AR
Arne Rufer
Author with expertise in Structure and Function of G Protein-Coupled Receptors
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
4
(75% Open Access)
Cited by:
686
h-index:
21
/
i10-index:
31
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Unique carbohydrate–carbohydrate interactions are required for high affinity binding between FcγRIII and antibodies lacking core fucose

Claudia Ferrara et al.Jul 18, 2011
Antibody-mediated cellular cytotoxicity (ADCC), a key immune effector mechanism, relies on the binding of antigen-antibody complexes to Fcγ receptors expressed on immune cells. Antibodies lacking core fucosylation show a large increase in affinity for FcγRIIIa leading to an improved receptor-mediated effector function. Although afucosylated IgGs exist naturally, a next generation of recombinant therapeutic, glycoenginereed antibodies is currently being developed to exploit this finding. In this study, the crystal structures of a glycosylated Fcγ receptor complexed with either afucosylated or fucosylated Fc were determined allowing a detailed, molecular understanding of the regulatory role of Fc-oligosaccharide core fucosylation in improving ADCC. The structures reveal a unique type of interface consisting of carbohydrate-carbohydrate interactions between glycans of the receptor and the afucosylated Fc. In contrast, in the complex structure with fucosylated Fc, these contacts are weakened or nonexistent, explaining the decreased affinity for the receptor. These findings allow us to understand the higher efficacy of therapeutic antibodies lacking the core fucose and also suggest a unique mechanism by which the immune system can regulate antibody-mediated effector functions.
20

Diverse chemotypes drive biased signaling by cannabinoid receptors

Tamara Miljuš et al.Nov 10, 2020
Abstract Cannabinoid CB1 and CB2 receptors are members of the G protein-coupled receptor family, which is the largest class of membrane proteins in the human genome. As part of the endocannabinoid system, they have many regulatory functions in the human body. Their malfunction therefore triggers a diverse set of undesired conditions, such as pain, neuropathy, nephropathy, pruritus, osteoporosis, cachexia and Alzheimer’s disease. Although drugs targeting the system exist, the molecular and functional mechanisms involved are still poorly understood, preventing the development of better therapeutics with fewer undesired effects. One path toward the development of better and safer medicines targeting cannabinoid receptors relies on the ability of some compounds to activate a subset of pathways engaged by the receptor while sparing or even inhibiting the others, a phenomenon known as biased signaling. To take advantage of this phenomenon for drug development, a better profiling of the pathways engaged by the receptors is required. Using a BRET-based signaling detection platform, we systematically analyzed the primary signaling cascades activated by CB1 and CB2 receptors, including 9 G protein and 2 β-arrestin subtypes. Given that biased signaling is driven by ligand-specific distinct active conformations of the receptor, establishing a link between the signaling profiles elicited by different drugs and their chemotypes may help designing compounds that selectively activate beneficial pathways while avoiding those leading to undesired effects. We screened a selection of 35 structurally diverse ligands, including endocannabinoids, phytocannabinoids and synthetic compounds structurally similar or significantly different from natural cannabinoids. Our data show that biased signaling is a prominent feature of the cannabinoid receptor system and that, as predicted, ligands with different chemotypes have distinct signaling profiles. The study therefore allows for better understanding of cannabinoid receptors signaling and provides the information about tool compounds that can now be used to link signaling pathways to biological outcomes, aiding the design of improved therapeutics.
20
Citation7
0
Save
0

A universal cannabinoid CB1 and CB2 receptor TR-FRET kinetic ligand binding assay.

Leire Borrega‐Román et al.Jul 18, 2024
Abstract INTRODUCTION The kinetics of ligand binding to G protein-coupled receptors (GPCRs) is an important determining factor in the preclinical evaluation of a molecule. Therefore, efforts should be made to measure this property as part of any drug development plan. The original assays used to assess ligand binding kinetics were developed using radioligands. However, these types of assays are very labor-intensive, limiting their application to the later phases of the drug discovery process. Recently, fluorescence-based ligand binding assays have been developed for multiple GPCRs, demonstrating their superiority through a homogeneous format and continuous data acquisition capabilities. The overriding aim of this study was to develop a fluorescence-based homogeneous ligand binding assay to profile the kinetics of compounds binding to human cannabinoid type 1 and 2 receptors (CB1R and CB2R). METHODS We designed and synthesized D77, a novel universal tracer based on the lower affinity non-selective naturally occurring psychoactive cannabinoid, Δ 8 -THC. Using the TR-FRET (time-resolved Förster resonance energy transfer) technique to develop an assay to study the kinetics of ligand binding to CB1R and CB2R at physiological temperature. To establish a CB1R construct suitable for this assay, it was necessary to truncate the first 90 amino acids of the flexible CB1R N-terminal domain, in order to reduce the FRET distance between the terbium cryptate (donor) and the fluorescent ligand (acceptor), while the full length CB2R construct remained functional due to its shorter N-terminus. We then used the Motulsky-Mahan competition binding model to study the binding kinetics of non-fluorescent ligands. RESULTS D77 tracer displayed affinity for the truncated human CB1R (CB1R 91-472 ) and full length CB2R (CB2R 1-360 ) in the nanomolar range, and competitive binding behavior with orthosteric ligands. Crucially, D77 displayed fast dissociation kinetics from both CB1R and CB2R, comparable to those of the most rapidly dissociating reference compounds tested. This unique property of D77 proved pivotal to accurately determining the on- and off-rates of the fastest dissociating compounds. Using D77, we successfully determined the kinetic binding properties of a series of CB1R and CB2R agonists and antagonists at 37°C, including rimonabant, which was marketed for the treatment of obesity but later withdrawn due to serious neurological side effects. DISCUSSION The k on values of molecules binding CB1R showed a difference of three orders of magnitude from the slowest associating compound, HU308 to the most rapid, rimonabant. Interestingly, we found a strong correlation between k on and affinity for compounds binding to CB1R, suggesting that the association rate is the main parameter determining the affinity of compounds binding to CB1R. For compounds binding to CB2R, both k on and k off parameters contributed as affinity determinants. However, in contrast to CB1R, a stronger correlation was found between the dissociation constant rate parameter and the affinity of these molecules, suggesting that a combination of k on and k off dictates the overall affinity of compounds binding to CB2R. Ultimately, exploring the kinetic parameters of potential cannabinoid drug candidates could help future drug development programs targeting these receptors.
0

Multiple triggers converge to preferential effector coupling in the CB2R through a complex allosteric communication network

Adrián Morales-Pastor et al.Feb 29, 2024
G protein-coupled receptors are important therapeutic drug targets for a wide range of diseases. Their ability to preferentially engage specific signaling pathways over others can be exploited to design drugs that target only disease-associated pathways leading to an improved safety profile. However, the underlying molecular mechanisms for preferential pathway engagement are complex and remain largely elusive. To elucidate the multifaceted actions at the receptor level that lead to preferential coupling, we employ a combination of techniques. Our approach integrates systematic mutagenesis of the CB2R and comprehensive profiling of Gαi2 and β-arrestin1 engagements with computer simulations to track mutant-induced impacts on receptor dynamics. Most importantly, our research discloses multiple triggers on a complex allosteric communication network (ACN) that converge to preferential CB2R coupling by modulating evolutionary conserved motifs (e.g., CWxP, NPxxY, sodium binding site). Potent triggers for a preferential Gαi2 response exhibit high levels of connectivity and are located in proximity to connections with high information transmission. Our insights highlight the complexity of GPCR signaling and can guide the rational design of drug candidates tailored to evoke specific functional responses that can enhance the precision and efficacy of therapeutic interventions.