ABSTRACT Cognitive skills are a strong predictor of a wide range of later life outcomes. Genetic and epigenetic associations across the genome explain some of the variation in general cognitive abilities in the general population and it is plausible that epigenetic associations might arise from prenatal environmental exposures and/or genetic variation early in life. We investigated the association between cord blood DNA methylation at birth and cognitive skills assessed in children from eight pregnancy cohorts (N=2196-3798) within the Pregnancy And Childhood Epigenetics (PACE) Consortium across overall, verbal and non-verbal cognitive scores. The associations at single CpG sites were weak for all of the cognitive domains investigated. One region near DUSP22 on chromosome 6 was associated with non-verbal cognition in a model adjusted for maternal IQ. We conclude that there is little evidence to support the idea that cord blood DNA methylation at single CpGs can predict cognitive skills and further studies are needed to confirm regional differences.

ABSTRACT Attention-deficit and hyperactivity disorder (ADHD) is a common childhood disorder with a substantial genetic component. However, the extent to which epigenetic mechanisms play a role in the etiology of the disorder is not known. We performed epigenome-wide association studies (EWAS) within the Pregnancy And Childhood Epigenetics (PACE) Consortium to identify DNA methylation sites associated with ADHD symptoms at two methylation assessment periods: birth and school-age. We examined associations of DNA methylation in cord blood with repeatedly assessed ADHD symptoms (age range 4-15 years) in 2477 children from five cohorts and DNA methylation at school-age with concurrent ADHD symptoms (age 7-11 years) in 2374 children from ten cohorts. CpGs identified with nominal significance (p<0.05) in either of the EWAS were correlated between timepoints (ρ=0.30), suggesting overlap in associations, however, top signals were very different. At birth, we identified nine CpGs that were associated with later ADHD symptoms (P<1*10 −7 ), including ERC2 and CREB5. Peripheral blood DNA methylation at one of these CpGs (cg01271805 located in the promotor region of ERC2, which regulates neurotransmitter release) was previously associated with brain methylation. Another (cg25520701) lies within the gene body of CREB5, which was associated with neurite outgrowth and an ADHD diagnosis in previous studies. In contrast, at school-age, no CpGs were associated with ADHD with P<1*10 −7 . In conclusion, we found evidence in this study that DNA methylation at birth is associated with ADHD. Future studies are needed to confirm the utility of methylation variation as biomarker and its involvement in causal pathways.

Excessive alcohol consumption is one of the main causes of death and disability worldwide. Alcohol consumption is a heritable complex trait. We conducted a genome-wide association study (GWAS) of alcohol use in ~480,000 people of European descent to decipher the genetic architecture of alcohol intake. We identified 46 novel, common loci, and investigated their potential functional significance using magnetic resonance imaging data, gene expression and behavioral studies in Drosophila. Our results identify new genetic pathways associated with alcohol consumption and suggest common genetic mechanisms with several neuropsychiatric disorders including schizophrenia.

Abstract Our retrospective study (2010–2020) examined treatment patterns, outcomes, and healthcare resource utilization in Finnish acute myeloid leukemia (AML) patients. Data covered 153 patients diagnosed at Hospital District of Southwest Finland (HDSF) and 107 from other districts who underwent allogeneic stem cell transplantation (aSCT) at HDSF. Of the 153 patients, 56.2% received intensive chemotherapy (IC), while 43.8% deemed ineligible for IC received low‐intensity therapies or best supportive care (BSC). Median overall survival for IC patients was 31.2 months, compared to 5.3 months for those under azacytidine and 1.2 months on BSC. Majority (57.5%) of patients over 60 with intermediate/high European leukemia network risk had poor outcomes with IC and couldn't proceed to aSCT. These patients carried the highest costs and hospital resource use per patient month. Most common reasons for transplant ineligibility after IC were refractory disease and infection. Our data provides a comprehensive view on AML treatment landscape from a period when the latest treatment advancements were not yet accessible. The data describes patient groups with poor prognosis and increased healthcare burden, emphasizing the need to improve treatment practices and identify better ways to get more patients to transplant, in a rapidly evolving treatment landscape.

Background and purpose: Data on real-world prevalence and outcomes in patients diagnosed with pathogenic germline variants in BRCA1 or BRCA2 (gBRCAm) breast cancer is sparse. Material and methods: An observational cohort study including all patients diagnosed with incident early-stage breast cancer and recorded in Helsinki University Hospital data lake 2012–2022, accounting for one-third of the Finnish breast cancer patient population. Results: Among 14,696 incident early-stage breast cancer patients, 11.2% (n = 1,644) were tested for gBRCAm. Of the tested population, 7.4% (n = 122) carried gBRCAm. Of the 122 gBRCAm patients, 95.1% (n = 116) were women, with a median age at diagnosis of 46.4 years. Among the same patient group, HER2 status was available for 87.7% (n = 107) of the patients. Among these, 49.5% (n = 53) had hormone receptor-positive (HR+), HER2-negative breast cancer, 13.1% were (n = 14) HER2-positive, and 37.3% (n = 40) of patients had triple-negative breast cancer. The tested patients were significantly younger compared with non-tested patients. No significant differences in overall survival or healthcare resource utilization between the tested patients with gBRCAm and gBRCA wild-type (gBRCAwt) were observed. Interpretation: This comprehensive observational study supports previous findings of gBRCAm prevalence in the Western early-stage breast cancer population. While no differences in survival were observed between patients with gBRCAm and gBRCAwt, it is important to consider the potential influence of selection bias, particularly due to the younger gBRCAm testing target population and the overall low frequency of testing. Therefore, a substantial proportion of the patients carrying gBRCAm likely remained undiagnosed, and wider screening criteria are warranted.