Liability to alcohol dependence (AD) is heritable, but little is known about its complex polygenic architecture or its genetic relationship with other disorders. To discover loci associated with AD and characterize the relationship between AD and other psychiatric and behavioral outcomes, we carried out the largest genome-wide association study to date of DSM-IV-diagnosed AD. Genome-wide data on 14,904 individuals with AD and 37,944 controls from 28 case–control and family-based studies were meta-analyzed, stratified by genetic ancestry (European, n = 46,568; African, n = 6,280). Independent, genome-wide significant effects of different ADH1B variants were identified in European (rs1229984; P = 9.8 × 10–13) and African ancestries (rs2066702; P = 2.2 × 10–9). Significant genetic correlations were observed with 17 phenotypes, including schizophrenia, attention deficit–hyperactivity disorder, depression, and use of cigarettes and cannabis. The genetic underpinnings of AD only partially overlap with those for alcohol consumption, underscoring the genetic distinction between pathological and nonpathological drinking behaviors. Different functional variants in ADH1B (and elsewhere) in Europeans and Africans strongly affect risk for alcohol dependence. Dependence only partly genetically correlates with consumption, with strong correlations to other psychiatric disorders.

Abstract Liability to alcohol dependence (AD) is heritable, but little is known about its complex polygenic architecture or its genetic relationship with other disorders. To discover loci associated with AD and characterize the relationship between AD and other psychiatric and behavioral outcomes, we carried out the largest GWAS to date of DSM - IV diagnosed AD. Genome - wide data on 14,904 individuals with AD and 37,944 controls from 28 case / control and family - based studies were meta - analyzed, stratified by genetic ancestry (European, N = 46,568; African; N = 6,280). Independent, genome - wide significant effects of different ADH1B variants were identified in European (rs1229984; p = 9.8E - 13) and African ancestries (rs2066702; p = 2.2E - 9). Significant genetic correlations were observed with schizophrenia, ADHD, depression, and use of cigarettes and cannabis. There was only modest genetic correlation with alcohol consumption and inconsistent associations with problem drinking. The genetic underpinnings of AD only partially overlap with those for alcohol consumption, underscoring the genetic distinction between pathological and non - pathological drinking behaviors.

Summary Glucocorticoids are important for proper organ maturation and their levels are tightly regulated during development. Here we use human cerebral organoids and mice to study cell-type specific effects of glucocorticoids on neurogenesis. We show that glucocorticoids increase a specific type of basal progenitors (co-expressing PAX6 and EOMES ) that has been shown to drive cortical expansion in gyrified species. This effect is mediated via the transcription factor ZBTB16 and leads to increased production of neurons. A phenome-wide mendelian randomization analysis of an enhancer variant that moderates glucocorticoid-induced ZBTB16 levels, reveals causal relationships with higher educational attainment and altered brain structure. The relationship with postnatal cognition is supported by data from a prospective pregnancy cohort. This study provides a novel cellular and molecular pathway for the effects of glucocorticoids on human neurogenesis that relates to lasting postnatal phenotypes.

Eating disorders and substance use disorders frequently co-occur. Twin studies reveal shared genetic variance between liabilities to eating disorders and substance use, with the strongest associations between symptoms of bulimia nervosa (BN) and problem alcohol use (genetic correlation [rg], twin-based=0.23-0.53). We estimated the genetic correlation between eating disorder and substance use and disorder phenotypes using data from genome-wide association studies (GWAS). Four eating disorder phenotypes (anorexia nervosa [AN], AN with binge-eating, AN without binge-eating, and a BN factor score), and eight substance-use-related phenotypes (drinks per week, alcohol use disorder [AUD], smoking initiation, current smoking, cigarettes per day, nicotine dependence, cannabis initiation, and cannabis use disorder) from eight studies were included. Significant genetic correlations were adjusted for variants associated with major depressive disorder (MDD). Total sample sizes per phenotype ranged from ~2,400 to ~537,000 individuals. We used linkage disequilibrium score regression to calculate single nucleotide polymorphism-based genetic correlations between eating disorder and substance-use-related phenotypes. Significant positive genetic associations emerged between AUD and AN (rg=0.18; false discovery rate q=0.0006), cannabis initiation and AN (rg=0.23; q<0.0001), and cannabis initiation and AN with binge-eating (rg=0.27; q=0.0016). Conversely, significant negative genetic correlations were observed between three non-diagnostic smoking phenotypes (smoking initiation, current smoking, and cigarettes per day) and AN without binge-eating (rgs=-0.19 to -0.23; qs<0.04). The genetic correlation between AUD and AN was no longer significant after co-varying for MDD loci. The patterns of association between eating disorder- and substance-use-related phenotypes highlights the potentially complex and substance-specific relationships between these behaviors.

