JS
John Shapiro
Author with expertise in Developmental Origins of Adult Health and Disease
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(67% Open Access)
Cited by:
1,118
h-index:
22
/
i10-index:
30
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Protection from Fas-Mediated Apoptosis by a Soluble Form of the Fas Molecule

Jinhua Cheng et al.Mar 25, 1994
+5
C
T
J
Fas is an apoptosis-signaling receptor molecule on the surface of a number of cell types. Molecular cloning and nucleotide sequence analysis revealed a human Fas messenger RNA variant capable of encoding a soluble Fas molecule lacking the transmembrane domain because of the deletion of an exon encoding this region. The expression of soluble Fas was confirmed by flow cytometry and immunocytochemical analysis. Supernatants from cells transfected with the variant messenger RNA blocked apoptosis induced by the antibody to Fas. Levels of soluble Fas were elevated in patients with systemic lupus erythematosus, and mice injected with soluble Fas displayed autoimmune features.
1

A reference tissue atlas for the human kidney

Jens Hansen et al.Jul 24, 2020
+38
R
R
J
A bstract Kidney Precision Medicine Project (KPMP) is building a spatially-specified human tissue atlas at the single-cell resolution with molecular details of the kidney in health and disease. Here, we describe the construction of an integrated reference tissue map of cells, pathways and genes using unaffected regions of nephrectomy tissues and undiseased human biopsies from 55 subjects. We use single-cell and -nucleus transcriptomics, subsegmental laser microdissection bulk transcriptomics and proteomics, near-single-cell proteomics, 3-D nondestructive and CODEX imaging, and spatial metabolomics data to hierarchically identify genes, pathways and cells. Integrated data from these different technologies coherently describe cell types/subtypes within different nephron segments and interstitium. These spatial profiles identify cell-level functional organization of the kidney tissue as indicative of their physiological functions and map different cell subtypes to genes, proteins, metabolites and pathways. Comparison of transcellular sodium reabsorption along the nephron to levels of mRNAs encoding the different sodium transporter genes indicate that mRNA levels are largely congruent with physiological activity.This reference atlas provides an initial framework for molecular classification of kidney disease when multiple molecular mechanisms underlie convergent clinical phenotypes.
1
Citation5
0
Save
1

Deletion of NuRD component Mta2 in nephron progenitor cells causes developmentally programmed FSGS

Jeannine Basta et al.Oct 20, 2023
+9
L
L
J
Low nephron endowment at birth is a risk factor for chronic kidney disease. The prevalence of this condition is increasing due to higher survival rates of preterm infants and children with multi-organ birth defect syndromes that affect the kidney and urinary tract. We created a mouse model of congenital low nephron number due to deletion of Mta2 in nephron progenitor cells. Mta2 is a core component of the Nucleosome Remodeling and Deacetylase (NuRD) chromatin remodeling complex. These mice developed albuminuria at 4 weeks of age followed by focal segmental glomerulosclerosis (FSGS) at 8 weeks, with progressive kidney injury and fibrosis. Our studies reveal that altered mitochondrial metabolism in the post-natal period leads to accumulation of neutral lipids in glomeruli at 4 weeks of age followed by reduced mitochondrial oxygen consumption. We found that NuRD cooperated with Zbtb7a/7b to regulate a large number of metabolic genes required for fatty acid oxidation and oxidative phosphorylation. Analysis of human kidney tissue also supported a role for reduced mitochondrial lipid metabolism and ZBTB7A/7B in FSGS and CKD. We propose that an inability to meet the physiological and metabolic demands of post-natal somatic growth of the kidney promotes the transition to CKD in the setting of glomerular hypertrophy due to low nephron endowment.