A randomized, multicentre, open-label, phase II study compared temozolomide (TMZ), an oral second-generation alkylating agent, and procarbazine (PCB) in 225 patients with glioblastoma multiforme at first relapse. Primary objectives were to determine progression-free survival (PFS) at 6 months and safety for TMZ and PCB in adult patients who failed conventional treatment. Secondary objectives were to assess overall survival and health-related quality of life (HRQL). TMZ was given orally at 200 mg/m2/day or 150 mg/m2/day (prior chemotherapy) for 5 days, repeated every 28 days. PCB was given orally at 150 mg/m2/day or 125 mg/m2/day (prior chemotherapy) for 28 days, repeated every 56 days. HRQL was assessed using the European Organization for Research and Treatment of Cancer Quality of Life Questionnaire (EORTC QLQ-C30 [+3]) and the Brain Cancer Module 20 (BCM20). The 6-month PFS rate for patients who received TMZ was 21%, which met the protocol objective. The 6-month PFS rate for those who received PCB was 8% (P = 0.008, for the comparison). Overall PFS significantly improved with TMZ, with a median PFS of 12.4 weeks in the TMZ group and 8.32 weeks in the PCB group (P = 0.0063). The 6-month overall survival rate for TMZ patients was 60% vs. 44% for PCB patients (P = 0.019). Freedom from disease progression was associated with maintenance of HRQL, regardless of treatment received. TMZ had an acceptable safety profile; most adverse events were mild or moderate in severity. © 2000 Cancer Research Campaign

Aneuploidy, whole chromosome or chromosome arm imbalance, is a near-universal characteristic of human cancers. In 10,522 cancer genomes from The Cancer Genome Atlas, aneuploidy was correlated with TP53 mutation, somatic mutation rate, and expression of proliferation genes. Aneuploidy was anti-correlated with expression of immune signaling genes, due to decreased leukocyte infiltrates in high-aneuploidy samples. Chromosome arm-level alterations show cancer-specific patterns, including loss of chromosome arm 3p in squamous cancers. We applied genome engineering to delete 3p in lung cells, causing decreased proliferation rescued in part by chromosome 3 duplication. This study defines genomic and phenotypic correlates of cancer aneuploidy and provides an experimental approach to study chromosome arm aneuploidy.

Summary

 DNA damage repair (DDR) pathways modulate cancer risk, progression, and therapeutic response. We systematically analyzed somatic alterations to provide a comprehensive view of DDR deficiency across 33 cancer types. Mutations with accompanying loss of heterozygosity were observed in over 1/3 of DDR genes, including TP53 and BRCA1/2. Other prevalent alterations included epigenetic silencing of the direct repair genes EXO5, MGMT, and ALKBH3 in ∼20% of samples. Homologous recombination deficiency (HRD) was present at varying frequency in many cancer types, most notably ovarian cancer. However, in contrast to ovarian cancer, HRD was associated with worse outcomes in several other cancers. Protein structure-based analyses allowed us to predict functional consequences of rare, recurrent DDR mutations. A new machine-learning-based classifier developed from gene expression data allowed us to identify alterations that phenocopy deleterious TP53 mutations. These frequent DDR gene alterations in many human cancers have functional consequences that may determine cancer progression and guide therapy.

PURPOSE: To determine the antitumor efficacy and safety profile of temozolomide in patients with malignant astrocytoma at first relapse. PATIENTS AND METHODS: This open-label, multicenter, phase II trial enrolled 162 patients (intent-to-treat [ITT] population). After central histologic review, 111 patients were confirmed to have had an anaplastic astrocytoma (AA) or anaplastic mixed oligoastrocytoma. Chemotherapy-naive patients were treated with temozolomide 200 mg/m 2 /d. Patients previously treated with chemotherapy received temozolomide 150 mg/m 2 /d; the dose could be increased to 200 mg/m 2 /d in the absence of grade 3/4 toxicity. Therapy was administered orally on the first 5 days of a 28-day cycle. RESULTS: Progression-free survival (PFS) at 6 months, the primary protocol end point, was 46% (95% confidence interval, 38% to 54%). The median PFS was 5.4 months, and PFS at 12 months was 24%. The median overall survival was 13.6 months, and the 6- and 12-month survival rates were 75% and 56%, respectively. The objective response rate determined by independent central review of gadolinium-enhanced magnetic resonance imaging scans of the ITT population was 35% (8% complete response [CR], 27% partial response [PR]), with an additional 26% of patients with stable disease (SD). The median PFS for patients with SD was 4.4 months, with 33% progression-free at 6 months. Maintenance of progression-free status and objectively assessed response (CR/PR/SD) were both associated with health-related quality-of-life (HQL) benefits. Adverse events were mild to moderate, with hematologic side effects occurring in less than 10% of patients. CONCLUSION: Temozolomide demonstrated good single-agent activity, an acceptable safety profile, and documented HQL benefits in patients with recurrent AA.

