The dynamics of T-cell responses are investigated in tumour tissue from patients with advanced melanoma who were treated with a PD-1-blocking monoclonal antibody, revealing that clinical efficacy of the treatment correlates with increased frequencies of pre-existing CD8+ T cells and PD-1 and PD-L1 expression. Therapies that target the human cell-surface programmed death-1 (PD-1) receptor have shown unprecedented clinical responses in a variety of cancer types. Here Paul Tumeh et al. investigate the dynamics of T-cell responses in tumour tissues of patients with advanced melanoma treated with pembrolizumab, a humanized monoclonal antibody directed against human PD-1. Clinical efficacy is shown to correlate with increased frequencies of pre-existing CD8+ T cells and PD-1 and PD-L1 expression at the invasive tumour margin and within tumours. Therapies that target the programmed death-1 (PD-1) receptor have shown unprecedented rates of durable clinical responses in patients with various cancer types1,2,3,4,5. One mechanism by which cancer tissues limit the host immune response is via upregulation of PD-1 ligand (PD-L1) and its ligation to PD-1 on antigen-specific CD8+ T cells (termed adaptive immune resistance)6,7. Here we show that pre-existing CD8+ T cells distinctly located at the invasive tumour margin are associated with expression of the PD-1/PD-L1 immune inhibitory axis and may predict response to therapy. We analysed samples from 46 patients with metastatic melanoma obtained before and during anti-PD-1 therapy (pembrolizumab) using quantitative immunohistochemistry, quantitative multiplex immunofluorescence, and next-generation sequencing for T-cell antigen receptors (TCRs). In serially sampled tumours, patients responding to treatment showed proliferation of intratumoral CD8+ T cells that directly correlated with radiographic reduction in tumour size. Pre-treatment samples obtained from responding patients showed higher numbers of CD8-, PD-1- and PD-L1-expressing cells at the invasive tumour margin and inside tumours, with close proximity between PD-1 and PD-L1, and a more clonal TCR repertoire. Using multivariate analysis, we established a predictive model based on CD8 expression at the invasive margin and validated the model in an independent cohort of 15 patients. Our findings indicate that tumour regression after therapeutic PD-1 blockade requires pre-existing CD8+ T cells that are negatively regulated by PD-1/PD-L1-mediated adaptive immune resistance.

Sentinel-lymph-node biopsy is associated with increased melanoma-specific survival (i.e., survival until death from melanoma) among patients with node-positive intermediate-thickness melanomas (1.2 to 3.5 mm). The value of completion lymph-node dissection for patients with sentinel-node metastases is not clear.

Abstract Purpose: We have previously shown that a transcriptome is found in saliva and subpanels of these mRNAs can be used as oral cancer biomarkers. In this study, we measured the presence of microRNAs (miRNA) in saliva and determined their potential as an additional set of oral cancer biomarkers. Experimental Design: A total of 314 miRNAs were measured using reverse transcriptase-preamplification-quantitative PCR in 12 healthy controls. Degradation pattern of endogenous and exogenous saliva miRNAs were measured at room temperature over time. Selected miRNAs were validated in saliva of 50 oral squamous cell carcinoma patients and 50 healthy matched control subjects. Results: We detected ∼50 miRNAs in both the whole and supernatant saliva. Endogenous saliva miRNA degraded much slower compared with exogenous miRNA. Two miRNAs, miR-125a and miR-200a, were present in significantly lower levels (P < 0.05) in the saliva of oral squamous cell carcinoma patients than in control subjects. Conclusions: Both whole and supernatant saliva of healthy controls contained dozens of miRNAs, and similar to saliva mRNAs, these miRNAs are stable. Saliva miRNAs can be used for oral cancer detection. (Clin Cancer Res 2009;15(17):5473–7)

The human skin microbiome has important roles in skin health and disease. However, bacterial population structure and diversity at the strain level is poorly understood. We compared the skin microbiome at the strain level and genome level of Propionibacterium acnes, a dominant skin commensal, between 49 acne patients and 52 healthy individuals by sampling the pilosebaceous units on their noses. Metagenomic analysis demonstrated that although the relative abundances of P. acnes were similar, the strain population structures were significantly different in the two cohorts. Certain strains were highly associated with acne, and other strains were enriched in healthy skin. By sequencing 66 previously unreported P. acnes strains and comparing 71 P. acnes genomes, we identified potential genetic determinants of various P. acnes strains in association with acne or health. Our analysis suggests that acquired DNA sequences and bacterial immune elements may have roles in determining virulence properties of P. acnes strains, and some could be future targets for therapeutic interventions. This study demonstrates a previously unreported paradigm of commensal strain populations that could explain the pathogenesis of human diseases. It underscores the importance of strain-level analysis of the human microbiome to define the role of commensals in health and disease. The human skin microbiome has important roles in skin health and disease. However, bacterial population structure and diversity at the strain level is poorly understood. We compared the skin microbiome at the strain level and genome level of Propionibacterium acnes, a dominant skin commensal, between 49 acne patients and 52 healthy individuals by sampling the pilosebaceous units on their noses. Metagenomic analysis demonstrated that although the relative abundances of P. acnes were similar, the strain population structures were significantly different in the two cohorts. Certain strains were highly associated with acne, and other strains were enriched in healthy skin. By sequencing 66 previously unreported P. acnes strains and comparing 71 P. acnes genomes, we identified potential genetic determinants of various P. acnes strains in association with acne or health. Our analysis suggests that acquired DNA sequences and bacterial immune elements may have roles in determining virulence properties of P. acnes strains, and some could be future targets for therapeutic interventions. This study demonstrates a previously unreported paradigm of commensal strain populations that could explain the pathogenesis of human diseases. It underscores the importance of strain-level analysis of the human microbiome to define the role of commensals in health and disease. Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat Human Microbiome Project ribosomal DNA ribotype

