The identification of the genetic basis of complex human diseases such as schizophrenia and diabetes has proven difficult. In their Perspective, Risch and Merikangas propose that we can best accomplish this goal by combining the power of the human genome project with association studies, a method for determining the basis of a genetic disease.

Objective.

 —To examine more closely the association between apolipoprotein E (APOE) genotype and Alzheimer disease (AD) by age and sex in populations of various ethnic and racial denominations. 

Data Sources.

 —Forty research teams contributed data onAPOEgenotype, sex, age at disease onset, and ethnic background for 5930 patients who met criteria for probable or definite AD and 8607 controls without dementia who were recruited from clinical, community, and brain bank sources. 

Main Outcome Measures.

 —Odds ratios (ORs) and 95% confidence intervals (Cls) for AD, adjusted for age and study and stratified by major ethnic group (Caucasian, African American, Hispanic, and Japanese) and source, were computed forAPOEgenotypes ∈2/∈2,∈2/∈3,∈2/∈4,∈3/∈4 and ∈4/∈4 relative to the ∈3/∈3 group. The influence of age and sex on the OR for each genotype was assessed using logistic regression procedures. 

Results.

 —Among Caucasian subjects from clinic- or autopsy-based studies, the risk of AD was significantly increased for people with genotypes ∈2/∈4 (OR=2.6, 95% Cl=1.6-4.0), ∈3/∈4 (OR=3.2, 95% Cl=2.8-3.8), and ∈4/∈4 (OR=14.9, 95% CI=10.8-20.6); whereas, the ORs were decreased for people with genotypes ∈2/∈2 (OR=0.6, 95% Cl=0.2-2.0) and ∈2/∈3 (OR=0.6, 95% Cl=0.5-0.8). TheAPOE∈4-AD association was weaker among African Americans and Hispanics, but there was significant heterogeneity in ORs among studies of African Americans (P<.03). TheAPOE∈4—AD association in Japanese subjects was stronger than in Caucasian subjects (∈3/∈4: OR=5.6, 95% Cl=3.9-8.0; ∈4/∈4: OR=33.1, 95% Cl=13.6-80.5). The ∈2/∈3 genotype appears equally protective across ethnic groups. We also found that among Caucasians,APOEgenotype distributions are similar in groups of patients with AD whose diagnoses were determined clinically or by autopsy. In addition, we found that theAPOE∈4 effect is evident at all ages between 40 and 90 years but diminishes after age 70 years and that the risk of AD associated with a given genotype varies with sex. 

Conclusions.

 —TheAPOE∈4 allele represents a major risk factor for AD in all ethnic groups studied, across all ages between 40 and 90 years, and in both men and women. The association betweenAPOE∈4 and AD in African Americans requires clarification, and the attenuated effect ofAPOE∈4 in Hispanics should be investigated further.

A family history of premature coronary heart disease has long been thought to be a risk factor for coronary heart disease. Using data from 26 years of follow-up of 21,004 Swedish twins born between 1886 and 1925, we investigated this issue further by assessing the risk of death from coronary heart disease in pairs of monozygotic and dizygotic twins.

A debate has recently arisen over the use of racial classification in medicine and biomedical research. In particular, with the completion of a rough draft of the human genome, some have suggested that racial classification may not be useful for biomedical studies, since it reflects “a fairly small number of genes that describe appearance”1 and “there is no basis in the genetic code for race.”2 In part on the basis of these conclusions, some have argued for the exclusion of racial and ethnic classification from biomedical research.3 In the United States, race and ethnic background have been used as cause . . .

Linkage mapping generally localizes disease genes to 1- to 2-cM regions of chromosomes. In theory, further refinement of location can be achieved by population-based studies of linkage disequilibrium between disease locus alleles and alleles at adjacent markers. One approach to localization, dubbed simple disequilibrium mapping, is to determine the relative location of the disease locus by plotting disequilibrium values against marker locations. We investigate the simple mapping properties of five disequilibrium measures, the correlation coefficient Δ, Lewontin'sD′, the robust formulation of the population attributable risk δ, Yule'sQ, and Kaplan and Weir's proportional differencedunder the assumption of initial complete disequilibrium between disease and marker loci. The studies indicate that δ is a superior measure for fine mapping because it is directly related to the recombination fraction between the disease and the marker loci, and it is invariant when disease haplotypes are sampled at a rate higher than their population frequencies, as in a case-control study.D′ yields results comparable to those of δ in many realistic settings. Of the remaining three measures,Q, Δ, andd,Qyields the best results. From simulations of short-term evolution, all measures show some sensitivity to marker allele frequencies; however, as predicted by analytic results,Q, Δ, anddexhibit the greatest sensitivity to variation in marker allele frequencies across loci.

Background. Improvements in screening techniques have made significant contributions to the early detection of breast cancer. Physicians thus face the task of providing appropriate screening schedules for their patients. One group for whom this is particularly important are those women with a family history of breast cancer. Methods. In this report, data from the Cancer and Steroid Hormone Study, a population-based, case-control study conducted by the Centers for Disease Control, are used to provide age-specific risk estimates of breast cancer for women with a family history of breast cancer. The data set includes 4730 patients with histologically confirmed breast cancer age 20–54 years and 4688 control subjects who were frequency matched to patients by geographic region and 5-year age intervals. The data set also includes family histories of breast cancer in mothers and sisters of both patients and control subjects. Results. Genetic models fit previously to these data by the authors have provided evidence for a rare autosomal dominant allele that results in increased susceptibility to breast cancer. In addition, these models predict that women who carry the allele are at greater risk of developing breast cancer at any age than are women who do not carry the allele. The increase in risk in carriers versus noncarriers does, however, decrease with increasing age. Based on the parameters of this model, age-specific risks for a woman with one or more relatives affected with breast cancer at various ages at onset are given. Conclusions. These tables can be used for the purpose of counseling women at high risk of breast cancer development, that is, women with a family history of breast cancer.

The ability to taste the substance phenylthiocarbamide (PTC) has been widely used for genetic and anthropological studies, but genetic studies have produced conflicting results and demonstrated complex inheritance for this trait. We have identified a small region on chromosome 7q that shows strong linkage disequilibrium between single-nucleotide polymorphism (SNP) markers and PTC taste sensitivity in unrelated subjects. This region contains a single gene that encodes a member of the TAS2R bitter taste receptor family. We identified three coding SNPs giving rise to five haplotypes in this gene worldwide. These haplotypes completely explain the bimodal distribution of PTC taste sensitivity, thus accounting for the inheritance of the classically defined taste insensitivity and for 55 to 85% of the variance in PTC sensitivity. Distinct phenotypes were associated with specific haplotypes, which demonstrates that this gene has a direct influence on PTC taste sensitivity and that sequence variants at different sites interact with each other within the encoded gene product.