DS
Duane Smoot
Author with expertise in MicroRNA Regulation in Cancer and Development
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(67% Open Access)
Cited by:
659
h-index:
44
/
i10-index:
122
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

NIH Consensus Conference. Helicobacter pylori in peptic ulcer disease. NIH Consensus Development Panel on Helicobacter pylori in Peptic Ulcer Disease

Tadataka Yamada et al.Jul 6, 1994
+49
D
J
T
The National Institutes of Health Consensus Development Conference onHelicobacter pyloriin Peptic Ulcer Disease brought together specialists in gastroenterology, surgery, infectious diseases, epidemiology, and pathology, as well as the public to address the following questions: (1) What is the causal relationship ofH pylorito upper gastrointestinal disease? (2) How does one diagnose and eradicateH pyloriinfection? (3) Does eradication ofH pyloriinfection benefit the patient with peptic ulcer disease? (4) What is the relationship betweenH pyloriinfection and gastric malignancy? (5) WhichH pylori—infected patients should be treated? (6) What are the most important questions that must be addressed by future research inH pyloriinfections? Following 1½ days of presentations by experts and discussion by the audience, a consensus panel weighed the evidence and prepared their consensus statement. Among their findings, the consensus panel concluded that (1) ulcer patients withH pyloriinfection require treatment with antimicrobial agents in addition to antisecretory drugs whether on first presentation with the illness or on recurrence; (2) the value of treating of nonulcerative dyspepsia patients withH pyloriinfection remains to be determined; and (3) the interesting relationship betweenH pyloriinfection and gastric cancers requires further exploration. (JAMA. 1994;272:65-69)
1

Communication between the nucleus and the mitochondria via NDUFS4 alternative splicing in gastric cancer cells

Vasiliki Papadaki et al.Oct 7, 2022
+7
M
Z
V
Abstract A constant communication between the nucleus and the mitochondria allows both organelles to ensure cellular homeostasis and adaptation to mitochondrial stress. Mitochondrial biogenesis and function are controlled by anterograde regulatory pathways involving a large number of nuclear-encoded proteins. Transcriptional networks controlling the nuclear-encoded mitochondrial genes are known, however alternative splicing (AS) regulation has not been implicated in this communication. Here, we show that IQGAP1, a scaffold protein that regulates AS of distinct subsets of genes in gastric cancer cells, participates in AS regulation that strongly affects mitochondrial respiration. Combined proteomic analyses and RNA-seq profiles of IQGAP1 KO and parental cells show that IQGAP1 KO alters a specific AS event of the mitochondrial respiratory chain complex I subunit NDUFS4 and downregulates a subset of complex I subunits. In IQGAP1 KO cells, respiratory complex I intermediates accumulate resembling assembly deficiencies observed in patients with Leigh syndrome bearing NDUFS4 mutations. Mitochondrial complex I activity is significantly lower in KO compared to parental cells, while exogenous expression of IQGAP1 partially restores NDUFS4 AS pattern and expression and reverses mitochondrial defects of IQGAP1 KO cells. Our work sheds light to a novel facet of IQGAP1 in mitochondrial quality control that involves fine-tuning of complex I activity through AS regulation.
0

Discovering cancer stem-like cells using Spatial transcriptomic analysis: Nuclear factor I X as a novel therapeutic target for gastric cancer

Akira Ishikawa et al.Apr 1, 2024
+9
A
T
A
ABSTRACT Background Gastric cancer (GC) is characterized by significant intratumoral heterogeneity and stem cells presenting as promising therapeutic targets. Despite advancements in spatial transcriptome analysis, unexplored targets for addressing cancer stemness remain unknown. This study aims to identify Nuclear Factor IX (NFIX) as a critical regulator of cancer stemness in GC and evaluate its clinicopathological significance and function. Methods Spatial transcriptome analysis was conducted on GC. NFIX expression’s correlation with clinicopathological factors and prognosis was assessed through immunostaining in 127 GC cases. Functional analyses in cancer cell lines validated these findings. Results Spatial transcriptome analysis stratified GC tissues based on genetic profiles, pinpointing CSC-like cells and further refined the classification to identify and highlight the NFIX’s significance, validated by Monocle 3 and CytoTRACE analyses. Knockdown experiments in cancer cell lines demonstrated the involvement of NFIX in cancer cell proliferation and kinase activity. Conclusions This study underscores spatial transcriptome analysis’s role in refining GC tissue classification and identifying therapeutic targets, highlighting NFIX as pivotal. NFIX expression correlates with poor prognosis and drives GC progression, suggesting its potential as a novel therapeutic target for personalized GC therapies.