YZ
Yuxuan Zhao
Author with expertise in Advanced Techniques in Bioimage Analysis and Microscopy
Achievements
This user has not unlocked any achievements yet.
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
7
(29% Open Access)
Cited by:
2
h-index:
16
/
i10-index:
38
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

A General Approach for the Synthesis of Cyanoisopropyl Bicyclo[1.1.1]pentane (BCP) Motifs by Energy Transfer Process

Lin Li et al.Aug 13, 2024
+6
B
Q
L
Bicyclo[1.1.1]pentane (BCP) heteroaryls make up an important class of BCP derivatives in drug discovery. Herein, we report the visible-light-mediated synthesis of cyanoisopropyl BCP-heteroaryls motifs from N-containing heterocycles, [1.1.1]propellane, and AIBN (2,2′-azobis(isobutyronitrile)) through three-component cascade reaction. Importantly, this protocol is compatible with pyrazinones, quinoxaline-2(1H)-one, azauracils, quinoline derivatives, and imidazo[1,2-b]pyridazine, as well as various phenyl disulfide derivatives; thus, this operationally simple and general methodology could enable rapid library generation of sought-after BCP derivatives for drug development.
0
Citation2
0
Save
0

Changes in flavour- and taste-presenting substances in Hypsizygus marmoreus mushroom packaged in polypropylene nanofilm

Biao Wang et al.Jul 1, 2024
+4
J
K
B
Hypsizygus marmoreus mushroom is known for its pleasant flavour and delicious taste. However, its flavour quality deteriorates rapidly during postharvest storage. In the present work, we explored the dynamic changes in flavour-presenting substances and taste components in H. marmoreus packaged in polyethylene nanofilm (0.05 mm) during low temperature storage (12 days). We used headspace solid-phase microextraction combined with gas chromatography-mass spectrometry to analyse the volatile flavour components; high performance liquid chromatography and liquid chromatography-mass spectrometry to analyse the non-volatile flavour (taste-presenting) substances (e.g., soluble sugars, taste nucleotides, free amino acids, and organic acids); and the relative odour activity value (ROAV) and taste active value (TAV) methods to determine the flavour substances in fresh and stored H. marmoreus. Results revealed that n-octanal, 1-octene-3-one, and 1-octene-3-ol were the characteristic volatile flavour substances, and that trans-2-octenal was the key substance affecting the formation of volatile flavours in fresh H. marmoreus. Trans,trans-2,4-nonadienal, and 3-octanone were the key volatile substances that resulted in flavour deterioration. Among the non-volatile flavour substances, trehalose, 5'-GMP, glutamic acid, alanine, and arginine were the key taste-presenting substances. In addition, oxalic acid and lysine were the key taste substances after H. marmoreus deterioration. These results provided a theoretical basis for rapid quality detection, flavour identification, and shelf-life prediction of H. marmoreus.
0

A new type of carboxysomal carbonic anhydrase in sulfur chemolithoautotrophs from alkaline environments

Jana Wieschollek et al.Aug 23, 2024
+17
A
D
J
ABSTRACT Autotrophic bacteria are able to fix CO 2 in a great diversity of habitats, even though this dissolved gas is relatively scarce at neutral pH and above. As many of these bacteria rely on CO 2 fixation by ribulose 1,5-bisphospate carboxylase/oxygenase (RubisCO) for biomass generation, they must compensate for the catalytical constraints of this enzyme with CO 2 -concentrating mechanisms (CCMs). CCMs consist of CO 2 and HCO 3 − transporters and carboxysomes. Carboxysomes encapsulate RubisCO and carbonic anhydrase (CA) within a protein shell and are essential for the operation of a CCM in autotrophic Bacteria that use the Calvin-Benson-Basham cycle. Members of the genus Thiomicrospira lack genes homologous to those encoding previously described CA, and prior to this work, the mechanism of function for their carboxysomes was unclear. In this paper, we provide evidence that a member of the recently discovered iota family of carbonic anhydrase enzymes (ιCA) plays a role in CO 2 fixation by carboxysomes from members of Thiomicrospira and potentially other Bacteria . Carboxysome enrichments from Thiomicrospira pelophila and Thiomicrospira aerophila were found to have CA activity and contain ιCA, which is encoded in their carboxysome loci. When the gene encoding ιCA was interrupted in T. pelophila , cells could no longer grow under low-CO 2 conditions, and CA activity was no longer detectable in their carboxysomes. When T. pelophila ιCA was expressed in a strain of Escherichia coli lacking native CA activity, this strain recovered an ability to grow under low CO 2 conditions, and CA activity was present in crude cell extracts prepared from this strain. IMPORTANCE Here, we provide evidence that iota carbonic anhydrase (ιCA) plays a role in CO 2 fixation by some organisms with CO 2 -concentrating mechanisms; this is the first time that ιCA has been detected in carboxysomes. While ιCA genes have been previously described in other members of bacteria, this is the first description of a physiological role for this type of carbonic anhydrase in this domain. Given its distribution in alkaliphilic autotrophic bacteria, ιCA may provide an advantage to organisms growing at high pH values and could be helpful for engineering autotrophic organisms to synthesize compounds of industrial interest under alkaline conditions.
3

