Abstract Electronic health records (EHRs) and other administrative health data are increasingly used in research to generate evidence on the effectiveness, safety, and utilisation of medical products and services, and to inform public health guidance and policy. Reproducibility is a fundamental step for research credibility and promotes trust in evidence generated from EHRs. At present, ensuring research using EHRs is reproducible can be challenging for researchers. Research software platforms can provide technical solutions to enhance the reproducibility of research conducted using EHRs. In response to the COVID‐19 pandemic, we developed the secure, transparent, analytic open‐source software platform OpenSAFELY designed with reproducible research in mind. OpenSAFELY mitigates common barriers to reproducible research by: standardising key workflows around data preparation; removing barriers to code‐sharing in secure analysis environments; enforcing public sharing of programming code and codelists; ensuring the same computational environment is used everywhere; integrating new and existing tools that encourage and enable the use of reproducible working practices; and providing an audit trail for all code that is run against the real data to increase transparency. This paper describes OpenSAFELY's reproducibility‐by‐design approach in detail.

Objective To investigate the effect of the covid-19 pandemic on the number of patients with group A streptococcal infections and related antibiotic prescriptions. Design Retrospective cohort study in England using OpenSAFELY-TPP. Setting Primary care practices in England that used TPP SystmOne software, 1 January 2018 to 31 March 2023, with the approval of NHS England. Participants Patients registered at a TPP practice at the start of each month of the study period. Patients with missing data for sex or age were excluded, resulting in a population of 23 816 470 in January 2018, increasing to 25 541 940 by March 2023. Main outcome measures Monthly counts and crude rates of patients with group A streptococcal infections (sore throat or tonsillitis, scarlet fever, and invasive group A streptococcal infections), and recommended firstline, alternative, and reserved antibiotic prescriptions linked with a group A streptococcal infection before (pre-April 2020), during, and after (post-April 2021) covid-19 restrictions. Maximum and minimum count and rate for each infectious season (time from September to August), as well as the rate ratio of the 2022-23 season compared with the last comparably high season (2017-18). Results The number of patients with group A streptococcal infections, and antibiotic prescriptions linked to an indication of group A streptococcal infection, peaked in December 2022, higher than the peak in 2017-18. The rate ratios for monthly sore throat or tonsillitis (possible group A streptococcal throat infection), scarlet fever, and invasive group A streptococcal infection in 2022-23 relative to 2017-18 were 1.39 (95% confidence interval (CI) 1.38 to 1.40), 2.68 (2.59 to 2.77), and 4.37 (2.94 to 6.48), respectively. The rate ratio for prescriptions of first line, alternative, and reserved antibiotics to patients with group A streptococcal infections in 2022-23 relative to 2017-18 were 1.37 (95% CI 1.35 to 1.38), 2.30 (2.26 to 2.34), and 2.42 (2.24 to 2.61), respectively. For individual antibiotic prescriptions in 2022-23, azithromycin showed the greatest relative increase versus 2017-18, with a rate ratio of 7.37 (6.22 to 8.74). This finding followed a marked decrease in the recording of patients with group A streptococcal infections and associated prescriptions during the period of covid-19 restrictions where the maximum count and rates were lower than any minimum rates before the covid-19 pandemic. Conclusions Recording of rates of scarlet fever, sore throat or tonsillitis, and invasive group A streptococcal infections, and associated antibiotic prescribing, peaked in December 2022. Primary care data can supplement existing infectious disease surveillance through linkages with relevant prescribing data and detailed analysis of clinical and demographic subgroups.

Some studies have shown that the incidence of type 2 diabetes increases after a diagnosis of COVID-19, although the evidence is not conclusive. However, the effects of the COVID-19 vaccine on this association, or the effect on other diabetes subtypes, are not clear. We aimed to investigate the association between COVID-19 and incidence of type 2, type 1, gestational and non-specific diabetes, and the effect of COVID- 19 vaccination, up to 52 weeks after diagnosis.

Background:

 Emerging evidence suggests an arrhythmogenic effect of Anti-Ro/SSA (anti-Ro) and anti-La/SSB (anti-La) antibodies in adults, potentially involving a subclinical intracardiac inflammatory process. Despite the established association between inflammation and ischemic heart disease (IHD), it is noteworthy that as of now no study has delved into the potential link between these antibodies and IHD. 

Objectives:

 To describe and assess the association between asymptomatic Anti-Ro/La antibodies seropositivity to IHD. 

Methods:

 We conducted a retrospective study using electronic medical records from the largest health maintenance organization in Israel. Patients with positive serology for either or both anti-Ro and anti-La antibodies were included, along with matched controls. Multivariate logistic regression models were utilized to assess the odds of IHD in seropositive patients compared to controls. 

Results:

 Among 17,231 seropositive patients and 84,368 controls, the rate of IHD was significantly higher in the seropositive group (9.7% vs. 8.1%,OR=1.23; 95%CI 1.14-1.31; p<0.001). The association was more pronounced in younger patients [<40 years old(OR=3.36; 95%CI 1.66-6.82;p<0.001), 40-49 years old(OR=1.85; 95%CI 1.26 -2.73;p<0.01), 50-59 years old(OR=1.87; 95%CI 1.55-2.26; p<0.001), 60-69 years old(OR=1.26; 95%CI 1.11-1.42; p<0.001), ≥ 70 years old(OR=1.11; 95%CI 1.03-1.20;p<0.01)]. As well as in patients with fewer traditional cardiovascular risk-factors (none:OR=1.29; 95% CI 1.09 to 1.77;p<0.01, 1-2:OR=1.30; 95% CI 1.19 to 1.41;p<0.001, ≥3:OR=1.09; 95% CI 0.99 to 1.21;p=0.076). 

Conclusion:

 Our study demonstrates for the first time a positive association between anti-Ro/La seropositivity and IHD in the general adult population, especially among younger individuals with fewer traditional cardiovascular risk factors. 

REFERENCES:

 NIL. 

Acknowledgements:

 NIL. 

Disclosure of Interests:

 None declared.