The ongoing coronavirus disease 2019 (COVID-19) outbreak expanded rapidly throughout China. Major behavioral, clinical, and state interventions were undertaken to mitigate the epidemic and prevent the persistence of the virus in human populations in China and worldwide. It remains unclear how these unprecedented interventions, including travel restrictions, affected COVID-19 spread in China. We used real-time mobility data from Wuhan and detailed case data including travel history to elucidate the role of case importation in transmission in cities across China and to ascertain the impact of control measures. Early on, the spatial distribution of COVID-19 cases in China was explained well by human mobility data. After the implementation of control measures, this correlation dropped and growth rates became negative in most locations, although shifts in the demographics of reported cases were still indicative of local chains of transmission outside of Wuhan. This study shows that the drastic control measures implemented in China substantially mitigated the spread of COVID-19.

Cases of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection in Manaus, Brazil, resurged in late 2020 despite previously high levels of infection. Genome sequencing of viruses sampled in Manaus between November 2020 and January 2021 revealed the emergence and circulation of a novel SARS-CoV-2 variant of concern. Lineage P.1 acquired 17 mutations, including a trio in the spike protein (K417T, E484K, and N501Y) associated with increased binding to the human ACE2 (angiotensin-converting enzyme 2) receptor. Molecular clock analysis shows that P.1 emergence occurred around mid-November 2020 and was preceded by a period of faster molecular evolution. Using a two-category dynamical model that integrates genomic and mortality data, we estimate that P.1 may be 1.7- to 2.4-fold more transmissible and that previous (non-P.1) infection provides 54 to 79% of the protection against infection with P.1 that it provides against non-P.1 lineages. Enhanced global genomic surveillance of variants of concern, which may exhibit increased transmissibility and/or immune evasion, is critical to accelerate pandemic responsiveness.

Zika virus genomes from Brazil The Zika virus outbreak is a major cause for concern in Brazil, where it has been linked with increased reports of otherwise rare birth defects and neuropathology. In a phylogenetic analysis, Faria et al. infer a single introduction of Zika to the Americas and estimated the introduction date to be about May to December 2013—some 12 months earlier than the virus was reported. This timing correlates with major events in the Brazilian cultural calendar associated with increased traveler numbers from areas where Zika virus has been circulating. A correlation was also observed between incidences of microcephaly and week 17 of pregnancy. Science , this issue p. 345

Genome sequencing has become a powerful tool for studying emerging infectious diseases; however, genome sequencing directly from clinical samples (i.e., without isolation and culture) remains challenging for viruses such as Zika, for which metagenomic sequencing methods may generate insufficient numbers of viral reads. Here we present a protocol for generating coding-sequence-complete genomes, comprising an online primer design tool, a novel multiplex PCR enrichment protocol, optimized library preparation methods for the portable MinION sequencer (Oxford Nanopore Technologies) and the Illumina range of instruments, and a bioinformatics pipeline for generating consensus sequences. The MinION protocol does not require an Internet connection for analysis, making it suitable for field applications with limited connectivity. Our method relies on multiplex PCR for targeted enrichment of viral genomes from samples containing as few as 50 genome copies per reaction. Viral consensus sequences can be achieved in 1-2 d by starting with clinical samples and following a simple laboratory workflow. This method has been successfully used by several groups studying Zika virus evolution and is facilitating an understanding of the spread of the virus in the Americas. The protocol can be used to sequence other viral genomes using the online Primal Scheme primer designer software. It is suitable for sequencing either RNA or DNA viruses in the field during outbreaks or as an inexpensive, convenient method for use in the lab.

Abstract The global population at risk from mosquito-borne diseases—including dengue, yellow fever, chikungunya and Zika—is expanding in concert with changes in the distribution of two key vectors: Aedes aegypti and Aedes albopictus . The distribution of these species is largely driven by both human movement and the presence of suitable climate. Using statistical mapping techniques, we show that human movement patterns explain the spread of both species in Europe and the United States following their introduction. We find that the spread of Ae. aegypti is characterized by long distance importations, while Ae. albopictus has expanded more along the fringes of its distribution. We describe these processes and predict the future distributions of both species in response to accelerating urbanization, connectivity and climate change. Global surveillance and control efforts that aim to mitigate the spread of chikungunya, dengue, yellow fever and Zika viruses must consider the so far unabated spread of these mosquitos. Our maps and predictions offer an opportunity to strategically target surveillance and control programmes and thereby augment efforts to reduce arbovirus burden in human populations globally.

