YZ
Yukui Zhang
Author with expertise in Catalytic Nanomaterials
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
1,447
(32% Open Access)
Cited by:
40,711
h-index:
178
/
i10-index:
2700
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

The Human Brainnetome Atlas: A New Brain Atlas Based on Connectional Architecture

Lingzhong Fan et al.May 26, 2016
The human brain atlases that allow correlating brain anatomy with psychological and cognitive functions are in transition from ex vivo histology-based printed atlases to digital brain maps providing multimodal in vivo information. Many current human brain atlases cover only specific structures, lack fine-grained parcellations, and fail to provide functionally important connectivity information. Using noninvasive multimodal neuroimaging techniques, we designed a connectivity-based parcellation framework that identifies the subdivisions of the entire human brain, revealing the in vivo connectivity architecture. The resulting human Brainnetome Atlas, with 210 cortical and 36 subcortical subregions, provides a fine-grained, cross-validated atlas and contains information on both anatomical and functional connections. Additionally, we further mapped the delineated structures to mental processes by reference to the BrainMap database. It thus provides an objective and stable starting point from which to explore the complex relationships between structure, connectivity, and function, and eventually improves understanding of how the human brain works. The human Brainnetome Atlas will be made freely available for download at http://atlas.brainnetome.org, so that whole brain parcellations, connections, and functional data will be readily available for researchers to use in their investigations into healthy and pathological states.
0

Human Infection with a Novel Avian-Origin Influenza A (H7N9) Virus

Rongbao Gao et al.Apr 11, 2013
Infection of poultry with influenza A subtype H7 viruses occurs worldwide, but the introduction of this subtype to humans in Asia has not been observed previously. In March 2013, three urban residents of Shanghai or Anhui, China, presented with rapidly progressing lower respiratory tract infections and were found to be infected with a novel reassortant avian-origin influenza A (H7N9) virus.We obtained and analyzed clinical, epidemiologic, and virologic data from these patients. Respiratory specimens were tested for influenza and other respiratory viruses by means of real-time reverse-transcriptase-polymerase-chain-reaction assays, viral culturing, and sequence analyses.A novel reassortant avian-origin influenza A (H7N9) virus was isolated from respiratory specimens obtained from all three patients and was identified as H7N9. Sequencing analyses revealed that all the genes from these three viruses were of avian origin, with six internal genes from avian influenza A (H9N2) viruses. Substitution Q226L (H3 numbering) at the 210-loop in the hemagglutinin (HA) gene was found in the A/Anhui/1/2013 and A/Shanghai/2/2013 virus but not in the A/Shanghai/1/2013 virus. A T160A mutation was identified at the 150-loop in the HA gene of all three viruses. A deletion of five amino acids in the neuraminidase (NA) stalk region was found in all three viruses. All three patients presented with fever, cough, and dyspnea. Two of the patients had a history of recent exposure to poultry. Chest radiography revealed diffuse opacities and consolidation. Complications included acute respiratory distress syndrome and multiorgan failure. All three patients died.Novel reassortant H7N9 viruses were associated with severe and fatal respiratory disease in three patients. (Funded by the National Basic Research Program of China and others.).
0

Genome sequence and analysis of the tuber crop potato

Xun Xu et al.Jul 1, 2011
Potato (Solanum tuberosum L.) is the world’s most important non-grain food crop and is central to global food security. It is clonally propagated, highly heterozygous, autotetraploid, and suffers acute inbreeding depression. Here we use a homozygous doubled-monoploid potato clone to sequence and assemble 86% of the 844-megabase genome. We predict 39,031 protein-coding genes and present evidence for at least two genome duplication events indicative of a palaeopolyploid origin. As the first genome sequence of an asterid, the potato genome reveals 2,642 genes specific to this large angiosperm clade. We also sequenced a heterozygous diploid clone and show that gene presence/absence variants and other potentially deleterious mutations occur frequently and are a likely cause of inbreeding depression. Gene family expansion, tissue-specific expression and recruitment of genes to new pathways contributed to the evolution of tuber development. The potato genome sequence provides a platform for genetic improvement of this vital crop. The genome of the potato (Solanum tuberosum L.), a staple crop vital to food security, has been sequenced. The Potato Genome Sequencing Consortium sequenced a homozygous doubled-monoploid potato clone as well as a heterozygous diploid clone. Genome analysis reveals traces of at least two genome duplication events and genes specific to Asterids, a large clade of flowering plants of which the potato is the first to be sequenced. Gene presence/absence variants and other potentially deleterious mutations are frequent and may be the cause of inbreeding depression. The genome sequence will facilitate genetic improvements in the potato with a view to improving yield and to increasing disease and stress resistance of this crop, which is a now a significant component of worldwide food production and is becoming increasingly important in the developing world.
0
Citation1,938
0
Save
0

