RA
Robert Atmar
Author with expertise in Gastrointestinal Viral Infections and Vaccines Development
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
29
(90% Open Access)
Cited by:
15,342
h-index:
91
/
i10-index:
231
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Remdesivir for the Treatment of Covid-19 — Final Report

John Hick et al.May 22, 2020
+41
R
D
J
Although several therapeutic agents have been evaluated for the treatment of coronavirus disease 2019 (Covid-19), no antiviral agents have yet been shown to be efficacious.We conducted a double-blind, randomized, placebo-controlled trial of intravenous remdesivir in adults who were hospitalized with Covid-19 and had evidence of lower respiratory tract infection. Patients were randomly assigned to receive either remdesivir (200 mg loading dose on day 1, followed by 100 mg daily for up to 9 additional days) or placebo for up to 10 days. The primary outcome was the time to recovery, defined by either discharge from the hospital or hospitalization for infection-control purposes only.A total of 1062 patients underwent randomization (with 541 assigned to remdesivir and 521 to placebo). Those who received remdesivir had a median recovery time of 10 days (95% confidence interval [CI], 9 to 11), as compared with 15 days (95% CI, 13 to 18) among those who received placebo (rate ratio for recovery, 1.29; 95% CI, 1.12 to 1.49; P<0.001, by a log-rank test). In an analysis that used a proportional-odds model with an eight-category ordinal scale, the patients who received remdesivir were found to be more likely than those who received placebo to have clinical improvement at day 15 (odds ratio, 1.5; 95% CI, 1.2 to 1.9, after adjustment for actual disease severity). The Kaplan-Meier estimates of mortality were 6.7% with remdesivir and 11.9% with placebo by day 15 and 11.4% with remdesivir and 15.2% with placebo by day 29 (hazard ratio, 0.73; 95% CI, 0.52 to 1.03). Serious adverse events were reported in 131 of the 532 patients who received remdesivir (24.6%) and in 163 of the 516 patients who received placebo (31.6%).Our data show that remdesivir was superior to placebo in shortening the time to recovery in adults who were hospitalized with Covid-19 and had evidence of lower respiratory tract infection. (Funded by the National Institute of Allergy and Infectious Diseases and others; ACTT-1 ClinicalTrials.gov number, NCT04280705.).
0

Replication of human noroviruses in stem cell-derived human enteroids

Khalil Ettayebi et al.Aug 26, 2016
+14
K
S
K
The major barrier to research and development of effective interventions for human noroviruses (HuNoVs) has been the lack of a robust and reproducible in vitro cultivation system. HuNoVs are the leading cause of gastroenteritis worldwide. We report the successful cultivation of multiple HuNoV strains in enterocytes in stem cell–derived, nontransformed human intestinal enteroid monolayer cultures. Bile, a critical factor of the intestinal milieu, is required for strain-dependent HuNoV replication. Lack of appropriate histoblood group antigen expression in intestinal cells restricts virus replication, and infectivity is abrogated by inactivation (e.g., irradiation, heating) and serum neutralization. This culture system recapitulates the human intestinal epithelium, permits human host-pathogen studies of previously noncultivatable pathogens, and allows the assessment of methods to prevent and treat HuNoV infections.
0
Citation1,135
0
Save
0

Norwalk Virus Shedding after Experimental Human Infection

Robert Atmar et al.Oct 1, 2008
+4
M
A
R
Noroviruses are the most common cause of viral gastroenteritis in the United States. To determine the magnitude and duration of virus shedding in feces, we evaluated persons who had been experimentally infected with Norwalk virus. Of 16 persons, clinical gastroenteritis (watery diarrhea and/or vomiting) developed in 11; symptomatic illness lasted 1-2 days. Virus shedding was first detected by reverse transcription-PCR (RT-PCR) 18 hours after participant inoculation and lasted a median of 28 days after inoculation (range 13-56 days). The median peak amount of virus shedding was 95 x 10(9) (range 0.5-1,640 x 10(9)) genomic copies/g feces as measured by quantitative RT-PCR. Virus shedding was first detected by antigen ELISA approximately 33 hours (median 42 hours) after inoculation and lasted 10 days (median 7 days) after inoculation. Understanding of the relevance of prolonged fecal norovirus excretion must await the development of sensitive methods to measure virus infectivity.
0