After initially containing severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), many European and Asian countries had a resurgence of COVID-19 consistent with a large proportion of the population remaining susceptible to the virus after the first epidemic wave.1Lucy CO Verity R Watson OJ et al.Have deaths from COVID-19 in Europe plateaued due to herd immunity?.Lancet. 2020; 395: e110-e111Summary Full Text Full Text PDF PubMed Scopus (50) Google Scholar By contrast, in Manaus, Brazil, a study of blood donors indicated that 76% (95% CI 67–98) of the population had been infected with SARS-CoV-2 by October, 2020.2Buss LF Prete CA Abrahim CMM et al.Three-quarters attack rate of SARS-CoV-2 in the Brazilian Amazon during a largely unmitigated epidemic.Science. 2020; 371: 288-292Crossref PubMed Scopus (290) Google Scholar High attack rates of SARS-CoV-2 were also estimated in population-based samples from other locations in the Amazon Basin—eg, Iquitos, Peru 70% (67–73).3Álvarez-Antonio C Meza-Sánchez G Calampa C et al.Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 antibodies in Iquitos, Loreto, Peru.MedRxiv. 2021; (published online 20.) (preprint)https://doi.org/10.1101/2021.01.17.21249913Google Scholar The estimated SARS-CoV-2 attack rate in Manaus would be above the theoretical herd immunity threshold (67%), given a basic case reproduction number (R0) of 3.4Fontanet A Cauchemez S COVID-19 herd immunity: where are we?.Nat Rev Immunol. 2020; 20: 583-584Crossref PubMed Scopus (373) Google Scholar In this context, the abrupt increase in the number of COVID-19 hospital admissions in Manaus during January, 2021 (3431 in Jan 1–19, 2021, vs 552 in Dec 1–19, 2020) is unexpected and of concern (figure).5Fundação de Vigilância em Saúde do AmazonasCOVID-19 no Amazonas. Dados epidemiológicos e financeiros das ações de combate à COVID-19. Publicações.http://www.fvs.am.gov.br/publicacoesDate accessed: January 20, 2021Google Scholar, 6Prefeitura de ManausPublicações. COVID-19.http://www.manaus.am.gov.br/noticia/Date accessed: January 20, 2021Google Scholar, 7Fundação de Vigilância em Saúde do AmazonasIndex of media publicacao.http://www.fvs.am.gov.br/media/publicacaoDate accessed: January 20, 2021Google Scholar, 8Marcelo Oliveira capyvaraPopular repositories. GitHub, 2021https://github.com/capyvaraDate accessed: January 20, 2021Google Scholar, 9Nelson BW Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA)Excess deaths Manaus.https://t.co/6g4HHEAuNYDate: 2021Date accessed: January 20, 2021Google Scholar, 10Parag KV Cowling BJ Donnelly CA et al.Deciphering early-warning signals of the elimination and resurgence potential of SARS-CoV-2 from limited data at multiple scales.MedRxiv. 2020; (published online Jan 5.) (preprint)https://doi.org/10.1101/2020.11.23.20236968Google Scholar After a large epidemic that peaked in late April, 2020, COVID-19 hospitalisations in Manaus remained stable and fairly low for 7 months from May to November, despite the relaxation of COVID-19 control measures during that period (figure). There are at least four non-mutually exclusive possible explanations for the resurgence of COVID-19 in Manaus. First, the SARS-CoV-2 attack rate could have been overestimated during the first wave, and the population remained below the herd immunity threshold until the beginning of December, 2020. In this scenario, the resurgence could be explained by greater mixing of infected and susceptible individuals during December. The 76% estimate of past infection2Buss LF Prete CA Abrahim CMM et al.Three-quarters attack rate of SARS-CoV-2 in the Brazilian Amazon during a largely unmitigated epidemic.Science. 