Chronic kidney disease (CKD) is a significant public health problem, and recent genetic studies have identified common CKD susceptibility variants. The CKDGen consortium performed a meta-analysis of genome-wide association data in 67,093 individuals of European ancestry from 20 predominantly population-based studies in order to identify new susceptibility loci for reduced renal function as estimated by serum creatinine (eGFRcrea), serum cystatin c (eGFRcys) and CKD (eGFRcrea < 60 ml/min/1.73 m(2); n = 5,807 individuals with CKD (cases)). Follow-up of the 23 new genome-wide-significant loci (P < 5 x 10(-8)) in 22,982 replication samples identified 13 new loci affecting renal function and CKD (in or near LASS2, GCKR, ALMS1, TFDP2, DAB2, SLC34A1, VEGFA, PRKAG2, PIP5K1B, ATXN2, DACH1, UBE2Q2 and SLC7A9) and 7 loci suspected to affect creatinine production and secretion (CPS1, SLC22A2, TMEM60, WDR37, SLC6A13, WDR72 and BCAS3). These results further our understanding of the biologic mechanisms of kidney function by identifying loci that potentially influence nephrogenesis, podocyte function, angiogenesis, solute transport and metabolic functions of the kidney.

We sequenced genomes from a ~7,000 year old early farmer from Stuttgart in Germany, an ~8,000 year old hunter-gatherer from Luxembourg, and seven ~8,000 year old hunter-gatherers from southern Sweden. We analyzed these data together with other ancient genomes and 2,345 contemporary humans to show that the great majority of present-day Europeans derive from at least three highly differentiated populations: West European Hunter-Gatherers (WHG), who contributed ancestry to all Europeans but not to Near Easterners; Ancient North Eurasians (ANE), who were most closely related to Upper Paleolithic Siberians and contributed to both Europeans and Near Easterners; and Early European Farmers (EEF), who were mainly of Near Eastern origin but also harbored WHG-related ancestry. We model these populations' deep relationships and show that EEF had ~44% ancestry from a "Basal Eurasian" lineage that split prior to the diversification of all other non-African lineages.

Abstract Glycaemic traits are used to diagnose and monitor type 2 diabetes, and cardiometabolic health. To date, most genetic studies of glycaemic traits have focused on individuals of European ancestry. Here, we aggregated genome-wide association studies in up to 281,416 individuals without diabetes (30% non-European ancestry) with fasting glucose, 2h-glucose post-challenge, glycated haemoglobin, and fasting insulin data. Trans-ancestry and single-ancestry meta-analyses identified 242 loci (99 novel; P <5×10 -8 ), 80% with no significant evidence of between-ancestry heterogeneity. Analyses restricted to European ancestry individuals with equivalent sample size would have led to 24 fewer new loci. Compared to single-ancestry, equivalent sized trans-ancestry fine-mapping reduced the number of estimated variants in 99% credible sets by a median of 37.5%. Genomic feature, gene-expression and gene-set analyses revealed distinct biological signatures for each trait, highlighting different underlying biological pathways. Our results increase understanding of diabetes pathophysiology by use of trans-ancestry studies for improved power and resolution.

The main goal of this research was to determine whether there is a correlation between adherence to the Mediterranean diet (assessed by the Mediterranean Diet Serving Score (MDSS)) and parameters indicating thyroid gland activity, such as concentration of thyroid-stimulating hormone (TSH), thyroid hormones (free triiodothyronine (fT3), free thyroxine (fT4)), thyroglobulin (Tg), antibodies to thyroid proteins (thyroglobulin antibodies (TgAb) and thyroid peroxidase antibodies (TPOAb)), and calcitonin (CT) in plasma and serum samples. An additional objective was to investigate whether there are differences in the values of the MDSS among clinical groups (euthyroid individuals, euthyroid individuals with positive TgAb and/or TPOAb, and hypothyroid and hyperthyroid participants). This cross-sectional study included 4620 participants over 18 years of age from the islands of Korčula and Vis, and the mainland city of Split. The MDSS was assessed from a food frequency questionnaire (FFQ). MDSS values were significantly higher in females compared to males and showed a positive association with the age of the participants. There was no significant difference in the MDSS values among the examined clinical groups. In the group of subjects with euthyroidism, a significant positive association was found between fT3 and the MDSS, while in the group of subjects with subclinical hypothyroidism, a significant positive association was observed between the MDSS and both fT3 and fT4. CT levels were also positively associated with the MDSS. Considering the significant positive association of the MDSS and both fT3 and fT4 levels in patients with subclinical hypothyroidism, the results of this study could be used to create guidelines for selecting an appropriate, potentially protective diet for these patients.

High blood pressure is the foremost heritable global risk factor for cardiovascular disease. We report the largest genetic association study of blood pressure traits to date (systolic, diastolic, pulse pressure) in over one million people of European ancestry. We identify 535 novel blood pressure loci that not only offer new biological insights into blood pressure regulation but also reveal shared loci influencing lifestyle exposures. Our findings offer the potential for a precision medicine strategy for future cardiovascular disease prevention.

Background Numerous organs, including the thyroid gland, depend on vitamin D to function normally. Insufficient levels of serum 25-hydroxyvitamin D [25(OH)D] are seen as a potential factor contributing to the emergence of several thyroid disorders, however, the causal relationship remains unclear. Here we use a Mendelian randomization (MR) approach to investigate the causal effect of serum 25(OH)D concentration on the indicators of thyroid function. Methods We conducted a two-sample MR analysis utilizing summary data from the most extensive genome-wide association studies (GWAS) of serum 25(OH)D concentration (n = 443,734 and 417,580), thyroid-stimulating hormone (TSH, n = 271,040), free thyroxine (fT4, n = 119,120), free triiodothyronine (fT3, n = 59,061), total triiodothyronine (TT3, n = 15,829), as well as thyroid peroxidase antibody levels and positivity (TPOAb, n = 12,353 and n = 18,297), low TSH (n = 153,241), high TSH (n = 141,549), autoimmune hypothyroidism (n = 287,247) and autoimmune hyperthyroidism (n = 257,552). The primary analysis was conducted using the multiplicative random-effects inverse variance weighted (IVW) method. The weighted mode, weighted median, MR-Egger, MR-PRESSO, and Causal Analysis Using Summary Effect estimates (CAUSE) were used in the sensitivity analysis. Results The IVW, as well as MR Egger and CAUSE analysis, showed a suggestive causal effect of 25(OH)D concentration on high TSH. Each 1 SD increase in serum 25(OH)D concentration was associated with a 12% decrease in the risk of high TSH (p = 0.02). Additionally, in the MR Egger and CAUSE analysis, we found a suggestive causal effect of 25(OH)D concentration on autoimmune hypothyroidism. Specifically, each 1 SD increase in serum 25(OH)D concentration was associated with a 16.34% decrease in the risk of autoimmune hypothyroidism (p = 0.02). Conclusions Our results support a suggestive causal effect which was negative in direction across all methods used, meaning that higher genetically predicted vitamin D concentration possibly lowers the odds of having high TSH or autoimmune hypothyroidism. Other thyroid parameters were not causally influenced by vitamin D serum concentration.