Promoter Mutations and Cancer Cancer genome sequencing projects have highlighted the pathogenic role of recurrent mutations within the protein-coding regions of genes. Now, two studies suggest that the scope of mutations in human tumors extends to gene regulatory regions. In a study of 70 melanomas, Huang et al. (p. 957 , published online 24 January) found that 71% harbored one of two specific mutations in the promoter region of TERT , the gene coding for the catalytic subunit of telomerase, the enzyme that caps chromosome ends. Independently, Horn et al. (p. 959 , published online 24 January) identified a disease-segregating germline mutation in the TERT promoter in a family predisposed to melanoma and found additional TERT promoter mutations in a high percentage of sporadic melanomas and melanoma cell lines. The mutations in both studies generated new binding sites for specific transcription factors and, in reporter assays, caused an increase in transcription.

The purpose of these guidelines is to provide concise guidance on the planning, performing and interpretation of studies to monitor groups or individuals exposed to genotoxic agents. Most human carcinogens are genotoxic but not all genotoxic agents have been shown to be carcinogenic in humans. Although the main interest in these studies is due to the association of genotoxicity with carcinogenicity, there is also an inherent interest in monitoring human genotoxicity independently of cancer as an endpoint. The most often studied genotoxicity endpoints have been selected for inclusion in this document and they are structural and numerical chromosomal aberrations assessed using cytogenetic methods (classical chromosomal aberration analysis (CA), fluorescence in situ hybridisation (FISH), micronuclei (MN)); DNA damage (adducts, strand breaks, crosslinking, alkali-labile sites) assessed using bio-chemical/electrophoretic assays or sister chromatid exchanges (SCE); protein adducts; and hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase (HPRT) mutations. The document does not consider germ cells or gene mutation assays other than HPRT or markers of oxidative stress, which have been applied on a more limited scale.

Richard Houlston, Melissa Bondy and colleagues identify variants at five loci associated with glioma susceptibility, providing insights into the etiology of this primary brain tumor. The risk loci include common variants near TERT, CDKN2A-CDKN2B and RTEL1. To identify risk variants for glioma, we conducted a meta-analysis of two genome-wide association studies by genotyping 550K tagging SNPs in a total of 1,878 cases and 3,670 controls, with validation in three additional independent series totaling 2,545 cases and 2,953 controls. We identified five risk loci for glioma at 5p15.33 (rs2736100, TERT; P = 1.50 × 10−17), 8q24.21 (rs4295627, CCDC26; P = 2.34 × 10−18), 9p21.3 (rs4977756, CDKN2A-CDKN2B; P = 7.24 × 10−15), 20q13.33 (rs6010620, RTEL1; P = 2.52 × 10−12) and 11q23.3 (rs498872, PHLDB1; P = 1.07 × 10−8). These data show that common low-penetrance susceptibility alleles contribute to the risk of developing glioma and provide insight into disease causation of this primary brain tumor.

Abstract Investigating epidemiology of metastatic colon and rectal cancer is challenging, because cancer registries seldom record metastatic sites. We used a population based approach to assess metastatic spread in colon and rectal cancers. 49,096 patients with colorectal cancer were identified from the nationwide Swedish Cancer Registry. Metastatic sites were identified from the National Patient Register and Cause of Death Register. Rectal cancer more frequently metastasized into thoracic organs (OR = 2.4) and the nervous system (1.5) and less frequently within the peritoneum (0.3). Mucinous and signet ring adenocarcinomas more frequently metastasized within the peritoneum compared with generic adenocarcinoma (3.8 [colon]/3.2 [rectum]), and less frequently into the liver (0.5/0.6). Lung metastases occurred frequently together with nervous system metastases, whereas peritoneal metastases were often listed with ovarian and pleural metastases. Thoracic metastases are almost as common as liver metastases in rectal cancer patients with a low stage at diagnosis. In colorectal cancer patients with solitary metastases the survival differed between 5 and 19 months depending on T or N stage. Metastatic patterns differ notably between colon and rectal cancers. This knowledge should help clinicians to identify patients in need for extra surveillance and gives insight to further studies on the mechanisms of metastasis.

Objectives Population-based data on metastatic sites and survival in site-specific metastases are lacking for lung cancer and for any cancer because most cancer registries do not record metastases. This study uses a novel population-based approach to identify metastases from both death certificates and national inpatient data to describe metastatic pathways in lung cancer patients. Materials and methods 17,431 deceased lung cancer patients diagnosed 2002–2010 were identified from the nationwide Swedish Cancer Registry, which is based on compulsory reports. The influence of age at diagnosis, sex, and histological subtype on metastatic spread was investigated. Survival in metastatic lung cancer was assessed by histology and metastatic site. Results The most frequent metastatic sites were the nervous system, bone, liver, respiratory system, and adrenal gland. Liver (35%) and nervous system (47%) metastases were common in patients with metastases from small cell lung cancer, and bone (39%) and respiratory system (22%) metastases in adenocarcinoma. Women (43% vs. 35%) and younger patients had more metastases to the nervous system. Median survival after diagnosis was 13 months for non-metastatic and five months for metastatic lung cancer. In this novel data, liver metastases conferred the worst prognosis (three months), especially for large cell histology. Bone metastases also featured poor survival, whereas survival in respiratory and nervous system metastases was better. Conclusion Metastatic sites and survival in metastatic lung cancer is influenced by sex, histological subtype, and age at diagnosis. Liver and bone metastases signal poor survival, compared with nervous system metastases.

