IR
Igor Rudan
Author with expertise in Genomic Studies and Association Analyses
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
54
(65% Open Access)
Cited by:
26,549
h-index:
152
/
i10-index:
531
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Global, regional, and national causes of child mortality: an updated systematic analysis for 2010 with time trends since 2000

Li Liu et al.May 10, 2012
Background Information about the distribution of causes of and time trends for child mortality should be periodically updated. We report the latest estimates of causes of child mortality in 2010 with time trends since 2000. Methods Updated total numbers of deaths in children aged 0–27 days and 1–59 months were applied to the corresponding country-specific distribution of deaths by cause. We did the following to derive the number of deaths in children aged 1–59 months: we used vital registration data for countries with an adequate vital registration system; we applied a multinomial logistic regression model to vital registration data for low-mortality countries without adequate vital registration; we used a similar multinomial logistic regression with verbal autopsy data for high-mortality countries; for India and China, we developed national models. We aggregated country results to generate regional and global estimates. Findings Of 7·6 million deaths in children younger than 5 years in 2010, 64·0% (4·879 million) were attributable to infectious causes and 40·3% (3·072 million) occurred in neonates. Preterm birth complications (14·1%; 1·078 million, uncertainty range [UR] 0·916–1·325), intrapartum-related complications (9·4%; 0·717 million, 0·610–0·876), and sepsis or meningitis (5·2%; 0·393 million, 0·252–0·552) were the leading causes of neonatal death. In older children, pneumonia (14·1%; 1·071 million, 0·977–1·176), diarrhoea (9·9%; 0·751 million, 0·538–1·031), and malaria (7·4%; 0·564 million, 0·432–0·709) claimed the most lives. Despite tremendous efforts to identify relevant data, the causes of only 2·7% (0·205 million) of deaths in children younger than 5 years were medically certified in 2010. Between 2000 and 2010, the global burden of deaths in children younger than 5 years decreased by 2 million, of which pneumonia, measles, and diarrhoea contributed the most to the overall reduction (0·451 million [0·339–0·547], 0·363 million [0·283–0·419], and 0·359 million [0·215–0·476], respectively). However, only tetanus, measles, AIDS, and malaria (in Africa) decreased at an annual rate sufficient to attain the Millennium Development Goal 4. Interpretation Child survival strategies should direct resources toward the leading causes of child mortality, with attention focusing on infectious and neonatal causes. More rapid decreases from 2010–15 will need accelerated reduction for the most common causes of death, notably pneumonia and preterm birth complications. Continued efforts to gather high-quality data and enhance estimation methods are essential for the improvement of future estimates. Funding The Bill & Melinda Gates Foundation.
0

Global, regional, and national causes of child mortality in 2008: a systematic analysis

Robert Black et al.May 12, 2010
Background Up-to-date information on the causes of child deaths is crucial to guide global efforts to improve child survival. We report new estimates for 2008 of the major causes of death in children younger than 5 years. Methods We used multicause proportionate mortality models to estimate deaths in neonates aged 0–27 days and children aged 1–59 months, and selected single-cause disease models and analysis of vital registration data when available to estimate causes of child deaths. New data from China and India permitted national data to be used for these countries instead of predictions based on global statistical models, as was done previously. We estimated proportional causes of death for 193 countries, and by application of these proportions to the country-specific mortality rates in children younger than 5 years and birth rates, the numbers of deaths by cause were calculated for countries, regions, and the world. Findings Of the estimated 8·795 million deaths in children younger than 5 years worldwide in 2008, infectious diseases caused 68% (5·970 million), with the largest percentages due to pneumonia (18%, 1·575 million, uncertainty range [UR] 1·046 million–1·874 million), diarrhoea (15%, 1·336 million, 0·822 million–2·004 million), and malaria (8%, 0·732 million, 0·601 million–0·851 million). 41% (3·575 million) of deaths occurred in neonates, and the most important single causes were preterm birth complications (12%, 1·033 million, UR 0·717 million–1·216 million), birth asphyxia (9%, 0·814 million, 0·563 million–0·997 million), sepsis (6%, 0·521 million, 0·356 million–0·735 million), and pneumonia (4%, 0·386 million, 0·264 million–0·545 million). 49% (4·294 million) of child deaths occurred in five countries: India, Nigeria, Democratic Republic of the Congo, Pakistan, and China. Interpretation These country-specific estimates of the major causes of child deaths should help to focus national programmes and donor assistance. Achievement of Millennium Development Goal 4, to reduce child mortality by two-thirds, is only possible if the high numbers of deaths are addressed by maternal, newborn, and child health interventions. Funding WHO, UNICEF, and Bill & Melinda Gates Foundation.
0

