Objectives. This study compares the effects of an integrated yoga program with brief supportive therapy in breast cancer outpatients undergoing adjuvant radiotherapy at a cancer center. Methods. Eighty-eight stage II and III breast cancer outpatients are randomly assigned to receive yoga (n = 44) or brief supportive therapy (n = 44) prior to radiotherapy treatment. Assessments include diurnal salivary cortisol levels 3 days before and after radiotherapy and self-ratings of anxiety, depression, and stress collected before and after 6 weeks of radiotherapy. Results. Analysis of covariance reveals significant decreases in anxiety ( P < .001), depression ( P = .002), perceived stress ( P < .001), 6 a.m. salivary cortisol ( P = .009), and pooled mean cortisol ( P = .03) in the yoga group compared with controls. There is a significant positive correlation between morning salivary cortisol level and anxiety and depression. Conclusion. Yoga might have a role in managing self-reported psychological distress and modulating circadian patterns of stress hormones in early breast cancer patients undergoing adjuvant radiotherapy.

Abstract The complexity of the ER-negative subtype of breast cancer arises due to the heterogeneous nature of the disease rendering them more aggressive and this poses a challenge to effective treatment and eventually the prognosis of the patients. We have explored the miRNA regulation of altered molecular signatures and the effect on tumour progression in ER-negative breast cancer. Using breast tumour specimens, gene expression data from public datasets and in-vitro and in-vivo model systems we have shown that low-levels of miR-18a in ER-negative tumours drives enrichment of hybrid Epithelial/Mesenchymal (E/M) cells with luminal attributes. On inhibition of miR-18a in ER-negative breast cancer cell lines, the cells showed traits of increased migration, stemness and drug-resistance. miR-18a/low tumours were also associated with increased expression of genes associated with EMT, stemness, drug resistance and immune-suppression. Further analysis of the miR-18a targets pointed out at a possible HIF-1α mediated signalling in these tumours. HIF-1α inhibition reduced the enrichment of the hybrid E/M cells and decreased the migratory ability of miR-18a/low cells. Our study reports for the first time a dual role of miR-18a in breast cancer that is subtype specific based on hormone receptor expression and a novel association of low miR-18a levels and enrichment of hybrid E/M cells. The results highlight the possibility of stratifying the ER-negative disease into clinically relevant groups by analysing epigenetic signatures.

PURPOSE Gene fusions are critical oncogenic mutations that drive cancer development and serve as diagnostic and prognostic biomarkers. Despite the increasing cancer burden in India, large-scale analyses of molecular landscapes, particularly gene fusions, have been relatively scarce. MATERIALS AND METHODS This retrospective study used RNA-exome data from 1,392 Indian patients with cancer across 15 major cancer types to explore gene fusions. The study used a comprehensive framework that integrated open-source and proprietary tools to detect gene fusions from formalin-fixed paraffin-embedded tumor samples. The process involved RNA extraction, RNA-exome library preparation, and analysis using tools such as FastQC, DRAGEN RNA Pipeline, STAR-Fusion, and FusionInspector. We validated and filtered potential false-positive fusion calls using AGFusion and FusionAnnotator to annotate fusion breakpoints and their functional impact through various in silico tools. RESULTS The study found a notable prevalence of FGFR fusions across cancer types, especially FGFR3, with FGFR3::TACC3 as the most recurrent. Kinase fusions were prevalent in the cohort accounting for 37% of incidence in the patients. We also identified 91 novel potential driver fusions, including those involving FGFR2 , MET , ESR1 , and PDGFRA. CONCLUSION This study underscores the critical role of gene fusions as biomarkers in cancer, extending beyond fusion-driven malignancies to encompass all cancer types. Gene fusions serve as both diagnostic markers and tumor-agnostic therapeutic targets within the current cancer treatment paradigm. Our insights into the prevalence of oncogenic drivers and novel targets expand the understanding of gene fusions, shedding new light on their mechanisms and clinical implications.

Resilience for Indian women with breast cancer involves maintaining positivity and adaptability amid the complex challenges affecting their physical, emotional, and social well-being. However, research focused on resilience amongst this population in Indian settings is limited. Therefore, the aim of the study is to explore the experience of levels, patterns, and processes of resilience in Indian women living with breast cancer. A qualitative phenomenological approach was used to study resilience. Thirty-three participants from two hospitals underwent semistructured interviews, including survivors, women in cancer therapy, and family members. Data collected via audio recordings were analyzed using reflective thematic analysis techniques. The finding describes four themes of experience of resilience in women living with breast cancer. (a) Cancer diagnosis is a life-changing experience. Breast cancer diagnosis and therapy cause existential crisis, psychological distress, and social stigma. (b) Restoring healthy perception in an adverse event. Navigating challenges and achieving a balance between internal and external factors. (c) Types of support—the pathway to resilience. Enhanced their resilience through internal support including attributes, past experiences, sociodemographic factors, and brain fitness. External support includes family, friends, religious or spiritual advisors, medical care, role models, other cancer survivors, and comfortable environments. (d) Learning and growing from the experience. Gained a better perspective on life, ultimately resulting in a new normal and finding meaning in the experience. Data show breast cancer survivors experience dynamic resilience, highlighting the need for culturally tailored interventions and supportive avenues within cancer care by healthcare providers and policymakers.