CoNi@SiO2@TiO2 and CoNi@Air@TiO2 Microspheres with Strong Wideband Microwave Absorption

Qinghe Liu et al.Nov 20, 2015
Advanced MaterialsVolume 28, Issue 3 p. 486-490 Communication CoNi@SiO2@TiO2 and CoNi@Air@TiO2 Microspheres with Strong Wideband Microwave Absorption Qinghe Liu, Qinghe Liu Laboratory of Advanced Materials, Department of Materials Science, Collaborative Innovation Center of Chemistry for Energy Materials, Fudan University, Shanghai, 200438 ChinaSearch for more papers by this authorQi Cao, Qi Cao Laboratory of Advanced Materials, Department of Materials Science, Collaborative Innovation Center of Chemistry for Energy Materials, Fudan University, Shanghai, 200438 ChinaSearch for more papers by this authorHan Bi, Han Bi Laboratory of Advanced Materials, Department of Materials Science, Collaborative Innovation Center of Chemistry for Energy Materials, Fudan University, Shanghai, 200438 ChinaSearch for more papers by this authorChongyun Liang, Chongyun Liang Laboratory of Advanced Materials, Department of Materials Science, Collaborative Innovation Center of Chemistry for Energy Materials, Fudan University, Shanghai, 200438 ChinaSearch for more papers by this authorKaiping Yuan, Kaiping Yuan Laboratory of Advanced Materials, Department of Materials Science, Collaborative Innovation Center of Chemistry for Energy Materials, Fudan University, Shanghai, 200438 ChinaSearch for more papers by this authorWen She, Wen She Laboratory of Advanced Materials, Department of Materials Science, Collaborative Innovation Center of Chemistry for Energy Materials, Fudan University, Shanghai, 200438 ChinaSearch for more papers by this authorYongji Yang, Corresponding Author Yongji Yang Department of Biophysics and Center of TEM, Second Military Medical University, Shanghai, 200433 ChinaE-mail: rcche@fudan.edu.cnSearch for more papers by this authorRenchao Che, Corresponding Author Renchao Che Laboratory of Advanced Materials, Department of Materials Science, Collaborative Innovation Center of Chemistry for Energy Materials, Fudan University, Shanghai, 200438 ChinaE-mail: rcche@fudan.edu.cnSearch for more papers by this author Qinghe Liu, Qinghe Liu Laboratory of Advanced Materials, Department of Materials Science, Collaborative Innovation Center of Chemistry for Energy Materials, Fudan University, Shanghai, 200438 ChinaSearch for more papers by this authorQi Cao, Qi Cao Laboratory of Advanced Materials, Department of Materials Science, Collaborative Innovation Center of Chemistry for Energy Materials, Fudan University, Shanghai, 200438 ChinaSearch for more papers by this authorHan Bi, Han Bi Laboratory of Advanced Materials, Department of Materials Science, Collaborative Innovation Center of Chemistry for Energy Materials, Fudan University, Shanghai, 200438 ChinaSearch for more papers by this authorChongyun Liang, Chongyun Liang Laboratory of Advanced Materials, Department of Materials Science, Collaborative Innovation Center of Chemistry for Energy Materials, Fudan University, Shanghai, 200438 ChinaSearch for more papers by this authorKaiping Yuan, Kaiping Yuan Laboratory of Advanced Materials, Department of Materials Science, Collaborative Innovation Center of Chemistry for Energy Materials, Fudan University, Shanghai, 200438 ChinaSearch for more papers by this authorWen She, Wen She Laboratory of Advanced Materials, Department of Materials Science, Collaborative Innovation Center of Chemistry for Energy Materials, Fudan University, Shanghai, 200438 ChinaSearch for more papers by this authorYongji Yang, Corresponding Author Yongji Yang Department of Biophysics and Center of TEM, Second Military Medical University, Shanghai, 200433 ChinaE-mail: rcche@fudan.edu.cnSearch for more papers by this authorRenchao Che, Corresponding Author Renchao Che Laboratory of Advanced Materials, Department of Materials Science, Collaborative Innovation Center of Chemistry for Energy Materials, Fudan University, Shanghai, 200438 ChinaE-mail: rcche@fudan.edu.cnSearch for more papers by this author First published: 20 November 2015 https://doi.org/10.1002/adma.201503149Citations: 1,241Read the full textAboutPDF ToolsRequest permissionExport citationAdd to favoritesTrack citation ShareShare Give accessShare full text accessShare full-text accessPlease review our Terms and Conditions of Use and check box below to share full-text version of article.I have read and accept the Wiley Online Library Terms and Conditions of UseShareable LinkUse the link below to share a full-text version of this article with your friends and colleagues. Learn more.Copy URL Share a linkShare onFacebookTwitterLinkedInRedditWechat Graphical Abstract The synthesis of CoNi@SiO2@TiO2 core–shell and CoNi@Air@TiO2 yolk–shell microspheres is reported for the first time. Owing to the magnetic–dielectric synergistic effect, the obtained CoNi@SiO2@TiO2 microspheres exhibit outstanding microwave absorption performance with a maximum reflection loss of −58.2 dB and wide bandwidth of 8.1 GHz (8.0–16.1 GHz, < −10 dB). Citing Literature Supporting Information As a service to our authors and readers, this journal provides supporting information supplied by the authors. Such materials are peer reviewed and may be re-organized for online delivery, but are not copy-edited or typeset. Technical support issues arising from supporting information (other than missing files) should be addressed to the authors. Filename Description adma201503149-sup-0001-S1.pdf1.4 MB Supplementary Please note: The publisher is not responsible for the content or functionality of any supporting information supplied by the authors. Any queries (other than missing content) should be directed to the corresponding author for the article. Volume28, Issue3January 20, 2016Pages 486-490 RelatedInformation
0

