The marked increase in the incidence of infections due to antibiotic-resistant gram-negative bacilli in recent years is of great concern, as patients infected by those isolates might initially receive antibiotics that are inactive against the responsible pathogens. To evaluate the effect of inappropriate initial antimicrobial therapy on survival, a total of 286 patients with antibiotic-resistant gram-negative bacteremia, 61 patients with Escherichia coli bacteremia, 65 with Klebsiella pneumoniae bacteremia, 74 with Pseudomonas aeruginosa bacteremia, and 86 with Enterobacter bacteremia, were analyzed retrospectively. If a patient received at least one antimicrobial agent to which the causative microorganisms were susceptible within 24 h of blood culture collection, the initial antimicrobial therapy was considered to have been appropriate. High-risk sources of bacteremia were defined as the lung, peritoneum, or an unknown source. The main outcome measure was 30-day mortality. Of the 286 patients, 135 (47.2%) received appropriate initial empirical antimicrobial therapy, and the remaining 151 (52.8%) patients received inappropriate therapy. The adequately treated group had a 27.4% mortality rate, whereas the inadequately treated group had a 38.4% mortality rate (P = 0.049). Multivariate analysis showed that the significant independent risk factors of mortality were presentation with septic shock, a high-risk source of bacteremia, P. aeruginosa infection, and an increasing APACHE II score. In the subgroup of patients (n = 132) with a high-risk source of bacteremia, inappropriate initial antimicrobial therapy was independently associated with increased mortality (odds ratio, 3.64; 95% confidence interval, 1.13 to 11.72; P = 0.030). Our data suggest that inappropriate initial antimicrobial therapy is associated with adverse outcome in antibiotic-resistant gram-negative bacteremia, particularly in patients with a high-risk source of bacteremia.

Among the nosocomial pathogens, Pseudomonas aeruginosa is recognized as a major cause of morbidity and mortality. Data on 136 patients with P. aeruginosa bacteremia were retrospectively analyzed to evaluate risk factors for mortality. The median age of the patients was 55 years (range, 15-85 years), 78.7% of the cases were hospital-acquired, and the 30-day mortality rate was 39% (53 of 136 patients). Multivariate analysis demonstrated that risk factors for mortality included severe sepsis, pneumonia, delay in starting effective antimicrobial therapy, and an increasing APACHE II score (all P values <.05). In 123 of the 136 patients (excluding 13 patients treated with inadequate definitive antibiotics), 30-day mortality was 27.7% (13 of 47 patients) in the group of patients who received initially effective empirical antimicrobial therapy, and 43.4% (33 of 76) in the group of patients who received delayed effective antimicrobial therapy (P=.079). There was a trend toward higher mortality as the length of delay increased. Delay in starting effective antimicrobial therapy for P. aeruginosa bacteremia tended to be associated with higher mortality.

Recently, several plasmid-mediated quinolone resistance (PMQR) genes conferring low levels of quinolone resistance have been discovered. To evaluate the temporal change in the prevalence of PMQR genes over a decade in a tertiary hospital in the Republic of Korea, we selected every fifth isolate of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae and every third isolate of Enterobacter cloacae between 1998 and 2001 and between 2005 and 2006 from a collection of blood isolates. Six PMQR genes [qnrA, qnrB, qnrC, qnrS, aac(6')-Ib-cr, and qepA] were screened by multiplex PCR and then confirmed by direct sequencing, and the aac(6')-Ib-positive PCR products were digested with BtsCI to identify the aac(6')-Ib-cr variant. Of 461 isolates, 37 (8%) had one of the six PMQR genes; 13 (5%) of 261 E. coli strains, 13 (10%) of 135 K. pneumoniae strains, and 11 (17%) of 65 E. cloacae strains. qnrB was the most common PMQR gene and was found as early as 1998, whereas qnrS, aac(6')-Ib-cr, and qepA emerged after 2000. None of the isolates carried qnrA or qnrC. Ciprofloxacin resistance increased over time (P < 0.001), and the overall prevalence of PMQR genes tended to increase (P = 0.20). PMQR-positive isolates had significantly higher ciprofloxacin resistance and multidrug resistance rates (P = 0.005 and P < 0.001, respectively). The increasing frequency of ciprofloxacin resistance in Enterobacteriaceae was associated with an increasing prevalence of PMQR genes, and this change involved an increase in the diversity of the PMQR genes and also an increase in the prevalence of the mutations in gyrA, parC, or both in PMQR-positive strains but not PMQR-negative strains.

