FH
Freddie Hamdy
Author with expertise in Advancements in Prostate Cancer Research
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
37
(78% Open Access)
Cited by:
10,234
h-index:
104
/
i10-index:
418
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Association analyses of more than 140,000 men identify 63 new prostate cancer susceptibility loci

Fredrick Schumacher et al.Jun 8, 2018
Genome-wide association studies (GWAS) and fine-mapping efforts to date have identified more than 100 prostate cancer (PrCa)-susceptibility loci. We meta-analyzed genotype data from a custom high-density array of 46,939 PrCa cases and 27,910 controls of European ancestry with previously genotyped data of 32,255 PrCa cases and 33,202 controls of European ancestry. Our analysis identified 62 novel loci associated (P < 5.0 × 10−8) with PrCa and one locus significantly associated with early-onset PrCa (≤55 years). Our findings include missense variants rs1800057 (odds ratio (OR) = 1.16; P = 8.2 × 10−9; G>C, p.Pro1054Arg) in ATM and rs2066827 (OR = 1.06; P = 2.3 × 10−9; T>G, p.Val109Gly) in CDKN1B. The combination of all loci captured 28.4% of the PrCa familial relative risk, and a polygenic risk score conferred an elevated PrCa risk for men in the ninetieth to ninety-ninth percentiles (relative risk = 2.69; 95% confidence interval (CI): 2.55–2.82) and first percentile (relative risk = 5.71; 95% CI: 5.04–6.48) risk stratum compared with the population average. These findings improve risk prediction, enhance fine-mapping, and provide insight into the underlying biology of PrCa1. A large meta-analysis combining genome-wide and custom high-density genotyping array data identifies 63 new susceptibility loci for prostate cancer, enhancing fine-mapping efforts and providing insights into the underlying biology.
0
Citation750
0
Save
0

Changes in circulating microRNA levels associated with prostate cancer

Richard Bryant et al.Jan 12, 2012
The aim of this study was to investigate the hypothesis that changes in circulating microRNAs (miRs) represent potentially useful biomarkers for the diagnosis, staging and prediction of outcome in prostate cancer. Real-time polymerase chain reaction analysis of 742 miRs was performed using plasma-derived circulating microvesicles of 78 prostate cancer patients and 28 normal control individuals to identify differentially quantified miRs. A total of 12 miRs were differentially quantified in prostate cancer patients compared with controls, including 9 in patients without metastases. In all, 11 miRs were present in significantly greater amounts in prostate cancer patients with metastases compared with those without metastases. The association of miR-141 and miR-375 with metastatic prostate cancer was confirmed using serum-derived exosomes and microvesicles in a separate cohort of patients with recurrent or non-recurrent disease following radical prostatectomy. An analysis of five selected miRs in urine samples found that miR-107 and miR-574-3p were quantified at significantly higher concentrations in the urine of men with prostate cancer compared with controls. These observations suggest that changes in miR concentration in prostate cancer patients may be identified by analysing various body fluids. Moreover, circulating miRs may be used to diagnose and stage prostate cancer.
0
Citation669
0
Save
0

Identification of 23 new prostate cancer susceptibility loci using the iCOGS custom genotyping array

Rosalind Eeles et al.Mar 27, 2013
Rosalind Eeles and colleagues report meta-analysis of genome-wide association studies for prostate cancer and genotyping on the custom iCOGS array in 25,074 cases and 24,272 controls from 32 studies available in the PRACTICAL Consortium. They identify 23 new prostate cancer susceptibility loci, 20 of which are associated with both aggressive and non-aggressive disease. Prostate cancer is the most frequently diagnosed cancer in males in developed countries. To identify common prostate cancer susceptibility alleles, we genotyped 211,155 SNPs on a custom Illumina array (iCOGS) in blood DNA from 25,074 prostate cancer cases and 24,272 controls from the international PRACTICAL Consortium. Twenty-three new prostate cancer susceptibility loci were identified at genome-wide significance (P < 5 × 10−8). More than 70 prostate cancer susceptibility loci, explaining ∼30% of the familial risk for this disease, have now been identified. On the basis of combined risks conferred by the new and previously known risk loci, the top 1% of the risk distribution has a 4.7-fold higher risk than the average of the population being profiled. These results will facilitate population risk stratification for clinical studies.
0
Citation527
0
Save
0

Effect of a Low-Intensity PSA-Based Screening Intervention on Prostate Cancer Mortality