Evidence regarding metabolic alterations associated with maternal antenatal depression (AD) is limited, and their role as potential biomarkers improving the prediction of AD and adverse child birth, neurodevelopmental, and mental health outcomes remains unexplored.

Objective . Depressive symptoms during pregnancy increase the risk for adverse outcomes in women and children. Lower vitamin D levels are suggested to be associated with higher depressive symptoms in nonpregnant populations. We studied if the level of or change in serum of 25‐hydroxyvitamin D (25(OH)D) concentration was associated with the levels of depressive symptoms during pregnancy. Methods . The participants of this prospective longitudinal study came from the Prediction and Prevention of Preeclampsia and Intrauterine Growth Restriction (PREDO) study. The analytic sample comprised 307 women (mean age = 32.5 (range 20.3–44.3)) who reported depressive symptoms concurrently with serum 25(OH)D measurements at a median of 13.0, 19.3, and 27.0 gestational weeks. Depressive symptoms were assessed using the Center for Epidemiologic Studies Depression Scale. Linear and mixed‐model regression analyses were used to study the associations. Results . The 25(OH)D levels were not associated with depressive symptoms cross‐sectionally ( p values > 0.58) or across the three assessment points during pregnancy ( B = −0.05; 95% CI, −0.12, 0.01; and p = 0.12). Yet, a higher increase in 25(OH)D during pregnancy was associated with lower levels of depressive symptoms ( B = −1.41; 95% CI, −2.75, −0.07; and p = 0.04) but not after adjusting for covariates ( p = 0.08). Conclusions . The 25(OH)D levels and depressive symptoms were not associated among pregnant women throughout the pregnancy. However, there is a need for randomized controlled trials to fully exclude the possibility of vitamin D supplementation in the prevention of depression during pregnancy.

Children who have a parent with a psychotic disorder present an increased risk of developing psychosis. It is unclear to date, however, what proportion of all psychosis cases in the population are captured by a familial high-risk for psychosis (FHR-P) approach. This is essential information for prevention research and health service planning, as it tells us the total proportion of psychosis cases that this high-risk approach would prevent if an effective intervention were developed. Through a prospective cohort study including all individuals born in Finland between January 1, 1987 and December 31, 1992, we examined the absolute risk and total proportion of psychosis cases captured by FHR-P and by a transdiagnostic familial risk approach (TDFR-P) based on parental inpatient hospitalization for any mental disorder. Outcomes of non-affective psychosis (ICD-10: F20-F29) and schizophrenia (ICD-10: F20) were identified in the index children up to December 31, 2016. Of the index children (N=368,937), 1.5% (N=5,544) met FHR-P criteria and 10.3% (N=38,040) met TDFR-P criteria. By the study endpoint, 1.9% (N=6,966) of the index children had been diagnosed with non-affective psychosis and 0.5% (N=1,846) with schizophrenia. In terms of sensitivity, of all non-affective psychosis cases in the index children, 5.2% (N=355) were captured by FHR-P and 20.6% (N=1,413) by TDFR-P approaches. The absolute risk of non-affective psychosis was 6.4% in those with FHR-P, and 3.7% in those with TDFR-P. There was notable variation in the sensitivity and total proportion of FHR-P and TDFR-P cases captured based on the age at which FHR-P/TDFR-P were determined. The absolute risk for psychosis, however, was relatively time invariant. These metrics are essential to inform intervention strategies for psychosis risk requiring pragmatic decision-making.

Background: Epigenetic processes, including DNA methylation (DNAm), are among the mechanisms allowing integration of genetic and environmental factors to shape cellular function. While many studies have investigated either environmental or genetic contributions to DNAm, few have assessed their integrated effects. We examined the relative contributions of prenatal environmental factors and genotype on DNA methylation in neonatal blood at variably methylated regions (VMRs), defined as consecutive CpGs showing the highest variability of DNAm in 4 independent cohorts (PREDO, DCHS, UCI, MoBa, N=2,934). Results: We used Akaike's information criterion to test which factors best explained variability of methylation in the cohort-specific VMRs: several prenatal environmental factors (E) including maternal demographic, psychosocial and metabolism related phenotypes, genotypes in cis (G), or their additive (G+E) or interaction (GxE) effects. G+E and GxE models consistently best explained variability in DNAm of VMRs across the cohorts, with G explaining the remaining sites best. VMRs best explained by G, GxE or G+E, as well as their associated functional genetic variants (predicted using deep learning algorithms), were located in distinct genomic regions, with different enrichments for transcription and enhancer marks. Genetic variants of not only G and G+E models, but also of variants in GxE models were significantly enriched in genome wide association studies (GWAS) for complex disorders. Conclusion: Genetic and environmental factors in combination best explain DNAm at VMRs. The CpGs best explained by G, G+E or GxE are functionally distinct. The enrichment of GxE variants in GWAS for complex disorders supports their importance for disease risk.