Risk factors for acute GVHD (AGVHD), overall survival, and transplant-related mortality were evaluated in adults receiving allogeneic hematopoietic cell transplants (1999-2005) from HLA-identical sibling donors (SDs; n = 3191) or unrelated donors (URDs; n = 2370) and reported to the Center for International Blood and Marrow Transplant Research, Minneapolis, MN. To understand the impact of transplant regimen on AGVHD risk, 6 treatment categories were evaluated: (1) myeloablative conditioning (MA) with total body irradiation (TBI) + PBSCs, (2) MA + TBI + BM, (3) MA + nonTBI + PBSCs, (4) MA + nonTBI + BM, (5) reduced intensity conditioning (RIC) + PBSCs, and (6) RIC + BM. The cumulative incidences of grades B-D AGVHD were 39% (95% confidence interval [CI], 37%-41%) in the SD cohort and 59% (95% CI, 57%-61%) in the URD cohort. Patients receiving SD transplants with MA + nonTBI + BM and RIC + PBSCs had significantly lower risks of grades B-D AGVHD than patients in other treatment categories. Those receiving URD transplants with MA + TBI + BM, MA + nonTBI + BM, RIC + BM, or RIC + PBSCs had lower risks of grades B-D AGVHD than those in other treatment categories. The 5-year probabilities of survival were 46% (95% CI, 44%-49%) with SD transplants and 33% (95% CI, 31%-35%) with URD transplants. Conditioning intensity, TBI and graft source have a combined effect on risk of AGVHD that must be considered in deciding on a treatment strategy for individual patients.

PURPOSE Acute myelogenous leukemia (AML) and myelodysplastic syndrome (MDS) primarily afflict older individuals. Hematopoietic cell transplantation (HCT) is generally not offered because of concerns of excess morbidity and mortality. Reduced-intensity conditioning (RIC) regimens allow increased use of allogeneic HCT for older patients. To define prognostic factors impacting long-term outcomes of RIC regimens in patients older than age 40 years with AML in first complete remission or MDS and to determine the impact of age, we analyzed data from the Center for International Blood and Marrow Transplant Research (CIBMTR). PATIENTS AND METHODS We reviewed data reported to the CIBMTR (1995 to 2005) on 1,080 patients undergoing RIC HCT. Outcomes analyzed included neutrophil recovery, incidence of acute or chronic graft-versus-host disease (GVHD), nonrelapse mortality (NRM), relapse, disease-free survival (DFS), and overall survival (OS). RESULTS Univariate analyses demonstrated no age group differences in NRM, grade 2 to 4 acute GVHD, chronic GVHD, or relapse. Patients age 40 to 54, 55 to 59, 60 to 64, and > or = 65 years had 2-year survival rates as follows: 44% (95% CI, 37% to 52%), 50% (95% CI, 41% to 59%), 34% (95% CI, 25% to 43%), and 36% (95% CI, 24% to 49%), respectively, for patients with AML (P = .06); and 42% (95% CI, 35% to 49%), 35% (95% CI, 27% to 43%), 45% (95% CI, 36% to 54%), and 38% (95% CI, 25% to 51%), respectively, for patients with MDS (P = .37). Multivariate analysis revealed no significant impact of age on NRM, relapse, DFS, or OS (all P > .3). Greater HLA disparity adversely affected 2-year NRM, DFS, and OS. Unfavorable cytogenetics adversely impacted relapse, DFS, and OS. Better pre-HCT performance status predicted improved 2-year OS. CONCLUSION With these similar outcomes observed in older patients, we conclude that older age alone should not be considered a contraindication to HCT.

