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Giulia Faini
Author with expertise in Optogenetics in Neuroscience and Biophysics Research
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Evolutionary divergence of locomotion in two related vertebrate species

Gokul Rajan et al.Mar 1, 2022
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Summary

 Locomotion exists in diverse forms in nature; however, little is known about how closely related species with similar neuronal circuitry can evolve different navigational strategies to explore their environments. Here, we investigate this question by comparing divergent swimming pattern in larval Danionella cerebrum (DC) and zebrafish (ZF). We show that DC displays long continuous swimming events when compared with the short burst-and-glide swimming in ZF. We reveal that mesencephalic locomotion maintenance neurons in the midbrain are sufficient to cause this increased swimming. Moreover, we propose that the availability of dissolved oxygen and timing of swim bladder inflation drive the observed differences in the swim pattern. Our findings uncover the neural substrate underlying the evolutionary divergence of locomotion and its adaptation to their environmental constraints.
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Ultrafast Light Targeting for High-Throughput Precise Control of Neuronal Networks

Giulia Faini et al.Jun 14, 2021
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ABSTRACT Understanding how specific sets of neurons fire and wire together during cognitive-relevant activity is one of the most pressing questions in neuroscience. Two-photon, single-cell resolution optogenetics based on holographic light-targeting approaches enables accurate spatio-temporal control of individual or multiple neurons. Yet, currently, the ability to drive asynchronous activity in distinct cells is critically limited to a few milliseconds and the achievable number of targets to several dozens. In order to expand the capability of single-cell optogenetics, we introduce an approach capable of ultra-fast sequential light targeting (FLiT), based on switching temporally focused beams between holograms at kHz rates. We demonstrate serial-parallel photostimulation strategies capable of multi-cell sub-millisecond temporal control and many-fold expansion of the number of activated cells. This approach will be important for experiments that require rapid and precise cell stimulation with defined spatio-temporal activity patterns and optical control of large neuronal ensembles.
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Evolutionary divergence of locomotion in two related vertebrate species

Gokul Rajan et al.Feb 12, 2021
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Abstract Locomotion exists in diverse forms in nature and is adapted to the environmental constraints of each species 1 . However, little is known about how closely related species with similar neuronal circuitry can evolve different navigational strategies to explore their environments. We established a powerful approach in comparative neuroethology to investigate evolution of neuronal circuits in vertebrates by comparing divergent swimming pattern of two closely related larval fish species, Danionella translucida (DT) and Danio rerio or zebrafish (ZF) 2,3 . During swimming, we demonstrate that DT utilizes lower half tail-beat frequency and amplitude to generate a slower and continuous swimming pattern when compared to the burst-and-glide swimming pattern in ZF. We found a high degree of conservation in the brain anatomy between the two species. However, we revealed that the activity of a higher motor region, referred here as the Mesencephalic Locomotion Maintenance Neurons (MLMN) correlates with the duration of swim events and differs strikingly between DT and ZF. Using holographic stimulation, we show that the activation of the MLMN is sufficient to increase the frequency and duration of swim events in ZF. Moreover, we propose two characteristics, availability of dissolved oxygen and timing of swim bladder inflation, which drive the observed differences in the swim pattern. Our findings uncover the neuronal circuit substrate underlying the evolutionary divergence of navigational strategies and how they are adapted to their respective environmental constraints.
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Perineuronal nets set the strength of thalamic recruitment of interneurons in the adult visual cortex

Giulia Faini et al.Jul 23, 2018
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In the neocortex, the closure of critical periods (CPs) of plasticity is paralleled by the accumulation of perineuronal nets (PNNs) around parvalbumin (PV)-positive inhibitory interneurons. Accordingly, PNN degradation in adult mammals re-opens cortical plasticity. However, how PNNs tune cortical function and plasticity is unknown. We found that PNNs modulated the gain of visual responses in the adult mouse visual cortex in vivo. Removal of PNNs in adult V1 strongly increased thalamic neurotransmission selectively on layer 4 PV cells. This produced a differential gating of feed-forward inhibition on principal neurons and other PV cells, with no alterations of unitary inhibitory synaptic transmission and neuronal excitability. These effects depended on visual input, as they were strongly attenuated by monocular deprivation in PNN-depleted adult mice. Thus, PNNs control visual processing and plasticity by selectively setting the strength of thalamic recruitment of PV cells. We conclude that PNN accumulation during circuit maturation likely prevents excessive thalamic excitation of PV cells at the expense of cortical plasticity.
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Two-photon voltage imaging with rhodopsin-based sensors

Christiane Grimm et al.May 10, 2024
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Abstract The recent advances in sophisticated optical techniques, coupled with two-photon sensitive genetic voltage indicators (GEVIs), have enabled in-depth voltage imaging in vivo at single spike and single-cell resolution. To date, these results have been only achieved using ASAP-type sensors, as the complex photocycle of rhodopsin-based voltage indicators posed challenges for their two-photon use, restricting their application to one-photon approaches. In this work, we demonstrate that rhodopsin-based GEVIs (FRET-opsin) can be used under two-photon illumination when their peculiar light intensity dependence of kinetics and sensitivity are considered. We rationally engineer a fully genetically-encoded, rhodopsin-based voltage indicator with the brightest known fluorophore AaFP1, Jarvis, and demonstrate its utility under both one- and two-photon illumination. We also showed two-photon usability of the similar FRET-opsin sensor pAce. Our comparison of 2P scanless with fast 2P scanning illumination revealed that the latter approach is less suitable for this class of indicators and, on the contrary, both sensors responded well when scanless approaches were used. Furthermore, utilising Jarvis, we demonstrated high-fidelity, high-SNR action potential detection at kilohertz-imaging rates both in mouse hippocampal slices and in zebrafish larvae. To the best of our knowledge, this study represents the first report of a fully genetically-encoded rhodopsin-based voltage indicator for high contrast action potential detection under two-photon illumination in vitro and in vivo .