Following a replicated genome-wide association study for basal cell carcinoma, Thorunn Rafnar and Patrick Sulem and colleagues have identified a locus associated with multiple cancers that contains the telomerase reverse transcriptase gene TERT and the CLPTM1L gene implicated in cisplatin-induced apoptosis. The common sequence variants that have recently been associated with cancer risk are particular to a single cancer type or at most two. Following up on our genome-wide scan of basal cell carcinoma1, we found that rs401681[C] on chromosome 5p15.33 satisfied our threshold for genome-wide significance (OR = 1.25, P = 3.7 × 10−12). We tested rs401681 for association with 16 additional cancer types in over 30,000 cancer cases and 45,000 controls and found association with lung cancer (OR = 1.15, P = 7.2 × 10−8) and urinary bladder, prostate and cervix cancer (ORs = 1.07−1.31, all P < 4 × 10−4). However, rs401681[C] seems to confer protection against cutaneous melanoma (OR = 0.88, P = 8.0 × 10−4). Notably, most of these cancer types have a strong environmental component to their risk. Investigation of the region led us to rs2736098[A], which showed stronger association with some cancer types. However, neither variant could fully account for the association of the other. rs2736098 corresponds to A305A in the telomerase reverse transcriptase (TERT) protein and rs401681 is in an intron of the CLPTM1L gene.

The epidemiology of metastatic gastric cancer is unexplored because cancer registries seldom cover metastatic involvement apart from "present or not". We used a novel approach by utilizing Swedish registers to assess metastatic spread in gastric cancer. To our knowledge, this is the first nationwide description of metastases in gastric cancer.The most common sites of metastasis were liver (in 48% of metastatic cancer patients), peritoneum (32%), lung (15%), and bone (12%). Metastases to the lung, nervous system, and bone were more frequent in cardia cancer and men, whereas non-cardia cancer more frequently metastasized within the peritoneum. Signet ring adenocarcinomas more frequently metastasized within the peritoneum, bone and ovaries, and less frequently to the lungs and liver compared with generic adenocarcinoma. The liver and the peritoneum were commonly single metastases while lung metastases occurred frequently together with liver metastases. The median survival in metastatic gastric cancer was 3 months, worst among those with bone and liver metastases (2 months).A total of 7,559 patients with gastric cancer were identified. Metastatic patterns and survival depending on sex, age, stage, anatomical location (cardia and non-cardia), and histological type were assessed.The patterns of metastasis differ notably depending on histological type. Cardia cancer exhibits a completely different metastatic behavior than non-cardia cancer. Awareness of the differing patterns may guide in tailored diagnosis of metastases. Survivors from cardia cancer would benefit from increased surveillance of extraperitoneal metastases. Bone metastases should be considered in patients with signet ring adenocarcinoma if symptoms emerge.

Simon Stacey and colleagues report several new susceptibility variants for basal cell carcinoma, including coding variants in KRT5, a variant at 9p21 near CDKN2A and CDKN2B and a variant at 7q32 near KLF14. The latter is an imprinted gene, and the effect at this locus is dependent on the parental origin of the risk allele. In a follow-up to our previously reported genome-wide association study of cutaneous basal cell carcinoma (BCC)1, we describe here several new susceptibility variants. SNP rs11170164, encoding a G138E substitution in the keratin 5 (KRT5) gene, affects risk of BCC (OR = 1.35, P = 2.1 × 10−9). A variant at 9p21 near CDKN2A and CDKN2B also confers susceptibility to BCC (rs2151280[C]; OR = 1.19, P = 6.9 × 10−9), as does rs157935[T] at 7q32 near the imprinted gene KLF14 (OR = 1.23, P = 5.7 × 10−10). The effect of rs157935[T] is dependent on the parental origin of the risk allele. None of these variants were found to be associated with melanoma or fair-pigmentation traits. A melanoma- and pigmentation-associated variant in the SLC45A2 gene, L374F, is associated with risk of both BCC and squamous cell carcinoma. Finally, we report conclusive evidence that rs401681[C] in the TERT-CLPTM1L locus confers susceptibility to BCC but protects against melanoma.

In a case--control study, we examined the relation between fetal loss and occupational exposure to antineoplastic drugs in nurses in 17 Finnish hospitals. The pregnancies studied occurred in 1973 through 1980 and were identified using three national sources: the Central Register of Health Care Personnel, the Hospital Discharge Registry, and policlinic data. Each nurse with fetal loss was matched with three nurses who gave birth. Data on health and exposure were obtained by self-administered, mailed questionnaires; a response rate of 87 per cent was achieved after three mailings. A statistically significant association was observed between fetal loss and occupational exposure to antineoplastic drugs during the first trimester of pregnancy: odds ratio = 2.30 (95 per cent confidence interval, 1.20 to 4.39). Analyses suggested associations between fetal loss and cyclophosphamide, doxorubicin, and vincristine, although the independent effect of each individual drug could not be specifically identified, since many nurses reported handling more than one of these agents. The results of this study, combined with existing data on animals and human beings, suggest that caution be exercised in the handling of these valuable drugs.