Abstract Background Over the past 20 years there has been a >95% reduction in the number of Gambian Human African trypanosomiasis (g-HAT) cases reported globally, largely as a result of large-scale active screening and treatment programmes. There are however still foci where the disease persists, particularly in parts of the Democratic Republic of the Congo (DRC). Additional control efforts such as tsetse control using Tiny Targets may therefore be required to achieve g-HAT elimination goals. The purpose of this study was to evaluate the impact of Tiny Targets within DRC. Methodology/Principal findings In 2015-2017, pre- and post-intervention tsetse abundance data were collected from 1,234 unique locations across three neighbouring Health Zones (Yasa Bonga, Mosango, Masi Manimba). Remotely sensed dry season data were combined with pre-intervention tsetse presence/absence data from 332 locations within a species distribution modelling framework to produce a habitat suitability map. The impact of Tiny Targets on the tsetse population was then evaluated by fitting a generalised linear mixed model to the relative fly abundance data collected from 889 post-intervention monitoring sites within Yasa Bonga, with habitat suitability, proximity to the intervention and intervention duration as covariates. Immediately following the introduction of the intervention, we observe a dramatic reduction in fly catches by > 85% (pre-intervention: 0.78 flies/trap/day, 95% CI 0.676-0.900; 3 month post-intervention: 0.11 flies/trap/day, 95% CI 0.070-0.153) which is sustained throughout the study period. Declines in catches were negatively associated with proximity to Tiny Targets, and while habitat suitability is positively associated with abundance its influence is reduced in the presence of the intervention. Conclusions/Significance This study adds to the body of evidence demonstrating the impact of Tiny Targets on tsetse across a range of ecological settings, and further characterises the factors which modify its impact. The habitat suitability maps have the potential to guide the expansion of tsetse control activities in this area. Authors Summary There have been large declines in the number of cases of sleeping sickness as a result of programmes that actively screen and treat the at-risk population. Additional control is needed in areas where the disease persists such as parts of the Democratic Republic of Congo (DRC). The disease is transmitted by tsetse flies, and reducing the tsetse population using Tiny Targets has been shown to control the disease in other countries. Extensive tsetse monitoring has been undertaken in one Health Zone in DRC where Tiny Targets have been deployed. We used these data to gain a better understanding of tsetse habitat, to produce habitat suitability maps, and to subsequently measure the impact of Tiny Targets on the tsetse population. We show that tsetse flies are largely found along rivers and surrounding densely vegetated habitat, with there being a positive relationship between habitat suitability and the number of flies caught. Once Tiny Targets were introduced, the number of flies caught in monitoring traps decreased by >85%, with habitat suitability at the trap location, and the proximity of the trap to the nearest Tiny Target influencing the size of the effect of the intervention. This study adds to the body of evidence demonstrating the impact of Tiny Targets on tsetse distribution in addition to providing information that can be used to guide the expansion of tsetse control activities in this area.

Abstract Introduction Tsetse flies ( Glossina ) transmit Trypanosoma brucei gambiense which causes gambiense human African trypanosomiasis (gHAT). As part of national efforts to eliminate gHAT as a public health problem, Uganda implemented a large-scale programme of deploying Tiny Targets, which comprise panels of insecticide-treated material which attract and kill tsetse. At its peak, the programme was the largest tsetse control operation in Africa. Here, we quantify the impact of Tiny Targets and environmental changes on the spatial and temporal patterns of tsetse abundance across north-western Uganda. Methods We leverage a 100-month longitudinal dataset detailing Glossina fuscipes fuscipes catches from monitoring traps between October 2010 and December 2019 within seven districts in north-western Uganda. We fitted a boosted regression tree model assessing environmental suitability which was used alongside Tiny Target data to fit a spatio-temporal geostatistical model predicting tsetse abundance across our study area (∼16,000 km 2 ). We used the spatio-temporal model to quantify the impact of Tiny Targets and environmental changes on the distribution of tsetse, alongside metrics of uncertainty. Results Environmental suitability across the study area remained relatively constant over time, with suitability being driven largely by elevation and distance to rivers. By performing a counterfactual analysis using the fitted spatio-temporal geostatistical model we show that deployment of Tiny Targets across an area of 4000 km 2 reduced the overall abundance of tsetse to low levels (median daily catch = 1.1 tsetse/trap, IQR = 0.85-1.28) with no spatial-temporal locations having high (>10 tsetse/trap/day) numbers of tsetse compared to 18% of locations for the counterfactual. Conclusions In Uganda, Tiny Targets reduced the abundance of G. f. fuscipes and maintained tsetse populations at low levels. Our model represents the first spatio-temporal model investigating the effects of a national tsetse control programme. The outputs provide important data for informing next steps for vector-control and surveillance. Key questions What is already known on this topic? Small panels of insecticide-treated fabric, called Tiny Targets, are used to attract, and kill riverine tsetse, the vectors of T. b. gambiense which causes gambiense human African trypanosomiasis (gHAT). In large-scale (250-2000 km 2 ) trials conducted in five countries, deployment of Tiny Targets reduced the densities of tsetse by between 60 and >90%. What this study adds We report an analysis of, and data from, a large-scale (∼4,000km 2 ) national tsetse control programme, implemented in Uganda to eliminate gHAT as a public health problem. We found that Tiny Targets reduced tsetse abundance across the study period (2011-2019) and maintained densities at low (<1 tsetse/trap/day) levels. We produce maps which detail spatial variances in tsetse abundance in response to vector control. How this study might affect research, practice, or policy In 2022, Uganda received validation from the World Health Organisation (WHO) that it had eliminated gHAT as a public health problem. The large-scale deployment of Tiny Targets contributed to this achievement. Our findings provide evidence that Tiny Targets are an important intervention for other countries aiming to eliminate gHAT.

