RC
Robert Culverhouse
Author with expertise in Genomic Studies and Association Analyses
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(67% Open Access)
Cited by:
2,265
h-index:
31
/
i10-index:
43
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Clinical classification schemes for predicting hemorrhage: Results from the National Registry of Atrial Fibrillation (NRAF)

Brian Gage et al.Mar 1, 2006
Although warfarin and other anticoagulants can prevent ischemic events, they can cause hemorrhage. Quantifying the rate of hemorrhage is crucial for determining the risks and net benefits of prescribing antithrombotic therapy. Our objective was to find a bleeding classification scheme that could quantify the risk of hemorrhage in elderly patients with atrial fibrillation.We combined bleeding risk factors from existing classification schemes into a new scheme, HEMORR2HAGES, and validated all bleeding classification schemes. We scored HEMORR2HAGES by adding 2 points for a prior bleed and 1 point for each of the other risk factors: hepatic or renal disease, ethanol abuse, malignancy, older (age > 75 years), reduced platelet count or function, hypertension (uncontrolled), anemia, genetic factors, excessive fall risk, and stroke. We used data from quality improvement organizations representing 7 states to assemble a registry of 3791 Medicare beneficiaries with atrial fibrillation.There were 162 hospital admissions with an International Classification of Diseases, Ninth Revision, Clinical Modification code for hemorrhage. With each additional point, the rate of bleeding per 100 patient-years of warfarin increased: 1.9 for 0, 2.5 for 1, 5.3 for 2, 8.4 for 3, 10.4 for 4, and 12.3 for > or =5 points. In patients prescribed warfarin, HEMORR2HAGES had greater predictive accuracy (c statistic 0.67) than other bleed prediction schemes (P < .001).Adaptations of existing classification schemes, especially a new bleeding risk scheme, HEMORR2HAGES, can quantify the risk of hemorrhage and aid in the management of antithrombotic therapy.
1

Transancestral GWAS of alcohol dependence reveals common genetic underpinnings with psychiatric disorders

Raymond Walters et al.Nov 19, 2018
Liability to alcohol dependence (AD) is heritable, but little is known about its complex polygenic architecture or its genetic relationship with other disorders. To discover loci associated with AD and characterize the relationship between AD and other psychiatric and behavioral outcomes, we carried out the largest genome-wide association study to date of DSM-IV-diagnosed AD. Genome-wide data on 14,904 individuals with AD and 37,944 controls from 28 case–control and family-based studies were meta-analyzed, stratified by genetic ancestry (European, n = 46,568; African, n = 6,280). Independent, genome-wide significant effects of different ADH1B variants were identified in European (rs1229984; P = 9.8 × 10–13) and African ancestries (rs2066702; P = 2.2 × 10–9). Significant genetic correlations were observed with 17 phenotypes, including schizophrenia, attention deficit–hyperactivity disorder, depression, and use of cigarettes and cannabis. The genetic underpinnings of AD only partially overlap with those for alcohol consumption, underscoring the genetic distinction between pathological and nonpathological drinking behaviors. Different functional variants in ADH1B (and elsewhere) in Europeans and Africans strongly affect risk for alcohol dependence. Dependence only partly genetically correlates with consumption, with strong correlations to other psychiatric disorders.
1
Citation577
0
Save
0

The CHRNA5-CHRNA3-CHRNB4 Nicotinic Receptor Subunit Gene Cluster Affects Risk for Nicotine Dependence in African-Americans and in European-Americans

