SG
Shaorong Gao
Author with expertise in Epigenetic Modifications and Their Functional Implications
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
14
(64% Open Access)
Cited by:
2,520
h-index:
54
/
i10-index:
162
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
1

Dynamic nucleosome organization after fertilization reveals regulatory factors for mouse zygotic genome activation

Chenfei Wang et al.Mar 4, 2022
Abstract Chromatin remodeling is essential for epigenome reprogramming after fertilization. However, the underlying mechanisms of chromatin remodeling remain to be explored. Here, we investigated the dynamic changes in nucleosome occupancy and positioning in pronucleus-stage zygotes using ultra low-input MNase-seq. We observed distinct features of inheritance and reconstruction of nucleosome position in both paternal and maternal genomes. Genome-wide de novo nucleosome occupancy in the paternal genome was observed as early as 1 hour after the injection of sperm into ooplasm. The nucleosome positioning pattern was continually rebuilt to form nucleosome depletion regions (NDRs) at promoters and transcription factor (TF) binding sites with differential dynamics in paternal and maternal genomes. NDRs formed more quickly on the promoters of genes involved in zygotic genome activation (ZGA), and this formation is closely connected with histone acetylation, but not transcription elongation or DNA replication. Importantly, we found that NDR establishment on the binding motifs of specific TFs might be associated with their potential pioneer functions in ZGA. Further investigations suggested that the predicted factors MLX and RFX1 played important roles in regulating minor and major ZGA, respectively. Our data not only elucidate the nucleosome positioning dynamics in both male and female pronuclei following fertilization, but also provide an efficient method for identifying key transcription regulators during development.
1
Citation2
0
Save
1

Maternal Ezh1/2 deficiency in oocyte delays H3K27me2/3 restoration and impairs epiblast development responsible for embryonic sub-lethality in mouse

Yinan Zhao et al.Oct 28, 2021
Abstract Mammalian embryonic development is a complex process regulated by various epigenetic modifications. Recently, maternal histone H3 methylations were found to be inherited and reprogrammed in early embryos to regulate embryonic development. The enhancer of zest homolog 1 and 2 (Ezh1 and Ezh2) belong to the core components of Polycomb repressive complex 2 (PRC2) and are the histone methyltransferase of histone 3 lysine 27 (H3K27). How maternal Ezh1 and Ezh2 function on H3K27 methylation in in vivo preimplantation embryos and embryonic development are not clear. Here, we deleted Ezh1 or/and Ezh2 in growing oocytes using gene knockout mouse models, and found that H3K27me3 in oocytes was disappeared by loss of Ezh2 alone while H3K27me2 was absent upon deletion of both Ezh1 and Ezh2. The effects of Ezh1/2 were inherited in maternal knockout zygotes and early embryos, in which restoration of H3K27me3 was delayed until late blastocyte by loss of Ezh2 alone and H3K27me2 was reestablished until morulae by deletion of Ezh1 and Ezh2. However, the ablation of both Ezh1 and Ezh2 , but not single Ezh1 or Ezh2 , led to significantly decreased litter size due to growth retardation during post-implantation. Furthermore, maternal Ezh1/2 deficiency caused compromised H3K27me3 and pluripotent epiblast cells in late blastocyst, followed by defective development of epiblast. These results demonstrate that in oocytes, Ezh2 is indispensable for H3K27me3 while Ezh1 complements Ezh2 in H3K27me2. Also, maternal Ezh1/2-H3K27 methylation is inherited in descendant embryos and has a critical effect on fetus and placenta development. Thus, this work sheds light on maternal epigenetic modifications during embryonic development.
1
Citation1
0
Save
2

The dual role of N6-methyladenosine on mouse maternal RNAs and 2-cell specific RNAs revealed by ULI-MeRIP sequencing

You Wu et al.Dec 16, 2021
Abstract N 6 -methyladenosine (m 6 A) and its regulatory components play critical roles in various developmental processes in mammals( 1-5 ). However, the landscape and function of m 6 A in the maternal-to-zygotic transition (MZT) remain unclear due to limited materials. Here, by developing an ultralow-input MeRIP-seq method, we revealed the dynamics of the m 6 A RNA methylome during the MZT process in mice. We found that more than 1/3 maternal decay and 2/3 zygotic mRNAs were modified by m 6 A. Moreover, m 6 As are highly enriched in the RNA of transposable elements MTA and MERVL, which are highly expressed in oocytes and 2-cell embryos, respectively. Notably, maternal depletion of Kiaa1429 , a component of the m 6 A methyltransferase complex, leads to a reduced abundance of m 6 A-marked maternal RNAs, including both genes and MTA, in GV oocytes, indicating m 6 A-dependent regulation of RNA stability in oocytes. Interestingly, when the writers were depleted, some m 6 A-marked 2-cell specific RNAs, including Zscan4 and MERVL, appeared normal at the 2-cell stage but failed to be decayed at later stages, suggesting that m 6 A regulates the clearance of these transcripts. Together, our study uncovered that m 6 As function in context-specific manners during MZT, which ensures the transcriptome stability of oocytes and regulates the stage specificity of zygotic transcripts after fertilization. One Sentence Summary m 6 A RNA methylation stabilizes the maternal RNAs in mouse oocytes and degrades the 2-cell specific RNAs in the cleavage-stage embryos.
2
Citation1
0
Save
Load More