Global, regional, and national causes of child mortality in 2000–13, with projections to inform post-2015 priorities: an updated systematic analysis

Li Liu et al.Oct 1, 2014
Background Trend data for causes of child death are crucial to inform priorities for improving child survival by and beyond 2015. We report child mortality by cause estimates in 2000–13, and cause-specific mortality scenarios to 2030 and 2035. Methods We estimated the distributions of causes of child mortality separately for neonates and children aged 1–59 months. To generate cause-specific mortality fractions, we included new vital registration and verbal autopsy data. We used vital registration data in countries with adequate registration systems. We applied vital registration-based multicause models for countries with low under-5 mortality but inadequate vital registration, and updated verbal autopsy-based multicause models for high mortality countries. We used updated numbers of child deaths to derive numbers of deaths by causes. We applied two scenarios to derive cause-specific mortality in 2030 and 2035. Findings Of the 6·3 million children who died before age 5 years in 2013, 51·8% (3·257 million) died of infectious causes and 44% (2·761 million) died in the neonatal period. The three leading causes are preterm birth complications (0·965 million [15·4%, uncertainty range (UR) 9·8−24·5]; UR 0·615–1·537 million), pneumonia (0·935 million [14·9%, 13·0–16·8]; 0·817–1·057 million), and intrapartum-related complications (0·662 million [10·5%, 6·7–16·8]; 0·421–1·054 million). Reductions in pneumonia, diarrhoea, and measles collectively were responsible for half of the 3·6 million fewer deaths recorded in 2013 versus 2000. Causes with the slowest progress were congenital, preterm, neonatal sepsis, injury, and other causes. If present trends continue, 4·4 million children younger than 5 years will still die in 2030. Furthermore, sub-Saharan Africa will have 33% of the births and 60% of the deaths in 2030, compared with 25% and 50% in 2013, respectively. Interpretation Our projection results provide concrete examples of how the distribution of child causes of deaths could look in 15–20 years to inform priority setting in the post-2015 era. More evidence is needed about shifts in timing, causes, and places of under-5 deaths to inform child survival agendas by and beyond 2015, to end preventable child deaths in a generation, and to count and account for every newborn and every child. Funding Bill & Melinda Gates Foundation.
0

Genetic variants in novel pathways influence blood pressure and cardiovascular disease risk

Georg Ehret et al.Sep 9, 2011
Compared to other common complex diseases, it has proved remarkably difficult to establish the genetic basis of blood-pressure elevation. A multi-stage genome-wide association study involving 200,000 individuals of European descent provides some of the missing detail in the genetic picture. The study identified 16 relevant loci, of which only 6 contain genes previously known or suspected to regulate blood pressure. An association was found between hypertension, the thickness of the left ventricular wall, stroke and coronary artery disease, but not kidney disease or kidney function. Comparison with data from more than 75,000 people of East Asian, South Asian and African ancestries confirmed that many of the variants identified in European-ancestry subjects also influence blood pressure in other populations. Blood pressure is a heritable trait1 influenced by several biological pathways and responsive to environmental stimuli. Over one billion people worldwide have hypertension (≥140 mm Hg systolic blood pressure or ≥90 mm Hg diastolic blood pressure)2. Even small increments in blood pressure are associated with an increased risk of cardiovascular events3. This genome-wide association study of systolic and diastolic blood pressure, which used a multi-stage design in 200,000 individuals of European descent, identified sixteen novel loci: six of these loci contain genes previously known or suspected to regulate blood pressure (GUCY1A3–GUCY1B3, NPR3–C5orf23, ADM, FURIN–FES, GOSR2, GNAS–EDN3); the other ten provide new clues to blood pressure physiology. A genetic risk score based on 29 genome-wide significant variants was associated with hypertension, left ventricular wall thickness, stroke and coronary artery disease, but not kidney disease or kidney function. We also observed associations with blood pressure in East Asian, South Asian and African ancestry individuals. Our findings provide new insights into the genetics and biology of blood pressure, and suggest potential novel therapeutic pathways for cardiovascular disease prevention.
0
Citation1,948
0
Save
0