We analyzed molecular data on 2,579 tumors from The Cancer Genome Atlas (TCGA) of four gynecological types plus breast. Our aims were to identify shared and unique molecular features, clinically significant subtypes, and potential therapeutic targets. We found 61 somatic copy-number alterations (SCNAs) and 46 significantly mutated genes (SMGs). Eleven SCNAs and 11 SMGs had not been identified in previous TCGA studies of the individual tumor types. We found functionally significant estrogen receptor-regulated long non-coding RNAs (lncRNAs) and gene/lncRNA interaction networks. Pathway analysis identified subtypes with high leukocyte infiltration, raising potential implications for immunotherapy. Using 16 key molecular features, we identified five prognostic subtypes and developed a decision tree that classified patients into the subtypes based on just six features that are assessable in clinical laboratories.

This integrated, multiplatform PanCancer Atlas study co-mapped and identified distinguishing molecular features of squamous cell carcinomas (SCCs) from five sites associated with smoking and/or human papillomavirus (HPV). SCCs harbor 3q, 5p, and other recurrent chromosomal copy-number alterations (CNAs), DNA mutations, and/or aberrant methylation of genes and microRNAs, which are correlated with the expression of multi-gene programs linked to squamous cell stemness, epithelial-to-mesenchymal differentiation, growth, genomic integrity, oxidative damage, death, and inflammation. Low-CNA SCCs tended to be HPV(+) and display hypermethylation with repression of TET1 demethylase and FANCF, previously linked to predisposition to SCC, or harbor mutations affecting CASP8, RAS-MAPK pathways, chromatin modifiers, and immunoregulatory molecules. We uncovered hypomethylation of the alternative promoter that drives expression of the ΔNp63 oncogene and embedded miR944. Co-expression of immune checkpoint, T-regulatory, and Myeloid suppressor cells signatures may explain reduced efficacy of immune therapy. These findings support possibilities for molecular classification and therapeutic approaches.

Abstract Despite improved outcomes with checkpoint blockade immunotherapy, patients with brain metastases have the worst prognosis among patients with metastatic cancer. Immune checkpoint blockade agents target inhibitory receptors, such as PD-1, on exhausted CD8 + T cells to restore their anti-cancer function. Many patients, however, either do not respond or progress after an initial response to immune checkpoint blockade, and distant intracranial failure is common despite excellent options for local treatment of brain metastasis. To develop more effective therapeutic strategies for the treatment of brain metastases, an understanding of the phenotype of brain metastasis-infiltrating CD8 + T cells is essential. Here we performed a detailed characterization of the CD8 + T cells contained in brain metastases. Brain metastases were densely infiltrated by CD8 + T cells; blood contamination of tumor samples was rare. Compared to patient-matched circulating cells, brain metastasis-infiltrating CD8 + T cells had a distinct phenotype characterized by more frequent expression of PD-1, with subpopulations defined by expression of additional co-inhibitory molecules and the residence marker CD69. Single cell RNA-sequencing identified four phenotypic subpopulations within brain metastasis-infiltrating PD-1 + CD8 + T cells. Two of these populations — a terminally-differentiated and a dividing population — were characterized by high expression of co-inhibitory molecules and lacked expression of progenitor markers such as TCF-1. There was significant T cell receptor (TCR) overlap between the terminally-differentiated and dividing populations, suggesting that the dividing cells give rise to the terminally-differentiated cells. There was minimal TCR overlap between these two populations and other brain metastasis-infiltrating PD-1 + CD8 + T cells. T cell clones from brain metastasis-infiltrating CD8 + T cells were rare in circulation, particularly clones from the terminally-differentiated and dividing populations. We systematically identified bystander CD8 + T cells specific for microbial antigens; these cells infiltrated brain metastases and expressed genes shared with exhausted progenitor CD8 + T cells, such as TCF7 and IL7R . We performed spatial transcriptomics on brain metastases and used a novel method to obtain TCR sequences from spatial transcriptomics data. These data revealed distinct niches within the TME defined by their gene expression patterns and cytokine profiles. Terminally-differentiated CD8 + T cells preferentially occupied niches within the tumor parenchyma. Together, our results show that antigen-specificity restricts the spatial localization, phenotypic states, and differentiation pathways available to CD8 + T cells within the brain metastasis TME.

