single nucleotide polymorphisms with small effect sizes and a handful of copy number variants (CNVs). This study investigates the prevalence of well-characterized CNV syndromes and candidate CNVs within a cohort of 348 SCZ patients, and explores correlations to their phenotypic findings. There was an enrichment of syndromic CNVs in the cohort, as well as brain-related and immune pathway genes within the detected CNVs. SCZ patients with brain-related CNVs had increased CNV burden, neurodevelopmental features, and types of hallucinations. Based on these results, we propose a CNV-SCZ model wherein specific phenotypic profiles should be prioritized for CNV screening within the SCZ patient population.

Schizophrenia (SCZ) and schizoaffective disorder (SAD) are severe and complex psychiatric disorders whose liability threshold is modulated by the interplay of biological, mainly genetic, and environmental factors. Consistent evidence has pointed to the role of serum brain‐derived neurotrophic factor (BDNF) as a plausible illness biomarker in SCZ spectrum disorders. There is no consensus, however, on the temporal trajectory of this decline. Here, we present a secondary analysis of the Longitudinal Assessment of BDNF in Sardinian Psychotic patients (LABSP) study, focusing on the impact of antipsychotic therapy, particularly long‐acting injectable (LAI), on the longitudinal trajectory of serum BDNF levels and analyzing the effect of BDNF genetic variants. LABSP patients were assessed every 6 months for a series of measures, including the assessment of BDNF serum levels over 24 months. Blood samples for each patient were taken at the same time of the day (between 8:00 and 10:00 a.m.). BDNF serum levels were determined using the BDNF ELISA Kit. Four tag single nucleotide polymorphisms (SNPs) within the BDNF gene (rs1519480, rs11030104, rs6265 [Val66Met], and rs7934165) were selected using standard parameters and analyzed with polymerase chain reaction (PCR). Mixed‐effects linear regression models (MLRMs) were used to analyze longitudinal data. Twenty‐four patients out of 105 LABSP (22.9%) patients received therapy with LAI. Analysis with MLRM showed a significant effect of LAI treatment associated with increasing serum BDNF levels ( Z = 2.2, p = 0.02). However, oral antipsychotics did not significantly impact the longitudinal trajectory of serum BDNF levels ( Z = 0.15, p = 0.9). There was no moderating effect of variants within the BDNF gene on the identified association. We identified a significant longitudinal increase in serum BDNF in SCZ and SAD patients treated with LAI antipsychotic therapy. The significant impact of this preparation of antipsychotic treatment on serum BDNF, despite the limited sample size, points to a moderate to large magnitude of effect that should be investigated in future prospective studies.

Identifying phenotypes at high risk of suicidal behaviour is a relevant objective of clinical and translational research and can facilitate the identification of possible candidate biomarkers. We probed the potential association and eventual stability of neuropsychological profiles and serum BDNF concentrations with lifetime suicide ideation and attempts (LSI and LSA, respectively) in individuals with schizophrenia (SCZ) and schizoaffective disorder (SCA) in a 2-year follow-up study. A secondary analysis was conducted on a convenience sample of previously recruited subjects from a single outpatient clinic. Retrospectively assessed LSI and LSA were recorded by analysing the available longitudinal clinical health records. LSI + LSA subjects consistently exhibited lower PANSS-defined negative symptoms and better performance in the BACS-letter fluency subtask. There was no significant association between BDNF levels and either LSI or LSA. We found a relatively stable pattern of lower negative symptoms over two years among patients with LSI and LSA. No significant difference in serum BDNF concentrations was detected. The translational viability of using neuropsychological profiles as a possible avenue for the identification of populations at risk for suicide behaviours rather than the categorical diagnosis represents a promising option but requires further confirmation.

Genetic influences on psychiatric disorders transcend diagnostic boundaries, suggesting substantial pleiotropy of contributing loci. However, the nature and mechanisms of these pleiotropic effects remain unclear. We performed a meta-analysis of 232,964 cases and 494,162 controls from genome-wide studies of anorexia nervosa, attention-deficit/hyperactivity disorder, autism spectrum disorder, bipolar disorder, major depression, obsessive-compulsive disorder, schizophrenia, and Tourette syndrome. Genetic correlation analyses revealed a meaningful structure within the eight disorders identifying three groups of inter-related disorders. We detected 109 loci associated with at least two psychiatric disorders, including 23 loci with pleiotropic effects on four or more disorders and 11 loci with antagonistic effects on multiple disorders. The pleiotropic loci are located within genes that show heightened expression in the brain throughout the lifespan, beginning in the second trimester prenatally, and play prominent roles in a suite of neurodevelopmental processes. These findings have important implications for psychiatric nosology, drug development, and risk prediction.