Background: We examined the cholesterol-lowering effects of a proprietary Chinese red-yeast-rice supplement in an American population consuming a diet similar to the American Heart Association Step I diet using a double-blind, placebo-controlled, prospectively randomized 12-wk controlled trial at a university research center.

We explored the association between liver metastases, tumor CD8+ T-cell count, and response in patients with melanoma or lung cancer treated with the anti-PD-1 antibody, pembrolizumab. The melanoma discovery cohort was drawn from the phase I Keynote 001 trial, whereas the melanoma validation cohort was drawn from Keynote 002, 006, and EAP trials and the non-small cell lung cancer (NSCLC) cohort from Keynote 001. Liver metastasis was associated with reduced response and shortened progression-free survival [PFS; objective response rate (ORR), 30.6%; median PFS, 5.1 months] compared with patients without liver metastasis (ORR, 56.3%; median PFS, 20.1 months) P ≤ 0.0001, and confirmed in the validation cohort (P = 0.0006). The presence of liver metastasis significantly increased the likelihood of progression (OR, 1.852; P < 0.0001). In a subset of biopsied patients (n = 62), liver metastasis was associated with reduced CD8+ T-cell density at the invasive tumor margin (liver metastasis+ group, n = 547 ± 164.8; liver metastasis- group, n = 1,441 ± 250.7; P < 0.016). A reduced response rate and shortened PFS was also observed in NSCLC patients with liver metastasis [median PFS, 1.8 months; 95% confidence interval (CI), 1.4-2.0], compared with those without liver metastasis (n = 119, median PFS, 4.0 months; 95% CI, 2.1-5.1), P = 0.0094. Thus, liver metastatic patients with melanoma or NSCLC that had been treated with pembrolizumab were associated with reduced responses and PFS, and liver metastases were associated with reduced marginal CD8+ T-cell infiltration, providing a potential mechanism for this outcome. Cancer Immunol Res; 5(5); 417-24. ©2017 AACR.

Purpose Given the limited information regarding the impact of obesity on treatment outcomes for prostate cancer, we sought to examine the relationship between body mass index (BMI) and cancer control after radical prostatectomy (RP). Patients and Methods We compared clinicopathologic and biochemical outcome information across BMI groups from 1,106 men treated with RP between 1988 and 2002. Multivariate analysis was used to determine if BMI significantly predicted adverse pathology or biochemical recurrence. Results Obesity was related to year of surgery (P < .001) and race (P < .001), with black men having the highest obesity rates. Obese patients had higher biopsy and pathologic grade tumors (P < .001). On multivariate analysis, BMI ≥ 35 kg/m 2 was associated with a trend for higher rates of positive surgical margins (P = .008). Overweight patients (BMI, 25 to 30 kg/m 2 ) had a significantly decreased risk of seminal vesicle invasion (P = .039). After controlling for all preoperative clinical variables including year of surgery, BMI ≥ 35 kg/m 2 significantly predicted biochemical failure after RP (P = .002). After controlling for surgical margin status, BMI ≥ 35 kg/m 2 remained a significant predictor of biochemical failure (P = .012). There was a trend for BMI ≥ 35 kg/m 2 to be associated with higher failure rates than BMI between 30 and 35 kg/m 2 (P = .053). Conclusion The percentage of obese men undergoing RP in our data set doubled in the last 10 years. Obesity was associated with higher-grade tumors, a trend toward increased risk of positive surgical margins, and higher biochemical failure rates among men treated with RP. A BMI ≥ 35 kg/m 2 was associated with a higher risk of failure than a BMI between 30 and 35 kg/m 2 .