Nancy Saccone et al.Aug 26, 2009
Abstract Genetic association studies have shown the importance of variants in the CHRNA5-CHRNA3-CHRNB4 cholinergic nicotinic receptor subunit gene cluster on chromosome 15q24-25.1 for the risk of nicotine dependence, smoking, and lung cancer in populations of European descent. We have carried out a detailed study of this region using dense genotyping in both European-Americans and African-Americans. We genotyped 75 known single nucleotide polymorphisms (SNPs) and one sequencing-discovered SNP in an African-American sample (N = 710) and in a European-American sample (N = 2,062). Cases were nicotine-dependent and controls were nondependent smokers. The nonsynonymous CHRNA5 SNP rs16969968 is the most significant SNP associated with nicotine dependence in the full sample of 2,772 subjects [P = 4.49 × 10−8; odds ratio (OR), 1.42; 95% confidence interval (CI), 1.25–1.61] as well as in African-Americans only (P = 0.015; OR, 2.04; 1.15–3.62) and in European-Americans only (P = 4.14 × 10−7; OR, 1.40; 1.23–1.59). Other SNPs that have been shown to affect the mRNA levels of CHRNA5 in European-Americans are associated with nicotine dependence in African-Americans but not in European-Americans. The CHRNA3 SNP rs578776, which has a low correlation with rs16969968, is associated with nicotine dependence in European-Americans but not in African-Americans. Less common SNPs (frequency ≤ 5%) are also associated with nicotine dependence. In summary, multiple variants in this gene cluster contribute to nicotine dependence risk, and some are also associated with functional effects on CHRNA5. The nonsynonymous SNP rs16969968, a known risk variant in populations of European-descent, is also significantly associated with risk in African-Americans. Additional SNPs contribute to risk in distinct ways in these two populations. [Cancer Res 2009;69(17):6848–56]
0
Citation257
0
Save
0

Trans-ancestral GWAS of alcohol dependence reveals common genetic underpinnings with psychiatric disorders

Raymond Walters et al.Mar 10, 2018
Abstract Liability to alcohol dependence (AD) is heritable, but little is known about its complex polygenic architecture or its genetic relationship with other disorders. To discover loci associated with AD and characterize the relationship between AD and other psychiatric and behavioral outcomes, we carried out the largest GWAS to date of DSM - IV diagnosed AD. Genome - wide data on 14,904 individuals with AD and 37,944 controls from 28 case / control and family - based studies were meta - analyzed, stratified by genetic ancestry (European, N = 46,568; African; N = 6,280). Independent, genome - wide significant effects of different ADH1B variants were identified in European (rs1229984; p = 9.8E - 13) and African ancestries (rs2066702; p = 2.2E - 9). Significant genetic correlations were observed with schizophrenia, ADHD, depression, and use of cigarettes and cannabis. There was only modest genetic correlation with alcohol consumption and inconsistent associations with problem drinking. The genetic underpinnings of AD only partially overlap with those for alcohol consumption, underscoring the genetic distinction between pathological and non - pathological drinking behaviors.
0
Citation20
0
Save
0

Shared Genetic Risk between Eating Disorder- and Substance-Use-Related Phenotypes: Evidence from Genome-Wide Association Studies

Melissa Munn‐Chernoff et al.Aug 23, 2019
Eating disorders and substance use disorders frequently co-occur. Twin studies reveal shared genetic variance between liabilities to eating disorders and substance use, with the strongest associations between symptoms of bulimia nervosa (BN) and problem alcohol use (genetic correlation [rg], twin-based=0.23-0.53). We estimated the genetic correlation between eating disorder and substance use and disorder phenotypes using data from genome-wide association studies (GWAS). Four eating disorder phenotypes (anorexia nervosa [AN], AN with binge-eating, AN without binge-eating, and a BN factor score), and eight substance-use-related phenotypes (drinks per week, alcohol use disorder [AUD], smoking initiation, current smoking, cigarettes per day, nicotine dependence, cannabis initiation, and cannabis use disorder) from eight studies were included. Significant genetic correlations were adjusted for variants associated with major depressive disorder (MDD). Total sample sizes per phenotype ranged from ~2,400 to ~537,000 individuals. We used linkage disequilibrium score regression to calculate single nucleotide polymorphism-based genetic correlations between eating disorder and substance-use-related phenotypes. Significant positive genetic associations emerged between AUD and AN (rg=0.18; false discovery rate q=0.0006), cannabis initiation and AN (rg=0.23; q<0.0001), and cannabis initiation and AN with binge-eating (rg=0.27; q=0.0016). Conversely, significant negative genetic correlations were observed between three non-diagnostic smoking phenotypes (smoking initiation, current smoking, and cigarettes per day) and AN without binge-eating (rgs=-0.19 to -0.23; qs<0.04). The genetic correlation between AUD and AN was no longer significant after co-varying for MDD loci. The patterns of association between eating disorder- and substance-use-related phenotypes highlights the potentially complex and substance-specific relationships between these behaviors.