A total of 2,618,862 participants reported their potential symptoms of COVID-19 on a smartphone-based app. Among the 18,401 who had undergone a SARS-CoV-2 test, the proportion of participants who reported loss of smell and taste was higher in those with a positive test result (4,668 of 7,178 individuals; 65.03%) than in those with a negative test result (2,436 of 11,223 participants; 21.71%) (odds ratio = 6.74; 95% confidence interval = 6.31–7.21). A model combining symptoms to predict probable infection was applied to the data from all app users who reported symptoms (805,753) and predicted that 140,312 (17.42%) participants are likely to have COVID-19. Analysis of data from a smartphone-based app designed for large-scale tracking of potential COVID-19 symptoms, used by over 2.5 million participants in the United Kingdom and United States, shows that loss of taste and smell sensations is predictive of potential SARS-CoV-2 infection.

Mobile symptom tracking The rapidity with which severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) spreads through a population is defying attempts at tracking it, and quantitative polymerase chain reaction testing so far has been too slow for real-time epidemiology. Taking advantage of existing longitudinal health care and research patient cohorts, Drew et al. pushed software updates to participants to encourage reporting of potential coronavirus disease 2019 (COVID-19) symptoms. The authors recruited about 2 million users (including health care workers) to the COVID Symptom Study (previously known as the COVID Symptom Tracker) from across the United Kingdom and the United States. The prevalence of combinations of symptoms (three or more), including fatigue and cough, followed by diarrhea, fever, and/or anosmia, was predictive of a positive test verification for SARS-CoV-2. As exemplified by data from Wales, United Kingdom, mathematical modeling predicted geographical hotspots of incidence 5 to 7 days in advance of official public health reports. Science , this issue p. 1362

Some studies have shown that the incidence of type 2 diabetes increases after a diagnosis of COVID-19, although the evidence is not conclusive. However, the effects of the COVID-19 vaccine on this association, or the effect on other diabetes subtypes, are not clear. We aimed to investigate the association between COVID-19 and incidence of type 2, type 1, gestational and non-specific diabetes, and the effect of COVID- 19 vaccination, up to 52 weeks after diagnosis.

OBJECTIVES: To conduct a genome-wide association study (GWAS) meta-analysis of chronic back pain (CBP). METHODS: Adults of European ancestry were included from 16 cohorts in Europe and North America. CBP cases were defined as those reporting back pain present for >3-6 months; non-cases were included as comparisons ('controls'). Each cohort conducted genotyping using commercially available arrays followed by imputation. GWAS used logistic regression models with additive genetic effects, adjusting for age, sex, study-specific covariates, and population substructure. The threshold for genome-wide significance in the fixed-effect inverse-variance weighted meta-analysis was p<5x10-8. Suggestive (p<5x10-7) and genome-wide significant (p<5x10-8) variants were carried forward for replication or further investigation in an independent sample. RESULTS: The discovery sample was comprised of 158,025 individuals, including 29,531 CBP cases. A genome-wide significant association was found for the intronic variant rs12310519 in SOX5 (OR 1.08, p=7.2x10-10). This was subsequently replicated in an independent sample of 283,752 subjects, including 50,915 cases (OR 1.06, p=5.3x10-11), and exceeded genome-wide significance in joint meta-analysis (OR=1.07, p=4.5x10-19). We found suggestive associations at three other loci in the discovery sample, two of which exceeded genome-wide significance in joint meta-analysis: an intergenic variant, rs7833174, located between CCDC26 and GSDMC (OR 1.05, p=4.4x10-13), and an intronic variant, rs4384683, in DCC (OR 0.97, p=2.4x10-10). DISCUSSION: In this first reported meta-analysis of GWAS for CBP, we identified and replicated a genetic locus associated with CBP (SOX5). We also identified 2 other loci that reached genome-wide significance in a 2-stage joint meta-analysis (CCDC26/GSDMC and DCC).

Age-related hearing impairment (ARHI) is the most common sensory impairment in the aging population; a third of individuals are affected by disabling hearing loss by the age of 65. ARHI is a multifactorial condition caused by both genetic and environmental factors, with estimates of heritability between 35% and 55%. The genetic risk factors and underlying biological pathology of ARHI are largely unknown, meaning that targets for new therapies remain elusive. We performed genome-wide association studies (GWAS) for two self-reported hearing phenotypes, hearing difficulty (HDiff) and hearing aid use (HAid), using over 250,000 UK Biobank volunteers aged between 40-69 years. We identified 44 independent genome-wide significant loci (P<5E-08), 33 of which have not previously been associated with any form of hearing loss. Gene sets from these loci are enriched in auditory processes such as synaptic activities, nervous system processes, inner ear morphology and cognition. Immunohistochemistry for protein localisation in adult mouse cochlea indicate metabolic, sensory and neuronal functions for NID2, CLRN2 and ARHGEF28 identified in the GWAS. These results provide new insight into the genetic landscape underlying susceptibility to ARHI.