In recent years, significant efforts have been made to improve methods for genomic studies of admixed populations using Local Ancestry Inference (LAI). Accurate LAI is crucial to ensure downstream analyses reflect the genetic ancestry of research participants accurately. Here, we test analytic strategies for LAI to provide guidelines for optimal accuracy, focusing on admixed populations reflective of Latin America's primary continental ancestries - African (AFR), Amerindigenous (AMR), and European (EUR). Simulating LD-informed admixed haplotypes under a variety of 2 and 3-way admixture models, we implemented a standard LAI pipeline, testing three reference panel compositions to quantify their overall and ancestry-specific accuracy. We examined LAI miscall frequencies and true positive rates (TPR) across simulation models and continental ancestries. AMR tracts have notably reduced LAI accuracy as compared to EUR and AFR tracts in all comparisons, with TPR means for AMR ranging from 88-94%, EUR from 96-99% and AFR 98-99%. When LAI miscalls occurred, they most frequently erroneously called European ancestry in true Amerindigenous sites. Using a reference panel well-matched to the target population, even with a lower sample size, LAI produced true-positive estimates that were not statistically different from a high sample size but mismatched reference, while being more computationally efficient. While directly responsive to admixed Latin American cohort compositions, these trends are broadly useful for informing best practices for LAI across other admixed populations. Our findings reinforce the need for inclusion of more underrepresented populations in sequencing efforts to improve reference panels.

Objective: Over 90% of suicide attempters have a psychiatric diagnosis, however twin and family studies suggest that the genetic etiology of suicide attempt (SA) is partially distinct from that of the psychiatric disorders themselves. Here, we present the largest genome-wide association study (GWAS) on suicide attempt using major depressive disorder (MDD), bipolar disorder (BIP) and schizophrenia (SCZ) cohorts from the Psychiatric Genomics Consortium. Method: Samples comprise 1622 suicide attempters and 8786 non-attempters with MDD, 3264 attempters and 5500 non-attempters with BIP and 1683 attempters and 2946 non-attempters with SCZ. SA GWAS were performed comparing attempters to non-attempters in each disorder followed by meta-analysis across disorders. Polygenic risk scoring investigated the genetic relationship between SA and the psychiatric disorders. Results: Three genome-wide significant loci for SA were found: one associated with SA in MDD, one in BIP, and one in the meta-analysis of SA in mood disorders. These associations were not replicated in independent mood disorder cohorts from the UK Biobank and iPSYCH. Polygenic risk scores for major depression were significantly associated with SA in MDD (P=0.0002), BIP (P=0.0006) and SCZ (P=0.0006). Conclusions: This study provides new information on genetic associations and the genetic etiology of SA across psychiatric disorders. The finding that polygenic risk scores for major depression predict suicide attempt across disorders provide a possible starting point for predictive modelling and preventative strategies. Further collaborative efforts to increase sample size hold potential to robustly identify genetic associations and gain biological insights into the etiology of suicide attempt.

Genomic copy number variants (CNVs) have been strongly implicated in the etiology of schizophrenia (SCZ). However, apart from a small number of risk variants, elucidation of the CNV contribution to risk has been difficult due to the rarity of risk alleles, all occurring in less than 1% of cases. We sought to address this obstacle through a collaborative effort in which we applied a centralized analysis pipeline to a SCZ cohort of 21,094 cases and 20,227 controls. We observed a global enrichment of CNV burden in cases (OR=1.11, P=5.7e-15), which persisted after excluding loci implicated in previous studies (OR=1.07, P=1.7e-6). CNV burden is also enriched for genes associated with synaptic function (OR = 1.68, P = 2.8e-11) and neurobehavioral phenotypes in mouse (OR = 1.18, P= 7.3e-5). We identified genome-wide significant support for eight loci, including 1q21.1, 2p16.3 (NRXN1), 3q29, 7q11.2, 15q13.3, distal 16p11.2, proximal 16p11.2 and 22q11.2. We find support at a suggestive level for nine additional candidate susceptibility and protective loci, which consist predominantly of CNVs mediated by non-allelic homologous recombination (NAHR).