Synergism between vascular endothelial growth factor and placental growth factor contributes to angiogenesis and plasma extravasation in pathological conditions

Peter Carmeliet et al.May 1, 2001
Vascular endothelial growth factor (VEGF) stimulates angiogenesis by activating VEGF receptor-2 (VEGFR-2). The role of its homolog, placental growth factor (PlGF), remains unknown. Both VEGF and PlGF bind to VEGF receptor-1 (VEGFR-1), but it is unknown whether VEGFR-1, which exists as a soluble or a membrane-bound type, is an inert decoy or a signaling receptor for PlGF during angiogenesis. Here, we report that embryonic angiogenesis in mice was not affected by deficiency of PlGF (Pgf−/−). VEGF-B, another ligand of VEGFR-1, did not rescue development in Pgf−/− mice. However, loss of PlGF impaired angiogenesis, plasma extravasation and collateral growth during ischemia, inflammation, wound healing and cancer. Transplantation of wild-type bone marrow rescued the impaired angiogenesis and collateral growth in Pgf−/− mice, indicating that PlGF might have contributed to vessel growth in the adult by mobilizing bone-marrow–derived cells. The synergism between PlGF and VEGF was specific, as PlGF deficiency impaired the response to VEGF, but not to bFGF or histamine. VEGFR-1 was activated by PlGF, given that anti-VEGFR-1 antibodies and a Src-kinase inhibitor blocked the endothelial response to PlGF or VEGF/PlGF. By upregulating PlGF and the signaling subtype of VEGFR-1, endothelial cells amplify their responsiveness to VEGF during the 'angiogenic switch' in many pathological disorders.
0

Epidemiological, clinical and virological characteristics of 74 cases of coronavirus-infected disease 2019 (COVID-19) with gastrointestinal symptoms