Laboratory efforts to cultivate noroviruses

Erwin Duizer et al.Jan 1, 2004
+3
F
K
E
Noroviruses (NoVs) are a leading cause of gastroenteritis worldwide and are recognized as the foremost cause of foodborne illness. Despite numerous efforts, routine cell cultures have failed to yield replicating NoV. This paper describes methods used to try to grow NoV in vitro in two laboratories. Cells (A549, AGS, Caco-2, CCD-18, CRFK, CR-PEC, Detroit 551, Detroit 562, FRhK-4, HCT-8, HeLa, HEC, HEp-2, Ht-29, HuTu-80, I-407, IEC-6, IEC-18, Kato-3, L20B, MA104, MDBK, MDCK, RD, TMK, Vero and 293) were cultured on solid or permeable surfaces. Differentiation was induced using cell culture supplements such as insulin, DMSO and butyric acid. In some cases, the cells and the NoV-containing stool samples were treated with bioactive digestive additives. Variables evaluated in cultivation experiments included the method of preparation of the virus inoculum, the genotype of the virus, conditions for maintenance of cell monolayers, additives in the maintenance medium and the method of inoculation of the cells. Serial blind passage studies were performed routinely. In addition to evaluation for CPE, evidence of virus replication was sought using immunofluorescent assays to detect newly produced viral capsid antigen and RT-PCR assays to detect the viral genome. Although some infected cultures remained NoV positive by RT-PCR for up to five passages and an occasional cell in a monolayer showed evidence of specific immunofluorescence, no reproducible NoV-induced CPE was observed and all RT-PCR results that were positive initially were negative following continued passaging. Thus, attempts to develop a method for the cultivation of NoV were unsuccessful.
0
Citation588
0
Save
0

Tropical Infectious Diseases: Principles, Pathogens, and Practice

A. White et al.Jan 18, 2000
S
R
A
Medical Writings: Book Notes18 January 2000Tropical Infectious Diseases: Principles, Pathogens, and PracticeA. Clinton White Jr., MD, Robert L. Atmar, MD, and Stephen B. Greenberg, MDA. Clinton White Jr., MDBaylor College of Medicine and Ben Taub General Hospital, Houston, Texas. (White, Atmar, Greenberg)Search for more papers by this author, Robert L. Atmar, MDBaylor College of Medicine and Ben Taub General Hospital, Houston, Texas. (White, Atmar, Greenberg)Search for more papers by this author, and Stephen B. Greenberg, MDBaylor College of Medicine and Ben Taub General Hospital, Houston, Texas. (White, Atmar, Greenberg)Search for more papers by this authorAuthor, Article, and Disclosure Informationhttps://doi.org/10.7326/0003-4819-132-2-200001180-00025 SectionsAboutFull TextPDF ToolsAdd to favoritesDownload CitationsTrack CitationsPermissions ShareFacebookTwitterLinkedInRedditEmail 2 volumes. Guerrant RL, Walker DH, Weller PF, eds. 1644 pages. Philadelphia: Churchill Livingstone; 1999. $295.00. ISBN 0443079080. Order phone 800-543-1918.Field of medicine: Infectious diseases and tropical medicine.Format: Two hardcover books.Audience: Specialists in infectious disease and tropical medicine; generalists who treat immigrants and travelers from developing countries; and practitioners in tropical countries.Purpose: To provide a comprehensive scholarly textbook on tropical infectious diseases.Content: The first section of the book discusses general considerations and noninfectious conditions. The second section covers individual bacterial, rickettsial, fungal, parasitic, and viral pathogens. Chapters on pathogens that are common worldwide (such as ... Author, Article, and Disclosure InformationAffiliations: Baylor College of Medicine and Ben Taub General Hospital, Houston, Texas. (White, Atmar, Greenberg) PreviousarticleNextarticle Advertisement FiguresReferencesRelatedDetails Metrics Cited by1,2,3-triazenes and 1,2,3-triazoles as antileishmanial, antitrypanosomal, and antiplasmodial agentsA Bibliometric Analysis of Global Scientific Research on Scrub Typhus 18 January 2000Volume 132, Issue 2Page: 168KeywordsHospital medicineInfectious diseasesPneumococcusSoftware toolsStaphylococcusStreptococcusToxinsTropical diseasesTuberculosisViral pathogens ePublished: 15 August 2000 Issue Published: 18 January 2000 Copyright & PermissionsCopyright © 2000 by American College of Physicians. All Rights Reserved.PDF downloadLoading ...
0
Citation586
0
Save
0

Immunization with SARS Coronavirus Vaccines Leads to Pulmonary Immunopathology on Challenge with the SARS Virus

Chien Tseng et al.Apr 20, 2012
+5
N
E
C
Severe acute respiratory syndrome (SARS) emerged in China in 2002 and spread to other countries before brought under control. Because of a concern for reemergence or a deliberate release of the SARS coronavirus, vaccine development was initiated. Evaluations of an inactivated whole virus vaccine in ferrets and nonhuman primates and a virus-like-particle vaccine in mice induced protection against infection but challenged animals exhibited an immunopathologic-type lung disease.
0

Impact of Respiratory Virus Infections on Persons With Chronic Underlying Conditions

