ABSTRACT Datasets consist of measurement data and metadata. Metadata provides context, essential for understanding and (re-)using data. Various metadata standards exist for different methods, systems and contexts. However, relevant information resides at differing stages across the data-lifecycle. Often, this information is defined and standardized only at publication stage, which can lead to data loss and workload increase. In this study, we developed Metadatasheet, a metadata standard based on interviews with members of two biomedical consortia and systematic screening of data repositories. It aligns with the data-lifecycle allowing synchronous metadata recording within Microsoft Excel, a widespread data recording software. Additionally, we provide an implementation, the Metadata Workbook, that offers user-friendly features like automation, dynamic adaption, metadata integrity checks, and export options for various metadata standards. By design and due to its extensive documentation, the proposed metadata standard simplifies recording and structuring of metadata for biomedical scientists, promoting practicality and convenience in data management. This framework can accelerate scientific progress by enhancing collaboration and knowledge transfer throughout the intermediate steps of data creation.

The primary cilium has emerged as critical in regulating whole-body energy metabolism, as reflected in the Bardet-Biedl syndrome (BBS) where primary cilia dysfunction leads to obesity due to hyperphagia and white adipose tissue (WAT) remodeling. The regulation of cell fate and differentiation of adipocyte precursor cells (APCs) is key to maintaining WAT homeostasis during obesity. Using mice that recapitulated the BBS patient phenotype (Bbs8-/-), we demonstrate that primary cilia dysfunction reduces the stem-cell-like P1 APC subpopulation by inducing a phenotypic switch into a fibrogenic progenitor state, characterized by extracellular matrix (ECM) remodeling and upregulation of CD9. Single-cell RNA sequencing revealed a direct transition of stem-cell-like P1 cells into fibrogenic progenitors, bypassing the committed P2 cells. Ectopic ciliary Hedgehog signaling upon loss of BBS8 emerged as a central driver of the molecular changes in Bbs8-/- APCs, altering differentiation into adipocytes and lipid uptake. These findings unravel a novel role for primary cilia in governing APC fate, determining the delicate balance between adipogenesis and fibrogenesis. The identified molecular mechanisms provide insights into potential therapeutic targets for obesity.