Rotational splittings are currently measured for several main sequence stars and a large number of red giants with the space mission Kepler. This will provide stringent constraints on rotation profiles. Our aim is to obtain seismic constraints on the internal transport and surface loss of angular momentum of oscillating solar-like stars. To this end, we study the evolution of rotational splittings from the pre-main sequence to the red-giant branch for stochastically excited oscillation modes. We modified the evolutionary code CESAM2K to take rotationally induced transport in radiative zones into account. Linear rotational splittings were computed for a sequence of $1.3 M_{\odot}$ models. Rotation profiles were derived from our evolutionary models and eigenfunctions from linear adiabatic oscillation calculations. We find that transport by meridional circulation and shear turbulence yields far too high a core rotation rate for red-giant models compared with recent seismic observations. We discuss several uncertainties in the physical description of stars that could have an impact on the rotation profiles. For instance, we find that the Goldreich-Schubert-Fricke instability does not extract enough angular momentum from the core to account for the discrepancy. In contrast, an increase of the horizontal turbulent viscosity by 2 orders of magnitude is able to significantly decrease the central rotation rate on the red-giant branch. Our results indicate that it is possible that the prescription for the horizontal turbulent viscosity largely underestimates its actual value or else a mechanism not included in current stellar models of low mass stars is needed to slow down the rotation in the radiative core of red-giant stars.

This paper gives an overview of the CARMENES instrument and of the survey that will be carried out with it during the first years of operation. CARMENES (Calar Alto high-Resolution search for M dwarfs with Exoearths with Near-infrared and optical Echelle Spectrographs) is a next-generation radial-velocity instrument under construction for the 3.5m telescope at the Calar Alto Observatory by a consortium of eleven Spanish and German institutions. The scientific goal of the project is conducting a 600-night exoplanet survey targeting ~ 300 M dwarfs with the completed instrument. The CARMENES instrument consists of two separate echelle spectrographs covering the wavelength range from 0.55 to 1.7 μm at a spectral resolution of R = 82,000, fed by fibers from the Cassegrain focus of the telescope. The spectrographs are housed in vacuum tanks providing the temperature-stabilized environments necessary to enable a 1 m/s radial velocity precision employing a simultaneous calibration with an emission-line lamp or with a Fabry-Perot etalon. For mid-M to late-M spectral types, the wavelength range around 1.0 μm (Y band) is the most important wavelength region for radial velocity work. Therefore, the efficiency of CARMENES has been optimized in this range. The CARMENES instrument consists of two spectrographs, one equipped with a 4k x 4k pixel CCD for the range 0.55 - 1.05 μm, and one with two 2k x 2k pixel HgCdTe detectors for the range from 0.95 - 1.7μm. Each spectrograph will be coupled to the 3.5m telescope with two optical fibers, one for the target, and one for calibration light. The front end contains a dichroic beam splitter and an atmospheric dispersion corrector, to feed the light into the fibers leading to the spectrographs. Guiding is performed with a separate camera; on-axis as well as off-axis guiding modes are implemented. Fibers with octagonal cross-section are employed to ensure good stability of the output in the presence of residual guiding errors. The fibers are continually actuated to reduce modal noise. The spectrographs are mounted on benches inside vacuum tanks located in the coud´e laboratory of the 3.5m dome. Each vacuum tank is equipped with a temperature stabilization system capable of keeping the temperature constant to within ±0.01°C over 24 hours. The visible-light spectrograph will be operated near room temperature, while the near-IR spectrograph will be cooled to ~ 140 K. The CARMENES instrument passed its final design review in February 2013. The MAIV phase is currently ongoing. First tests at the telescope are scheduled for early 2015. Completion of the full instrument is planned for the fall of 2015. At least 600 useable nights have been allocated at the Calar Alto 3.5m Telescope for the CARMENES survey in the time frame until 2018. A data base of M stars (dubbed CARMENCITA) has been compiled from which the CARMENES sample can be selected. CARMENCITA contains information on all relevant properties of the potential targets. Dedicated imaging, photometric, and spectroscopic observations are underway to provide crucial data on these stars that are not available in the literature.

Abstract During the spread of the COVID-19 pandemic, the SARS-CoV-2 coronavirus underwent mutation and recombination events that altered its genome compositional structure, thus providing an unprecedented opportunity to search for adaptive evolutionary trends in real-time. The mutation rate in coronavirus is known to be lower than expected for neutral evolution, thus suggesting a role for natural selection. We summarize the compositional heterogeneity of each viral genome by computing its Sequence Compositional Complexity (SCC). To study the full range of SCC diversity, random samples of high-quality coronavirus genomes covering pandemic time span were analyzed. We then search for evolutionary trends that could inform on the adaptive process of the virus to its human host by computing the phylogenetic ridge regression of SCC against time (i.e., the collection date of each viral isolate). In early samples, we find no statistical support for any trend in SCC, although the viral genome appears to evolve faster than Brownian Motion (BM) expectation. However, in samples taken after the emergence of high fitness variants, and despite the brief time span elapsed, a driven decreasing trend for SCC, and an increasing one for its absolute evolutionary rate, are detected, pointing to a role for selection in the evolution of SCC in coronavirus genomes. We conclude that the higher fitness of variant genomes leads to adaptive trends of SCC over pandemic time in the coronavirus.

Disclaimer text The author has withdrawn this manuscript due to a duplicate posting of manuscript number BIORXIV/2021/467547. Therefore, the author does not wish this work to be cited as reference for the project. If you have any questions, please contact the corresponding author.

Tropical gar (Atractosteus tropicus), is freshwater and estuarine fish that has inhabited the Earth since the Mesozoic era, undergoing limited physiological variation ever since. This omnivorous fish is endemic to southern Mexico and part of Central America. Besides its recognized cultural and scientific relevance, the species has seen remarkable growth in its economic impact due to pisciculture. Previous studies have highlighted the role of microbial communities in fish, particularly those in the gut microbiome, in maintaining their host homeostasis or disease. In this study, we present the first report of the whole taxonomic composition of microbial communities in gut contents of adults A. tropicus, by sex (female and male) and origin (wild and cultivated). Using culture-independent techniques, we extracted metagenomic DNA that was used for high throughput 16S rDNA profiling by amplifying the V4-V5 hypervariable regions of the bacterial gene. A total of 364,735 total paired-end reads were obtained on an Illumina MiSeq sequencing platform, belonging to 508 identified genera, with the most and least abundant are Cetobacterium, Edwardsiella, Serratia, Clostridium sensu stricto, Paludibacter and Campylobacter, Snodgrassella, Albirhodobacter, Lentilitoribacter, respectively. We detected that, by sex and origin, Proteobacteria, Fusobacteria, Firmicutes and Bacteroidetes phyla are the core gut microbiome of the adults A. tropicus. We discover the Deinococcus-Thermus phylum sequence, wildtype males only, with extremophile capacity in another freshwater fish. We also identified the species Lactococcus lactis strains CAU929 and CAU6600, Cp6 and CAU9951, Cetobacterium strain H69, Aeromonas hydrophila strains P5 and WR-5-3-2, Aeromonas sobria strain CP DC28 and Aeromonas hydrophila with probiotic potential in aquaculture within the three dominant phyla, especially in wildtype organisms.