Epidemiology and etiology of childhood pneumonia

Igor Rudan et al.May 1, 2008
Childhood pneumonia is the leading single cause of mortality in children aged less than 5 years.The incidence in this age group is estimated to be 0.29 episodes per child-year in developing and 0.05 episodes per child-year in developed countries.This translates into about 156 million new episodes each year worldwide, of which 151 million episodes are in the developing world.Most cases occur in India (43 million), China (21 million) and Pakistan (10 million), with additional high numbers in Bangladesh, Indonesia and Nigeria (6 million each).Of all community cases, 7-13% are severe enough to be life-threatening and require hospitalization.Substantial evidence revealed that the leading risk factors contributing to pneumonia incidence are lack of exclusive breastfeeding, undernutrition, indoor air pollution, low birth weight, crowding and lack of measles immunization.Pneumonia is responsible for about 19% of all deaths in children aged less than 5 years, of which more than 70% take place in sub-Saharan Africa and south-east Asia.Although based on limited available evidence, recent studies have identified Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae and respiratory syncytial virus as the main pathogens associated with childhood pneumonia.
0
Citation1,421
0
Save
0

Ancient human genomes suggest three ancestral populations for present-day Europeans

Iosif Lazaridis et al.Sep 1, 2014
A sequencing study comparing ancient and contemporary genomes reveals that most present-day Europeans derive from at least three highly differentiated populations: west European hunter-gatherers, ancient north Eurasians (related to Upper Palaeolithic Siberians) and early European farmers of mainly Near Eastern origin. By sequencing and comparing the genomes of nine ancient Europeans that bridge the transition to agriculture in Europe between 8,000 and 7,000 years ago, David Reich and colleagues show that most present-day Europeans derive from at least three highly differentiated populations — west European hunter-gatherers, ancient north Eurasians (related to Upper Palaeolithic Siberians) and early European farmers of mainly Near Eastern origin. They further propose that early European farmers had about 44% ancestry from a 'basal Eurasian' population that split before the diversification of other non-African lineages. These results raise interesting new questions, for instance that of where and when the Near Eastern farmers mixed with European hunter-gatherers to produce the early European farmers. We sequenced the genomes of a ∼7,000-year-old farmer from Germany and eight ∼8,000-year-old hunter-gatherers from Luxembourg and Sweden. We analysed these and other ancient genomes1,2,3,4 with 2,345 contemporary humans to show that most present-day Europeans derive from at least three highly differentiated populations: west European hunter-gatherers, who contributed ancestry to all Europeans but not to Near Easterners; ancient north Eurasians related to Upper Palaeolithic Siberians3, who contributed to both Europeans and Near Easterners; and early European farmers, who were mainly of Near Eastern origin but also harboured west European hunter-gatherer related ancestry. We model these populations’ deep relationships and show that early European farmers had ∼44% ancestry from a ‘basal Eurasian’ population that split before the diversification of other non-African lineages.
0
Citation1,264
0
Save
0

