XJ
Xiaofei Jia
Author with expertise in Human Immunodeficiency Virus/Acquired Immunodeficiency Syndrome
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Semantic relation priming is not constituent-specific: Evidence from ERP

Xiaofei Jia et al.Nov 11, 2021
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Abstract It is humankind’s unique wisdom to compose a limited number of words together through specific rules to convey endless information. Researchers have found that this composition process also plays a vital role in the comprehension of compounds. The specific manifestation is relation priming; that is, the previously used relation will promote subsequent word processing using the same relation. This priming phenomenon is bound to morpheme repetition (modifier or head). This study combines a self-paced priming paradigm with electrophysiological technology to explore whether relation priming will occur without sharing morphemes and its time course. We found that relation priming can occur independently of morpheme-repetition, which shows an independent representation of relation information. And it has been activated at a very early stage (about 200ms). As the word processing progresses, this activation gradually strengthens, indicating that the relation’s role is slowly increasing in the process of compound word recognition. It may first be used as a kind of context information to help determine the constituent morphemes’ meaning. After the meaning access of the constituent morphemes, they begin to play a role in the semantic composition process. This study uses electrophysiological technology to precisely describe the representation of relation and its time course for the first time. Which gives us a deeper understanding of the relation priming process, and at the same time, shed light on the meaning construction process of compounds.
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Enhancing Mental Well-being: Efficacy and Neural Mechanisms of Leyi Training in Emotional and Cognitive Intervention

Xiaofei Jia et al.Oct 16, 2023
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Abstract Leyi mental training comprises physical and mental cultivation methods, such as relaxation, breathing, meditation, koan, and cognitive regulation, with the ultimate goal of achieving enlightenment. Over a decade of practical experience has demonstrated its potential to enhance individuals’ mental well-being. In our study, we employed EEG and psychological scales to investigate the efficacy of Leyi training in emotional and cognitive intervention, as well as its underlying neural mechanisms. The results revealed significant improvements in both emotion and cognition following the intervention. We propose that the effectiveness of Leyi training in emotional regulation may stem from the heightened sensitivity to present experiences and the robust cognitive control ability cultivated through the practice, which enables practitioners to allocate equal, non-reactive attention to all stimuli, regardless of their emotional valence. Moreover, this training facilitates more effective allocation of cognitive resources to deal with current tasks, thus improving cognitive abilities.
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Structural Basis of CD4 Downregulation by HIV-1 Nef

Yonghwa Kwon et al.Apr 23, 2020
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The HIV-1 Nef protein suppresses multiple immune surveillance mechanisms to promote viral pathogenesis and is an attractive target for the development of novel therapeutics. A key function of Nef is to remove the CD4 receptor from the cell surface by hijacking clathrin- and AP2-dependent endocytosis. However, exactly how Nef does this has been elusive. Here, we present a high-resolution crystal structure that describes the underlying mechanism. An intricate combination of conformational changes occurs in both Nef and AP2 to enable CD4 binding and downregulation. Strikingly, a pocket on Nef previously identified as crucial for recruiting class I MHC is also responsible for recruiting CD4, revealing a potential approach to inhibit two activities of Nef and sensitize the virus to immune clearance.### Competing Interest StatementThe authors have declared no competing interest.
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A conserved acidic cluster motif in SERINC5 confers resistance to antagonism by HIV-1 Nef

Charlotte Stoneham et al.Mar 27, 2019
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The cellular protein SERINC5 inhibits the infectivity of diverse retroviruses and is counteracted by the glycoGag protein of MLV, the S2 protein of EIAV, and the Nef protein of HIV-1. Determining regions within SERINC5 that provide restrictive activity or Nef-sensitivity should inform mechanistic models of the SERINC5/HIV-1 relationship. Here, we report that deletion of the highly conserved sequence EDTEE, which is located within a cytoplasmic loop of SERINC5 and is reminiscent of an acidic cluster membrane trafficking signal, increases the sensitivity of SERINC5 to antagonism by Nef while having no effect on the intrinsic activity of the protein as an inhibitor of infectivity. The effects on infectivity correlated with enhanced removal of the ΔEDTEE mutant relative to wild type SERINC5 from the cell surface and with enhanced exclusion of the mutant protein from virions by Nef. Mutational analysis revealed that the acidic residues, but not the threonine, within the EDTEE motif are important for the relative resistance to Nef. Deletion of the EDTEE sequence did not increase the sensitivity of SERINC5 to antagonism by the glycoGag protein of MLV, suggesting that its virologic role is Nef-specific. These results are consistent with the reported mapping of the cytoplasmic loop that contains the EDTEE sequence as a general determinant of Nef-responsiveness, but they further indicate that sequences inhibitory to as well as supportive of Nef-activity reside in this region. We speculate that the EDTEE motif might have evolved to mediate resistance against retroviruses that use Nef-like proteins to antagonize SERINC5.
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Phosphoserine acidic cluster motifs in the cytoplasmic domains of transmembrane proteins bind distinct basic regions on the μ subunits of clathrin adaptor protein complexes

Rajendra Singh et al.Mar 21, 2018
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Protein trafficking in the endosomal system involves the recognition of specific signals within the cytoplasmic domains (CDs) of transmembrane proteins by clathrin adaptors. One such signal is the phosphoserine acidic cluster (PSAC), the prototype of which is in the endoprotease Furin. How PSACs are recognized by clathrin adaptors has been controversial. We reported previously that HIV-1 Vpu, which modulates cellular immunoreceptors, contains a PSAC that binds to the μ subunits of clathrin adaptor protein (AP) complexes. Here, we show that the CD of Furin binds the μ subunits of AP-1 and AP-2 in a phosphorylation-dependent manner. Moreover, we identify a PSAC in a cytoplasmic loop of the cellular transmembrane Serinc3, an inhibitor of the infectivity of retroviruses. The two serines within the PSAC of Serinc3 are phosphorylated by casein kinase II and mediate interaction with the μ subunits in vitro. The sites of these serines vary among mammals in a manner consistent with host-pathogen conflict, yet the Serinc3-PSAC seems dispensible for anti-HIV activity and for counteraction by HIV-1 Nef. The CDs of Vpu, Furin, and the PSAC-containing loop of Serinc3 each bind the μ subunit of AP-2 (μ) with similar affinities, but they appear to utilize different basic regions on μ. The Serinc3 loop requires a region previously reported to bind the acidic plasma membrane lipid phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate. These data suggest that the PSACs within different proteins recognize different basic regions on the μ surface, providing the potential to inhibit the activity of viral proteins without necessarily affecting cellular protein trafficking.