Gliomas are increasingly diagnosed in an aging population, with treatment outcomes influenced by factors like tumor genetics and patient frailty. This study focused on IDH-mutant gliomas and assessed how frailty affects 30-day readmission and overall survival (OS). We aimed to address a gap in understanding the impact of frailty on this specific glioma subtype. 136 patients with an IDH-mutant glioma between 2007 and 2021 were identified at our institution. High frailty was classified by scores ≥ 1 on the 5-factor modified frailty index (mFI-5) and ≥ 3 on the Charlson Comorbidity Index (CCI). Patient and tumor characteristics including age, sex, race, Karnofsky Performance Status (KPS), Body Mass Index (BMI), tumor type and location, type of operation, and therapy course were recorded. Outcomes measured included 30-day readmission and overall survival (OS). Analysis was conducted utilizing logistic regression and Kaplan–Meier curves. Of the 136 patients, 52 (38%) had high frailty: 18 with CCI ≥ 3, 34 with mFI-5 ≥ 1. High frailty correlated with increased BMI (CCI: 30.2, mFI-5: 30.1 kg/m2), more neurological deficits (CCI: 61%, mFI-5: 56%), and older age at surgery (CCI: 63, mFI-5: 48 years). Hospital readmission within 30 days occurred in 8 (5.9%) patients. Logistic regression indicated no significant difference in 30-day readmission rates (CCI: p = 0.30, mFI-5: p = 0.62) or median OS between high and low frailty groups. However, patients treated at our institution with newly diagnosed tumors with high mFI-5 had a 6.79 times higher adjusted death hazard than those with low mFI-5 (p = .049). Our analysis revealed that CCI and mFI-5 were not significantly associated with 30-day nor OS. However, in patients with non-recurrent tumors, there was a significant association of mFI-5 with OS. Further study of frailty with larger cohorts is warranted to enhance prognostication of outcome after neurosurgical treatment.

Clinical guidelines direct healthcare professionals toward evidence-based practices. Evaluating guideline impact can elucidate information penetration, relevance, effectiveness, and alignment with evolving medical knowledge and technological advancements. As the American Association of Neurological Surgeons/Congress of Neurological Surgeons Section on Tumors marks its 40th anniversary in 2024, this article reflects on the tumor guidelines established by the Section over the past decade and explores their impact on other publications, patents, and information dissemination. Six tumor guideline categories were reviewed: low-grade glioma, newly diagnosed glioblastoma, progressive glioblastoma, metastatic brain tumors, vestibular schwannoma, and pituitary adenomas. Citation data were collected from Google Scholar and PubMed. Further online statistics, such as social media reach, and features in policy, news, and patents were sourced from Altmetric. Online engagement was assessed through website and CNS+ mobile application visits. Data were normalized to time since publication. Metastatic Tumor guidelines (2019) had the highest PubMed citation rate at 26.1 per year and webpage visits (29 100 page views 1/1/2019-9/30/2023). Notably, this guideline had two endorsement publications by partner societies, the Society of Neuro-Oncology and American Society of Clinical Oncology, concerning antiepileptic prophylaxis and steroid use, and the greatest reach on X (19.7 mentions/y). Citation rates on Google Scholar were led by Vestibular Schwannoma (2018). Non-Functioning Pituitary Adenoma led Mendeley reads. News, patent, or policy publications were led by low-grade glioma at 1.5/year. Our study shows that the American Association of Neurological Surgeons/Congress of Neurological Surgeons Section on Tumors guidelines go beyond citations in peer-reviewed publications to include patents, online engagement, and information dissemination to the public.