Runs of Homozygosity in European Populations

Ruth McQuillan et al.Sep 1, 2008
Estimating individual genome-wide autozygosity is important both in the identification of recessive disease variants via homozygosity mapping and in the investigation of the effects of genome-wide homozygosity on traits of biomedical importance. Approaches have tended to involve either single-point estimates or rather complex multipoint methods of inferring individual autozygosity, all on the basis of limited marker data. Now, with the availability of high-density genome scans, a multipoint, observational method of estimating individual autozygosity is possible. Using data from a 300,000 SNP panel in 2618 individuals from two isolated and two more-cosmopolitan populations of European origin, we explore the potential of estimating individual autozygosity from data on runs of homozygosity (ROHs). Termed Froh, this is defined as the proportion of the autosomal genome in runs of homozygosity above a specified length. Mean Froh distinguishes clearly between subpopulations classified in terms of grandparental endogamy and population size. With the use of good pedigree data for one of the populations (Orkney), Froh was found to correlate strongly with the inbreeding coefficient estimated from pedigrees (r = 0.86). Using pedigrees to identify individuals with no shared maternal and paternal ancestors in five, and probably at least ten, generations, we show that ROHs measuring up to 4 Mb are common in demonstrably outbred individuals. Given the stochastic variation in ROH number, length, and location and the fact that ROHs are important whether ancient or recent in origin, approaches such as this will provide a more useful description of genomic autozygosity than has hitherto been possible. Estimating individual genome-wide autozygosity is important both in the identification of recessive disease variants via homozygosity mapping and in the investigation of the effects of genome-wide homozygosity on traits of biomedical importance. Approaches have tended to involve either single-point estimates or rather complex multipoint methods of inferring individual autozygosity, all on the basis of limited marker data. Now, with the availability of high-density genome scans, a multipoint, observational method of estimating individual autozygosity is possible. Using data from a 300,000 SNP panel in 2618 individuals from two isolated and two more-cosmopolitan populations of European origin, we explore the potential of estimating individual autozygosity from data on runs of homozygosity (ROHs). Termed Froh, this is defined as the proportion of the autosomal genome in runs of homozygosity above a specified length. Mean Froh distinguishes clearly between subpopulations classified in terms of grandparental endogamy and population size. With the use of good pedigree data for one of the populations (Orkney), Froh was found to correlate strongly with the inbreeding coefficient estimated from pedigrees (r = 0.86). Using pedigrees to identify individuals with no shared maternal and paternal ancestors in five, and probably at least ten, generations, we show that ROHs measuring up to 4 Mb are common in demonstrably outbred individuals. Given the stochastic variation in ROH number, length, and location and the fact that ROHs are important whether ancient or recent in origin, approaches such as this will provide a more useful description of genomic autozygosity than has hitherto been possible.
0
Citation1,024
0
Save
0

Loci influencing lipid levels and coronary heart disease risk in 16 European population cohorts

Yurii Aulchenko et al.Dec 7, 2008
Recent genome-wide association (GWA) studies of lipids have been conducted in samples ascertained for other phenotypes, particularly diabetes. Here we report the first GWA analysis of loci affecting total cholesterol (TC), low-density lipoprotein (LDL) cholesterol, high-density lipoprotein (HDL) cholesterol and triglycerides sampled randomly from 16 population-based cohorts and genotyped using mainly the Illumina HumanHap300-Duo platform. Our study included a total of 17,797-22,562 persons, aged 18-104 years and from geographic regions spanning from the Nordic countries to Southern Europe. We established 22 loci associated with serum lipid levels at a genome-wide significance level (P < 5 x 10(-8)), including 16 loci that were identified by previous GWA studies. The six newly identified loci in our cohort samples are ABCG5 (TC, P = 1.5 x 10(-11); LDL, P = 2.6 x 10(-10)), TMEM57 (TC, P = 5.4 x 10(-10)), CTCF-PRMT8 region (HDL, P = 8.3 x 10(-16)), DNAH11 (LDL, P = 6.1 x 10(-9)), FADS3-FADS2 (TC, P = 1.5 x 10(-10); LDL, P = 4.4 x 10(-13)) and MADD-FOLH1 region (HDL, P = 6 x 10(-11)). For three loci, effect sizes differed significantly by sex. Genetic risk scores based on lipid loci explain up to 4.8% of variation in lipids and were also associated with increased intima media thickness (P = 0.001) and coronary heart disease incidence (P = 0.04). The genetic risk score improves the screening of high-risk groups of dyslipidemia over classical risk factors.
0
Citation846
0
Save
0

