NL
Naomi Ling
Author with expertise in Role of AMP-Activated Protein Kinase in Cellular Metabolism
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
5
(60% Open Access)
Cited by:
844
h-index:
19
/
i10-index:
25
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

β-Subunit myristoylation is the gatekeeper for initiating metabolic stress sensing by AMP-activated protein kinase (AMPK)

Jonathan Oakhill et al.Oct 25, 2010
The AMP-activated protein kinase (AMPK) is an αβγ heterotrimer that acts as a master metabolic regulator to maintain cellular energy balance following increased energy demand and increases in the AMP/ATP ratio. This regulation provides dynamic control of energy metabolism, matching energy supply with demand that is essential for the function and survival of organisms. AMPK is inactive unless phosphorylated on Thr172 in the α-catalytic subunit activation loop by upstream kinases (LKB1 or calcium-calmodulin-dependent protein kinase kinase β). How a rise in AMP levels triggers AMPK α-Thr172 phosphorylation and activation is incompletely understood. Here we demonstrate unequivocally that AMP directly stimulates α-Thr172 phosphorylation provided the AMPK β-subunit is myristoylated. Loss of the myristoyl group abolishes AMP activation and reduces the extent of α-Thr172 phosphorylation. Once AMPK is phosphorylated, AMP further activates allosterically but this activation does not require β-subunit myristoylation. AMP and glucose deprivation also promote membrane association of myristoylated AMPK, indicative of a myristoyl-switch mechanism. Our results show that AMP regulates AMPK activation at the initial phosphorylation step, and that β-subunit myristoylation is important for transducing the metabolic stress signal.
0
Citation290
0
Save
1

Novel torin1-sensitive phosphorylation sites on the metabolic regulator AMPK revealed by label-free mass spectrometry

William Smiles et al.Oct 20, 2021
Abstract AMPK and mTORC1 are nutrient-sensitive protein kinases that form a fundamental negative feedback loop that governs cell growth and proliferation. AMPK is an αβγ heterotrimer that is directly phosphorylated by mTORC1 on α2 S345 to suppress AMPK activity and promote cell proliferation under nutrient stress conditions. Using mass spectrometry, we generated precise phosphorylation profiles of all 12 AMPK complexes expressed in proliferating human cells. Of the 18 phosphorylation sites detected, seven were sensitive to pharmacological mTORC1 inhibition, including four in the AMPK γ2 isoform NH 2 -terminal domain and α2 S377 which is located in the nucleotide-sensing motif. In particular, β1 S182 and β2 S184 were found to be mTORC1 substrates in vitro and near-maximally or substantially phosphorylated under cellular growth conditions. β S182 phosphorylation was elevated in α1-containing complexes, relative to α2, an effect partly attributable to the non-conserved α-subunit serine/threonine-rich loop. While mutation of β1 S182 to a non-phosphorylatable Ala had no effect on basal and ligand-stimulated AMPK activity, β2-S184A mutation increased nuclear AMPK activity and enhanced cell proliferation under nutrient stress. We conclude that mTORC1 governs the nuclear activity of AMPK to regulate transcription factors involved in metabolism and cell survival during nutrient shortage.
1
Citation1
0
Save
0

Modern Insights into Muscle Glycogen Phosphorylase Activity

Leonit Kiriaev et al.Feb 23, 2024
ABSTRACT Recent identification of new human muscle glycogen phosphorylation sites has renewed interest in understanding human variations in the regulation of glycogen metabolism and glucose homeostasis. This paper presents a detailed method for the measurement of glycogen phosphorylase (GPh) activity in skeletal muscle. Our approach incorporates modifications to existing radiolabelling assays, optimizing specificity and sensitivity while enabling the assessment of both active and total enzyme activity levels. The utilization of radioisotope tracers and scintillation counting ensures accurate quantification of GPh activity, which we use to validate a previously published reduction in GPh activity in an Actn3 deficient mouse model. Moreover, we introduce a step-by-step guide for data acquisition, highlight the use of appropriate homogenization, discuss the need for allosteric activators/inhibitors and the importance of assay optimization to record a GPh activity assay for skeletal muscle. In conclusion, our refined method not only contributes to a deeper understanding of glycogen metabolism in muscle tissue but also provides a framework for future investigations, underscoring its role in advancing research on glycogen utilization and glucose homeostasis. NEW & NOTEWORTHY The study optimizes the glycogen phosphorylase radiolabelled activity assay, unveiling nuances in muscle homogenization, sample dilution, and caffeine inclusion. The research introduces standardized conditions, enhancing assay reliability and reproducibility across mouse strains to reveal sex specific variations in GPh activity and underscore novel distinctions in an Actn3 deficient mouse model. These findings advance our understanding of muscle glycogen metabolism, offering a crucial tool for researchers and facilitating meaningful inter-laboratory comparisons.