Abstract T cell responses to minor histocompatibility antigens (mHAs) mediate graft versus leukemia (GvL) effects and graft versus host disease (GvHD) in allogeneic hematopoietic cell transplant (alloHCT). Therapies that boost T cell responses improve the efficacy of alloHCT; however, these have been limited by concurrent increases in the incidence and severity of GvHD. mHAs with expression restricted to hematopoietic tissue (GvL mHAs) are attractive targets for driving GvL without causing GvHD. Prior work to identify mHAs has focused on a small set of mHAs or population-level SNP association studies. We report here the discovery of a large set of novel GvL mHAs based on predicted peptide immunogenicity, restriction of expression to hematopoietic tissue or GvHD target organs, and degree of sharing among donor-recipient pairs (DRPs) in the DISCOVeRY-BMT dataset of 3231 alloHCT DRPs. The total number of predicted mHAs and count within each class of predicted mHAs significantly differed by recipient genomic ancestry group, with European American>Hispanic>African American for each. The number of mHAs also differed markedly by HLA allele, even among alleles of the same gene. From the pool of predicted mHAs, we identified the smallest sets of GvL mHAs needed to cover 100% of DRPs with a given HLA allele. We then used mass spectrometry to search for high population frequency mHAs for three common HLA alleles. We validated a total of 24 novel predicted GvL mHAs that cumulatively are found within 98.8%, 60.7%, and 78.9% of DRPs within DISCOVeRY-BMT that express HLA-A*02:01, HLA-B*35:01, and HLA-C*07:02 respectively. We also confirmed in vivo immunogenicity of one example novel mHA via coculture of healthy human CD8 T cells with mHA-pulsed dendritic cells. This work demonstrates that identification of shared mHAs is a feasible and promising technique for expanding mHA-targeting immunotherapeutics to larger numbers of patients.

Importance Utilization of hematopoietic cell transplantation (HCT) for hematologic cancers previously demonstrated race, ethnicity, and age-based disparities. Objective To evaluate utilization over time by race, ethnicity, and age to determine if disparities persist in light of recent significant increases in HCT volume. Design, Setting, and Participants This US population-based retrospective cohort study includes patients who received transplants from January 2009 to December 2018. Data collection and cleaning occurred from February 2019 to November 2021, and data analysis occurred from January 2022 to October 2023. Method 1 restricted the analysis to Surveillance, Epidemiology and End Results (SEER) reporting areas for cases and transplants. Method 2 applied SEER age-, race-, and ethnicity-specific incidence rates to corresponding US census population and included all transplants reported to the Center for International Blood and Marrow Transplant Research. Race and ethnicity groups were hierarchically defined as Hispanic (any race), non-Hispanic White, non-Hispanic Black, and non-Hispanic Other (Asian and American Indian). Exposure Receipt of HCT. Main Outcomes and Measures Utilization rate of autologous or allogeneic HCT for patients with hematologic cancers by age, race, and ethnicity. Results From 2009 to 2018, 136 280 HCTs were analyzed for 6 hematologic cancers comprising 16.7% pediatric/adolescent/young adults (0-39 years), 83.3% adults (40-84 years), 58% male, 10.3% Hispanic, 11.4% non-Hispanic Black, 3.8% non-Hispanic Other, and 74.5% non-Hispanic White patients, with 49 385 allogeneic and 86 895 autologous HCTs performed. HCT utilization increased over time for all disease, age, race, and ethnic groups. From 2017 to 2018, adult (40-84 years) allogeneic transplant utilization for acute myeloid leukemia and myelodysplastic syndrome (MDS) was similar for Hispanic and non-Hispanic White or Other patients but was lower for non-Hispanic Black patients (acute myeloid leukemia: 19% vs 13%; MDS: 9%-10% vs 5%). Similarly, autologous transplant utilization for lymphoma was similar for all race and ethnicity groups; however, autologous transplant for multiple myeloma was highest for non-Hispanic White patients and lower for all other groups (31% vs 26%-27%). In patients aged 0 to 39 years, utilization of allogeneic transplant for acute lymphoblastic leukemia was highest in Hispanic patients, followed by non-Hispanic White, Black, and Other races (acute lymphoblastic leukemia: 19%, 18%, 17%, and 16%, respectively). Conclusions and Relevance In this cohort study of autologous and allogeneic transplant utilization for hematologic cancers, disparities persisted for non-Hispanic Black patients. Hispanic, non-Hispanic Other, and younger age groups had increased utilization over time that was on par with non-Hispanic White patients in the most recent cohort.

