FZ
Feng Zhang
Author with expertise in Role of Long Noncoding RNAs in Cancer and Development
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
7
(43% Open Access)
Cited by:
3,363
h-index:
29
/
i10-index:
55
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Genome-wide association study identifies eight loci associated with blood pressure

Christopher Newton‐Cheh et al.May 10, 2009
Christopher Newton-Cheh and colleagues report a genome-wide association study for blood pressure traits as part of the Global BPgen consortium. They report eight loci with replicated association to systolic and/or diastolic blood pressure, with each also showing association to hypertension. Elevated blood pressure is a common, heritable cause of cardiovascular disease worldwide. To date, identification of common genetic variants influencing blood pressure has proven challenging. We tested 2.5 million genotyped and imputed SNPs for association with systolic and diastolic blood pressure in 34,433 subjects of European ancestry from the Global BPgen consortium and followed up findings with direct genotyping (N ≤ 71,225 European ancestry, N ≤ 12,889 Indian Asian ancestry) and in silico comparison (CHARGE consortium, N = 29,136). We identified association between systolic or diastolic blood pressure and common variants in eight regions near the CYP17A1 (P = 7 × 10−24), CYP1A2 (P = 1 × 10−23), FGF5 (P = 1 × 10−21), SH2B3 (P = 3 × 10−18), MTHFR (P = 2 × 10−13), c10orf107 (P = 1 × 10−9), ZNF652 (P = 5 × 10−9) and PLCD3 (P = 1 × 10−8) genes. All variants associated with continuous blood pressure were associated with dichotomous hypertension. These associations between common variants and blood pressure and hypertension offer mechanistic insights into the regulation of blood pressure and may point to novel targets for interventions to prevent cardiovascular disease.
0
Citation1,184
0
Save
0

Improved soybean oil quality by targeted mutagenesis of the fatty acid desaturase 2 gene family

William Haun et al.May 23, 2014
Summary Soybean oil is high in polyunsaturated fats and is often partially hydrogenated to increase its shelf life and improve oxidative stability. The trans‐fatty acids produced through hydrogenation pose a health threat. Soybean lines that are low in polyunsaturated fats were generated by introducing mutations in two fatty acid desaturase 2 genes ( FAD 2‐1A and FAD 2‐1B ), which in the seed convert the monounsaturated fat, oleic acid, to the polyunsaturated fat, linoleic acid. Transcription activator‐like effector nucleases ( TALEN s) were engineered to recognize and cleave conserved DNA sequences in both genes. In four of 19 transgenic soybean lines expressing the TALEN s, mutations in FAD 2‐1A and FAD 2‐1B were observed in DNA extracted from leaf tissue; three of the four lines transmitted heritable FAD 2 ‐1 mutations to the next generation. The fatty acid profile of the seed was dramatically changed in plants homozygous for mutations in both FAD 2‐1A and FAD 2‐1B : oleic acid increased from 20% to 80% and linoleic acid decreased from 50% to under 4%. Further, mutant plants were identified that lacked the TALEN transgene and only carried the targeted mutations. The ability to create a valuable trait in a single generation through targeted modification of a gene family demonstrates the power of TALEN s for genome engineering and crop improvement.
0
Citation481
0
Save
0

Pan-cancer single-cell landscape of drug-metabolizing enzyme genes

Wei Mao et al.May 17, 2024
Objective Varied expression of drug-metabolizing enzymes (DME) genes dictates the intensity and duration of drug response in cancer treatment. This study aimed to investigate the transcriptional profile of DMEs in tumor microenvironment (TME) at single-cell level and their impact on individual responses to anticancer therapy. Methods Over 1.3 million cells from 481 normal/tumor samples across 9 solid cancer types were integrated to profile changes in the expression of DME genes. A ridge regression model based on the PRISM database was constructed to predict the influence of DME gene expression on drug sensitivity. Results Distinct expression patterns of DME genes were revealed at single-cell resolution across different cancer types. Several DME genes were highly enriched in epithelial cells (e.g. GPX2, TST and CYP3A5 ) or different TME components (e.g. CYP4F3 in monocytes). Particularly, GPX2 and TST were differentially expressed in epithelial cells from tumor samples compared to those from normal samples. Utilizing the PRISM database, we found that elevated expression of GPX2, CYP3A5 and reduced expression of TST was linked to enhanced sensitivity of particular chemo-drugs (e.g. gemcitabine, daunorubicin, dasatinib, vincristine, paclitaxel and oxaliplatin). Conclusion Our findings underscore the varied expression pattern of DME genes in cancer cells and TME components, highlighting their potential as biomarkers for selecting appropriate chemotherapy agents.
0
Citation1
0
Save