AT
Asma Tariq
Author with expertise in Genomic Analysis of Ancient DNA
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
17
(47% Open Access)
Cited by:
82
h-index:
7
/
i10-index:
5
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Paromomycin: A potential dual targeted drug effectively inhibits both spike (S1) and main protease of COVID-19

Asma Tariq et al.Jun 21, 2020
ObjectivesWith the increasing number of people suffering from coronavirus disease 2019 (COVID-19), caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), there is a dire need to look for effective remedies against this pandemic. Drug repurposing seems to be the solution for the current situation.MethodsIn a quest to find a potential drug against this virus, 15 antimalarial drugs (including chloroquine) and 2413 US Food and Drug Administration-approved drugs were investigated for activity against both the protease and spike proteins of SARS-CoV-2 using an in silico approach. Molecular docking analysis followed by molecular dynamics simulation was performed to estimate the binding and stability of the complexes.ResultsThis study identified a single drug – paromomycin – with activity against two targets of SARS-CoV-2, i.e., spike protein (S1) and protease domain. Paromomycin was found to have strong binding affinity for both targets of coronavirus. The results also showed that no antimalarial drug exhibited effective binding for either S1 or protease.ConclusionsThis study found that paromomycin may be an effective dual targeting drug against coronavirus, as it binds not only to the protease domain of the virion, but also to the spike domain, with high stability. Furthermore, none of the antimalarial drugs showed strong binding affinity for either protease or the receptor binding domain (RBD).
0
Citation36
0
Save
0

A computer aided drug discovery based discovery of lead‐like compounds against KDM5A for cancers using pharmacophore modeling and high‐throughput virtual screening

Asma Tariq et al.Oct 13, 2021
KDM5A over-expression mediates cancer cell proliferation and promotes resistance toward chemotherapy through epigenetic modifications. As its complete mechanism of action is still unknown, there is no KDM5A specific drug available at clinical level. In the current study, lead compounds for KDM5A were determined through pharmacophore modeling and high-throughput virtual screening from Asinex libraries containing 0.5 million compounds. These virtual hits were further evaluated and filtered for ADMET properties. Finally, 726 compounds were used for docking analysis against KDM5A. On the basis of docking score, 10 top-ranked compounds were selected and further evaluated for non-central nervous system (CNS) and CNS drug-like properties. Among these compounds, N-{[(7-Methyl-4-oxo-1,2,3,4-tetrahydrocyclopenta [c] chromen-9-yl) oxy]acetyl}-l-phenylalanine (G-score: -11.363 kcal/mol) was estimated to exhibit non-CNS properties while 2-(3,4-Dimethoxy-phenyl)-7-methoxy-chromen-4-one (G-score: -7.977 kcal/mol) was evaluated as CNS compound. Docked complexes of both compounds were finally selected for molecular dynamic simulation to examine the stability. This study concluded that both these compounds can serve as lead compounds in the quest of finding therapeutic agents against KDM5A associated cancers.
0
Citation6
0
Save
1

In silico identification of potential drug-like molecules against G glycoprotein of Nipah virus by molecular docking, DFT studies, and molecular dynamic simulation

Iqra Naeem et al.Aug 27, 2022
Nipah virus (NiV) is a novel zoonotic pathogen that belongs to the Paramyxovirus family. The pathogen has infected a number of people in countries like Bangladesh, India, Singapore, and Malaysia with high mortality rates. Although the NiV has been classified as a biosafety level four pathogen (BSL-4), there is no drug approved for treatment against it. In this study, the G glycoprotein of the NiV was chosen as an antiviral target. Based on ADMET criteria, BBB- and BBB + group compounds were screened out of the Gold & platinum Asinex library containing 211620 compounds. After careful evaluation, the selected ligands were then virtually screened to identify the potential inhibitors against the G glycoprotein of the NiV through molecular docking, density functional theory (DFT), and molecular dynamic (MD) simulation studies. In our study we identified 5-(1,3-Benzodioxol-5-yl)-2-[(3-fluorobenzyl)sulfanyl]-5,8-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidine-4,7(1H,6H)-dione (from BBB- group) and 7,7-Dimethyl-1-(4-methylphenyl)-3-(4-morpholinylcarbonyl)-7,8-dihydro-2,5(1H,6H)-quinolinedione) (from BBB + group) as potential compounds for the prevention and treatment of NiV related diseases.Communicated by Ramaswamy H. Sarma
1
Citation5
0
Save
0