2020; 371: 288-292Crossref PubMed Scopus (290) Google Scholar might have been biased upwards due to adjustments to the observed 52·5% (95% CI 47·6–57·5) seroprevalence in June, 2020, to account for antibody waning. However, even this lower bound should confer important population immunity to avoid a larger outbreak. Furthermore, comparisons of blood donors with census data showed no major difference in a range of demographic variables,2Buss LF Prete CA Abrahim CMM et al.Three-quarters attack rate of SARS-CoV-2 in the Brazilian Amazon during a largely unmitigated epidemic.Science. 2020; 371: 288-292Crossref PubMed Scopus (290) Google Scholar and the mandatory exclusion of donors with symptoms of COVID-19 is expected to underestimate the true population exposure to the virus. Reanalysis and model comparison11Tassila S Pybus O França R et al.Coronavirus prevalence in Brazilian Amazon and Sao Paulo city [data set].Dryad. 2020; (published online Dec 8.)http://doi.org/10.5061/dryad.c59zw3r5nGoogle Scholar by independent groups will help inform the best-fitting models for antibody waning and the representativeness of blood donors. Second, immunity against infection might have already begun to wane by December, 2020, because of a general decrease in immune protection against SARS-CoV-2 after a first exposure. Waning of anti-nucleocapsid IgG antibody titres observed in blood donors2Buss LF Prete CA Abrahim CMM et al.Three-quarters attack rate of SARS-CoV-2 in the Brazilian Amazon during a largely unmitigated epidemic.Science. 2020; 371: 288-292Crossref PubMed Scopus (290) Google Scholar might reflect a loss of immune protection, although immunity to SARS-CoV-2 depends on a combination of B-cell and T-cell responses.12Dan JM Mateu J Kato Y et al.Immunological memory to SARS-CoV-2 assessed for up to 8 months after infection.Science. 2021; (published online Jan 6.)https://doi.org/10.1126/science.abf4063Crossref PubMed Scopus (1835) Google Scholar A study of UK health-care workers13Lumley SF O'Donnell D Stoesser NE et al.Antibody status and incidence of SARS-CoV-2 infection in health care workers.N Engl J Med. 2020; (published online Dec 23.)https://doi.org/10.1056/NEJMoa2034545Crossref PubMed Scopus (640) Google Scholar showed that reinfection with SARS-CoV-2 is uncommon up to 6 months after the primary infection. However, most of the SARS-CoV-2 infections in Manaus occurred 7–8 months before the resurgence in January, 2021; this is longer than the period covered by the UK study,13Lumley SF O'Donnell D Stoesser NE et al.Antibody status and incidence of SARS-CoV-2 infection in health care workers.N Engl J Med. 2020; (published online Dec 23.)https://doi.org/10.1056/NEJMoa2034545Crossref PubMed Scopus (640) Google Scholar but nonetheless suggests that waning immunity alone is unlikely to fully explain the recent resurgence. Moreover, population mobility in Manaus decreased from mid-November, 2020, with a sharp reduction in late December, 2020,14ODS Atlas AmazonasInloco. Índice de Isolamento Social das cidades do Amazonas. Dados cedidos pela empresa Inloco.https://datastudio.google.com/s/o1rTqejYd_4Date accessed: January 20, 2021Google Scholar suggesting that behavioural change does not account for the resurgence of hospitalisations. Third, SARS-CoV-2 lineages might evade immunity generated in response to previous infection.15Greaney AJ Loes AN Crawford KHD et al.Comprehensive mapping of mutations to the SARS-CoV-2 receptor-binding domain that affect recognition by polyclonal human serum antibodies.BioRxiv. 2021; (published online Jan 4.) (preprint)https://doi.org/10.1101/2020.12.31.425021PubMed Google Scholar Three recently detected SARS-CoV-2 lineages (B.1.1.7, B.1.351, and P.1), are unusually divergent and each possesses a unique constellation of mutations of potential biological importance.16Faria NR Claro IM Candido D et al.Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings. Virological.https://virological.org/t/genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-manaus-preliminary-findings/586Date: January, 2021Date accessed: January 20, 2021Google Scholar, 17Rambaut A Loman N Pybus OG et al.Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations. Virological.https://virological.org/t/preliminary-genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-the-uk-defined-by-a-novel-set-of-spike-mutations/563Date: December, 2020Date accessed: January 20, 2021Google Scholar, 18Tegally H Wilkinson E Giovanetti M et al.Emergence and rapid spread of a new severe acute respiratory syndrome-related coronavirus 2 (SARS-CoV-2) lineage with multiple spike mutations in South Africa.MedRxiv. 2020; (published online Dec 22.) (preprint)https://doi.org/10.1101/2020.12.21.20248640Google Scholar Of these, two are circulating in Brazil (B.1.1.7 and P.1) and one (P.1) was detected in Manaus on Jan 12, 2021.16Faria NR Claro IM Candido D et al.Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings. Virological.https://virological.org/t/genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-manaus-preliminary-findings/586Date: January, 2021Date accessed: January 20, 2021Google Scholar One case of SARS-CoV-2 reinfection has been associated with the P.1 lineage in Manaus19Naveca F da Costa C Nascimento V et al.SARS-CoV-2 reinfection by the new variant of concern (VOC) P.1 in Amazonas, Brazil. Virological.https://virological.org/t/sars-cov-2-reinfection-by-the-new-variant-of-concern-voc-p-1-in-amazonas-brazil/596Date: Jan 18, 2021Date accessed: January 20, 2021Google Scholar that accrued ten unique spike protein mutations, including E484K and N501K.16Faria NR Claro IM Candido D et al.Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings. Virological.https://virological.org/t/genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-manaus-preliminary-findings/586Date: January, 2021Date accessed: January 20, 2021Google Scholar Moreover, the newly classified P.2 lineage (sublineage of B.1.128 that independently accrued the spike E484K mutation) has now been detected in several locations in Brazil, including Manaus.20Naveca F Nascimento V Souza V et al.Phylogenetic relationship of SARS-CoV-2 sequences from Amazonas with emerging Brazilian variants harboring mutations E484K and N501Y in the Spike protein. Virological.https://virological.org/t/phylogenetic-relationship-of-sars-cov-2-sequences-from-amazonas-with-emerging-brazilian-variants-harboring-mutations-e484k-and-n501y-in-the-spike-protein/585Date: Jan 11, 2021Date accessed: January 20, 2021Google Scholar P.2 variants with the E484K mutation have been detected in two people who have been reinfected with SARS-CoV-2 in Brazil,21Nonaka VCK Franco MM Gräf T et al.Genomic evidence of a SARS-Cov-2 reinfection case with E484K spike mutation in Brazil.Preprints. 2021; (published online Jan 6.) (preprint)https://doi.org/10.20944/preprints202101.0132.v1Google Scholar, 22Resende PC Bezerra JF Vasconcelos RHT et al.Spike E484K mutation in the first SARS-CoV-2 reinfection case confirmed in Brazil, 2020. Virological.https://virological.org/t/spike-e484k-mutation-in-the-first-sars-cov-2-reinfection-case-confirmed-in-brazil-2020/584Date: Jan 10, 2021Date accessed: January 20, 2021Google Scholar and there is in-vitro evidence that the presence of the E484K mutation reduces neutralisation by polyclonal antibodies in convalescent sera.15Greaney AJ Loes AN Crawford KHD et al.Comprehensive mapping of mutations to the SARS-CoV-2 receptor-binding domain that affect recognition by polyclonal human serum antibodies.BioRxiv. 2021; (published online Jan 4.) (preprint)https://doi.org/10.1101/2020.12.31.425021PubMed Google Scholar Fourth, SARS-CoV-2 lineages circulating in the second wave might have higher inherent transmissibility than pre-existing lineages circulating in Manaus. The P.1 lineage was first discovered in Manaus.16Faria NR Claro IM Candido D et al.Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings. Virological.https://virological.org/t/genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-manaus-preliminary-findings/586Date: January, 2021Date accessed: January 20, 2021Google Scholar In a preliminary study, this lineage reached a high frequency (42%, 13 of 31) among genome samples obtained from COVID-19 cases in December, 2020, but was absent in 26 samples collected in Manaus between March and November, 2020.16Faria NR Claro IM Candido D et al.Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings. Virological.https://virological.org/t/genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-manaus-preliminary-findings/586Date: January, 2021Date accessed: January 20, 2021Google Scholar Thus far, little is known about the transmissibility of the P.1 lineage, but it shares several independently acquired mutations with the B.1.1.7 (N501Y) and the B.1.325 (K417N/T, E484K, N501Y) lineages circulating in the UK and South Africa, which seem to have increased transmissibility.18Tegally H Wilkinson E Giovanetti M et al.Emergence and rapid spread of a new severe acute respiratory syndrome-related coronavirus 2 (SARS-CoV-2) lineage with multiple spike mutations in South Africa.MedRxiv. 2020; (published online Dec 22.) (preprint)https://doi.org/10.1101/2020.12.21.20248640Google Scholar Contact tracing and outbreak investigation data are needed to better understand relative transmissibility of this lineage. The new SARS-CoV-2 lineages may drive a resurgence of cases in the places where they circulate if they have increased transmissibility compared with pre-existing circulating lineages and if they are associated with antigenic escape. For this reason, the genetic, immunological, clinical, and epidemiological characteristics of these SARS-CoV-2 variants need to be quickly investigated. Conversely, if resurgence in Manaus is due to waning of protective immunity, then similar resurgence scenarios should be expected in other locations. Sustained serological and genomic surveillance in Manaus and elsewhere is a priority, with simultaneous monitoring for SARS-CoV-2 reinfections and implementation of non-pharmaceutical interventions. Determining the efficacy of existing COVID-19 vaccines against variants in the P.1 lineage and other lineages with potential immune escape variants is also crucial. Genotyping viruses from COVID-19 patients who were not protected by vaccination in clinical trials would help us to understand if there are lineage-specific frequencies underlying reinfection. The protocols and findings of such studies should be coordinated and rapidly shared wherever such variants emerge and spread. Since rapid data sharing is the basis for the development and implementation of actionable disease control measures during public health emergencies, we are openly sharing in real-time monthly curated serosurvey data from blood donors through the Brazil–UK Centre for Arbovirus Discovery, Diagnosis, Genomics and Epidemiology (CADDE) Centre GitHub website and will continue to share genetic sequence data and results from Manaus through openly accessible data platforms such as GISAID and Virological. NRF reports funding from Wellcome Trust, the Royal Society, and the UK Medical Research Council. CAP reports grants from Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Brasil and FAPESP. NMF reports grants from the UK Medical Research Council, the UK National Institute of Health Research, Community Jameel, NIH NIGMS, Janssen Pharmaceuticals, the Bill & Melinda Gates Foundation, and Gavi, the Vaccine Alliance. The other authors declare no competing interests.

