BACKGROUND: COVID-19 predisposes patients to a prothrombotic state with demonstrated microvascular involvement. The degree of hypercoagulability appears to correlate with outcomes; however, optimal criteria to assess for the highest-risk patients for thrombotic events remain unclear; we hypothesized that deranged thromboelastography measurements of coagulation would correlate with thromboembolic events. STUDY DESIGN: Patients admitted to an ICU with COVID-19 diagnoses who had thromboelastography analyses performed were studied. Conventional coagulation assays, d-dimer levels, and viscoelastic measurements were analyzed using a receiver operating characteristic curve to predict thromboembolic outcomes and new-onset renal failure. RESULTS: Forty-four patients with COVID-19 were included in the analysis. Derangements in coagulation laboratory values, including elevated d-dimer, fibrinogen, prothrombin time, and partial thromboplastin time, were confirmed; viscoelastic measurements showed an elevated maximum amplitude and low lysis of clot at 30 minutes. A complete lack of lysis of clot at 30 minutes was seen in 57% of patients and predicted venous thromboembolic events with an area under the receiver operating characteristic curve of 0.742 (p = 0.021). A d-dimer cutoff of 2,600 ng/mL predicted need for dialysis with an area under the receiver operating characteristic curve of 0.779 (p = 0.005). Overall, patients with no lysis of clot at 30 minutes and a d-dimer > 2,600 ng/mL had a venous thromboembolic event rate of 50% compared with 0% for patients with neither risk factor (p = 0.008), and had a hemodialysis rate of 80% compared with 14% (p = 0.004). CONCLUSIONS: Fibrinolysis shutdown, as evidenced by elevated d-dimer and complete failure of clot lysis at 30 minutes on thromboelastography predicts thromboembolic events and need for hemodialysis in critically ill patients with COVID-19. Additional clinical trials are required to ascertain the need for early therapeutic anticoagulation or fibrinolytic therapy to address this state of fibrinolysis shutdown.

ABSTRACT RNA-binding proteins (RBPs) are essential for skeletal muscle regeneration and RBP dysfunction causes muscle degeneration and neuromuscular disease. How ubiquitously expressed RBPs orchestrate complex tissue regeneration and direct cell fate decisions in skeletal muscle remains poorly understood. Single cell RNA-sequencing of regenerating skeletal muscle reveals that RBP expression, including numerous neuromuscular disease-associated RBPs, is temporally regulated in skeletal muscle stem cells and correlates to stages of myogenic differentiation. By combining machine learning with RBP engagement scoring, we discover that the neuromuscular disease associated RBP Hnrnpa2b1 is a differentiation-specifying regulator of myogenesis controlling myogenic cell fate transitions during terminal differentiation. The timing of RBP expression specifies cell fate transitions by providing a layer of post-transcriptional regulation needed to coordinate stem cell fate decisions during complex tissue regeneration.

Abstract Evolution of morphological traits is hypothesized to act on an extended time scale, yet studies have suggested that these changes are possible within a few generations. Trophic polymorphism enabled through niche adaptations and ecological opportunity is one phenomenon that facilitate occurrence of rapid adaptive variation, common in many northern freshwater fish species. One such species is Arctic charr, which is known for its extensive variation in morphology and the occurrence of morphs. However, the speed at which such morphological variation arises is poorly studied despite the importance for understanding the onset of evolution. The aim of this study was to elucidate this process in a gradient of eight lakes that was stocked with Arctic charr in the period from 1910 to 1917 from Lake Tinnsjøen, Norway. We used morphological measurements to test for differences in traits between populations and Haldane and Darwin’s evolutionary rates to estimate divergence rates in traits. We also tested for correlation between putative genetic and morphological divergence. In addition, we contrasted the morphological divergence with that expected under neutral genetic expectations, using 12 microsatellite markers, to analyze whether and which morphological differences that is following early genetic divergence. A significant genetic differentiation was found between the source population and five of the translocated populations with corresponding differences in morphological traits for four of the populations. Population genetic structuring indicated six different genetic clusters. The translocated populations also exhibited trait divergence estimated with both Haldane and Darwin’s rates. Differences in morphological traits showed a significant correlation with genetic divergence, and the morphological differences were most likely affected by differences in lake parameters such as maximum depth, lake size and fish community. We conclude that intraspecific morphological and genetic divergence can form on short evolutionary time scales with important implications for conservation and management practices.

Background: The origin of species is a central topic in biology aiming at understanding mechanisms, level and rate of diversification. Ecological speciation is an important driver in adaptive radiation during post glacial intralacustrine niche diversification in fishes. The Arctic charr Salvelinus alpinus L. species complex in the Northern hemisphere freshwater systems display huge morphological and life history divergence in lakes with one or several morphs present, thus offering a unique opportunity to address ongoing speciation mechanisms. We studied Arctic charr in Lake Tinnsjoen by fishing in four nominal lake habitats (pelagial, littoral, shallow moderate profundal, and deep profundal habitats) down to 350 meters depth. Research topics addressed were; (1) to illuminate Holarctic phylogeography and lineages colonizing Lake Tinnsjoen, (2) to estimate reproductive isolation of morphs or fish using unbiased methods, and (3) to document ecomorphological and life history trait divergence. Also, we compared Lake Tinnsjoen with four Norwegian outgroup populations of Arctic charr. Results: Four field assigned morphs were identified in Lake Tinnsjoen; the planktivore morph in all habitats except deep profundal, the dwarf morph in shallow moderate profundal, the piscivore morph in shallow moderate profundal (less in littoral and deep profundal), and an undescribed new morph, being the abyssal morph in the deep profundal only. The morphs displayed extensive life history variation based on age and size patterns. A moderate to high concordance was observed between field assigned morphs and four unbiased genetic clusters obtained from microsatellite variation. MtDNA suggested the occurrence of two minor endemic clades in Lake Tinnsjoen likely originating from one widespread colonizing clade in the Holarctic. All morphs were genetically differentiated at microsatellites (Fst: 0.12 to 0.20; with some ongoing gene flow among morphs, and for most mtDNA comparisons (Fst: 0.04 to 0.38). Analyses of Norwegian outgroup lakes implied colonization from a river system below Lake Tinnsjoen. Conclusion: Our findings suggest postglacial adaptive radiation of one colonizing mtDNA lineage with divergent niche specialization along a depth temperature productivity pressure gradient. Concordance between reproductive isolation and the realized habitat of the morphs imply that ecological speciation may be the mechanism of divergence. Particularly novel is the extensive morph diversification with depth into the often unexplored deep water profundal habitat, suggesting we may have systematically underestimated biodiversity present in lakes. Key words: Adaptive radiation, Ecological speciation, Niche specialization, Population divergence, Morphs, Natural selection, Pleistocene iceage, Microsatellites, MtDNA, Salvelinus alpinus