Paromomycin: A Potential Dual Targeted Drug Effectively Inhibits both Spike (S1) and Main Protease of COVID-19

Asma Tariq et al.Jan 1, 2020
With increase in number of people suffering from COVID-19, there is a dire need to look for effective remedies against this pandemic. Several different approaches are being investigated for fighting against this virus. In this study, we propose a single drug Paromomycin against two targets of COVID-19 i.e. Spike protein (S1) and protease domain. In our quest for finding potentialdrug against this virus, we have docked 2413 FDA approved drugs against protease and spike proteins of COVID-19. Based upon their glide scores, Paromomycin was found to have strong binding affinity against both the targets of coronavirus. To further elucidate, MD simulation of both docked complexes was performed. RMSD and energy plots in comparison to the PDB backbone of proteins without ligands were calculated which further confirmed the stability of the complexes.In addition to these drugs,15 anti-malarial drugs including chloroquine were also investigated against both targets using in-silico approach. It has been observed that no anti-malarial drug showed effective binding against either S1 or protease targets. Current study concluded that Paromomycin is an effective double target drug against coronavirus, as it binds not only to the protease domain of the virion but also with the spike domain with high stability.
0
Citation4
0
Save
0

Persistence of Semen on five different fabric types in various water environments

Ahmed Nabi et al.Aug 13, 2021
Evidence collected from biological fluids obtained from a crime scene is essentially important in forensic cases. A potential profile can be generated from these obtained samples and this can help in identifying the victims and/or suspects of sexual assault. The water environments selected for this study are all related to the potential crime scenes from which there is a possibility of finding a dead body or clothing of a sexual assault victim. Tap water, River water, Swimming pool water, and Canal water were selected. Fabric types selected were khaddar, linen, silk, polyester, and chiffon. Detection of seminal stains was carried out by three methods; Alternate Light Source (ALS), Acid phosphatase (AP) testing, and Kernechtrot-Picro-indigo-carmine (KPIC) testing. These tests were performed for each fabric type in each water environment after regular intervals, 24 h, 48 h, 72 h, 4 days, 7 days, and 14 days. This study aimed to compare the ability of five types of fabrics to retain seminal material after immersion in four different types of water environments. Fluorescence was only detected in tap water-soaked silk fabric after 14 days of immersion. Seminal fluid was detected in khaddar, chiffon, silk, and polyester in samples immersed for 14 days in tap water. Spermatozoa were retained by khaddar and silk immersed in tap water, Polyester fabric in tap and river water, Chiffon in only river water and Linen in swimming pool water when immersed for 14 days. However, fluorescence, seminal fluid or spermatozoa were not detected in linen fabric regardless of all the afore mentioned variables.
0
Paper
Citation3
0
Save
0

Challenges Faced by Emotionally Intelligent Teachers at the University Level

Sidra Sarwer et al.Jun 30, 2024
This study aimed to explore the “Challenges faced by emotionally intelligent teachers at the university level”. To be fruitful this aim the two objectives were proposed. First objective was to identify the level of emotional intelligence among university teachers. Second objective was to recognize the challenges faced by emotionally intelligent teachers at the university level. Due to the broad nature of the topic, conducting an in-depth analytic study would have been time-consuming. Therefore, the research was delimited to focus specifically on 100 university teachers due to time constraints. A total of 100 university teachers were selected based on the informed consent of university-level teachers. The entire sample of 100 university teachers was included in the study. A five-point rating scale was developed specifically for university-level teachers. The literature relevant to emotional challenges faced by university-level teachers was reviewed. Based on this literature review, a five-point rating scale was constructed, comprising the following main categories. Emotional intelligence, Challenges faced by emotional intelligence, Emotional regulation and coping strategies, Support and training, and Suggestions for improving. The data were tabulated and statistically analyzed using percentages and standard deviations. The majority of respondents (45%) rated their understanding of emotional intelligence as average, followed by 25% rating it as high, and 15% defining it as very low. Only 5% of respondents rated their understanding as very high. Conclusions were drawn accordingly, and recommendations consistent with the findings were also provided.
Load More