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Peili Zhang
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A bio-inspired coordination polymer as outstanding water oxidation catalyst via second coordination sphere engineering

Wenlong Li et al.Nov 7, 2019
Abstract First-row transition metal-based catalysts have been developed for the oxygen evolution reaction (OER) during the past years, however, such catalysts typically operate at overpotentials ( η ) significantly above thermodynamic requirements. Here, we report an iron/nickel terephthalate coordination polymer on nickel form ( NiFeCP/NF ) as catalyst for OER, in which both coordinated and uncoordinated carboxylates were maintained after electrolysis. NiFeCP/NF exhibits outstanding electro-catalytic OER activity with a low overpotential of 188 mV at 10 mA cm −2 in 1.0 KOH, with a small Tafel slope and excellent stability. The pH-independent OER activity of NiFeCP/NF on the reversible hydrogen electrode scale suggests that a concerted proton-coupled electron transfer (c-PET) process is the rate-determining step (RDS) during water oxidation. Deuterium kinetic isotope effects, proton inventory studies and atom-proton-transfer measurements indicate that the uncoordinated carboxylates are serving as the proton transfer relays, with a similar function as amino acid residues in photosystem II (PSII), accelerating the proton-transfer rate.
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Construction of an Indium‐based Coordination Polymer with Redox Non‐Innocent Ligand for High‐Efficient Electrochemical CO2 Reduction

Chang Liu et al.Jan 19, 2025
Developing high‐activity and long‐term stable electrocatalysts for electrochemical CO2 reduction reaction (eCO2RR) to valuable products is still a challenge. An in‐depth understanding of reaction mechanisms and the structure‐function relationship is required for the development of an advanced catalytic eCO2RR system. Herein, a coordination polymer of indium(III) and benzenehexathiol (BHT) was developed as an electrocatalyst (In‐BHT) for eCO2RR to HCOO−, which displayed an outstanding catalytic performance over the entire pH range. However, experimental results revealed significantly different catalytic pathways in the acid and neutral/alkaline solutions, which are attributed to the influence of redox non‐innocent ligands on the rate‐determining step (RDS). In the acid solution, the RDS is the formation of *OCOH intermediate through the proton transfer that originates from H2O in the solution, leading to relatively sluggish kinetics. But in the neutral or alkaline solution, the thiolate groups could be protonated during the catalytic process, and such proton can attack on carbon of absorbed CO2 via an intramolecular proton transfer, promoting the formation of *OCHO intermediate, resulting in faster kinetics. Our findings revealed the pivotal roles of the redox non‐innocent ligands of metal active sites for eCO2RR, providing a new idea for designing highly efficient electrocatalysts.
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BioKG: a comprehensive, high-quality biomedical knowledge graph for AI-powered, data-driven biomedical research

Yuan Zhang et al.Jan 1, 2023
To cope with the rapid growth of scientific publications and data in biomedical research, knowledge graphs (KGs) have emerged as a powerful data structure for integrating large volumes of heterogeneous data to facilitate accurate and efficient information retrieval and automated knowledge discovery (AKD). However, transforming unstructured content from scientific literature into KGs has remained a significant challenge, with previous methods unable to achieve human-level accuracy. In this study, we utilized an information extraction pipeline that won first-place in the LitCoin NLP Challenge to construct a large-scale KG using all PubMed abstracts. The quality of the large-scale information extraction rivals that of human expert annotations, signaling a new era of automatic, high-quality database construction from literature. Our extracted information markedly surpasses the amount of content in manually curated public databases. To enhance the KG9s comprehensiveness, we integrated relation data from 40 public databases and relation information inferred from high-throughput genomics data. The comprehensive KG enabled rigorous performance evaluation of AKD, infeasible in previous studies. We designed an interpretable, probabilistic-based inference method to identify indirect causal relations and achieved unprecedented results for drug target identification and drug repurposing. Taking lung cancer as an example, we found that 40% of drug targets reported in literature could have been predicted by our algorithm about 15 years ago in a retrospective study, demonstrating that substantial acceleration in scientific discovery could be achieved through automated hypotheses generation and timely dissemination. A cloud-based platform was developed for academic users to freely access this rich structured data and associated tools.