W. Glezen et al.Jan 26, 2000
+2
R
S
W
While hospitalization rates have declined overall, hospitalizations for acute lower respiratory tract infections have increased steadily since 1980. Development of new approaches for prevention of acute respiratory tract conditions requires studies of the etiologies of infections and quantification of the risk of hospitalization for vulnerable patients.To determine the frequency of specific virus infections associated with acute respiratory tract conditions leading to hospitalization of chronically ill patients.Analysis of viral etiology of patients hospitalized with acute respiratory tract conditions between July 1991 and June 1995.Four large clinics and related hospitals serving diverse populations representative of Harris County, Texas.A total of 1029 patients who were hospitalized for pneumonia, tracheobronchitis, bronchiolitis, croup, exacerbations of asthma or chronic obstructive pulmonary disease, and/or congestive heart failure.Virus infection, defined by culture, antigen detection, and significant rise in serum antibodies, by underlying condition; hospitalization rates by low- vs middle-income status.Ninety-three percent of patients older than 5 years had a chronic underlying condition; a chronic pulmonary condition was most common. Patients with chronic pulmonary disease from low-income populations were hospitalized at a rate of 398.6 per 10000, almost 8 times higher than the rate for patients from middle-income groups (52.2 per 10000; P<.001). Of the 403 patients (44.4% of adults and 32.3% of children) who submitted convalescent serum specimens for antibody testing, respiratory tract virus infections were detected in 181 (44.9%). Influenza, parainfluenza, and respiratory syncytial virus (RSV) infections accounted for 75% of all virus infections.Our study suggests that respiratory virus infections commonly trigger serious acute respiratory conditions that result in hospitalization of patients with chronic underlying conditions, highlighting the need for development of effective vaccines for these viruses, especially for parainfluenza and RSV.
0

Use of the Selective Oral Neuraminidase Inhibitor Oseltamivir to Prevent Influenza

Frederick Hayden et al.Oct 28, 1999
+6
M
R
F
Safe and effective antiviral agents are needed to prevent infection with influenza A and B viruses. Oseltamivir (GS4104), which can be administered orally, is the prodrug of GS4071, a potent and selective inhibitor of influenzavirus neuraminidases. We studied the use of oseltamivir for long-term prophylaxis against influenza in two placebo-controlled, double-blind trials at different U.S. sites during the winter of 1997–1998.
0

Homologous and Heterologous Covid-19 Booster Vaccinations

Robert Atmar et al.Jan 26, 2022
+35
M
K
R
Although the three vaccines against coronavirus disease 2019 (Covid-19) that have received emergency use authorization in the United States are highly effective, breakthrough infections are occurring. Data are needed on the serial use of homologous boosters (same as the primary vaccine) and heterologous boosters (different from the primary vaccine) in fully vaccinated recipients.In this phase 1-2, open-label clinical trial conducted at 10 sites in the United States, adults who had completed a Covid-19 vaccine regimen at least 12 weeks earlier and had no reported history of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection received a booster injection with one of three vaccines: mRNA-1273 (Moderna) at a dose of 100 μg, Ad26.COV2.S (Johnson & Johnson-Janssen) at a dose of 5×1010 virus particles, or BNT162b2 (Pfizer-BioNTech) at a dose of 30 μg. The primary end points were safety, reactogenicity, and humoral immunogenicity on trial days 15 and 29.Of the 458 participants who were enrolled in the trial, 154 received mRNA-1273, 150 received Ad26.COV2.S, and 153 received BNT162b2 as booster vaccines; 1 participant did not receive the assigned vaccine. Reactogenicity was similar to that reported for the primary series. More than half the recipients reported having injection-site pain, malaise, headache, or myalgia. For all combinations, antibody neutralizing titers against a SARS-CoV-2 D614G pseudovirus increased by a factor of 4 to 73, and binding titers increased by a factor of 5 to 55. Homologous boosters increased neutralizing antibody titers by a factor of 4 to 20, whereas heterologous boosters increased titers by a factor of 6 to 73. Spike-specific T-cell responses increased in all but the homologous Ad26.COV2.S-boosted subgroup. CD8+ T-cell levels were more durable in the Ad26.COV2.S-primed recipients, and heterologous boosting with the Ad26.COV2.S vaccine substantially increased spike-specific CD8+ T cells in the mRNA vaccine recipients.Homologous and heterologous booster vaccines had an acceptable safety profile and were immunogenic in adults who had completed a primary Covid-19 vaccine regimen at least 12 weeks earlier. (Funded by the National Institute of Allergy and Infectious Diseases; DMID 21-0012 ClinicalTrials.gov number, NCT04889209.).
0
Citation502
0
Save
0

Norwalk Virus Infection and Disease Is Associated with ABO Histo–Blood Group Type

Anne Hutson et al.May 1, 2002
M
D
R
A
Some people are resistant to Norwalk virus (NV) infection; however, the factor(s) responsible for resistance or susceptibility to NV infection has not been identified. This study investigated the relationship between a person's ABO histo-blood group type and the risk of NV infection and symptomatic disease after clinical challenge. ABO phenotypes were identified by using serum samples from volunteers who participated in an NV challenge study (n 5 51). Individuals with an O phenotype were more likely to be infected with NV (odds ratio [OR], 11.8; 95% confidence interval [CI], 1.3-103), whereas persons with a B histo-blood group antigen had decreased risk of infection (OR, 0.096; 95% CI, 0.16–0.56) and symptomatic disease (OR, 0; 95% CI, 0–0.999). This is the first report demonstrating an association between a genetic factor and the risk of NV infection and symptomatic disease.
Load More