ABSTRACT Acquired somatic mutations in hematopoietic stem and progenitor cells (clonal hematopoiesis or CH) are associated with advanced age, increased risk of cardiovascular and malignant diseases, and decreased overall survival. 1–4 These adverse sequelae may be mediated by altered inflammatory profiles observed in patients with CH. 2,5,6 A pro-inflammatory immunologic profile is also associated with worse outcomes of certain infections, including SARS-CoV-2 and its associated disease Covid-19. 7,8 Whether CH predisposes to severe Covid-19 or other infections is unknown. Among 515 individuals with Covid-19 from Memorial Sloan Kettering (MSK) and the Korean Clonal Hematopoiesis (KoCH) consortia, we found that CH was associated with severe Covid-19 outcomes (OR=1.9, 95%=1.2-2.9, p=0.01). We further explored the relationship between CH and risk of other infections in 14,211 solid tumor patients at MSK. CH was significantly associated with risk of Clostridium Difficile (HR=2.0, 95% CI: 1.2-3.3, p=6×10 −3 ) and Streptococcus/Enterococcus infections (HR=1.5, 95% CI=1.1-2.1, p=5×10 −3 ). These findings suggest a relationship between CH and risk of severe infections that warrants further investigation.

Abstract In six of seven severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) patients, V H clonotypes, encoded by either immunoglobin heavy variable (IGHV)3-53 or IGHV3-66 and immunoglobin heavy joining (IGHJ)6, were identified in IgG 1 , IgA 1 , and IgA 2 subtypes, with minimal mutations, and could be paired with diverse light chains, resulting in binding to the SARS-CoV-2 receptor-binding domain (RBD). Because most human antibodies against the RBD neutralized the virus by inhibiting host cell entry, we selected one of these clonotypes and demonstrated that it could potently inhibit viral replication. Interestingly, these V H clonotypes pre-existed in six of 10 healthy individuals, predominantly as IgM isotypes, which could explain the expeditious and stereotypic development of these clonotypes among SARS-CoV-2 patients.

Abstract Identifying additional risk factors for COVID-19 severity in numerous previously healthy patients without canonical clinical risk factors remains challenging. In this study, we investigate whether clonal hematopoiesis of indeterminate potential (CHIP), a common aging-related process that predisposes various inflammatory responses, may exert COVID-19 severity. We examine the clinical impact of CHIP in 143 laboratory-confirmed COVID-19 patients. Both stratified analyses and logistic regression including the interaction between canonical risk factors and CHIP show that CHIP is an independent risk factor for severe COVID-19, especially in previously healthy patients. Analyses of 60,310 single-cell immune transcriptome profiles identify distinct immunological signatures for CHIP (+) severe COVID-19 patients, particularly in classical monocytes, with a marked increase in pro-inflammatory cytokine responses and potent IFN-γ mediated hyperinflammation signature. We further demonstrate that the enhanced expression of CHIP (+) specific IFN-γ response genes is attributed to the CHIP mutation-dependent epigenetic reprogramming of poised or bivalent cis -regulatory elements. Our results highlight a unique immunopathogenic mechanism of CHIP in the progression of severe COVID-19, which could be extended to elucidate how CHIP contributes to a variety of human infectious diseases.

Evaluation of hospital-specific antimicrobial use is necessary for successful national antimicrobial stewardship. This study aimed to identify antimicrobial use in long-term care hospitals (LCHs) in Korea.

Post-mastectomy radiotherapy plays a crucial role in breast cancer treatment but can lead to an inflammatory response causing soft tissue damage, particularly radiation-induced capsular contracture (RICC), impacting breast reconstruction outcomes. Adipose-derived stem cells (ADSCs), known for their regenerative potential via paracrine capacity, exhibit inherent radiotolerance. The influence of tumor necrosis factor-alpha (TNF-α) on ADSCs has been reported to enhance the paracrine effect of ADSCs, promoting wound healing by modulating inflammatory responses. This study investigates the potential of TNF-α-treated human ADSCs (T-hASCs) on silicone implants to alleviate RICC, hypothesizing to enhance suppressive effects on RICC by modulating inflammatory responses in a radiation-exposed environment. In vitro, T-hASCs were cultured on various surfaces to assess viability after exposure to radiation up to 20 Gy. In vivo, T-hASC and non-TNF-α-treated hASC (C-hASCs)-coated membranes were implanted in mice before radiation exposure, and an evaluation of the RICC mitigation took place 4 and 8 weeks after implantation. In addition, the growth factors released from T-hASCs were assessed. In vitro, hASCs displayed significant radiotolerance, maintaining consistent viability after exposure to 10 Gy. TNF-α treatment further enhanced radiation tolerance, as evidenced by significantly higher viability than C-hASCs at 20 Gy. In vivo, T-hASC-coated implants effectively suppressed RICC, reducing capsule thickness. T-hASCs exhibited remarkable modulation of the inflammatory response, suppressing M1 macrophage polarization while enhancing M2 polarization. The elevated secretion of vascular endothelial growth factor from T-hASCs is believed to induce macrophage polarization, potentially reducing RICC. This study establishes T-hASCs as a promising strategy for ameliorating the adverse effects experienced by breast reconstruction patients after mastectomy and radiation therapy. The observed radiotolerance, anti-fibrotic effects, and immune modulation suggest the possibility of enhancing patient outcomes and quality of life. Further research and clinical trials are warranted for broader clinical uses.