Summary: To address the limited software options for performing survival analyses with millions of SNPs, we developed gwasurvivr, an R/Bioconductor package with a simple interface for conducting genome wide survival analyses using VCF (outputted from Michigan or Sanger imputation servers) and IMPUTE2 files. To decrease the number of iterations needed for convergence when optimizing the parameter estimates in the Cox model we modified the R package survival such that the covariates in the model are first fit without the SNP, and those parameter estimates are used as initial points. We benchmarked gwasurvivr with other GWAS software capable of conducting genome wide survival analysis (genipe, SurvivalGWAS_SV, and GWASTools). gwasurvivr is significantly faster and shows better scalability as sample size and number of SNPs increase. Availability and implementation: gwasurvivr, including source code, documentation, and vignette are available at: https://github.com/suchestoncampbelllab/gwasurvivr Contact: Abbas Rizvi, Rizvi.33@osu.edu; Lara E Sucheston-Campbell, sucheston-campbell.1@osu.edu Supplementary information: Supplementary data are available at https://github.com/suchestoncampbelllab/gwasurvivr_manuscript

Haploidentical (Haplo) allogeneic HCTs (alloHCT) have been used more frequently over the last decade as survival is similar to HLA-matched related donor (MRD) alloHCTs. We aimed to identify donor and recipient immune signatures before alloHCT that are associated with clinically meaningful outcomes in MRD vs Haplo alloHCT recipients. This retrospective cohort study of 165 MRD (n=132) and Haplo (n=33) alloHCT recipients and their related donors between 2007-2019 with paired peripheral blood samples immunophenotyped for T-cell, B-cell, NK cell and dendritic cell (DC) subsets. Immune cells were quantified before alloHCT in donors and recipients; calculations of immune cell ratios were classified as high, intermediate, and low and analyzed with alloHCT outcomes. Haplo donors were younger than MRD donors (median: 35 vs 51 years), whereas Haplo recipients were older than MRD recipients (median: 68 vs 54 years), were more likely to have a Karnofsky Performance Score ≤70 (76% vs 57%), 3+ comorbidities (54% vs 47%), and were in complete remission prior to alloHCT (58% vs 42%). In MRD alloHCT, a lower ratio of CD4+ to CD8+ effector memory cells in the donor was associated with lower 4-yr overall survival (OS; 25% v 61%; p=0.009), lower 4-yr progression free survival (PFS; 25% v 58%; p=0.014) and higher incidence of 1-yr transplant-related mortality (TRM; 39% v 7%; p=0.009) in recipients. A higher ratio of CD8+ effector memory to total NK cells measured in MRD recipients was associated with a higher incidence of grade II-IV aGvHD (63% v 37%; p=0.004) but was not statistically significant for III-IV aGvHD (23% v 12%). In Haplo alloHCT, a lower ratio of total T-regulatory to CD4+ central memory cells in the donor was associated with lower 4-yr PFS (22% v 60%; p=0.0091). A higher ratio of CD4+ effector memory to CD8+ effector memory cells measured in Haplo recipients pre-alloHCT was associated with lower 4-yr OS (25% v 88%; p=0.0039). In both MRD and Haplo recipients, a higher ratio of CD4+ naïve to CD4+ central memory cells was associated with a higher incidence of grade II-IV aGvHD (64% v 38%; p=0.04). Evaluation of pre-alloHCT immune signatures of the donor and recipient may influence clinically meaningful patient outcomes in both MRD and Haplo transplants.

11164 Background: tMNs are rare, albeit serious complication in cancer survivors. A tMN risk prediction model is currently not available, therefore we leveraged clinical information and history in a large population-claims database to devise the first tMN risk prediction model in adult cancer survivors. Methods: SEER-Medicare was used to analyze 970,390 adults aged 66-84 diagnosed with first primary cancer (FPC) from 2000-2011 (with follow-up through 2015), who survived ≥1 year. Medicare claims data classified individuals with a priori identified conditions. We focused on prostate, GI, breast, lung, and bladder (n=830,468) FPCs to develop a tMN risk prediction model. The population was divided into training and validation cohorts. Χ 2 test identified risk factors associated with tMN. The tMN risk score (TMNRS) was created as a simple arithmetic sum of independent predictors of tMN weighted according to the adjusted odds ratio from logistic regression analysis. Pts were categorized into risk groups (Table) based on their TMNRS, which were tested in the validation cohort. Model performance was evaluated using ROC and c-statistics. Results: 87-96% of tMN developed within the first 10 years of FPC. Predictors of tMN included history of autoimmunity, infections, cardiovascular disease, granulocyte-colony stimulating factor, FPC stage, chemoradiotherapy exposure, age at FPC diagnosis, and sex. Training analysis distinguished survivors into distinct risk groups (table) with 10-year incidence of tMN ranging from 0.3% to 1.5% (prostate), 0.04% to 1.1% (GI), 0.2% to 1.4% (breast), 0.1% to 1.2% (lung) and 0.1% to 1.4% (bladder). The table summarizes the incidence of tMN and by risk category for each of the FPCs. After validation, the c-statistic ranged from 0.62-0.68. Conclusions: We utilized the largest SEER-Medicare cohort to date to develop a tMN risk model. The TMNRS captures several novel predictors and can be readily used in the clinic. This easy-to-use tool distinguishes cancer survivors into clinically relevant groups at risk of tMN development. This study lays the framework for screening and monitoring of pts at high risk of tMN. In future, we will leverage increasingly available molecular data to improve prediction performance of the model. Web-based calculator to be published with the manuscript/available at time of presentation. [Table: see text]

