The mucosa-associated gut microbiota directly modulates epithelial and mucosal function. In this study, we investigated the mucosa-associated microbial community in patients with inflammatory bowel disease (IBD), using endoscopic brush samples. A total of 174 mucus samples from 43 patients with ulcerative colitis (UC), 26 with Crohn’s disease (CD) and 14 non-IBD controls were obtained by gentle brushing of mucosal surfaces using endoscopic cytology brushes. The gut microbiome was analyzed using 16S rRNA gene sequencing. There were no significant differences in microbial structure among different anatomical sites (the ileum, cecum and sigmoid colon) within individuals. There was, however, a significant difference in microbial structure between CD, UC and non-IBD controls. The difference between CD and non-IBD controls was more marked than that between UC patients and non-IBD controls. α-Diversity was significantly lower in UC and CD patients than non-IBD controls. When comparing CD patients with non-IBD controls, the phylum Proteobacteria was significantly increased and the phyla Firmicutes and Bacteroidetes were significantly reduced. These included a significant increase in the genera Escherichia, Ruminococcus (R. gnavus), Cetobacterium, Actinobacillus and Enterococcus, and a significant decrease in the genera Faecalibacterium, Coprococcus, Prevotella and Roseburia. Comparisons between CD and UC patients revealed a greater abundance of the genera Escherichia, Ruminococcus (R. gnavus), Clostridium, Cetobacterium, Peptostreptococcus in CD patients, and the genera Faecalibacterium, Blautia, Bifidobacterium, Roseburia and Citrobacter in UC patients. Mucosa-associated dysbiosis was identified in IBD patients. CD and UC may be distinguishable from the mucosa-associated microbial community structure.

The effects of voluntary wheel-running exercise on cecal microbiota and short-chain fatty acid production were investigated in rats. The microbiota composition was notably different between the exercised and sedentary rats. Furthermore, the exercised rats showed a significantly higher n-butyrate concentration than the sedentary rats. This alteration of the cecal microbial environment may contribute to the beneficial effect of exercise on gastrointestinal disorders.

Abstract We defined naïve, central memory, effector memory and terminally differentiated porcine CD8 T cells and analyzed their phenotype in lymphoid and respiratory tissues after influenza infection or immunization using peptide-MHC tetramers of three influenza nucleoprotein (NP) epitopes. The hierarchy of response to the three epitopes changes during the response in different tissues. Most NP-specific CD8 T cells in broncho-alveolar lavage (BAL) and lung are tissue resident memory cells (TRM), that express CD69 and have an effector memory or terminally differentiated phenotype. NP-specific cells isolated from BAL express genes characteristic of TRM, but gene expression differs at 7, 21 and 63 days post infection. The frequency of NP-specific cells declines over 63 days in all tissues but is best maintained in BAL. The pig is a powerful model for understanding how best to induce and harness local immunity to respiratory viruses. One sentence summary Influenza NP-specific porcine tissue resident memory CD8 T cells persist in the lung with major changes in gene expression.

Early life environment influences mammalian brain development, a growing area of research within the Developmental Origins of Health and Disease framework, necessitating a deeper understanding of early life factors on children's brain development. This study introduces a mouse model,

Chronic inflammation is involved in the development of age-related diseases. Given its persistence, controlling chronic inflammation is essential for preventing age-related diseases. In this study, we investigated the effects of Enterococcus faecalis EC-12 (EC-12), which has immunomodulatory and antioxidant effects, on liver gene expression and aging phenomena in mice. Short-term EC-12 administration stimulated the expression of genes involved in lipid synthesis and metabolism in the liver. Furthermore, long-term EC-12 administration from 10 weeks to 1.5 years of age resulted in significant increases in blood interleukin (IL)-6 and IL-10 concentrations (both p < 0.05) and a significant decrease in the monocyte chemotactic protein-1 concentration (p < 0.05). These results indicated pathologic improvement, such as suppression of fat degeneration in the liver. These results suggest that continuous EC-12 intake from a young age can suppress liver function abnormalities, which is one of the aging phenomena in old age, and contribute to health in old age.

Activation-induced markers (AIMs) are frequently analyzed to identify re-activated human memory T cells. However, in pigs the analysis of AIMs is still not very common. Based on available antibodies, we designed a multi-color flow cytometry panel comprising pig-specific or cross-reactive antibodies against CD25, CD69, CD40L (CD154), and ICOS (CD278) combined with lineage/surface markers against CD3, CD4, and CD8α. In addition, we included an antibody against tumor necrosis factor alpha (TNF-α), to study the correlation of AIM expression with the production of this abundant T cell cytokine. The panel was tested on peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) stimulated with phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA)/ionomycin, Staphylococcus enterotoxin B (SEB) or PBMCs from African swine fever virus (ASFV) convalescent pigs, restimulated with homologous virus. PMA/ionomycin resulted in a massive increase of CD25/CD69 co-expressing T cells of which only a subset produced TNF-α, whereas CD40L expression was largely associated with TNF-α production. SEB stimulation triggered substantially less AIM expression than PMA/ionomycin but also here CD25/CD69 expressing T cells were identified which did not produce TNF-α. In addition, CD40L-single positive and CD25 + CD69 + CD40L + TNF-α − T cells were identified. In ASFV restimulated T cells TNF-α production was associated with a substantial proportion of AIM expressing T cells but also here ASFV-reactive CD25 + CD69 + TNF-α − T cells were identified. Within CD8α + CD4 T cells, several CD25/CD40L/CD69/ICOS defined phenotypes expanded significantly after ASFV restimulation. Hence, the combination of AIMs tested will allow the identification of primed T cells beyond the commonly used cytokine panels, improving capabilities to identify the full breadth of antigen-specific T cells in pigs.

Abstract Background Strangulated intestinal obstruction is a life‐threatening condition that should be considered as a differential diagnosis in children with shock. However, it has pitfalls in diagnosis and can lead to diagnostic errors. Case Presentation A 3‐month‐old male patient presented with a pale complexion lasting 2 h and abnormal crying. He was in shock with lactic acidosis, altered mental status, and slight abdominal distension. He required volume resuscitation, vasoactive agents, and transfusion. On Day 2, he had marked abdominal distension and acute kidney injury, which required continuous kidney replacement therapy. Contrast‐enhanced computed tomography revealed extensive intestinal ischemia. It took 33.5 h from his arrival to the computed tomography, leading to operative management. The small intestine had entered a mesenteric hiatus, leading to ischemia. He was diagnosed with strangulated mesenteric hernia. Conclusion In this case, four pitfalls led to delayed diagnosis. Factors for diagnostic errors specific to strangulated intestinal obstruction and intensive care should be noted.

Antimicrobial treatment disrupts human microbiota. The effects of lascufloxacin (LSFX), a new fluoroquinolone, on human microbiota remains unknown. Therefore, in this study, we aimed to evaluate the effects of LSFX administration on the gut and salivary microbiota of healthy participants and those with pneumonia.