DP
Daniel Parker
Author with expertise in Human Immunodeficiency Virus/Acquired Immunodeficiency Syndrome
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
4
(75% Open Access)
Cited by:
1,473
h-index:
14
/
i10-index:
16
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Administration of vorinostat disrupts HIV-1 latency in patients on antiretroviral therapy

Nancie Archin et al.Jul 24, 2012
The latent HIV-1 reservoir represents a major barrier to curing patients with HIV-1 infection, and now in vivo evidence is presented that vorinostat can disrupt proviral latency of HIV-1. A major barrier to achieving a cure in patients infected with HIV-1 is the ability of the HIV genome to integrate into the DNA of resting CD4+ T cells and adopt a state of latency, evading both immune detection and pharmaceutical attack. It was shown previously that induction of virus gene expression in latently HIV-1-infected cells can be achieved in vitro with histone deacetylase inhibitors such as vorinostat, a drug used to treat cutaneous lymphoma. In this study, the authors report the first in vivo evidence that vorinostat can disrupt proviral latency of HIV-1. Vorinostat has some toxic effects that would need to be considered when assessing the risks and benefits of attempts to eradicate HIV infection using this or similar drugs. Despite antiretroviral therapy, proviral latency of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) remains a principal obstacle to curing the infection1. Inducing the expression of latent genomes within resting CD4+ T cells is the primary strategy to clear this reservoir2,3. Although histone deacetylase inhibitors such as suberoylanilide hydroxamic acid (also known as vorinostat, VOR) can disrupt HIV-1 latency in vitro4,5,6, the utility of this approach has never been directly proven in a translational clinical study of HIV-infected patients. Here we isolated the circulating resting CD4+ T cells of patients in whom viraemia was fully suppressed by antiretroviral therapy, and directly studied the effect of VOR on this latent reservoir. In each of eight patients, a single dose of VOR increased both biomarkers of cellular acetylation, and simultaneously induced an increase in HIV RNA expression in resting CD4+ cells (mean increase, 4.8-fold). This demonstrates that a molecular mechanism known to enforce HIV latency can be therapeutically targeted in humans, provides proof-of-concept for histone deacetylase inhibitors as a therapeutic class, and defines a precise approach to test novel strategies to attack and eradicate latent HIV infection directly.
0
Citation1,077
0
Save
0

Expression of Latent HIV Induced by the Potent HDAC Inhibitor Suberoylanilide Hydroxamic Acid

Nancie Archin et al.Feb 1, 2009
Histone deacetylases (HDACs) act on histones within the nucleosome-bound promoter of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) to maintain proviral latency. HDAC inhibition leads to promoter expression and the escape of HIV from latency. We evaluated the ability of the potent inhibitor recently licensed for use in oncology, suberoylanilide hydroxamic acid (SAHA; Vorinostat), selective for Class I HDACs, to induce HIV promoter expression in cell lines and virus production from the resting CD4(+) T cells of antiretroviral-treated, aviremic HIV-infected patients. In J89, a Jurkat T cell line infected with a single HIV genome encoding the enhanced green fluorescence protein (EGFP) within the HIV genome, SAHA induced changes at nucleosome 1 of the HIV promoter in chromatin immunoprecipitation (ChIP) assays in concert with EGFP expression. In the resting CD4(+) T cells of antiretroviral-treated, aviremic HIV-infected patients clinically achievable exposures to SAHA induced virus outgrowth ex vivo. These results suggest that potent, selective HDAC inhibitors may allow improved targeting of persistent proviral HIV infection, and define parameters for in vivo studies using SAHA.
0
Citation338
0
Save
4

Effect of long-term caloric restriction on DNA methylation measures of biological aging in healthy adults from the CALERIE trial

Reem Waziry et al.Feb 9, 2023
Abstract The geroscience hypothesis proposes that therapy to slow or reverse molecular changes that occur with aging can delay or prevent multiple chronic diseases and extend healthy lifespan 1–3 . Caloric restriction (CR), defined as lessening caloric intake without depriving essential nutrients 4 , results in changes in molecular processes that have been associated with aging, including DNA methylation (DNAm) 5–7 , and is established to increase healthy lifespan in multiple species 8,9 . Here we report the results of a post hoc analysis of the influence of CR on DNAm measures of aging in blood samples from the Comprehensive Assessment of Long-term Effects of Reducing Intake of Energy (CALERIE) trial, a randomized controlled trial in which n = 220 adults without obesity were randomized to 25% CR or ad libitum control diet for 2 yr (ref. 10 ). We found that CALERIE intervention slowed the pace of aging, as measured by the DunedinPACE DNAm algorithm, but did not lead to significant changes in biological age estimates measured by various DNAm clocks including PhenoAge and GrimAge. Treatment effect sizes were small. Nevertheless, modest slowing of the pace of aging can have profound effects on population health 11–13 . The finding that CR modified DunedinPACE in a randomized controlled trial supports the geroscience hypothesis, building on evidence from small and uncontrolled studies 14–16 and contrasting with reports that biological aging may not be modifiable 17 . Ultimately, a conclusive test of the geroscience hypothesis will require trials with long-term follow-up to establish effects of intervention on primary healthy-aging endpoints, including incidence of chronic disease and mortality 18–20 .
4
Citation58
4
Save
0

Aqueous and Plasma Levels of Phosphorylated Tau 181 in Individuals with Normal Cognition

Hemal Patel et al.Jun 7, 2024
Background: Plasma and cerebrospinal fluid (CSF) levels of p-tau181 have been associated with Alzheimer’s disease (AD). The retina and vitreous have shown measurable quantities of phosphorylated tau 181 (p-tau181). The aqueous humor, which can be collected during cataract surgery, may have measurable concentrations of p-tau181. Objective: To determine whether p-tau181 is detectable in the aqueous humor and if so, whether it is associated with other measures that might be consistent with AD such as higher plasma p-tau181 concentration and lower Montreal Cognitive Assessment (MoCA-BLIND version 7.1) score. Methods: Aqueous humor samples, blood samples, and MoCA-BLIND scores were collected from patients who did not carry a clinical diagnosis of cognitive impairment at the time of cataract surgery. Aqueous p-tau181 concentrations and plasma p-tau181 concentrations were then measured using ultra-sensitive single-molecule assay ELISA technology. A rank-transformed mixed-effects multivariate regression model was used to determine associations between aqueous concentrations, plasma concentrations, and MoCA-BLIND scores. Results: 16 eyes of 16 participants were enrolled with an average age of 71.6. Average MoCA-BLIND score was 20.6/22, average aqueous p-tau181 concentration was 6.4 pg/mL, and average plasma p-tau181 concentration was 3.1 pg/mL. Higher plasma p-tau181 was significantly associated with higher aqueous p-tau181 (p = 0.02). Aqueous p-tau181 and plasma p-tau181 were negatively associated with MoCA-BLIND scores (p = 0.005 and p = 0.001 respectively) in these patients. Conclusions: Aqueous p-tau181 is positively correlated with plasma p-tau181 and is negatively correlated with MoCA-BLIND scores. Further study in individuals with mild cognitive impairment or AD characterized by cerebrospinal fluid and volumetric MRI metrics may yield further insights.