DS
Dana Shulman
Author with expertise in Mitochondrial Dynamics and Reactive Oxygen Species Regulation
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(100% Open Access)
Cited by:
1
h-index:
2
/
i10-index:
2
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
4

Cerebrospinal fluid and blood profiles of transfer RNA fragments show age, sex and Parkinson’s disease-related changes

Iddo Paldor et al.Jul 2, 2022
+3
D
N
I
Abstract Transfer RNA fragments (tRFs) have recently been shown to be an important family of small regulatory RNAs with diverse functions. Recent reports have revealed modified tRF blood levels in a number of nervous system conditions including epilepsy, ischemic stroke and neurodegenerative diseases, but little is known about tRF levels in the cerebrospinal fluid (CSF). To address this issue, we studied age, sex and Parkinson’s disease (PD) distributions of tRFs in the CSF and blood data of PD patients and healthy controls from the NIH and the PPMI small RNA-seq datasets. The higher levels of long tRFs were found in the CSF than in the blood. Furthermore, the CSF showed pronounced age-associated declines of the level of 3’-tRFs and i-tRFs and more pronounced differences between the sexes. Blood showed moderate elevation of 3’-tFs levels with age. In addition, different distinct sets of tRFs segregated PD patients from controls in the CSF and in the blood. Finally, we found enrichment of tRFs predicted to target cholinergic mRNAs (Cholino-tRFs) in the mitochondrial originated tRFs, raising the possibility that the neurodegeneration-related mitochondrial impairment may lead to deregulation of cholinergic tone. Our findings suggest that CSF expressed tRFs are not a mirror of blood tRFs but rather potentially reflect the cerebral changes. Further, both CSF and blood present modified levels of tRFs in a sex-, age-and disease-related manner, calling for including this important subset of small RNA regulators to future studies.
1

Sex-specific declines in cholinergic-targeting tRNA fragments in the nucleus accumbens in Alzheimer’s disease

Dana Shulman et al.Feb 8, 2023
+8
S
D
D
Females with Alzheimer's disease (AD) suffer accelerated dementia and loss of cholinergic neurons compared to males, but the underlying mechanisms are unknown. Seeking causal contributors to both these phenomena, we pursued changes in tRNA fragments (tRFs) targeting cholinergic transcripts (CholinotRFs).We analyzed small RNA-sequencing data from the nucleus accumbens (NAc) brain region which is enriched in cholinergic neurons, compared to hypothalamic or cortical tissues from AD brains; and explored small RNA expression in neuronal cell lines undergoing cholinergic differentiation.NAc CholinotRFs of mitochondrial genome origin showed reduced levels that correlated with elevations in their predicted cholinergic-associated mRNA targets. Single cell RNA seq from AD temporal cortices showed altered sex-specific levels of cholinergic transcripts in diverse cell types; inversely, human-originated neuroblastoma cells under cholinergic differentiation presented sex-specific CholinotRF elevations.Our findings support CholinotRFs contributions to cholinergic regulation, predicting their involvement in AD sex-specific cholinergic loss and dementia.