Background The association between lumbar intervertebral disc degeneration (LDD) and low back pain (LBP) is modest. We have recently shown that genetic propensity to pain is an effect modifier of the LDD-LBP relationship when LDD is defined as a summary score of LDD (LSUM), suggesting the association may be driven by individuals with the greatest genetic predisposition to pain. This study examined the association between individual spine magnetic resonance imaging (MRI)-determined LDD features and LBP in subgroups defined by genetic predisposition to pain. Method We developed a polygenic risk score (PRS) for “genetic propensity to pain” defined as the number of non-back pain locations (head, face, neck/shoulder, stomach/abdomen, hip, and knee) with duration ≥3 months in 377,538 UK Biobank participants of European ancestry. This PRS was used to stratify TwinsUK MRI samples (n=645) into four strata of genetic propensity to pain. We examined the association between LBP and MRI features of lumbar disc height, disc signal intensity, disc bulge, and osteophytes with adjustments for age, sex, PRS strata, interaction terms for each MRI feature x PRS strata, and twin status. Results We found significant effect modification of the LDD-LBP relationship by genetic propensity to pain for the lumbar MRI features of disc height (p=0.03 for the interaction term with highest quartile of genetically-predicted propensity to pain) and disc signal intensity (p=0.001), but not for disc bulge and osteophytes. Conclusion Genetic propensity to pain modifies the association between individual LDD features and LBP and should be considered in LBP clinical studies. Conflicts of interest No conflicts of interest Sources of funding No funding obtained Acknowledgement UKBB data were obtained under the project #18219 This paper is submitted to the Spine journal and is under review.

Objective The chronic pain syndromes (CPS) include syndromes such as chronic widespread pain (CWP), dry eye disease (DED) and irritable bowel syndrome (IBS). Highly prevalent and lacking pathognomonic biomarkers, the CPS are known to cluster in individuals in part due to their genetic overlap, but patient diagnosis can be difficult. The success of quantitative sensory testing (QST) and inflammatory biomarkers as phenotyping tools in conditions such as painful neuropathies warrant their investigation in CPS. We aimed to examine whether individual QST modalities and candidate inflammatory markers were associated with CWP, DED or IBS in a large, highly phenotyped population sample. Design Cross-sectional study. Setting Community-dwelling cohort. Participants Twins from the TwinsUK cohort Primary and secondary outcome measures We compared 10 QST modalities, measured in participants with and without a CWP diagnosis between 2007 and 2012. We investigated whether inflammatory markers measured by Olink were associated with CWP, including interleukin-6 (IL-6), IL-8, IL-10, monocyte chemoattractant protein-1 and tumour necrosis factor. All analyses were repeated in DED and IBS with correction for multiple testing. Results In N=3022 twins (95.8% women), no association was identified between individual QST modalities and CPS diagnoses (CWP, DED and IBS). Analyses of candidate inflammatory marker levels and CPS diagnoses in n=1368 twins also failed to meet statistical significance. Conclusion Our findings in a large population cohort suggest a lack of true association between singular QST modalities or candidate inflammatory markers and CPS.

Background: Common types of musculoskeletal conditions include pain in the neck and shoulder areas. This study seeks to identify the genetic variants associated with neck or shoulder pain based on a genome-wide association approach using 203,309 subjects from the UK Biobank cohort and look for replication evidence from the Generation Scotland: Scottish Family Health Study (GS:SFHS) and TwinsUK. Methods: Cases in the UK Biobank were determined by a question which asked the participants if they had experienced pain in the neck or shoulder in the previous month influencing daily activities. Controls were the UK Biobank participants who reported no pain anywhere in the last month. A genome-wide association study was performed adjusting for age, sex, BMI and 9 population principal components. Significant and independent genetic variants were then sent to GS:SFHS and TwinsUK for replication. Results: We identified 3 genetic loci that were associated with neck or shoulder pain in the UK Biobank samples. The most significant locus was in an intergenic region in chromosome 17, rs12453010, having P = 1.66 x 10-11. The second most significant locus was located in the FOXP2 gene in chromosome 7 with P = 2.38 x 10-10 for rs34291892. The third locus was located in the LINC01572 gene in chromosome 16 with P = 4.50 x 10-8 for rs62053992. In the replication stage, among 4 significant and independent genetic variants, rs2049604 in the FOXP2 gene and rs62053992 in the LINC01572 gene were weakly replicated in GS:SFHS (P = 0.024 and P = 0.020, respectively). None of the single nucleotide polymorphisms (SNPs) were replicated in the TwinsUK cohort (P > 0.05). Conclusions: We have identified 3 loci associated with neck or shoulder pain in the UK Biobank cohort, two of which were weakly supported in a replication cohort. Further evidence is needed to confirm their roles in neck or shoulder pain. Key words: neck pain, shoulder pain, GWAS, genetics, FOXP2, UK Biobank

The relationship between rheumatoid arthritis (RA) and early onset atherosclerosis is well depicted, each with an important inflammatory component. Glycoprotein acetyls (GlycA), a novel biomarker of inflammation, may play a role in the manifestation of these two inflammatory conditions. The present study examined a potential mediating role of GlycA within the RA–atherosclerosis relationship to determine whether it accounts for the excess risk of cardiovascular disease over that posed by lipid risk factors. The UK Biobank dataset was acquired to establish associations among RA, atherosclerosis, GlycA, and major lipid factors: total cholesterol (TC), high- and low-density lipoprotein (HDL, LDL) cholesterol, and triglycerides (TGs). Genome-wide association study summary statistics were collected from various resources to perform genetic analyses. Causality among variables was tested using Mendelian Randomization (MR) analysis. Genes of interest were identified using colocalization analysis and gene enrichment analysis. MR results appeared to indicate that the genetic relationship between GlycA and RA and also between RA and atherosclerosis was explained by horizontal pleiotropy (p-value = 0.001 and <0.001, respectively), while GlycA may causally predict atherosclerosis (p-value = 0.017). Colocalization analysis revealed several functionally relevant genes shared between GlycA and all the variables assessed. Two loci were apparent in all relationships tested and included the HLA region as well as SLC22A1. GlycA appears to mediate the RA–atherosclerosis relationship through several possible pathways. GlycA, although pleiotropically related to RA, appears to causally predict atherosclerosis. Thus, GlycA is suggested as a significant factor in the etiology of atherosclerosis development in RA.