Abstract Background Androgen receptor (AR) is considered marker associated with better prognosis within hormone receptor positive tumors. Its role in triple negative tumors however is controversial showing both better and worse prognosis and different methods are used for identification of AR driven tumors. Conflicting results could be due to intrinsic molecular differences or scoring method for AR positivity. We attempted to develop an AR driven gene score and examined its utility in subtypes of breast cancer (BC). Methods A bioinformatic pipeline was constructed and applied on publicly available microarray data sets obtained from AR positive BC cell lines treated with dihydrotestosterone (DHT). Expression levels of genes identified through the pipeline along with set of epithelial mesenchymal transition (EMT) markers, proliferation associated genes and enzymes involved in intracrinal androgen metabolism was evaluated in a cohort of Indian Breast cancer patients. Tumors were divided into AR high and low based on the gene score and association with clinical parameters, circulating androgens, disease free survival, proliferation and EMT markers were examined, all results were further validated in external public datasets. Results AR driven gene score was calculated as average expression of the 6 genes selected through bioinformatic analysis. 53% (133/249) tumors were classified as AR high by the gene score and had significantly better clinical parameters such as higher age, smaller tumor size, lower grade and lower proliferation. Tumors with high AR driven gene score had significantly better disease-free survival (mean survival time of 86.13 vs 72.69 months, log rank p=0.032) when compared to the AR low tumors. A subset analysis within TNBC (N=66) showed 36% (24/66) were AR high and had significantly higher expression of EMT markers (p=0.024). Though circulating levels of total testosterone was not different between the groups, intratumoral levels of 5 alfa reductase (SRD5A1) was significantly high in tumors with high AR driven score. Conclusion Role of AR in breast cancer is debatable and difficult to decipher with protein detection alone. Our results support the context dependent function of AR in driving better prognosis, while identifying its role in driving EMT within TNBC tumors.

Abstract Background Triple-negative breast cancer (TNBC) is a heterogeneous disease with a significant clinical challenge. TNBC alarmingly comprises 25-30% of breast cancers in India compared with only 10-15% in the West. However, immunotherapy was approved for high-risk early-stage TNBCs in the West. Hence, a long-standing question is whether Indian TNBCs immunologically and clinically resemble Western TNBCs such that they respond similarly to immunotherapies. Here we sought to elucidate the immune landscape of Indian TNBCs for the first time, compare them to Western disease and associate them with clinical parameters, cellular types/signaling, and immunotherapy response. Methods We profiled 730 immune genes in 88 retrospective Indian TNBC samples using NanoString platform, clustered them into subtypes using a machine-learning approach, and compared them with Western TNBCs (n=422; public datasets). Subtype-specific gene signatures were identified, followed by clinicopathological, immune cell type, and pathway (multiomics) analyses. We also assessed responses to (cross-cancer) immunotherapy. Tumor-infiltrating lymphocytes (TILs) and pan-macrophage marker were evaluated using hematoxilin-eosin staining and immunohistochemistry, respectively. Results We identified three robust and similarly distributed TNBC immune transcriptome subtypes (Subtypes-1-3) in Indian women, and they are represented correspondingly in Western TNBCs and associated with well-known TNBC subtypes. Irrespective of the ethnicity, Subtype-1 harbored tumor microenvironmental and anti-tumor immune events associated with smaller tumors, younger age, and a better prognosis. Subtype-1 mainly represented basal-like/claudin-low breast cancer and immunomodulatory TNBC subtypes. Subtype-1 showed an increase in a cascade of events, including damage-associated molecular patterns, acute inflammation, Th1 responses, T-cell receptor-related and chemokine-specific signaling, antigen presentation, and viral-mimicry pathways. Subtype-1 was significantly (p<0.05) associated with pre-menopausal women, dense TILs and responses and/or improved prognosis to anti-PD-L1 and MAGEA3 immunotherapies. Subtype-2 was enriched for Th2/Th17 responses, CD4 + regulatory cells, basal-like/mesenchymal subtypes, and an intermediate prognosis. Subtype-3 patients expressed innate immune genes/proteins, including those representing macrophages and neutrophils, and had poor survival. Conclusion We identified three immune-specific TNBC subtypes in Indian patients with differential clinical and immune behaviors, which largely overlapped with the Western TNBC cohorts. This study suggests cancer immunotherapy in TNBC may work similarly in both populations. Hence, this may expedite pharmaceutical adoption of immunotherapy to Indian TNBC patients.