Xi Jin et al.Mar 24, 2020
The SARS-CoV-2-infected disease (COVID-19) outbreak is a major threat to human beings. Previous studies mainly focused on Wuhan and typical symptoms. We analysed 74 confirmed COVID-19 cases with GI symptoms in the Zhejiang province to determine epidemiological, clinical and virological characteristics.COVID-19 hospital patients were admitted in the Zhejiang province from 17 January 2020 to 8 February 2020. Epidemiological, demographic, clinical, laboratory, management and outcome data of patients with GI symptoms were analysed using multivariate analysis for risk of severe/critical type. Bioinformatics were used to analyse features of SARS-CoV-2 from Zhejiang province.Among enrolled 651 patients, 74 (11.4%) presented with at least one GI symptom (nausea, vomiting or diarrhoea), average age of 46.14 years, 4-day incubation period and 10.8% had pre-existing liver disease. Of patients with COVID-19 with GI symptoms, 17 (22.97%) and 23 (31.08%) had severe/critical types and family clustering, respectively, significantly higher than those without GI symptoms, 47 (8.14%) and 118 (20.45%). Of patients with COVID-19 with GI symptoms, 29 (39.19%), 23 (31.08%), 8 (10.81%) and 16 (21.62%) had significantly higher rates of fever >38.5°C, fatigue, shortness of breath and headache, respectively. Low-dose glucocorticoids and antibiotics were administered to 14.86% and 41.89% of patients, respectively. Sputum production and increased lactate dehydrogenase/glucose levels were risk factors for severe/critical type. Bioinformatics showed sequence mutation of SARS-CoV-2 with m6A methylation and changed binding capacity with ACE2.We report COVID-19 cases with GI symptoms with novel features outside Wuhan. Attention to patients with COVID-19 with non-classic symptoms should increase to protect health providers.
0

One thousand plant transcriptomes and the phylogenomics of green plants

Mack Leebens et al.Oct 23, 2019
Green plants (Viridiplantae) include around 450,000-500,000 species1,2 of great diversity and have important roles in terrestrial and aquatic ecosystems. Here, as part of the One Thousand Plant Transcriptomes Initiative, we sequenced the vegetative transcriptomes of 1,124 species that span the diversity of plants in a broad sense (Archaeplastida), including green plants (Viridiplantae), glaucophytes (Glaucophyta) and red algae (Rhodophyta). Our analysis provides a robust phylogenomic framework for examining the evolution of green plants. Most inferred species relationships are well supported across multiple species tree and supermatrix analyses, but discordance among plastid and nuclear gene trees at a few important nodes highlights the complexity of plant genome evolution, including polyploidy, periods of rapid speciation, and extinction. Incomplete sorting of ancestral variation, polyploidization and massive expansions of gene families punctuate the evolutionary history of green plants. Notably, we find that large expansions of gene families preceded the origins of green plants, land plants and vascular plants, whereas whole-genome duplications are inferred to have occurred repeatedly throughout the evolution of flowering plants and ferns. The increasing availability of high-quality plant genome sequences and advances in functional genomics are enabling research on genome evolution across the green tree of life.
0
Citation1,323
0
Save
0

Therapeutic effects of ablative radiation on local tumor require CD8+ T cells: changing strategies for cancer treatment

You Lee et al.Apr 7, 2009
Patients with locally advanced cancer or distant metastasis frequently receive prolonged treatment with chemotherapy and/or fractionated radiotherapy (RT). Despite the initial clinical response, treatment resistance frequently develops and cure in these patients is uncommon. Developments in RT technology allow for the use of high-dose (or ablative) RT to target local tumors, with limited damage to the surrounding normal tissue. We report that reduction of tumor burden after ablative RT depends largely on T-cell responses. Ablative RT dramatically increases T-cell priming in draining lymphoid tissues, leading to reduction/eradication of the primary tumor or distant metastasis in a CD8(+) T cell-dependent fashion. We further demonstrate that ablative RT-initiated immune responses and tumor reduction are abrogated by conventional fractionated RT or adjuvant chemotherapy but greatly amplified by local immunotherapy. Our study challenges the rationale for current RT/chemotherapy strategies and highlights the importance of immune activation in preventing tumor relapse. Our findings emphasize the need for new strategies that not only reduce tumor burden but also enhance the role of antitumor immunity.
0
Citation1,212
0
Save
Load More