The hidden history of the HIV pandemic Rail and river transport in 1960s Congo, combined with the sexual revolution and changes in health care practices, primed the HIV pandemic. Faria et al. unpick the circumstances surrounding the ascendancy of HIV from its origins before 1920 in chimpanzee hunters in the Cameroon to amplification in Kinshasa. Around 1960, rail links promoted the spread of the virus to mining areas in southeastern Congo and beyond. Ultimately, HIV crossed the Atlantic in Haitian teachers returning home. From those early events, a pandemic was born. Science , this issue p. 56

Virus genomes reveal the establishment of Zika virus in Brazil and the Americas, and provide an appropriate timeframe for baseline (pre-Zika) microcephaly in different regions. Three papers in this issue present a wealth of new Zika virus (ZIKV) genome sequences and further insights into the genetic epidemiology of ZIKV. Nathan Grubaugh et al. provide 39 new ZIKV genome sequences from infected patients and Aedes aegypti mosquitoes in Florida. Phylogenetic analysis suggests that the virus has been introduced on multiple separate occasions, probably linked to travel from the Caribbean. They find a low probability of long-term persistence of ZIKV transmission chains within Florida, suggesting that the potential for future ZIKV outbreaks there will depend on transmission dynamics in the Americas. Nuno Faria et al. and Hayden Metsky et al. reconstruct the spread of ZIKV in Brazil and the Americas. Faria et al. provide 54 new ZIKV genomes, several sequenced in real time in a mobile genomics laboratory. They trace the spatial origins and spread of ZIKV in Brazil and the Americas and date the timing of the international spread of ZIKV from Brazil. They find that northeast Brazil had a crucial role in the establishment of the epidemic and the spread of the virus within Brazil and the Americas. Metsky et al. generate 110 ZIKV genomes from clinical and mosquito samples from ten regions. They also see rapid expansion of the epidemic within Brazil and multiple introductions to other geographic areas. In agreement with Faria et al., they find that ZIKV circulated unobserved for many months before transmission was detected. Metsky et al. additionally describe ZIKV evolution and discuss how the accumulation of mutations might affect the performance of diagnostic tests in the future. Transmission of Zika virus (ZIKV) in the Americas was first confirmed in May 2015 in northeast Brazil1. Brazil has had the highest number of reported ZIKV cases worldwide (more than 200,000 by 24 December 20162) and the most cases associated with microcephaly and other birth defects (2,366 confirmed by 31 December 20162). Since the initial detection of ZIKV in Brazil, more than 45 countries in the Americas have reported local ZIKV transmission, with 24 of these reporting severe ZIKV-associated disease3. However, the origin and epidemic history of ZIKV in Brazil and the Americas remain poorly understood, despite the value of this information for interpreting observed trends in reported microcephaly. Here we address this issue by generating 54 complete or partial ZIKV genomes, mostly from Brazil, and reporting data generated by a mobile genomics laboratory that travelled across northeast Brazil in 2016. One sequence represents the earliest confirmed ZIKV infection in Brazil. Analyses of viral genomes with ecological and epidemiological data yield an estimate that ZIKV was present in northeast Brazil by February 2014 and is likely to have disseminated from there, nationally and internationally, before the first detection of ZIKV in the Americas. Estimated dates for the international spread of ZIKV from Brazil indicate the duration of pre-detection cryptic transmission in recipient regions. The role of northeast Brazil in the establishment of ZIKV in the Americas is further supported by geographic analysis of ZIKV transmission potential and by estimates of the basic reproduction number of the virus.

Brazil currently has one of the fastest-growing severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) epidemics in the world. Because of limited available data, assessments of the impact of nonpharmaceutical interventions (NPIs) on this virus spread remain challenging. Using a mobility-driven transmission model, we show that NPIs reduced the reproduction number from >3 to 1 to 1.6 in São Paulo and Rio de Janeiro. Sequencing of 427 new genomes and analysis of a geographically representative genomic dataset identified >100 international virus introductions in Brazil. We estimate that most (76%) of the Brazilian strains fell in three clades that were introduced from Europe between 22 February and 11 March 2020. During the early epidemic phase, we found that SARS-CoV-2 spread mostly locally and within state borders. After this period, despite sharp decreases in air travel, we estimated multiple exportations from large urban centers that coincided with a 25% increase in average traveled distances in national flights. This study sheds new light on the epidemic transmission and evolutionary trajectories of SARS-CoV-2 lineages in Brazil and provides evidence that current interventions remain insufficient to keep virus transmission under control in this country.

Attack rate in Manaus Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) incidence peaked in Manaus, Brazil, in May 2020 with a devastating toll on the city's inhabitants, leaving its health services shattered and cemeteries overwhelmed. Buss et al. collected data from blood donors from Manaus and São Paulo, noted when transmission began to fall, and estimated the final attack rates in October 2020 (see the Perspective by Sridhar and Gurdasani). Heterogeneities in immune protection, population structure, poverty, modes of public transport, and uneven adoption of nonpharmaceutical interventions mean that despite a high attack rate, herd immunity may not have been achieved. This unfortunate city has become a sentinel for how natural population immunity could influence future transmission. Events in Manaus reveal what tragedy and harm to society can unfold if this virus is left to run its course. Science , this issue p. 288 ; see also p. 230