DS
Daniel Swerdlow
Author with expertise in Genomic Studies and Association Analyses
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
4
(50% Open Access)
Cited by:
603
h-index:
28
/
i10-index:
36
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

PCSK9 genetic variants and risk of type 2 diabetes: a mendelian randomisation study

Amand Schmidt et al.Nov 28, 2016
Statin treatment and variants in the gene encoding HMG-CoA reductase are associated with reductions in both the concentration of LDL cholesterol and the risk of coronary heart disease, but also with modest hyperglycaemia, increased bodyweight, and modestly increased risk of type 2 diabetes, which in no way offsets their substantial benefits. We sought to investigate the associations of LDL cholesterol-lowering PCSK9 variants with type 2 diabetes and related biomarkers to gauge the likely effects of PCSK9 inhibitors on diabetes risk.In this mendelian randomisation study, we used data from cohort studies, randomised controlled trials, case control studies, and genetic consortia to estimate associations of PCSK9 genetic variants with LDL cholesterol, fasting blood glucose, HbA1c, fasting insulin, bodyweight, waist-to-hip ratio, BMI, and risk of type 2 diabetes, using a standardised analysis plan, meta-analyses, and weighted gene-centric scores.Data were available for more than 550 000 individuals and 51 623 cases of type 2 diabetes. Combined analyses of four independent PCSK9 variants (rs11583680, rs11591147, rs2479409, and rs11206510) scaled to 1 mmol/L lower LDL cholesterol showed associations with increased fasting glucose (0·09 mmol/L, 95% CI 0·02 to 0·15), bodyweight (1·03 kg, 0·24 to 1·82), waist-to-hip ratio (0·006, 0·003 to 0·010), and an odds ratio for type diabetes of 1·29 (1·11 to 1·50). Based on the collected data, we did not identify associations with HbA1c (0·03%, -0·01 to 0·08), fasting insulin (0·00%, -0·06 to 0·07), and BMI (0·11 kg/m2, -0·09 to 0·30).PCSK9 variants associated with lower LDL cholesterol were also associated with circulating higher fasting glucose concentration, bodyweight, and waist-to-hip ratio, and an increased risk of type 2 diabetes. In trials of PCSK9 inhibitor drugs, investigators should carefully assess these safety outcomes and quantify the risks and benefits of PCSK9 inhibitor treatment, as was previously done for statins.British Heart Foundation, and University College London Hospitals NHS Foundation Trust (UCLH) National Institute for Health Research (NIHR) Biomedical Research Centre.
0
Citation337
0
Save
0

Association of Lipid Fractions With Risks for Coronary Artery Disease and Diabetes

Jon White et al.Aug 3, 2016

Importance

 Low-density lipoprotein cholesterol (LDL-C) is causally related to coronary artery disease (CAD), but the relevance of high-density lipoprotein cholesterol (HDL-C) and triglycerides (TGs) is uncertain. Lowering of LDL-C levels by statin therapy modestly increases the risk of type 2 diabetes, but it is unknown whether this effect is specific to statins. 

Objective

 To investigate the associations of 3 routinely measured lipid fractions with CAD and diabetes through mendelian randomization (MR) using conventional MR and making use of newer approaches, such as multivariate MR and MR-Egger, that address the pleiotropy of genetic instruments where relevant. 

Design, Setting, and Participants

 Published data from genome-wide association studies were used to construct genetic instruments and then applied to investigate associations between lipid fractions and the risk of CAD and diabetes using MR approaches that took into account pleiotropy of genetic instruments. The study was conducted from March 12 to December 31, 2015. 

Main Outcomes and Measures

 Coronary artery disease and diabetes. 