Burden of Streptococcus pneumoniae and Haemophilus influenzae type b disease in children in the era of conjugate vaccines: global, regional, and national estimates for 2000–15

Brian Wahl et al.Jun 13, 2018
Pneumococcal conjugate vaccine (PCV) and Haemophilus influenzae type b (Hib) vaccine are now used in most countries. To monitor global and regional progress towards improving child health and to inform national policies for disease prevention and treatment, we prepared global, regional, and national disease burden estimates for these pathogens in children from 2000 to 2015.Using WHO and Maternal and Child Epidemiology Estimation collaboration country-specific estimates of pneumonia and meningitis mortality and pneumonia morbidity from 2000 to 2015, we applied pneumococcal and Hib cause-specific proportions to estimate pathogen-specific deaths and cases. Summary estimates of the proportion of pneumonia deaths and cases attributable to these pathogens were derived from four Hib vaccine and six PCV efficacy and effectiveness study values. The proportion of meningitis deaths due to each pathogen was derived from bacterial meningitis aetiology and adjusted pathogen-specific meningitis case-fatality data. Pneumococcal and Hib meningitis cases were inferred from modelled pathogen-specific meningitis deaths and literature-derived case-fatality estimates. Cases of pneumococcal and Hib syndromes other than pneumonia and meningitis were estimated using the ratio of pathogen-specific non-pneumonia, non-meningitis cases to pathogen-specific meningitis cases from the literature. We accounted for annual HIV infection prevalence, access to care, and vaccine use.We estimated that there were 294 000 pneumococcal deaths (uncertainty range [UR] 192 000-366 000) and 29 500 Hib deaths (18 400-40 700) in HIV-uninfected children aged 1-59 months in 2015. An additional 23 300 deaths (15 300-28 700) associated with pneumococcus and fewer than 1000 deaths associated Hib were estimated to have occurred in children infected with HIV. We estimate that pneumococcal deaths declined by 51% (7-74) and Hib deaths by 90% (78-96) from 2000 to 2015. Most children who died of pneumococcus (81%) and Hib (76%) presented with pneumonia. Less conservative assumptions result in pneumococcccal death estimates that could be as high as 515 000 deaths (302 000-609 000) in 2015. Approximately 50% of all pneumococcal deaths in 2015 occurred in four countries in Africa and Asia: India (68 700 deaths, UR 44 600-86 100), Nigeria (49 000 deaths, 32 400-59 000), the Democratic Republic of the Congo (14 500 deaths, 9300-18 700), and Pakistan (14 400 deaths, 9700-17 000]). India (15 600 deaths, 9800-21 500), Nigeria (3600 deaths, 2200-5100), China (3400 deaths, 2300-4600), and South Sudan (1000 deaths, 600-1400) had the greatest number of Hib deaths in 2015. We estimated 3·7 million episodes (UR 2·7 million-4·3 million) of severe pneumococcus and 340 000 episodes (196 000-669 000) of severe Hib globally in children in 2015.The widespread use of Hib vaccine and the recent introduction of PCV in countries with high child mortality is associated with reductions in Hib and pneumococcal cases and deaths. Uncertainties in the burden of pneumococcal disease are largely driven by the fraction of pneumonia deaths attributable to pneumococcus. Progress towards further reducing the global burden of Hib and pneumococcal disease burden will depend on the efforts of a few large countries in Africa and Asia.Bill & Melinda Gates Foundation.
Load More