Implicit encoding via semantic redundancy elimination enabling adaptive compression of multidimensional biological data

Yifan Ma et al.Aug 23, 2023
+12
Y
Y
Y
Abstract With the rapid development in advanced bioimaging techniques, numerous image data has been generated for various high-throughput applications, which pose big challenges to efficient storage, transmission and sharing of these data. Traditional compression techniques and current deep learning-based compression methods lack the elimination of semantic redundancy on multidimensional biomedical data containing high dynamic range and complex structural features. Here, we propose compression with implicit function correlation (SWIFT) approach based on the first-proved high correlation of biomedical data in the implicit function domain. Through reducing the extra-compression of data correlation, SWIFT approach shows compression ratios and processing speed higher than existing implicit neural representation-based approaches. With further combination of residual entropy coding and attention mechanism, SWIFT achieves compression of various biological data with high time continuity and structure fidelity, for example, yielding 1500-fold, effective compression of live-cell 3D super-resolution data to enables downstream tasks and quantitative analyses at notably improved efficiency.
4

Knowledge and Awareness of coronavirus disease 2019 (COVID-19) among Chinese dental students——a comparison study

Chao Deng et al.Feb 3, 2021
+4
H
C
C
Abstract Backgroud This study aimed to measure the knowledge and awareness of COVID-19 among Chinese dental students during the global outbreak recently. Method A descriptive cross-sectional study was performed among dental students and nonmedical college students in China. All the participants were required to anonymously answer a reliable online questionnaire, which covered 3 different fields of COVID-19. Average scores of dental students (D group), including junior (JD group) and senior dental students (SD group), and nonmedical college students (N group) were compared respectively. Chi-square test and independent sample T test were taken for statistical analysis with SPSS.12. Results Totally 497 questionnaires were collected, including 224 from dental students and 273 from non-medical students. The overall average score was 57±19.2. The average scores of dental students were 64.5±18. The D group had significantly higher scores on the total score, section scores, and 20 questions respectively than with the N group. No significant differences were found on 5 questions. Compared with the N group, the SD group won on all three sections while JD group failed to win on the diagnose section. Conclusion Although the dental student showed good awareness regarding the clinical aspects of COVID-19 than non-medical students, there are still some weakness in the part of treatment and prevention, which need to be strengthened for better prepare during work. Besides, the low accuracy rate of lower grade dental students is also worth noting.
0

Tailoring the gas transport properties of network polyimide membranes by bromination/debromination

Jun Hu et al.Jun 13, 2024
+4
Y
J
J
Constructing membranes that possess both exceptional gas transport property and strong resistance to CO2-induced plasticization is a crucial need in membrane separation, yet it still stands as an ongoing challenge. In present study, we firstly added the bromine atom into the 2, 2′-bis(trifluoromethyl)benzidine (TF) to synthesis two new bromine substituted diamines, and subsequently one of the brominated diamines was employed as a comonomer alongside commercial tris(4-aminophenyl)amine (TAPA) and dianhydride 6FDA to prepare the network polyimide (PI) membrane via copolymerization. Following this, these new brominated PIs would undergo debromination process during the subsequent heating treatment. As a result, the bromination/debromination effect created new microporosity, which increased the d-spacing and BET surface area of the membrane, thereby largely enhancing the crosslinked PI membrane's gas separation performance. Moreover, the robust network structures achieved through in-situ crosslinking way, derived from a segment of trifunctional TAPA monomers, enhance the resultant membrane's resistance to CO2 plasticization issue. An exemplified membrane referred to as 6 F-TA/TF-dBr-450 membrane displays outstanding CO2/CH4 separation capabilities, with a CO2 permeability of 1420.56 Barrer and a CO2/CH4 selectivity of 39.67, surpassing the 2008 Roberson upper bound by a considerable margin. Besides, this membrane demonstrates outstanding durability against CO2-induced plasticization, showcasing its strength under pressures of at least 35 Bar.
0

The Cross-zonal Day-ahead ATC Calculation Model Considering the Uncertainty of Wind Power

Zhongyang Chen et al.May 9, 2024
+3
M
X
Z