Results

 Genetic instruments composed of 130 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) were used for LDL-C (explaining 7.9% of its variance), 140 SNPs for HDL-C (6.6% of variance), and 140 SNPs for TGs (5.9% of variance). A 1-SD genetically instrumented elevation in LDL-C levels (equivalent to 38 mg/dL) and TG levels (equivalent to 89 mg/dL) was associated with higher CAD risk; odds ratios (ORs) were 1.68 (95% CI, 1.51-1.87) for LDL-C and 1.28 (95% CI, 1.13-1.45) for TGs. The corresponding OR for HDL-C (equivalent to a 16-mg/dL increase) was 0.95 (95% CI, 0.85-1.06). All 3 lipid traits were associated with a lower risk of type 2 diabetes. The ORs were 0.79 (95% CI, 0.71-0.88) for LDL-C and 0.83 (95% CI, 0.76-0.90) for HDL-C per 1-SD elevation. For TG, the MR estimates for diabetes were inconsistent, with MR-Egger giving an OR of 0.83 (95%CI, 0.72-0.95) per 1-SD elevation. 

Conclusions and Relevance

 Routinely measured lipid fractions exhibit contrasting associations with the risk of CAD and diabetes. Increased LDL-C, HDL-C, and possibly TG levels are associated with a lower risk of diabetes. This information will be relevant to the design of clinical trials of lipid-modifying agents, which should carefully monitor participants for dysglycemia and the incidence of diabetes.
0
Citation266
0
Save
0

Genome-wide association study provides new insights into the genetic architecture and pathogenesis of heart failure

Sonia Shah et al.Jul 10, 2019
Heart failure (HF) is a leading cause of morbidity and mortality worldwide. A small proportion of HF cases are attributable to monogenic cardiomyopathies and existing genome-wide association studies (GWAS) have yielded only limited insights, leaving the observed heritability of HF largely unexplained. We report the largest GWAS meta-analysis of HF to-date, comprising 47,309 cases and 930,014 controls. We identify 12 independent associations with HF at 11 genomic loci, all of which demonstrate one or more associations with coronary artery disease (CAD), atrial fibrillation, or reduced left ventricular function suggesting shared genetic aetiology. Expression quantitative trait analysis of non-CAD-associated loci implicate genes involved in cardiac development (MYOZ1, SYNPO2L), protein homeostasis (BAG3), and cellular senescence (CDKN1A). Using Mendelian randomisation analysis we provide new evidence supporting previously equivocal causal roles for several HF risk factors identified in observational studies, and demonstrate CAD-independent effects for atrial fibrillation, body mass index, hypertension and triglycerides. These findings extend our knowledge of the genes and pathways underlying HF and may inform the development of new therapeutic approaches.
0

Phenome-wide association analysis of LDL-cholesterol lowering genetic variants in PCSK9

Amand Schmidt et al.May 25, 2018
Background: We characterised the phenotypic consequence of genetic variation at the PCSK9 locus and compared findings with recent trials of pharmacological inhibitors of PCSK9. Methods: Published and individual participant level data (300,000+ participants) were combined to construct a weighted PCSK9 gene-centric score (GS). Fourteen randomized placebo controlled PCSK9 inhibitor trials were included, providing data on 79,578 participants. Results were scaled to a one mmol/L lower LDL-C concentration. Results: The PCSK9 GS (comprising 4 SNPs) associations with plasma lipid and apolipoprotein levels were consistent in direction with treatment effects. The GS odds ratio (OR) for myocardial infarction (MI) was 0.53 (95%CI 0.42; 0.68), compared to a PCSK9 inhibitor effect of 0.90 (95%CI 0.86; 0.93). For ischemic stroke ORs were 0.84 (95%CI 0.57; 1.22) for the GS, compared to 0.85 (95%CI 0.78; 0.93) in the drug trials. ORs with type 2 diabetes mellitus (T2DM) were 1.29 (95% CI 1.11; 1.50) for the GS, as compared to 1.00 (95%CI 0.96; 1.04) for incident T2DM in PCSK9 inhibitor trials. No genetic associations were observed for cancer, heart failure, atrial fibrillation, chronic obstructive pulmonary disease, or Alzheimer's disease - outcomes for which large-scale trial data were unavailable. Conclusions: Genetic variation at the PCSK9 locus recapitulates the effects of therapeutic inhibition of PCSK9 on major blood lipid fractions and MI. Apparent discordance between genetic associations and trial outcome for T2DM might be explained lack by a of statistical precision, or differences in the nature and duration of genetic versus pharmacological perturbation of PCSK9.