JB
James Barrett
Author with expertise in Human Papillomavirus and Cervical Cancer Epidemiology
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(50% Open Access)
Cited by:
1,197
h-index:
44
/
i10-index:
161
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Social Support and Depressive Symptoms in the Elderly

Thomas Oxman et al.Feb 15, 1992
The purpose of this study was to examine the effect of characteristics of social networks and support on depressive symptoms in the elderly. The subjects were 1,962 noninstitutionalized persons 65 years and older from the New Haven Establishment of Populations for Epidemiologic Study of the Elderly in 1982, who were available to give a complete follow-up interview in 1985. Baseline depression, functional disability in 1982, and any change in disability by 1985 were considered as additional influences on 1985 depression, requiring adjustment along with sociodemographic variables. Multiple regression procedures were used to simultaneously examine the variables. Baseline depression, functional disability, and change in functional disability made the largest contribution to explaining the variance in depression. Among the social support and network characteristics, loss of a spouse, adequacy of emotional support, and its change during 1982–1985 made the largest contributions. Other significant characteristics in relative order of magnitude of effect, based on contrast tests, included tangible support adequacy and its change, loss of a confidant between 1982 and 1985, number of children making weekly visits and change in this number by 1985, and the absence of a confidant in both 1982 and 1985. For mental health outcomes, these findings emphasize the need to consider specific dimensions of social support and networks rather than global measures. Am J Epidemiol 1992;135:356–68.
0

Cervical cancer screening using DNA methylation triage in a real-world population

Lena Schreiberhuber et al.Jun 4, 2024
Cervical cancer (CC) screening in women comprises human papillomavirus (HPV) testing followed by cytology triage of positive cases. Drawbacks, including cytology's low reproducibility and requirement for short screening intervals, raise the need for alternative triage methods. Here we used an innovative triage technique, the WID-qCIN test, to assess the DNA methylation of human genes DPP6, RALYL and GSX1 in a real-life cohort of 28,017 women aged ≥30 years who attended CC screening in Stockholm between January and March 2017. In the analysis of all 2,377 HPV-positive samples, a combination of WID-qCIN (with a predefined threshold) and HPV16 and/or HPV18 (HPV16/18) detected 93.4% of cervical intraepithelial neoplasia grade 3 and 100% of invasive CCs. The WID-qCIN/HPV16/18 combination predicted 69.4% of incident cervical intraepithelial neoplasia grade 2 or worse compared with 18.2% predicted by cytology. Cytology or WID-qCIN/HPV16/18 triage would require 4.1 and 2.4 colposcopy referrals to detect one cervical intraepithelial neoplasia grade 2 or worse, respectively, during the 6 year period. These findings support the use of WID-qCIN/HPV16/18 as an improved triage strategy for HPV-positive women.
0
Citation3
0
Save
12

Performance comparison and in-silico harmonisation of commercial platforms for DNA methylome analysis by targeted bisulfite sequencing

Miljana Tanić et al.Mar 12, 2021
Abstract DNA methylation is a key epigenetic modification in the regulation of cell fate and differentiation, and its analysis is gaining increasing importance in both basic and clinical research. Targeted Bisulfite Sequencing (TBS) has become the method of choice for the cost-effective, targeted analysis of the human methylome at base-pair resolution. Here we benchmarked five commercially available TBS platforms, including three hybridization capture-based (Agilent, Roche, and Illumina) and two RRBS-based (Diagenode and NuGen), across 16 samples. A subset of these were also compared to whole-genome DNA methylation sequencing with the Illumina and Oxford Nanopore platforms. We assessed performance with respect to workflow complexity, on/off-target performance, coverage, accuracy and reproducibility. We find all platforms able to produce usable data but major differences for some performance criteria, especially in the number and identity of the CpG sites covered, which affects the interoperability of datasets generated on these different platforms. To overcome this limitation, we used imputation and show that it improves the interoperability from an average of 10.35% (0.8M CpG sites) to 97% (7.6M CpG sites). Our study provides cross-validated guidance on which TBS platform to use for different features of the methylome and offers an imputation-based harmonization solution for improved interoperability between platforms, allowing comparative and integrative analysis.
12
Citation1
0
Save
0

A historical perspective and recent advances on the evolution of the relationship between acute and chronic pain and cardiovascular disease

James Barrett et al.Jun 1, 2024
The relationship between acute pain and the cardiovascular system was recognized approximately 50 years ago following the initial observation, along with several subsequent experimental studies, that hypertension can result in decreases in the perception of pain. These studies provided a strong impetus to study potential mechanisms to clarify commonalities between the regulatory pathways associated with pain and the cardiovascular system. Attention subsequently shifted to an emphasis on the impact of chronic pain on cardiovascular diseases and mortality with several large meta-analyses of longitudinal studies providing clear evidence that chronic widespread pain increases the risk for developing cardiovascular disease and is associated with excess morbidity and mortality. Cardiovascular associated mortality from myocardial infarction and stroke appears to be directly related to the duration and severity of chronic pain, a result often characterized as a 'dose-response' relationship. The availability and reproducibility of extensive large-scale observational and retrospective studies have emphasized the critical need for more research, including prospective studies, along with the need for the development of preclinical animal models, to better understand the relationship(s) and underlying mechanisms between chronic pain, associated comorbidities, and cardiovascular disease. Elucidation and a deeper understanding of these relationships, including a focus on the link between chronic pain, cardiovascular disease, and depression, could provide valuable information to guide the development of potential treatment interventions to aid in attenuating pain while preventing pain-associated cardiovascular disease, comorbidities, and mortality.