PV
Pietro Verzelli
Author with expertise in Molecular Mechanisms of Synaptic Plasticity and Neurological Disorders
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(100% Open Access)
Cited by:
1
h-index:
4
/
i10-index:
0
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
10

Unbiased choice of global clustering parameters for single-molecule localization microscopy

Pietro Verzelli et al.Feb 22, 2021
+3
C
A
P
Abstract Single-molecule localization microscopy resolves objects below the diffraction limit of light via sparse, stochastic detection of target molecules. Single molecules appear as clustered detection events after image reconstruction. However, identification of clusters of localizations is often complicated by the spatial proximity of target molecules and by background noise. Clustering results of existing algorithms often depend on user-generated training data or user-selected parameters, which can lead to unintentional clustering errors. Here we suggest an unbiased algorithm (FINDER) based on adaptive global parameter selection and demonstrate that the algorithm is robust to noise inclusion and target molecule density. We benchmarked FINDER against the most common density based clustering algorithms in test scenarios based on experimental datasets. We show that FINDER can keep the number of false positive inclusions low while also maintaining a low number of false negative detections in densely populated regions.
0

Deciphering the astrocytic contribution to learning and relearning

Lorenzo Squadrani et al.Jan 12, 2024
+4
D
C
L
Abstract Astrocytes play a key role in the regulation of synaptic strength and are thought to orchestrate synaptic plasticity and memory. Yet, how specifically astrocytes and their neuroactive transmitters control learning and memory is currently an open question. Recent experiments have uncovered an astrocyte-mediated feedback loop in CA1 pyramidal neurons which is started by the release of endocannabinoids by active neurons and closed by astrocytic regulation of the D-serine levels at the dendrites. D-serine is a co-agonist for the NMDA receptor regulating the strength and direction of synaptic plasticity. Activity-dependent D-serine release mediated by astrocytes is therefore a candidate for mediating between long-term synaptic depression (LTD) and potentiation (LTP) during learning. Here, we show that the mathematical description of this astrocytic regulation is consistent with the classic Bienenstock Cooper Munro (BCM) model for synaptic plasticity, which postulated the existence of an activity-dependent LTP/LTD threshold. We show how the resulting mathematical framework can explain the experimentally observed behavioral effects of astrocytic cannabinoid receptor knock-out on mice during a place avoidance task and give rise to new testable predictions about the learning process advancing our understanding of the functional role of neuron-glia interaction in learning.