The agriGO platform, which has been serving the scientific community for >10 years, specifically focuses on gene ontology (GO) enrichment analyses of plant and agricultural species. We continuously maintain and update the databases and accommodate the various requests of our global users. Here, we present our updated agriGO that has a largely expanded number of supporting species (394) and datatypes (865). In addition, a larger number of species have been classified into groups covering crops, vegetables, fish, birds and insects closely related to the agricultural community. We further improved the computational efficiency, including the batch analysis and P-value distribution (PVD), and the user-friendliness of the web pages. More visualization features were added to the platform, including SEACOMPARE (cross comparison of singular enrichment analysis), direct acyclic graph (DAG) and Scatter Plots, which can be merged by choosing any significant GO term. The updated platform agriGO v2.0 is now publicly accessible at http://systemsbiology.cau.edu.cn/agriGOv2/.

Chopped up: The success of the title reaction strongly depends on the domain size of the WO3 crystallites, and the type of support. Structurally stable WO3 plays a bifunctional role in the promotion of the hydrolysis of cellulose into sugar intermediates, and more significantly in the selective cleavage of the CC bonds in these sugars. Detailed facts of importance to specialist readers are published as ”Supporting Information”. Such documents are peer-reviewed, but not copy-edited or typeset. They are made available as submitted by the authors. Please note: The publisher is not responsible for the content or functionality of any supporting information supplied by the authors. Any queries (other than missing content) should be directed to the corresponding author for the article.

Hydrogen transfer is the major route in catalytic conversion of methanol to olefins (MTO) for the formation of nonolefinic byproducts, including alkanes and aromatics. Two separate, noninterlinked hydrogen transfer pathways have been identified. In the absence of methanol, hydrogen transfer occurs between olefins and naphthenes via protonation of the olefin and the transfer of the hydride to the carbenium ion. A hitherto unidentified hydride transfer pathway involving Lewis and Brønsted acid sites dominates as long as methanol is present in the reacting mixture, leading to aromatics and alkanes. Experiments with purely Lewis acidic ZSM-5 showed that methanol and propene react on Lewis acid sites to HCHO and propane. In turn, HCHO reacts with olefins stepwise to aromatic molecules on Brønsted acid sites. The aromatic molecules formed at Brønsted acid sites have a high tendency to convert to irreversibly adsorbed carbonaceous deposits and are responsible for the critical deactivation in the methanol to olefin process.

The elementary reactions leading to the formation of the first carbon-carbon bond during early stages of the zeolite-catalyzed methanol conversion into hydrocarbons were identified by combining kinetics, spectroscopy, and DFT calculations. The first intermediates containing a C-C bond are acetic acid and methyl acetate, which are formed through carbonylation of methanol or dimethyl ether even in presence of water. A series of acid-catalyzed reactions including acetylation, decarboxylation, aldol condensation, and cracking convert those intermediates into a mixture of surface bounded hydrocarbons, the hydrocarbon pool, as well as into the first olefin leaving the catalyst. This carbonylation based mechanism has an energy barrier of 80 kJ mol(-1) for the formation of the first C-C bond, in line with a broad range of experiments, and significantly lower than the barriers associated with earlier proposed mechanisms.

Peroxyacetic acid (PAA) oxidation has received widespread concerns for organic pollutant degradation with low secondary pollution. Nanoconfinement is an effective means to enhance the REDOX process by regulating reactive oxygen species formation and shortening the mass transfer distance. Herein, nanoconfined Co species were encapsulated in carbon nanotubes (Co3O4-in-CNTs), with more active sites and faster electron transfer, and exhibited excellent catalytic capacity on PAA activation. Consequently, the PAA/Co3O4-in-CNTs system achieved 100 % removal of sulfadiazine (SDZ) within 5 min, which was kinetically 24 times faster than the unconfined one. CH3C(O)OO and CH3C(O)O were the vital contributors, and the Co(IV) and 1O2 created non-radical oxidation pathways via electron transfer. Theoretical calculations revealed that the electron delocalization around Co-active sites and electron rearrangement induced by nanoconfinement promoted the Co(IV), 1O2, CH3C(O)OO, and CH3C(O)O formation, thus accelerating SDZ removal process. Moreover, the PAA/Co3O4-in-CNTs system performed great stability under different environmental conditions.

In the presence of water, hydronium ions formed within the micropores of zeolite H-BEA significantly influence the surrounding environment and the reactivity of organic substrates. The positive charge of these ions, coupled with the zeolite's negatively charged framework, results in an ionic environment that causes a strongly nonideal solvation behavior of cyclohexanol. This leads to a significantly higher excess chemical potential in the initial state and stabilizes at the same time the charged transition state in the dehydration of cyclohexanol. As a result, the free-energy barrier of the reaction is lowered, leading to a marked increase in the reaction rates. Nonetheless, there is a limit to the reaction rate enhancement by the hydronium ion concentration. Experiments conducted with low concentrations of reactants show that beyond an optimal concentration, the required spatial rearrangement between hydronium ions and cyclohexanols inhibits further increases in the reaction rate, leading to a peak in the intrinsic activity of hydronium ions. The quantification of excess chemical potential in both initial and transition states for zeolites H-BEA, along with findings from HMFI, provides a basis to generalize and predict rates for hydronium-ion-catalyzed dehydration reactions in Brønsted zeolites.