JM
Jonas Mengel‐From
Author with expertise in Epigenetic Modifications and Their Functional Implications
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(67% Open Access)
Cited by:
653
h-index:
25
/
i10-index:
50
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Mitochondrial DNA copy number in peripheral blood cells declines with age and is associated with general health among elderly

Jonas Mengel‐From et al.Jun 5, 2014
The role of the mitochondria in disease, general health and aging has drawn much attention over the years. Several attempts have been made to describe how the numbers of mitochondria correlate with age, although with inconclusive results. In this study, the relative quantity of mitochondrial DNA compared to nuclear DNA, i.e. the mitochondrial DNA copy number, was measured by PCR technology and used as a proxy for the content of mitochondria copies. In 1,067 Danish twins and singletons (18–93 years of age), with the majority being elderly individuals, the estimated mean mitochondrial DNA copy number in peripheral blood cells was similar for those 18–48 years of age [mean relative mtDNA content: 61.0; 95 % CI (52.1; 69.9)], but declined by −0.54 mtDNA 95 % CI (−0.63; −0.45) every year for those older than approximately 50 years of age. However, the longitudinal, yearly decline within an individual was more than twice as steep as observed in the cross-sectional analysis [decline of mtDNA content: −1.27; 95 % CI (−1.71; −0.82)]. Subjects with low mitochondrial DNA copy number had poorer outcomes in terms of cognitive performance, physical strength, self-rated health, and higher all-cause mortality than subjects with high mitochondrial DNA copy number, also when age was controlled for. The copy number mortality association can contribute to the smaller decline in a cross-sectional sample of the population compared to the individual, longitudinal decline. This study suggests that high mitochondrial DNA copy number in blood is associated with better health and survival among elderly.
0
Citation305
0
Save
0

Integrative analysis of clinical and epigenetic biomarkers of mortality

Tianxiao Huan et al.May 12, 2022
DNA methylation (DNAm) has been reported to be associated with many diseases and with mortality. We hypothesized that the integration of DNAm with clinical risk factors would improve mortality prediction. We performed an epigenome-wide association study of whole blood DNAm in relation to mortality in 15 cohorts (n = 15,013). During a mean follow-up of 10 years, there were 4314 deaths from all causes including 1235 cardiovascular disease (CVD) deaths and 868 cancer deaths. Ancestry-stratified meta-analysis of all-cause mortality identified 163 CpGs in European ancestry (EA) and 17 in African ancestry (AA) participants at p < 1 × 10-7 , of which 41 (EA) and 16 (AA) were also associated with CVD death, and 15 (EA) and 9 (AA) with cancer death. We built DNAm-based prediction models for all-cause mortality that predicted mortality risk after adjusting for clinical risk factors. The mortality prediction model trained by integrating DNAm with clinical risk factors showed an improvement in prediction of cancer death with 5% increase in the C-index in a replication cohort, compared with the model including clinical risk factors alone. Mendelian randomization identified 15 putatively causal CpGs in relation to longevity, CVD, or cancer risk. For example, cg06885782 (in KCNQ4) was positively associated with risk for prostate cancer (Beta = 1.2, PMR = 4.1 × 10-4 ) and negatively associated with longevity (Beta = -1.9, PMR = 0.02). Pathway analysis revealed that genes associated with mortality-related CpGs are enriched for immune- and cancer-related pathways. We identified replicable DNAm signatures of mortality and demonstrated the potential utility of CpGs as informative biomarkers for prediction of mortality risk.
0
Citation13
0
Save
0

Age and mortality associated DNA methylation patterns on the X-chromosome in male and female samples

Shuxia Li et al.May 14, 2019
Background: Multiple epigenetic association studies on human aging have been performed reporting large numbers of sites differentially methylated across ages on the autosomal chromosomes. The X-chromosome has been studied little, due to analytical difficulties in dealing with sex differences in X-chromosome content and X-inactivation in females. Based on large collections of genome-wide DNA methylation data on two Danish cohorts of identical twins (mean ages, 66 and 79 years) and the Lothian Birth Cohort 1921 (mean age 79 years), we conducted a chromosome-wide association analysis on male and female samples separately with equal sample sizes to discover age-dependent X-linked DNA methylation patterns using chromosome 20 with about same number of CpGs analysed as an autosomal reference, and compare the age-related changes in DNA methylation between the two sexes. In addition, age-related methylation sites were assessed for their associations with mortality. Results: We identified more age-related DNA methylation sites (FDR<0.05) in females than in males. Among them, predominantly more sites were hypermethylated in the older as compared with the younger cohorts, a pattern similar to that observed on chromosome 20. Among the age-related sites, 13 CpGs in males and 24 CpGs in females were found significant (FDR<0.05) in all cohorts. Survival analysis showed that there are more age-methylated CpGs that contribute to reduce mortality than those that increase mortality in male but not in female samples. Conclusion: The X-chromosome displays significant age- and sex-dependent methylation patterns which might be differentially associated with mortality in the two sexes.