The role of common genetic variation in susceptibility to acute myeloid leukemia (AML), and myelodysplastic syndrome (MDS), a group of rare clonal hematologic disorders characterized by dysplastic hematopoiesis and high mortality, remains unclear. We performed AML and MDS genome-wide association studies (GWAS) in the DISCOVeRY-BMT cohorts (2309 cases and 2814 controls). Association analysis based on subsets (ASSET) was used to conduct a summary statistics SNP-based analysis of MDS and AML subtypes. For each AML and MDS case and control we used PrediXcan to estimate the component of gene expression determined by their genetic profile and correlate this imputed gene expression level with risk of developing disease in a transcriptome-wide association study (TWAS). ASSET identified an increased risk for de novo AML and MDS (OR=1.38, 95% CI, 1.26-1.51, Pmeta=2.8×10-12) in patients carrying the T allele at rs12203592 in Interferon Regulatory Factor 4 ( IRF4 ), a transcription factor which regulates myeloid and lymphoid hematopoietic differentiation. Our TWAS analyses showed increased IRF4 gene expression is associated with increased risk of de novo AML and MDS (OR=3.90, 95% CI, 2.36-6.44, Pmeta =1.0×10-7). The identification of IRF4 by both GWAS and TWAS contributes valuable insight on the role of genetic variation in AML and MDS susceptibility.### Competing Interest StatementThe authors have declared no competing interest.

ABSTRACT The role of minor histocompatibility antigens (mHAs) in mediating graft versus leukemia (GvL) and graft versus host disease (GvHD) following allogeneic hematopoietic cell transplantation (alloHCT) is recognized but not well-characterized. By implementing improved methods for mHA prediction in two large patient cohorts, this study aimed to comprehensively explore the role of mHAs in alloHCT by analyzing whether (1) the number of predicted mHAs, or (2) individual mHAs are associated with clinical outcomes using multi-variate survival models corrected for multiple testing. Cox proportional hazard results showed that patients with a class I mHA count greater than the population median had an increased hazard of GvHD mortality (HR=1.39, 95%CI 1.01, 1.77, P=0.046). Competing risk analyses identified the class I mHAs DLRCKYISL (gene GSTP ), WEHGPTSLL ( CRISPLD2 ) and STSPTTNVL ( SERPINF2 ) were associated with increased GVHD death (HR=2.84, 95%CI 1.52, 5.31, P=0.01), decreased leukemia-free survival (LFS) (HR=1.94,95%CI 1.27, 2.95, P=0.044), and increased disease-related mortality (DRM) (HR=2.32, 95%CI 1.5, 3.6, P=0.008), respectively. One class II mHA YQEIAAIPSAGRERQ (T ACC2 ) was associated with increased risk of treatment-related mortality (TRM) (HR=3.05, 95%CI 1.75, 5.31, P=0.02). WEHGPTSLL and STSPTTNVL were present in conjunction within HLA haplotype B*40:01-C*03:04 and showed a positive dose-response relationship with increased all-cause mortality and DRM and decreased LFS, indicating these two mHAs contribute to risk of mortality in an additive manner. Our study reports the first large scale investigation of the associations of predicted class I and class II mHA peptides with clinical outcomes following alloHCT. Graphical Abstract