Background: Large-scale control of sleeping sickness has led to a decline in the number of cases of Gambian human African trypanosomiasis (g-HAT) to <2000/year. However, achieving complete and lasting interruption of transmission may be difficult because animals may act as reservoir hosts for T. b. gambiense. Our study aims to update our understanding of T. b. gambiense in local vectors and domestic animals of N.W. Uganda. Methods: We collected blood from 2896 cattle and 400 pigs and In addition, 6664 tsetse underwent microscopical examination for the presence of trypanosomes. Trypanosoma species were identified in tsetse from a subsample of 2184 using PCR. Primers specific for T. brucei s.l. and for T. brucei sub-species were used to screen cattle, pig and tsetse samples. Results: In total, 39/2,088 (1.9%; 95% CI=1.9-2.5) cattle, 25/400 (6.3%; 95% CI=4.1-9.1) pigs and 40/2,184 (1.8%; 95% CI=1.3-2.5) tsetse, were positive for T. brucei s.l.. Of these samples 24 cattle (61.5%), 15 pig (60%) and 25 tsetse (62.5%) samples had sufficient DNA to be screened using the T. brucei sub-species PCR. Further analysis found no cattle or pigs positive for T. b. gambiense, however, 17/40 of the tsetse samples produced a band suggestive of T. b. gambiense. When three of these 17 PCR products were sequenced the sequences were markedly different to T. b. gambiense, indicating that these flies were not infected with T. b. gambiense. Conclusion: The absence of T. b. gambiense in cattle, pigs and tsetse accords with the low prevalence of g-HAT in the human population. We found no evidence that livestock are acting as reservoir hosts. However, this study highlights the limitations of current methods of detecting and identifying T. b. gambiense which relies on a single copy-gene to discriminate between the different sub-species of T. brucei s.l.

Abstract We investigated genetic variation at 37 newly-developed microsatellite loci in populations of the tsetse fly Glossina fuscipes fuscipes captured from the upper and lower reaches of a single hydrographical network within an endemic Human African Trypanosomiasis focus. Our primary aim was to assess the impact of vector control using insecticide-treated baits (Tiny Targets) on genetic structure. We initially used STRUCTURE to delineate geographical boundaries of two stable ‘ancestral’ reference populations without any history of vector control but marked for either vector control (‘intervention’) or no control (‘non-intervention’). We then used the ADMIXTURE model to assess genetic divergence in temporal populations collected after vector control implementation. We applied the Linkage Disequilibrium method to explicitly measure spatial and temporal changes in effective population size ( N e ). We observed a significant reduction in N e coincident with vector control, whereas N e remained stable in the non-intervention area. Our empirical findings show how classical population genetics approaches detected within a short period of time, a significant genetic bottleneck associated with vector control, and opens up the possibility of using routine genomic surveillance. We have also generated a resource of new genetic markers for studies on the population genetics of tsetse at finer-scale resolution. Funding This work was funded through a Wellcome Trust Master’s Fellowship in Public Health and Tropical Medicine awarded to Allan Muhwezi (103268/Z/13/Z).

Gambiense human African trypanosomiasis (gHAT), a neglected tropical disease caused by a parasite transmitted by tsetse flies, once inflicted over 30,000 annual cases and resulted in an estimated half a million deaths in the late twentieth century. An international gHAT control program has reduced cases to under 1,000 annually, encouraging the World Health Organization to target the elimination of gHAT transmission by 2030. This requires adopting innovative disease control approaches in foci where transmission persists. Since the last decade, case detection and treatment, the mainstay of controlling the disease, is supplemented by vector control using Tiny Targets, small insecticide-treated screens, which attract and kill tsetse. The advantages of Tiny Targets lie in their relatively low cost, easy deployment, and effectiveness. The Democratic Republic of Congo (DRC), bearing 65% of the 799 gHAT cases reported globally in 2022, introduced Tiny Targets in 2015. This study estimates the annual cost of vector control using Tiny Targets in the health district of Yasa Bonga in the DRC and identifies the main cost drivers. Economic and financial costs, collected from the provider’s perspective, were used to estimate the average cost of tsetse control expressed as cost (i) per target used, (ii) per target deployed, (iii) linear kilometre of river controlled, and (iv) square kilometres protected by vector control. Sensitivity analyses were conducted on key parameters for results robustness. The estimated annual economic cost for protecting an area of 1,925 km 2 was 120,000 USD. This translates to 5.3 USD per target used each year, 11 USD per target deployed in the field, 573 USD per linear km treated, and 62 USD per km 2 protected. These costs in the DRC are comparable to those in other countries. The study provides valuable information for practitioners and policymakers making rational, evidence-based decisions to control gHAT.