The phenomenon of inbreeding depression is well documented and behavioral adaptations for inbreeding avoidance have been described. However, there is debate over whether inbreeding depression is always an important selective force on behavior. Here, we summarize recent evidence for inbreeding depression under natural conditions, review inbreeding avoidance mechanisms, and discuss how these are influenced by social structure. We also examine the idea that animals have evolved mechanisms to avoid outbreeding.

High-coverage sequencing of 79 (wild and captive) individuals representing all six non-human great ape species has identified over 88 million single nucleotide polymorphisms providing insight into ape genetic variation and evolutionary history and enabling comparison with human genetic diversity. In an effort to provide insights into great ape genetic variation, the authors sequence 79 wild- and captive-born individuals from across all six great ape species and seven subspecies. Their data and analyses shed light on population structure and gene flow, inbreeding, inferred dynamics of effective population sizes and the differences in the rate of gene loss among the great apes. This new catalogue of great ape genome diversity provides a valuable resource for evolutionary and conservation studies. Most great ape genetic variation remains uncharacterized1,2; however, its study is critical for understanding population history3,4,5,6, recombination7, selection8 and susceptibility to disease9,10. Here we sequence to high coverage a total of 79 wild- and captive-born individuals representing all six great ape species and seven subspecies and report 88.8 million single nucleotide polymorphisms. Our analysis provides support for genetically distinct populations within each species, signals of gene flow, and the split of common chimpanzees into two distinct groups: Nigeria–Cameroon/western and central/eastern populations. We find extensive inbreeding in almost all wild populations, with eastern gorillas being the most extreme. Inferred effective population sizes have varied radically over time in different lineages and this appears to have a profound effect on the genetic diversity at, or close to, genes in almost all species. We discover and assign 1,982 loss-of-function variants throughout the human and great ape lineages, determining that the rate of gene loss has not been different in the human branch compared to other internal branches in the great ape phylogeny. This comprehensive catalogue of great ape genome diversity provides a framework for understanding evolution and a resource for more effective management of wild and captive great ape populations.

Sex differences in dispersal distance are widespread in birds and mammals, but the predominantly dispersing sex differs consistently between the classes. There has been persistent debate over the relative importance of two factors - intrasexual competition and inbreeding avoidance - in producing sex-biased dispersal, and over the sources of the difference in dispersal patterns between the two classes. Recent studies cast new light on these questions.

Extensive observations of foraging female lions reveal that two group sizes maximize foraging success during the season of prey scarcity: one female and five or six females. Foraging success does not vary significantly with group size when prey is abundant. Female lions live in fission-fusion social units (prides) and forage only with members of their own pride. If lion grouping patterns were primarily related to group-size-specific feeding efficiency, females in prides containing fewer than five females should forage alone when prey is scarce, whereas females in larger prides should forage alone or in groups of five or six. However, extensive data on the grouping patterns of radio-collared females show that females in small prides most commonly forage in as large a group as possible, even at the expense of foraging efficiency. Females in large prides most often forage in intermediate group sizes of four or five. However, mothers keep their cubs in a creche and form highly stable maternity groups that are effective in defending the cubs against infanticidal males. Most large prides contain a creche involving four or five mothers, and in the absence of a creche, large prides show no preference for any group size. Females also compete aggressively against neighboring prides, and larger groups successfully repel smaller ones in territorial disputes. Small prides appear to be excessively gregarious in order to compete against larger neighboring prides.

Female chimpanzees often forage alone and do not display obvious linear dominance hierarchies; consequently, it has been suggested that dominance is not of great importance to them. However, with the use of data from a 35-year field study of chimpanzees, high-ranking females were shown to have significantly higher infant survival, faster maturing daughters, and more rapid production of young. Given the foraging behavior of chimpanzees, high rank probably influences reproductive success by helping females establish and maintain access to good foraging areas rather than by sparing them stress from aggression.

Abstract. Theoretical and experimental studies of assessment in animal contests have, until now, focused on disputes between single individuals. However, whereas single competitors usually avoid fights with opponents that are larger or stronger than themselves, in contests between social groups competitors might be expected to adjust their agonistic behaviour according to the number of individuals in their own and the opposing group. This hypothesis was tested using playback experiments to generate controlled artificial contests between groups of female lions. Recordings of single females roaring and groups of three females roaring in chorus were played back to simulate the presence of unfamiliar intruders within the territories of 21 different lion prides in Serengeti National Park, Tanzania. Defending adult females were less likely to approach playbacks of three intruders than of a single intruder and on occasions when they did approach three intruders they made their approach more cautiously. Defenders also carefully adjusted their decision to approach according to the size and composition of their own group, and attempted to recruit extra companions to the contest by roaring when some were absent at the time of playback. A strong selective advantage to avoiding the costs of fighting with larger groups could have led to the widespread evolution of numerical assessment skills in social species.

Human-microbiota coevolution The bacteria that make their home in the intestines of modern apes and humans arose from ancient bacteria that colonized the guts of our common ancestors. Moeller et al. have developed a method to compare rapidly evolving gyrB gene sequences in fecal samples from humans and wild chimpanzees, bonobos, and gorillas (see the Perspective by Segre and Salafsky). Comparison of the gyrB phylogenies of major bacterial lineages reveals that they mostly match the apehominid phylogeny, except for some rare symbiont transfers between primate species. Gut bacteria therefore are not simply acquired from the environment, but have coevolved for millions of years with hominids to help shape our immune systems and development. Science , this issue p. 380 ; see also p. 350

In order to compare evolved human and chimpanzees' life histories we present a synthetic life table for free-living chimpanzees, derived from data collected in five study populations (Gombe, Taı̈, Kibale, Mahale, Bossou). The combined data from all populations represent 3711 chimpanzee years at risk and 278 deaths. Males show higher mortality than females and data suggest some inter-site variation in mortality. Despite this variation, however, wild chimpanzees generally have a life expectancy at birth of less than 15 years and mean adult lifespan (after sexual maturity) is only about 15 years. This is considerably lower survival than that reported for chimpanzees in zoos or captive breeding colonies, or that measured among modern human hunter-gatherers. The low mortality rate of human foragers relative to chimpanzees in the early adult years may partially explain why humans have evolved to senesce later than chimpanzees, and have a longer juvenile period.