Background National Comprehensive Cancer Network guidelines consider 18F-fluciclovine PET-CT for prostate cancer biochemical recurrence localisation after radical prostatectomy, whereas European Association of Urology guidelines recommend prostate-specific membrane antigen (PSMA) PET-CT. To the best of our knowledge, no prospective head-to-head comparison between these tests has been done so far. The aim of this study was to compare prospectively paired 18F-fluciclovine and PSMA PET-CT scans for localising biochemical recurrence of prostate cancer after radical prostatectomy in patients with low prostate-specific antigen (PSA) concentrations (<2·0 ng/mL). Methods This was a prospective, single-centre, open-label, single-arm comparative study done at University of California Los Angeles (Los Angeles, CA, USA). Patients older than 18 years of age with prostate cancer biochemical recurrence after radical prostatectomy and PSA levels ranging from 0·2 to 2·0 ng/mL without any prior salvage therapy and with a Karnofsky performance status of at least 50 were eligible. Patients underwent 18F-fluciclovine (reference test) and PSMA (index test) PET-CT scans within 15 days. Detection rate of biochemical recurrence at the patient level and by anatomical region was the primary endpoint. A statistical power analysis demonstrated that a sample size of 50 patients was needed to show a 22% difference in detection rates in favour of PSMA (test for superiority). Each PET scan was interpreted by three independent masked readers and a consensus majority interpretation was generated (two vs one) to determine positive findings. This study is registered with ClinicalTrials.gov, number NCT03515577, and is complete. Findings Between Feb 26, 2018, and Sept 20, 2018, 143 patients were screened for eligibility, of whom 50 patients were enrolled into the study. Median follow-up was 8 months (IQR 7–9). The primary endpoint was met; detection rates were significantly lower with 18F-fluciclovine PET-CT (13 [26%; 95% CI 15–40] of 50) than with PSMA PET-CT (28 [56%; 41–70] of 50), with an odds ratio (OR) of 4·8 (95% CI 1·6–19·2; p=0·0026) at the patient level; in the subanalysis of the pelvic nodes region (four [8%; 2–19] with 18F-fluciclovine vs 15 [30%; 18–45] with PSMA PET-CT; OR 12·0 [1·8–513·0], p=0·0034); and in the subanalysis of any extrapelvic lesions (none [0%; 0–6] vs eight [16%; 7–29]; OR non-estimable [95% CI non-estimable], p=0·0078). Interpretation With higher detection rates, PSMA should be the PET tracer of choice when PET-CT imaging is considered for subsequent treatment management decisions in patients with prostate cancer and biochemical recurrence after radical prostatectomy and low PSA concentrations (≤2·0 ng/mL). Further research is needed to investigate whether higher detection rates translate into improved oncological outcomes. Funding None.

OBJECTIVE We sought to establish β-cell mass, β-cell apoptosis, and β-cell replication in humans in response to obesity and advanced age. RESEARCH DESIGN AND METHODS We examined human autopsy pancreas from 167 nondiabetic individuals 20–102 years of age. The effect of obesity on β-cell mass was examined in 53 lean and 61 obese subjects, and the effect of aging was examined in 106 lean subjects. RESULTS β-Cell mass is increased by ∼50% with obesity (from 0.8 to 1.2 g). With advanced aging, the exocrine pancreas undergoes atrophy but β-cell mass is remarkably preserved. There is minimal β-cell replication or apoptosis in lean humans throughout life with no detectable changes with obesity or advanced age. CONCLUSIONS β-Cell mass in human obesity increases by ∼50% by an increase in β-cell number, the source of which is unknown. β-Cell mass is well preserved in humans with advanced aging.

To identify baseline characteristics of patients with scleroderma-related interstitial lung disease (SSc-ILD) that could serve as predictors of the most favorable response to 12-month treatment with oral cyclophosphamide (CYC).Regression analyses were retrospectively applied to the Scleroderma Lung Study data in order to identify baseline characteristics that correlated with the absolute change in forced vital capacity (FVC) (% predicted values) and the placebo-adjusted change in % predicted FVC over time (the CYC treatment effect).Completion of the CYC arm of the Scleroderma Lung Study was associated with a placebo-adjusted improvement in the % predicted FVC of 2.11% at 12 months, which increased to 4.16% when patients were followed up for another 6 months (P=0.014). Multivariate regression analyses identified the maximal severity of reticular infiltrates (assessed as maximum fibrosis scores) on high-resolution computed tomography (HRCT) at baseline, the modified Rodnan skin thickness score (MRSS) at baseline, and the Mahler baseline dyspnea index as independent correlates of treatment response. When patients were stratified on the basis of whether 50% or more of any lung zone was involved by reticular infiltrates on HRCT and/or whether patients exhibited an MRSS of at least 23, a subgroup of patients emerged in whom there was an average CYC treatment effect of 9.81% at 18 months (P<0.001). Conversely, there was no treatment effect (a -0.58% difference) in patients with less severe HRCT findings and a lower MRSS at baseline.A retrospective analysis of the Scleroderma Lung Study data identified the severity of reticular infiltrates on baseline HRCT and the baseline MRSS as patient features that might be predictive of responsiveness to CYC therapy.