Richard Martin et al.Mar 6, 2018
Importance Prostate cancer screening remains controversial because potential mortality or quality-of-life benefits may be outweighed by harms from overdetection and overtreatment. Objective To evaluate the effect of a single prostate-specific antigen (PSA) screening intervention and standardized diagnostic pathway on prostate cancer–specific mortality. Design, Setting, and Participants The Cluster Randomized Trial of PSA Testing for Prostate Cancer (CAP) included 419 582 men aged 50 to 69 years and was conducted at 573 primary care practices across the United Kingdom. Randomization and recruitment of the practices occurred between 2001 and 2009; patient follow-up ended on March 31, 2016. Intervention An invitation to attend a PSA testing clinic and receive a single PSA test vs standard (unscreened) practice. Main Outcomes and Measures Primary outcome: prostate cancer–specific mortality at a median follow-up of 10 years. Prespecified secondary outcomes: diagnostic cancer stage and Gleason grade (range, 2-10; higher scores indicate a poorer prognosis) of prostate cancers identified, all-cause mortality, and an instrumental variable analysis estimating the causal effect of attending the PSA screening clinic. Results Among 415 357 randomized men (mean [SD] age, 59.0 [5.6] years), 189 386 in the intervention group and 219 439 in the control group were included in the analysis (n = 408 825; 98%). In the intervention group, 75 707 (40%) attended the PSA testing clinic and 67 313 (36%) underwent PSA testing. Of 64 436 with a valid PSA test result, 6857 (11%) had a PSA level between 3 ng/mL and 19.9 ng/mL, of whom 5850 (85%) had a prostate biopsy. After a median follow-up of 10 years, 549 (0.30 per 1000 person-years) died of prostate cancer in the intervention group vs 647 (0.31 per 1000 person-years) in the control group (rate difference, −0.013 per 1000 person-years [95% CI, −0.047 to 0.022]; rate ratio [RR], 0.96 [95% CI, 0.85 to 1.08]; P = .50). The number diagnosed with prostate cancer was higher in the intervention group (n = 8054; 4.3%) than in the control group (n = 7853; 3.6%) (RR, 1.19 [95% CI, 1.14 to 1.25]; P &amp;lt; .001). More prostate cancer tumors with a Gleason grade of 6 or lower were identified in the intervention group (n = 3263/189 386 [1.7%]) than in the control group (n = 2440/219 439 [1.1%]) (difference per 1000 men, 6.11 [95% CI, 5.38 to 6.84]; P &amp;lt; .001). In the analysis of all-cause mortality, there were 25 459 deaths in the intervention group vs 28 306 deaths in the control group (RR, 0.99 [95% CI, 0.94 to 1.03]; P = .49). In the instrumental variable analysis for prostate cancer mortality, the adherence-adjusted causal RR was 0.93 (95% CI, 0.67 to 1.29; P = .66). Conclusions and Relevance Among practices randomized to a single PSA screening intervention vs standard practice without screening, there was no significant difference in prostate cancer mortality after a median follow-up of 10 years but the detection of low-risk prostate cancer cases increased. Although longer-term follow-up is under way, the findings do not support single PSA testing for population-based screening. Trial Registration ISRCTN Identifier: ISRCTN92187251
0
Citation336
0
Save
0

Multiple Loci With Different Cancer Specificities Within the 8q24 Gene Desert

Maya Ghoussaini et al.Jun 24, 2008
Recent studies based on genome-wide association, linkage, and admixture scan analysis have reported associations of various genetic variants in 8q24 with susceptibility to breast, prostate, and colorectal cancer. This locus lies within a 1.18-Mb region that contains no known genes but is bounded at its centromeric end by FAM84B and at its telomeric end by c-MYC , two candidate cancer susceptibility genes. To investigate the associations of specific loci within 8q24 with specific cancers, we genotyped the nine previously reported cancer-associated single-nucleotide polymorphisms across the region in four case–control sets of prostate (1854 case subjects and 1894 control subjects), breast (2270 case subjects and 2280 control subjects), colorectal (2299 case subjects and 2284 control subjects), and ovarian (1975 case subjects and 3411 control subjects) cancer. Five different haplotype blocks within this gene desert were specifically associated with risks of different cancers. One block was solely associated with risk of breast cancer, three others were associated solely with the risk of prostate cancer, and a fifth was associated with the risk of prostate, colorectal, and ovarian cancer, but not breast cancer. We conclude that there are at least five separate functional variants in this region.
0
Citation325
0
Save
Load More