AA
Alessandro Andreani
Author with expertise in Regulation of RNA Processing and Function
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(67% Open Access)
Cited by:
492
h-index:
12
/
i10-index:
14
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Use in routine clinical practice of two commercial blood tests for diagnosis of infection with Mycobacterium tuberculosis: a prospective study

Giovanni Ferrara et al.Apr 1, 2006
+11
R
M
G
Background Two commercial blood assays for the diagnosis of latent tuberculosis infection—T-SPOT.TB and QuantiFERON-TB Gold—have been separately compared with the tuberculin skin test. Our aim was to compare the efficacy of all three tests in the same population sample. Methods We did a prospective study in 393 consecutively enrolled patients who were tested simultaneously with T-SPOT.TB and QuantiFERON-TB Gold because of suspected latent or active tuberculosis. 318 patients also had results available for a tuberculin skin test. Findings Overall agreement with the skin test was similar (T-SPOT.TB κ=0·508, QuantiFERON-TB Gold κ=0·460), but fewer BCG-vaccinated individuals were identified as positive by the two blood assays than by the tuberculin skin test (p=0·003 for T-SPOT.TB and p<0.0001 for QuantiFERON-TB Gold). Indeterminate results were significantly more frequent with QuantiFERON-TB Gold (11%, 43 of 383) than with T-SPOT.TB (3%, 12 of 383; p<0·0001) and were associated with immunosuppressive treatments for both tests. Age younger than 5 years was significantly associated with indeterminate results with QuantiFERON-TB Gold (p=0.003), but not with T-SPOT.TB. Overall, T-SPOT.TB produced significantly more positive results (38%, n=144, vs 26%, n=100, with QuantiFERON-TB Gold; p<0·0001), and close contacts of patients with active tuberculosis were more likely to be positive with T-SPOT.TB than with QuantiFERON-TB Gold (p=0·0010). Interpretation T-SPOT.TB and QuantiFERON-TB Gold have higher specificity than the tuberculin skin test. Rates of indeterminate and positive results, however, differ between the blood tests, suggesting that they might provide different results in routine clinical practice.
18

Targeting the conserved active site of splicing machines with specific and selective small molecule modulators

Ilaria Silvestri et al.Jun 22, 2023
+3
A
J
I
Abstract The self-splicing group II introns are bacterial and organellar ancestors of the nuclear spliceosome and retro-transposable elements of pharmacological and biotechnological importance. Integrating enzymatic, crystallographic, and simulation studies, we demonstrate how these introns recognize small molecules through their conserved active site. These RNA-binding small molecules selectively inhibit the two steps of splicing by adopting distinctive poses at different stages of catalysis, and by preventing crucial active site conformational changes that are essential for splicing progression. Our data exemplify the enormous power of RNA binders to mechanistically probe vital cellular pathways. Most importantly, by proving that the evolutionarily-conserved RNA core of splicing machines can recognize small molecules specifically, our work puts solid bases for the rational design of splicing modulators not only against bacterial and organellar introns, but also against the human spliceosome, which is a validated drug target for the treatment of congenital diseases and cancers.
18
Citation1
0
Save
0

Targeting the conserved active site of splicing machines with specific and selective small molecule modulators

Ilaria Silvestri et al.Jun 19, 2024
+8
A
J
I
Abstract The self-splicing group II introns are bacterial and organellar ancestors of the nuclear spliceosome and retro-transposable elements of pharmacological and biotechnological importance. Integrating enzymatic, crystallographic, and simulation studies, we demonstrate how these introns recognize small molecules through their conserved active site. These RNA-binding small molecules selectively inhibit the two steps of splicing by adopting distinctive poses at different stages of catalysis, and by preventing crucial active site conformational changes that are essential for splicing progression. Our data exemplify the enormous power of RNA binders to mechanistically probe vital cellular pathways. Most importantly, by proving that the evolutionarily-conserved RNA core of splicing machines can recognize small molecules specifically, our work provides a solid basis for the rational design of splicing modulators not only against bacterial and organellar introns, but also against the human spliceosome, which is a validated drug target for the treatment of congenital diseases and cancers.
0
Citation1
0
Save