PN
Phi‐Yen Nguyen
Author with expertise in MicroRNA Regulation in Cancer and Development
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(67% Open Access)
Cited by:
59
h-index:
14
/
i10-index:
18
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Effect of nature prescriptions on cardiometabolic and mental health, and physical activity: a systematic review

Phi‐Yen Nguyen et al.Apr 1, 2023
X
H
T
P
Nature prescriptions are gaining popularity as a form of social prescribing in support of sustainable health care. This systematic review and meta-analysis aims to synthesise evidence on the effectiveness of nature prescriptions and determine the factors important for their success. We searched five databases from inception up to July 25, 2021. Randomised and non-randomised controlled studies featuring a nature prescription (ie, a referral or an organised programme, by a health or social professional, to encourage spending time in nature) were included. Two reviewers independently conducted all steps of study selection; one reviewer collected summary data from published reports and conducted the risk of bias assessment. Random-effect DerSimonian-Laird meta-analyses were conducted for five key outcomes. We identified 92 unique studies (122 reports), of which 28 studies contributed data to meta-analyses. Compared with control conditions, nature prescription programmes resulted in a greater reduction in systolic blood pressure (mean difference –4·82 mm Hg [–8·92 to –0·72]) and diastolic blood pressure (mean difference –3·82 mm Hg [–6·47 to –1·16). Nature prescriptions also had a moderate to large effect on depression scores (post-intervention standardised mean difference –0·50 [–0·84 to –0·16]; change from baseline standardised mean difference –0·42 [–0·82 to –0·03]) and anxiety scores (post-intervention standardised mean difference –0·57 [–1·12 to –0·03]; change from baseline standardised mean difference –1·27 [–2·20 to –0·33]). Nature prescriptions resulted in a greater increase in daily step counts than control conditions (mean difference 900 steps [790 to 1010]) but did not improve weekly time of moderate physical activity (mean difference 25·90 min [–10·26 to 62·06]). A subgroup analysis restricted to studies featuring a referring institution showed stronger effects on depression scores, daily step counts, and weekly time of moderate physical activity than the general analysis. Beneficial effects on anxiety and depression scores were mainly provided by interventions involving social professionals whereas beneficial effects on blood pressures and daily step counts were provided mainly by interventions involving health professionals. Most studies have a moderate to high risk of bias. Nature prescription programmes showed evidence of cardiometabolic and mental health benefits and increases in walking. Effective nature prescription programmes can involve a range of natural settings and activities and can be implemented via social and community channels, in addition to health professionals.
35

Generation of Schwann cell derived melanocytes from hPSCs identifies pro-metastatic factors in melanoma

Ryan Samuel et al.Mar 7, 2023
+15
A
A
R
Summary/Abstract The neural crest (NC) is highly multipotent and generates diverse lineages in the developing embryo. However, spatiotemporally distinct NC populations display differences in fate potential, such as increased gliogenic and parasympathetic potential from later migrating, nerve-associated Schwann cell precursors (SCPs). Interestingly, while melanogenic potential is shared by both early migrating NC and SCPs, differences in melanocyte identity resulting from differentiation through these temporally distinct progenitors have not been determined. Here, we leverage a human pluripotent stem cell (hPSC) model of NC temporal patterning to comprehensively characterize human NC heterogeneity, fate bias, and lineage development. We captured the transition of NC differentiation between temporally and transcriptionally distinct melanogenic progenitors and identified modules of candidate transcription factor and signaling activity associated with this transition. For the first time, we established a protocol for the directed differentiation of melanocytes from hPSCs through a SCP intermediate, termed trajectory 2 (T2) melanocytes. Leveraging an existing protocol for differentiating early NC-derived melanocytes, termed trajectory 1 (T1), we performed the first comprehensive comparison of transcriptional and functional differences between these distinct melanocyte populations, revealing differences in pigmentation and unique expression of transcription factors, ligands, receptors and surface markers. We found a significant link between the T2 melanocyte transcriptional signature and decreased survival in melanoma patients in the cancer genome atlas (TCGA). We performed an in vivo CRISPRi screen of T1 and T2 melanocyte signature genes in a human melanoma cell line and discovered several T2-specific markers that promote lung metastasis in mice. We further demonstrated that one of these factors, SNRPB, regulates the splicing of transcripts involved in metastasis relevant functions such as migration, cell adhesion and proliferation. Overall, this study identifies distinct developmental trajectories as a source of diversity in melanocytes and implicates the unique molecular signature of SCP-derived melanocytes in metastatic melanoma.
35
Citation1
0
Save
0

Biomedical researchers perspectives on the reproducibility of research: a cross-sectional international survey

Kelly Cobey et al.Jan 1, 2023
+4
M
S
K
We conducted an international cross-sectional survey of biomedical researchers perspectives on the reproducibility of research. This study builds on a widely cited 2016 survey on reproducibility, and provides a biomedical-specific and contemporary perspective on reproducibility. To sample the community, we randomly selected 400 journals indexed in MEDLINE, from which we extracted the author names and e-mails from all articles published between October 1, 2020 and October 1, 2021. We invited participants to complete an anonymous online survey which collected basic demographic information, perceptions about a reproducibility crisis, perceived causes of irreproducibility of research results, experience conducting replication studies, and knowledge of funding and training for research on reproducibility. A total of 1924 participants accessed our survey, of which 1630 provided useable responses (response rate 7% of 23,234). Key findings include that 72% of participants agreed there was a reproducibility crisis in biomedicine, with 27% of participants indicating the crisis was significant. The leading perceived cause of irreproducibility was a pressure to publish with 62% of participants indicating it always or very often contributes. About half of the participants (54%) had run a replication of their own previously published study while slightly more (57%) had run a replication of another researchers study. Just 16% of participants indicated their institution had established procedures to enhance the reproducibility of biomedical research; and 67% felt their institution valued new research over replication studies. Participants also reported few opportunities to obtain funding to attempt to reproduce a study and 83% perceived it would be harder to do so than to get funding to do a novel study. Our results may be used to guide training and interventions to improve research reproducibility and to monitor rates of reproducibility over time. The findings are also relevant to policy makers and academic leadership looking to create incentives and research cultures that support reproducibility and value research quality.
0
0
Save